Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113559842
Help
Entry
113559842 CDS
T06065
Name
(RefSeq) ATP-binding cassette sub-family A member 3-like
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Pathway
rmd02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
113559842
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rmd02000
]
113559842
Transporters [BR:
rmd02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
113559842
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
R1_ABCA1
SMC_N
SbcC_Walker_B
AAA_23
AAA_29
MukB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113559842
NCBI-ProteinID:
XP_026821418
LinkDB
All DBs
Position
3:9315668..9330577
Genome browser
AA seq
1738 aa
AA seq
DB search
MWLKIKVLSWKSLQLRKRHWLGTIIEITVPCLLFFLINYLKSIEKTSKPITMDQTIPTPI
SEDVLYKEFTPHNNFILYTPQTKETEEIMNIVKTKLNLLNNTIGTAISESEIINKFKRKL
KNSSHNPNLIGFGIVFEETIKSHTLKYKIRSTDTLLQTDSLFPSIELPGPMNSGDRYLTM
GFLALQLTLDKAFILLGAHNKSGLNIKDYSLEIQSFPYTKYIMDSSFQMYFKFHFPLFTV
LGFFLMCSNTTKRVVEEKDSGIRELMTIMGLRPWMIWIGWILHNFFVYAISITIITYITC
FKTTTDHGKLLNYTNPLLFWIFLIMYMIAGVFFCFAISSFFSRPLMALIVGVSVWLFTYV
LPSCIVKPSTSILIQTLLTLLPNFAIVYVYKAISSLETQGTGLQFSTLFTAGKGGNNFSV
GFILLMFVVDCFLYGFIAWYIDSIMPGEFGVAKPFNFLCKWSKNKEENNVTIPISKRNSR
LFEKPSNNYEVGISVQNLHKRFGNVYAVNGVNLDLYKGQITALLGHNGAGKTTTMSIITG
LFSPTYGTVNVNGNDLFTNIDNFRQNLGLCPQHNLLFSYLTTLDHLIFFGMLKGLPLKNA
KSDGLHSLKLLNMLEKKNELVSNLSGGMKRKLSLAISLVGDPKILILDEPTSGMDPESRR
QMWDLLLSFRGTRTILITTHFMEEADVLGDRIAIMDHGKVICYGTSLFLKKAYGTGYNLT
IVKEESFDESKIIEEIKNIIPEAEIQSSLAAQVVINLPNENIDQFPDVFRKLELNRENFS
IKGMGISCTTMEEVFIKAETNIPDDDISSVNTPVDGNSYQLIIAKGVDCNVDQVTNLIQQ
YVPEFILMDETEMQIIFNLPATKKNQFGALFSALEFQKENFQMKNIKIINSTTGGIYPNS
VISGDDEDEPKQPSNNDFIQTFRPKYTSGIILLKNQFKVLLEKKIIYTHRKWFLSLFFGI
IPILLGLLVMKFTNSMMNDSYVSHGLKISLSTYKDSSAYYRAGDNSPQNLEPTFVAISKK
NKATVSEISSENNIINDLLKMCKENVLNYRTNLMIAGDFNQTKSTILYNNIAIHTPPIAV
NLYSNALLQKLSGNYESCISTVNEPILLDEMNSCNESLGTALVLLWLTVFTPGLLYSIGY
VMALPLYERASGIKHLQMMTKLSPIMYWITCFIWDYFCYIIVILLTMTGIYFMDKNGIFT
GSNEVCALFTLLFLYGWSLIFYVYVYSYLKNSLISSMLLFVSINFIIGLFISIFFYLLAD
FIRNINKTSSFNTLNIIRLILLIIPHFSYSSCLVGFLLITWENNMCKVCKSTMVEMCTDA
IGSKPKSYFVFKSDKNPYGILEETLFLFLSSILYISIILLFDYKIFPLLYQYAFNKIIGT
GESYRDVNEDSDVSKERDKVNVAKTHPNNASSPLLLIDDLVKKFNFKFTGVRGISFAVSP
GECFGLLGVNGAGKTTTFRILTGDIFPSKGDASILTNKLYKLSSNRNQYISLIGYCPQFD
AINDQLTGRETLKLMAVLRGISPTDAKMHVSKWIKLLGFEEYQNRPCGKYSGGNKRKLNT
AMALIGDPPVVFLDEPTSGVDPVARRNLWKLLAASQRDGQAIVLTSHSMDECEALCNRLT
IMVDGVMKCIGNIQYLKNRYGQGFTIMIKLRNNENFNVTELKFDIEQQFAPDIVLKDEHK
GLLHYHVTNPSSLLSEVFSKIKAIKENYTAIEDYTVGDTTLEQVFIAFAKKQAVLNMT
NT seq
5217 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggctaaaaatcaaagtactttcatggaaaagcttacaactacgaaaaagacattgg
ttgggtactataattgaaataacagtaccgtgcttattattttttttaataaattattta
aagtcaatcgaaaaaacatctaaaccaataactatggaccaaactataccaacaccaatt
tctgaagatgtcttatacaaggaatttacgccacacaataattttatactatatactcct
caaaccaaagaaacagaagaaattatgaacatagtaaaaacaaaattaaaccttttgaat
aatactattggaacagctattagtgaaagtgaaataataaataaatttaaaagaaaatta
aaaaacagttcacataatccaaatcttattggatttggaattgtttttgaagaaactata
aaatcccatactttgaagtacaagataagaagcacagatacgttactgcaaaccgattct
ttgtttccatcgattgaattaccaggacctatgaactctggcgatcgatacctaactatg
ggatttttagcattacagttgaccttagacaaagcttttattttgttgggtgcccataat
aaaagtggtcttaatataaaagattatagtttagaaattcagtcgtttccctatacaaaa
tacataatggattcatcatttcaaatgtattttaaatttcactttccgctatttactgtt
ttgggttttttcttaatgtgttccaatacaactaaaagagttgttgaagaaaaagattcg
ggcataagagaactaatgacaattatgggtcttcgaccatggatgatatggataggatgg
atattacataacttttttgtatatgcgatatcaattacaattatcacgtatattacttgt
tttaaaacaactactgatcacggaaagttattaaattatacaaatccattactgttttgg
atttttttaataatgtatatgattgctggagtatttttttgtttcgcaattagtagtttc
ttcagtcgaccattaatggctttaattgttggagttagtgtatggttattcacttacgtt
ttacccagttgtattgtgaaaccctctacaagtattctaattcaaacactattgacatta
cttccaaattttgcaatagtatatgtttataaagctatatcatcacttgaaactcaagga
acgggtcttcaattctccactctatttactgctggaaaaggcggtaataatttttctgtt
ggtttcattctactaatgtttgttgttgattgtttcttatatggatttattgcttggtac
attgattcaatcatgccaggagaatttggtgttgcaaaaccatttaatttcttgtgtaaa
tggtcgaaaaataaggaagaaaataatgtaacaattcccattagtaaacgcaatagtagg
cttttcgaaaaaccttcaaataattatgaagttggaattagtgttcaaaatttacataaa
cgttttggaaatgtttatgcagttaatggagtaaatttggacctatataaagggcaaata
actgcacttttaggtcacaatggtgctggaaaaacaaccacaatgtcaattataacaggg
ttattttctccaacatatggtactgtaaatgttaatgggaatgacttatttactaacatt
gacaattttagacaaaatcttggtttatgccctcaacataatttacttttctcttatttg
actactctggatcatttaatattttttggaatgctaaaaggtttaccattgaaaaatgca
aagtcagatggtttacattcgcttaaacttttaaatatgctggaaaagaaaaatgaacta
gtaagtaatctctctggaggaatgaaacgaaagttgtcacttgcaatttcattagttggc
gatcctaaaatactaatattagatgaaccaacatctggaatggatcctgaatctcgaaga
caaatgtgggatttactactgtctttcagaggaaccagaactattttgataacgacacat
tttatggaagaagctgatgttcttggtgataggattgctatcatggatcatggaaaagtt
atatgttatggaacttcattgtttttaaaaaaagcatatggaactggatataacttgact
attgtaaaagaagaatcatttgacgagtctaaaattatagaagaaattaaaaatattata
ccagaagcagaaattcaaagctcattggcagctcaagttgtcattaatttacccaatgaa
aatattgatcaatttccagatgtatttagaaaattagaacttaatagagaaaacttctct
attaaaggaatgggtatatcttgtacaacaatggaagaagtatttataaaagctgaaaca
aatatacctgatgatgatatatcatctgtaaacacaccagtagatggtaatagttaccag
ttgattatagccaaaggagttgattgtaatgttgaccaagtgactaatttaattcaacag
tatgtgcctgaatttattttgatggacgagacagaaatgcaaattatatttaatctacca
gctacaaaaaaaaatcaatttggtgccctattttctgctcttgaatttcaaaaagaaaat
tttcagatgaaaaatattaaaataatcaactcaactacaggcggcatctatccaaattca
gtcatatctggggatgatgaagatgaaccaaaacaaccatctaataatgattttatacaa
acttttaggccaaagtatacaagtggaattatattattgaaaaatcaatttaaagtatta
ttagaaaaaaaaatcatttatacacataggaaatggtttttgtcattattttttggaatt
atacctattttattgggtctattagttatgaaattcactaattctatgatgaatgattcc
tatgtttcccacggtttaaagatatcattaagcacctacaaagatagcagtgcatattac
cgtgctggagataattctccacaaaatttggaacccacatttgtagctatttctaaaaaa
aataaagctaccgtcagtgaaatatcatcagagaacaatataattaatgatttattaaaa
atgtgcaaagaaaatgtattaaactacagaacaaatcttatgatcgctggtgactttaac
caaacaaaatcaactattttatataataatatagctattcatactccaccaattgcagta
aatctttattctaatgctttattacaaaaattgtctggaaattatgaatcatgcatttca
actgtcaatgaaccgattttattggatgaaatgaattcatgtaatgaatcacttggaaca
gcattagtattactttggctaactgttttcacgcctggtttactgtactcaataggatat
gtaatggcgttaccattatatgaaagagcgagtggaattaaacacttacaaatgatgact
aaactttctccaatcatgtattggattacttgtttcatttgggactatttttgttacata
attgtgattttattaacaatgacaggtatatatttcatggataaaaatggtatatttact
ggttcaaacgaagtttgtgctttatttacattactatttctttatggatggagtttaata
ttctatgtatatgtttatagctatttaaaaaattccctaatcagttccatgttattgttt
gtttcaattaattttataatcggtttgtttattagtattttcttttatctacttgccgat
ttcataagaaatattaacaaaactagttcatttaacacattgaatataataagattaata
cttttaattattccacatttttcttattcatcatgcttagtaggatttctactaataaca
tgggaaaacaatatgtgtaaagtatgtaaatctactatggttgaaatgtgtacagatgct
attggttctaaaccaaaaagttattttgttttcaaatctgataaaaatccatatggcata
ctcgaagaaactttatttttatttctcagtagcatactgtatatatccattatattatta
tttgattataaaatatttcctttattatatcagtatgcttttaacaaaattattggcact
ggtgaaagttatagagatgttaatgaagattcagatgtcagcaaagaaagggataaagtt
aatgtagctaaaactcatccaaataatgcttcatcgccattattgctgattgatgatttg
gttaaaaagtttaattttaaattcaccggtgttagaggtataagttttgccgtttcccct
ggtgaatgttttggcttacttggagtaaatggtgcaggtaaaacaactacattccgaatt
ttaactggtgatatatttccttcaaaaggtgacgcttccattttgactaataagttgtac
aaactcagctctaatagaaatcagtatatttctttgattggttattgtcctcaattcgat
gcaataaatgatcaacttactggaagagaaactttaaaactaatggcagttttgagaggt
atatcgccaacagacgccaaaatgcatgttagtaaatggattaaacttttagggtttgaa
gaatatcaaaatcgaccctgtggaaaatatagcggtggtaataagagaaaattaaatact
gcaatggcattaattggagatcctcctgttgtatttttggacgaacccactagtggagta
gaccccgtagcaagacgtaacttatggaaattattggctgctagtcaaagagatggacaa
gctattgtacttacatcacatagtatggatgagtgtgaagcactttgcaaccgtttgaca
ataatggtggatggcgtaatgaaatgtattggtaacatacaatatttgaaaaatcgttat
ggacaagggtttacaataatgataaaactacgtaataatgaaaatttcaatgttactgaa
ctaaagtttgatatagaacaacagtttgctccagacatcgttttaaaagacgaacataaa
ggtttattgcattatcacgttactaatcccagttcactattgtctgaggtatttagtaag
ataaaagcaattaaagaaaattatactgcaattgaagactatactgttggtgacacaact
cttgaacaagtattcattgcatttgcaaaaaaacaggctgtcttaaatatgacataa
DBGET
integrated database retrieval system