Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113561339
Help
Entry
113561339 CDS
T06065
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: rap guanine nucleotide exchange factor 1-like
KO
K06277
Rap guanine nucleotide exchange factor 1
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RasGEF
RasGEF_N
Glyco_transf_64
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113561339
NCBI-ProteinID:
XP_026823487
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(23093515..23107168)
Genome browser
AA seq
1036 aa
AA seq
DB search
MSSTNKHDSDKDDEIEQCRVVPDEKYKKWNSNIGSGNKFARRARSFKEDLLDIISSAMRS
PSHSAISSRSGSPKNGLPKQRHASSGSSPKRSLNDIDFNVRQVQIALRHFLDVVTKNKLE
MLPGNGTVVLETVTTICGVFKSYDINEQSSLVVSALNQVYQSVAQLIKLCDDVLIFGEKA
INTDNVSDILRLVELAIQNLVSLTNDKLNHGVLKTVYKDEDSLKLPDELKQRVSLPDIPL
TPREREILEQTSNHSFDTVDCNPPSKPPLPDRTWLKKTDQNNSPPPLPPKRRTGHNNTKH
ALCNLSLEPLSLSDRSSSIGSLDSILNDDEVNIAMSNDDSSFLLDDTNHVCGYCNCSSSS
ASVDQGNEKRISPFSEYPPQHTMVEKKTAFIHQASNQVWTHSKSTTIHQITNRTVVSNEI
NCLTTNDEIPPPVPEKKRIVRQRLRSTYDNLSMDEMATQYNXHRNNSHCSIQALTHTASL
DNPAVDPSNPPPLPLKKKHMFHSVAYSVMAYMEMFGNCTHGNTTEFLRHSVHTYTMLHQS
NWHSPQKYQSEIQSYSVENSCQQYYFTNDSDPPALPPKRGKIMTSPYRELTPPNTPNKVY
ITEVISTPIQTQCLEIQDVTPSTTEQPLQTDISEVNIMEELNVSQWLLFKKPEEDGPLVR
GGHADALVVHATNAVKNDFMYQEAFLTTYRTFISPLELIQKLCMRHQRFQNSGDLNRQRA
GRESFSLLVRVVSDLTLTDLDNEVLQILMEFVYQLLCAGDLTMAKALRVKLLERYQAKLV
HNTSINALLPSQNIYTRQATLLDYKTELIAEQMTMLDSELFMKIEIPEVLIWVKEQNEER
SPNLTEFTEHFNKMSYWARSRILEQNEAKERERYVLKFIKIMKXLRKMNNFNSYLALLSA
LDSAPIRRLEWQKYITEGLKEYCALIDSSSSFRAYRQALADTNPPCIPYIGLVLQDLTFV
HIGNNDYISDNIINFSKRWQQFNIVENMKRFKKGCYNFKKHDHIIAFFNNFDEFLCEEAM
WQISESIKPRGSKKTT
NT seq
3111 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcgacgaataaacatgattctgataaagatgatgaaattgagcaatgtagagtc
gtcccggatgaaaagtacaaaaaatggaatagtaacattggtagtggtaataaatttgct
agacgagctcgttcatttaaagaagatttattggatattatatcatcagcaatgcgatca
cctagtcatagcgccatcagctctagaagtggttcgccaaaaaatggtttgccaaagcaa
agacatgcttcatctggaagtagtcctaagcggtcccttaatgacatcgactttaacgtt
agacaagttcagatagccttaagacatttccttgatgtagtaacaaagaataaattagaa
atgttacctggaaatggtacagtagttttagaaactgtaacaacaatttgtggggtgttt
aaatcatatgatattaatgagcaaagttcattggttgtatctgctttaaatcaagtgtac
caaagtgtagcacaactaattaagctatgtgatgatgttctcatatttggagaaaaagca
atcaatacagataatgtatcagatatactgcgcttagttgagctggctattcagaacttg
gtatcattaactaatgataaacttaaccatggtgtacttaaaactgtgtacaaagatgag
gattcattaaaacttcctgatgaattgaagcaaagagtttctttaccagatataccatta
acaccaagggaaagagaaatattagaacaaacaagtaatcattcctttgatacagttgac
tgtaatcctccttcaaagccacctttacctgatcgaacatggttaaaaaagactgaccaa
aataattctcctcctcctttgccaccaaaacgtcgtactggacataataacaccaagcat
gctctatgtaacttatctttagagccattaagcctttcggataggtcttcatcaattggt
tcactagattcaattttaaatgatgatgaagttaacattgctatgtccaatgatgatagt
tcttttttattagatgataccaatcatgtatgtggctattgtaactgttcttccagttct
gcttcagtagaccaaggcaatgaaaaacgaatatctccgttttctgaatatccacctcag
catacaatggtagaaaagaaaactgcatttattcatcaggcatctaatcaagtttggaca
cattctaaatccacaacaatacatcaaatcactaatagaactgtagtatcaaacgaaatt
aattgtttaacaacaaatgatgaaattccaccaccagtgccagaaaaaaaacgaatagtc
agacaaaggctaaggtctacttatgacaatttatctatggatgaaatggccacacaatat
aacnttcatagaaataacagtcattgtagtatccaagccttaacacatactgcatcactt
gataaccctgcagtggatccttcaaatccaccacctttaccgttaaaaaagaaacatatg
tttcattcggtggcatattctgtaatggcatacatggaaatgtttggcaattgtacgcat
gggaatactacggaatttctacgtcattctgttcatacatacacaatgcttcatcaaagt
aattggcattcacctcaaaagtatcagagtgaaatccaaagttatagtgttgaaaattct
tgtcaacaatattattttaccaatgactctgacccacctgcattaccgcctaaacgaggt
aaaataatgacatctccttatagagaactgacaccacctaatactccaaataaagtatac
ataaccgaagttatatcaactccgattcaaactcaatgtttagaaattcaggatgttaca
ccaagtactactgaacaacctttacaaactgatattagtgaagttaacattatggaagaa
ttaaatgtatctcaatggctattatttaaaaaaccagaagaagacggaccacttgttcgt
ggtgggcatgcagatgctcttgtagttcatgcaacaaatgcagttaaaaatgattttatg
tatcaagaagcgtttttaacaacatatagaacatttatatcacctctagaattaatacaa
aaactttgcatgcgacatcaaaggtttcaaaactctggtgatttaaataggcaaagagct
ggccgagagtcattttctctgttagttagagtagttagtgatttaactttaacagactta
gataatgaagtgttgcaaattctcatggaatttgtatatcaactattatgtgctggagat
ttaactatggcaaaagcactcagagtaaaacttttggaaaggtatcaggcaaaattggtg
cataatacttcaattaatgctctattaccatctcaaaatatatacactcgtcaagccact
ttattagactataaaacagaacttattgctgaacaaatgacaatgttggattcagaacta
tttatgaaaattgagatacctgaagttttaatttgggttaaggaacaaaatgaagagcgt
agtccaaatctcacagaatttacagaacattttaacaaaatgtcatactgggcgagatcg
cgtatactagaacaaaatgaagctaaagaacgtgaacgttatgttttaaagtttatcaaa
attatgaaanagttgagaaagatgaataattttaattcatatttagcccttttgtctgct
ttagatagtgcaccaattagacgtctagaatggcaaaaatatattaccgaaggattaaaa
gaatactgtgcactgattgatagttcgtcaagttttagagcttatagacaagctttagca
gacacaaatcctccttgcatcccttacataggactagtattacaagatttaacatttgta
cacattggcaacaatgattatatatcagataatataattaatttttccaaaagatggcaa
cagtttaatattgtggaaaatatgaagagatttaaaaaaggatgctataatttcaagaaa
catgatcatatcattgcattctttaacaattttgatgagtttttatgtgaagaagccatg
tggcaaatcagtgaaagcattaagcctagaggaagtaaaaaaactacatag
DBGET
integrated database retrieval system
