Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113557456
Help
Entry
113557456 CDS
T06065
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC113557456 isoform X1
KO
K24387
lethal(3)malignant brain tumor-like protein
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Pathway
rmd03083
Polycomb repressive complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03083 Polycomb repressive complex
113557456
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
rmd03000
]
113557456
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
113557456
Transcription factors [BR:
rmd03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Cys2HisCys zinc factors
113557456
Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
Eukaryotic type
Histone modification proteins
Polycomb repressive complex (PRC) and associated proteins
Noncanonical PRC1 (PRC1.6)
113557456
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBT
SAM_1
zf-C2HC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113557456
NCBI-ProteinID:
XP_026818788
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(41368276..41381269)
Genome browser
AA seq
1495 aa
AA seq
DB search
MDLDSLKDPHNSHCNISSTLNNNSNTSGIENTKLNESTLNKVEQINTKNSKIGDNNGVEL
SKQQVPIKQMITTASIVNVPKLIKINLNSHCISSSLDTSSSTSGKKITKLNESISTQLQE
INKTENFKIGDIHDVEISKQQKSVNQIISTTSVKNENNIYPQKISSSLNNSSSTTGKEVT
QSNESISTVIQERKKIDNFKVDDVEISLSNRKIPVKHVLPAIAFVNSSNIHFHNTHRDLS
SLLDNNNKKYGIEVSKINKSTSTKVLEQKKTVSLKILDNINIEKSKQQIPINKLIKAPLF
LNTLNKSQKTVCIRPNTYSLNVEKISVPQTVISNVKLLPSVITGQIKKPSTFSIIPSTTR
INPTNTIIKRLQPKLNPVNITNNKCISTLKPGFKIISPNDLKSKIVLNPQKSCKYVLTNI
ENGKVTNLPTCISKSPMLKPLNSIIPVTVAEKFNAIEEKPKIKDIKSKFVVNFKEFQNQR
YKALRIEKKKNFKKFKHLFASNTSFQPIQQSSTNAFIRKQKRKLKSHTDPSNSKEMKIDA
SITDSKHNQQEKELSSLNKNKNLTDFGDVSGLKKHIPHTIISKDLINNHKNVVILNNNIK
KEFCPTPGFIQLSSKPESLIKTYGQPLAITKYGKFTAKEQKTVRLVPLSSINQSKTKPNA
TVMIHGKPVPVRIMKKNDNNPNNNITKIPTNQLLKMIPNKVYTAKNTKLNKFSNKPNVCY
KKISLEPLIKDLLPKVTMTQRILPKSSPNKMNTTKNQLTFPPGPLVTCEYEYCSIVGHKL
EMIDFMYCSKGCKRLATKLKLATEKPVVIGQPQENTDFSKKPPIDRKLLLAKLRSRINKR
KQNLPSFQKEDVSGHQVETLCKVPYTSISSAIPITVNRSFQKSENKRKSSKSIRATATVE
NGKLEKEKILSYLQHTDYVPAPKRLFDNPFPLDANPFKVGQRLEGIDPEHEALFCVMSVV
EVCGYRIKLHFDGYPDIYNFWVNANCPDLFFPRWCEQNSRILQPPKNYNRPFRWTDYLHI
PGVTPAPKWNFPTALNTNRITNHSFYIGAKLEALDKLTRTTSKQLICVATIADFLGNRIR
IHFDGWTDDFDYWTDITSTTIHPVGWCDKNGRSLCPPHGYDDCKGKNPFSWTKYLKETNS
QPVPENAFFRRPLREFTNSMAIEVVDIANPSLIRIAKVVDVKGDELKILYDGFDTIYAYW
IEDDSPNIHPLGWCLKTNHPIELFKANAILWTCRVPGCNGKGNANNSKNTHVFAKDCPYE
FESWKKLISGLIVKPDRIKPEDLLSSVPSSLKPESTVVTKEDNKKEKLKSNKLKRYRFKK
SKKSKKYKKSKKRINNKLKKNLKKKIPNGRSKTVYKRAVEAMDELEIIKGVNDYTSYGYG
SFKRPRLNAWTRHNVLDDIPIFNTTDVRKWPIKEVATFVEIVVSNNYTDDNPSDRIKISK
SFLNQEIDGDVFLMLTQKDLTDVLNIPLGPALKLHNAIVVLRQRTSAFDVANGLL
NT seq
4488 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttagattcgttaaaagatcctcacaattcgcattgtaacattagtagtacatta
aataacaacagtaatacaagtggtattgaaaatacaaaattaaatgaatctactttaaat
aaagtagaacaaattaatactaaaaattctaaaattggcgataataatggtgttgaatta
tctaaacaacaggtgccaattaaacaaatgataacaactgcctctattgtaaatgtacct
aaactaattaaaatcaatttaaattctcactgcataagtagctcattagataccagcagt
agtacaagtggtaaaaaaattaccaaattaaatgaatccatttcaactcaactccaagaa
ataaataaaactgaaaattttaaaattggagatatacatgatgttgaaatatctaaacaa
caaaagtcagtaaatcaaattatttcaactacttctgttaaaaatgaaaacaatatatat
cctcaaaaaataagtagttcattgaataacagcagtagtacaactggtaaagaagttacc
caatcaaatgaatctatctcaactgtaattcaagaacgaaaaaaaattgataattttaaa
gttgatgatgttgaaatatcgttatctaatcgtaaaattccagtgaagcacgtactacct
gctatagcttttgtcaattcatctaatatacattttcataatactcatcgtgatttgagt
agtttattggataataacaataagaaatatggtatagaagtttccaaaataaataaatct
acttcaactaaagtacttgaacaaaaaaaaactgttagtttaaaaattcttgataatatt
aatattgaaaaatctaaacaacagataccaatcaacaaactgatcaaagctcctttgttt
ttaaatacacttaataaaagtcaaaaaaccgtatgtataagaccaaacacatattctttg
aatgtagaaaaaatttctgttccacaaacagttatatctaatgtgaaactacttccttca
gttattactggccaaattaaaaaaccatcaactttctctataataccttccactacacgc
atcaatccaacaaatacaattattaaaagattacaacccaagttaaatcctgttaatatt
actaataataaatgcatttcgacattaaaacctggattcaaaataatatctccaaatgac
ttaaagtcgaaaatagttctaaatccacaaaaaagttgtaagtatgtattaactaatata
gaaaatggaaaagtcacgaacttgccgacttgtatttccaaatcaccaatgttaaaacca
ttaaattctataataccagtaacagtcgccgaaaaatttaatgcaattgaagaaaaacca
aaaattaaagatattaaatcaaaatttgttgttaacttcaaagaatttcagaatcaaaga
tacaaagctttacgaattgaaaaaaaaaaaaatttcaaaaaattcaaacatttatttgca
tcaaacactagttttcaacctatacaacagagttctacaaatgcatttattagaaaacaa
aaaaggaaattgaaatctcatacagatccatcaaactctaaagaaatgaagattgacgca
agtattacagattctaaacataatcaacaagaaaaagaactatcatcattaaacaaaaat
aaaaatttaactgattttggagatgtcagtggactgaaaaaacatataccccatactatt
attagtaaagatttaataaataatcataaaaatgtggttattttaaataataatattaaa
aaagaattttgtcctacacctggatttattcaactatcatcaaagcctgaatctctaatc
aaaacatatggtcaacctttagctatcacaaaatatggtaaatttactgctaaagaacaa
aaaactgtaagattagtacctttaagttcaattaaccaatcaaaaacaaaaccgaatgct
actgttatgatacatggtaaaccagttcctgttcgtattatgaaaaaaaatgataataat
cccaacaataatattactaaaattcctactaatcaattattgaagatgattcctaataaa
gtttatacagcaaaaaatacaaaattgaataaatttagtaacaaacccaacgtttgttac
aagaaaatatcgttagaaccattaattaaggatttattaccaaaagttactatgacccag
agaatattaccaaaatcatctcccaataaaatgaatacgaccaaaaatcaactgacgttt
ccaccaggtccattggttacatgtgaatatgaatattgtagtatagtaggacacaaactt
gaaatgattgattttatgtattgtagcaagggttgtaaaagattagctactaaactaaag
ttagctacagaaaagcctgttgttattggacaaccacaagaaaatacagatttttcaaaa
aaacctccgattgatcgaaaattgcttttagcaaaattgagaagtagaattaataaaagg
aagcaaaacttaccatcttttcaaaaagaagatgtatctgggcatcaagttgaaacactt
tgtaaggtgccctacacttctatttcatctgcaataccaataactgtaaatcgttctttt
caaaaatcagaaaataaaagaaaatcctcaaaatcaattagagctactgctacagttgaa
aacggtaaactagaaaaagaaaaaatattgagctatttgcaacatactgattatgtacct
gctccaaaaagattatttgacaatccttttccattagatgctaacccttttaaagttgga
caaagattagaaggtattgatccagaacatgaagccttgttttgtgttatgagtgtagtg
gaagtttgtggatatcgcattaagttacactttgatggctatccagatatatataatttt
tgggtaaatgcaaattgcccagatttatttttccctagatggtgtgaacaaaactctcgc
attttgcaaccaccaaaaaattataatcgaccattcaggtggactgattaccttcatata
cctggtgttacgcctgctccaaaatggaattttcctactgccttaaatactaatcgtata
acaaatcattcattttatattggagctaaactagaagctttagataaattaacacgcaca
acatcaaaacaacttatatgtgttgctactattgctgattttttgggaaatcgtatacgt
attcattttgatggatggacagatgattttgactactggacagatattacatcaactact
atacatcctgtgggatggtgtgataaaaatggtcgatctttatgtccacctcatggttac
gatgattgcaaaggcaaaaatcctttttcttggactaaatatttaaaagaaaccaatagt
caacctgtaccagaaaatgcattttttcgcagaccattacgagaatttactaatagcatg
gcaattgaagttgtagatattgcaaatccttcattaattagaattgctaaagtagtagat
gttaaaggagatgaacttaaaatactttatgatggatttgataccatatatgcgtactgg
attgaagatgacagtccaaatattcatccacttggatggtgtttaaaaactaatcaccca
attgagctatttaaagcaaatgcaatactttggacttgtagagttcctggttgtaatggt
aaaggcaatgcaaataattccaaaaatactcatgtatttgctaaagattgcccatatgaa
tttgagtcatggaaaaaattaatttctggattaatagttaaacctgatagaataaaacct
gaagatttattatcttcagttccaagtagtttgaaacctgagagtactgttgtaactaaa
gaagataataaaaaagaaaaattgaagtcaaataaactaaaaagataccgttttaagaag
tctaaaaagtctaaaaagtataagaagtctaaaaaaagaatcaataacaaattaaaaaag
aatttaaaaaaaaagatacccaacggtcgttcaaaaactgtttataaaagagctgttgaa
gcaatggatgaattagaaataattaaaggtgttaatgattatacaagctatggttatggc
tcttttaaacgtcctaggcttaatgcatggaccagacataatgttctagatgatatacca
atatttaatactactgatgtaagaaaatggcctataaaagaagtagctacttttgttgaa
atagtagtttctaataattatacagatgataatccctctgatcgaatcaaaatatctaaa
tcttttttaaatcaggaaatcgatggtgatgtatttttaatgttaacccaaaaagattta
acagatgtattaaacattccacttggtccggcgctaaaactgcataatgctattgtagtg
ttaagacaaagaacttctgcatttgatgttgcgaatggactgttataa
DBGET
integrated database retrieval system