Rattus norvegicus (rat): 100912943
Help
Entry
100912943 CDS
T01003
Symbol
Muc3a
Name
(RefSeq) mucin-3A-like
Organism
rno
Rattus norvegicus (rat)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_TEN
EGF_2
DUF5874
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100912943
NCBI-ProteinID:
XP_017454084
RGD:
6485223
LinkDB
All DBs
Position
12:25082728..25091494
Genome browser
AA seq
2728 aa
AA seq
DB search
MTDTALTSSSMGFTEPLTTASHTATLTVPTLSPTDSTPSKTTIGHTVTTLVYTAHSTASA
LTGNTPVQSLGTSIPVTPVFSSATEGSTPGTAQNEHEHSAPTLLHTLYTTAVSTPPPTIT
DTLPVSLSPEGSAPTAVSGAGWPSSPSTAATSSGEATLTPHTDLTTESPQTQRPSAPPTT
SSVTPTDTLASGSPIPSSPGTSSALTSTTNGVLPSVSDSSTKLVTAGPTLSTTISALETT
LPVTQATSAATPEVTSPNSVSSSVTHSPSHNISPTSTLGTRSPDTSATPSWPSTLPSETS
TTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTVSLSTTDISLTPATIETMRTLTSTIPSTHSSGLPTM
TDTALTSSSMGFTEPLTSVSHTATLTVPSLSPTDSTPSNPTSGHTVTTLVYTAHTTSSVT
AVPVSTGNSPPPLASSSPAASASSSTISASTVGTTQSVSVPSAPTITHTLPSSPESTQTP
TALTTLTTPTSVETSLPPSAVTGTDQHPIPSLAATSTGKTTENAATGLPTDSLTTYTAGR
SPVTSSVTVTVTGPLTYGRSTVPSHVTSNMGTSHTSTTLSSMSVSGSQSDATGSVSSSPL
SALVTSLPSTNATSAATPQVTFPNSFSSSVTQSPSHITSPTSTLGTSSPDTSAPPSWPST
LPSETRSAVTTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTISLSMTDISLTPVSSDTTGILTHKIPS
SHSSGLPTMTDTALTSSSMGFMEPLTTASHTATLTVPSLSPTDSTPSKTTIGHTVTTLVF
PAHSTASALTGNTPVQSLGTSIPVTSVFSSATEGSTPETTQNEPEPSAPTLLHTLYTTAV
STPPPTITDTLPVSLSPEGSAPTAVSGAGWPSSPSTAATSSGEATLTPHTDLTTESPQTQ
RPSAPPTTSSVTPTDTLASGSPIPSSPGTSSALTSTTNGVLPSVSDSSTKLVTAGPTLST
TISALETTLPVTQATSVATPEVTSPNSVSSSVTHSPSHNISPTSTLGTRSPDTSATPSWP
STLPSETSTTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTVSLSTTDISLTPATIETMRTLTSTIPST
HSSGLPTMTDTALTSSSMGFTEPLTSVSHTATLTVPSLSPTDSTPSNPTSGHTVTTLVYT
AHTTSSVTAVPVSTGNSPPPLASSSPAASASSSTISASTVGTTQSVSVPSAPTITHTLPS
SPESTRTPTALTTLTTPTSVETSLPPSAVTGTDQHPIPSLAATSTGKTTENAATGLPTDS
LTTYTAGRSPVTSSVTVTVTGPLTYGRSTVPSHVTSNMGTSHTSTTLSSMSVSGSQSDAT
GSVSSSPLSALVTSLPSTNATSAATPQVTFPNSFSSSVTHSPSHTTSPTSTLGTSSPDTS
APPSWPSTLPSETRSDVTTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTISLSTTDISLPPVSSDTTG
TLTHKIPSSHSSGLPTMTDTALTSSSMGFTEPLTTVSHTASLTVPTLSPTDSTPSNPTSG
DTVTTLVYTAHTTSSVTGLPVSTGNSPPPLVLSSPAASASSSTISASTVGTTQSVSVPSA
PTITHTLPSSPESTQTPTALTTLTTPTSVETSLPPSAVTGTDQHPIPSLAATSTGKTTEN
AATGLPTDSLTTYTAGRSPVTSSVTVTVTGPLTYGRSTVPSHVTSNMGTSHTSTTLSSMS
VSGSQSDATGSVSSSPLSALVTSLPSTNATSAATPQVTFPNSFSSSVTQSPSHITSPTST
LGTSSPDTSAPPSWPSTLPSETSTTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTVSLSTTDISLPPA
TTETMRTLTSTIPSSHSSGLPTMTDTALTSSSMGFTEPLTTASHTATLTVPSLSPTYSTP
SNPTSGHTVTTLVYTAHTTSSVTAVPVSTGNSPPPLASSSPAASASSSTISASTVGTTQS
VSVPSAPTITHTLPSSPESTQTPTALTTLTTPTSVETSLPPSAVTGTDQHPIPSLAATST
GKTTENAATGLPTDSLTTYTAGRSPVTSSVTVTVTGPLTYGRSTVPSHVTSNMGTSHTST
TLSSMSVSGSQSDATGSVSSSPLSALVTSLPSTNATSAATPQVTSPNSVSSSVTHSPSHI
TSPTSTLGTSSPDTSAPPSWPSTLPSETRSAVTTQMTTMATTPSWPSLTSLNSYPTISLS
TTDISLPPVSSDTTGTLTHKIPSSHSSGLPTMTDTALTSSSMGFTEPLTTVSHTASLTVP
TLSPTDSTPSNPTSGDTVTTLVYTAHTTSSVTGLPVSTGNSPPPLALSSPAASASSSTIS
ASTVGTTQSVSVPSAPTITHTLPSSPESTQTPTALTTLTTPTSVETSLPPSTVVTSFATL
ISSTPTVIMSASQSFPATRPVLSTTARSLSPFPLSSSTEAITSSLATSFPPSSTTRTSPT
TSLLSTAQTQSTPFSYISLPSTTPCPETITITIVPSSPSTPCVDINPSTGVTSAPITPFS
IIPSSTKMVTSSSYTSERPFLPTHLDTPTMTPETEPPDTVTDAPSSTDTRAIVTDTVSTS
ASTWDNQLSATSVTTPNMLDSISVPSSLKPSNSVPTTATSSKVIYPVRSTIKTPETSVST
TKPPTTLTSRSTSTSTPTTTPASLTTTPGVCDNGGTWEKDRCICLPGFSGDHCQDLDNRC
QNGGSWNGIRCVCPSTFQGSFCELPVEQLEIGEWPEPRAPVSSLEKPCALCSPLSHPLLT
SLPCPLLLHIHTPFTLNLRQASPTFFEL
NT seq
8187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagacacagctctcacctcctcatccatgggcttcacggagcccttgaccacagcg
tcacacactgccaccctcacagttcccaccctctctcctactgactccaccccatctaag
accaccattgggcacactgtaaccactcttgtctacacagcccacagcactgcctctgct
ctgacgggaaacactcctgttcagtccctgggcacgagtattccagtcactcctgtgttc
tcctcagccacggagggcagcactcctgggactgcacagaacgaacatgagcattcagct
ccaacacttctgcacacattgtacacaactgctgtctccaccccaccacccacgatcaca
gacacactcccagtctccttgtctccagaagggagtgctcctacagcagtgagtggagca
ggatggccttcctcccctagcacagctgctacatccagtggggaagccacactgacgcct
catacagaccttacaacagaatctccccagacacaaagaccctcagctccaccaaccact
tcttcagtcacacccactgatactctggcttctggctcacctatcccttcttctccaggg
accagcagtgctctgacttccacaacaaatggggttctgccctctgtgtctgactcaagc
acaaaactagtcacagctggtcccacactcagcacgacgatatctgccttggagaccaca
ctcccagttacacaagcgacatctgcagctacacctgaggtgacctcccccaactctgtc
agtagctctgttacccattccccatcccacaacatttctcccacctccaccttaggtaca
agatccccagacacctctgccacaccgtcatggccctccacactcccttcagaaacaagc
accacacagatgaccaccatggccaccactcccagctggcccagcctcacctccttaaac
agctaccccactgtcagcttgtccacgactgacatctctttaactcctgccactatagag
accatgaggactctcacatccaccattccatcaacacatagctcaggcctgcccaccatg
acagacacagctctcacctcctcatccatgggcttcacggagcccttgacctcagtgtca
cacactgcaaccctcacagttcccagcctgtctcctactgactccaccccatctaatccc
accagcgggcacaccgtaaccactcttgtctacacagcccacaccacgagcagtgtgaca
gctgtccccgtcagtactggaaactctccacctccccttgcctcgagctcccctgctgca
tctgcctcctcctcaaccatctctgccagtacagtagggaccacacagagtgtcagtgtc
ccctcagctccaaccatcacccatacactgccctcctcacctgagtccacccagacgccc
acagccctcacaacactcacaactcccacctctgtagagacttcccttcctccctcggct
gtgactgggacagatcaacaccctatccccagcctcgctgccacttccactgggaaaacc
acagagaatgctgccacaggccttcctacagactcactcacgacgtacacagccgggcgt
tccccagtcacatcctcggtcactgtcactgtcacaggcccactcacctatggcagatcc
acagtgccttcccatgtcacctccaatatggggacctcacacacgagtacaacactgtcc
tctatgtctgtctctggttcacagtcagatgccactggcagtgtgtccagctccccattg
tctgccttggtgacctcactcccaagcactaatgccacatctgcagctacacctcaggtc
acctttcccaactcttttagtagctctgttacccaatcaccttcccacatcacttcaccc
acctccaccttaggtacaagttccccagacacctctgccccaccctcatggccctccacg
ctcccttcagaaacaaggagtgctgtcaccacacagatgaccaccatggccaccactccc
agctggcccagcctcacctccttaaacagctaccccaccatcagcttgtccatgactgac
atctctttaactcctgtcagttcagacaccacagggatcctcacacacaaaattccatct
tcacatagctcaggcctgcccaccatgacagacacagctctcacctcctcatccatgggc
ttcatggagcccttgaccacagcgtcacacactgccaccctcacagttcccagcctgtct
cctactgactccaccccatctaagaccaccattgggcacactgtaaccactcttgtcttc
ccagcccacagcactgcctctgctctgacgggaaacactcctgttcagtccctgggcacg
agtattccggtcacttctgtgttctcctcagccacggagggcagcactcctgaaactaca
cagaacgaacctgagccttcagctccaacacttctgcacacattgtacacaactgctgtc
tccaccccaccacccacgatcacagacacactcccagtctccttgtctccagaagggagt
gctcctacagcagtgagtggagcaggatggccttcctcccctagcacagctgctacatcc
agtggggaagccacactgacgcctcatacagaccttacaacagaatctccccagacacaa
agaccctcagctccaccaaccacttcttcagtcacacccactgatactctggcttctggc
tcacctatcccttcttctccagggaccagcagtgctctgacttccacaacaaatggggtt
ctgccctctgtgtctgactcaagcacaaaactagtcacagctggtcccacactcagcacg
acgatatctgccttggagaccacactcccagttacacaagcgacatctgtagctacacct
gaggtgacctcccccaactctgtcagtagctctgttacccattccccatcccacaacatt
tctcccacctccaccttaggtacaagatccccagacacctctgccacaccgtcatggccc
tccacactcccttcagaaacaagcaccacacagatgaccaccatggccaccactcccagc
tggcccagcctcacctccttaaacagctaccccactgtcagcttgtccacgactgacatc
tctttaactcctgccactatagagaccatgaggactctcacatccaccattccatcaaca
catagctcaggcctgcccaccatgacagacacagctctcacctcctcatccatgggcttc
acggagcccttgacctcagtgtcacacactgcaaccctcacagttcccagcctgtctcct
actgactccaccccatctaatcccaccagcgggcacaccgtaaccactcttgtctacaca
gcccacaccacgagcagtgtgacagctgtccccgtcagtactggaaactctccacctccc
cttgcctcgagctcccctgctgcatctgcctcctcctcaaccatctctgccagtacagta
gggaccacacagagtgtcagtgtcccctcagctccaaccatcacccatacactgccctcc
tcacctgagtccacccggacacccacagccctcacaacactcacaactcccacctctgta
gagacttcccttcctccctcggctgtgactgggacagatcaacaccctatcccaagcctc
gctgccacttccactgggaaaaccacagagaatgctgccacaggccttcctacagactca
ctcacgacgtacacagccgggcgttccccagtcacatcctcggtcactgtcactgtcaca
ggcccactcacctatggcagatccacagtgccttcccatgtcacctccaatatggggacc
tcacacacgagtacaacactgtcctctatgtctgtctctggttcacagtcagatgccact
ggcagtgtgtccagctccccattgtctgccttggtgacctcactcccaagcactaatgcc
acatctgcagctacacctcaggtcacctttcccaactcttttagtagctctgttacccat
tccccatcccacaccacttctcccacctccaccttaggtacaagttccccagacacctct
gccccaccctcatggccctccacgctcccttcagaaacaaggagtgatgtcaccacacag
atgaccaccatggccaccactcccagctggcccagcctcacctccttaaacagctacccc
accatcagcttgtccacgactgacatctctttacctcctgtcagttcagacaccacaggg
accctcacacacaaaattccatcttcacatagctcaggcctgcccaccatgacagacaca
gctctcacctcctcatccatgggcttcacggagcccttgaccacagtgtcacacactgca
tccctcacagttcccaccctctctcctactgactccaccccttctaatcccaccagcggg
gacactgtaaccactcttgtctacacagcccacaccacgagcagtgtgacaggtctcccc
gtcagtactggaaactctccacctccccttgtcttgagctcccctgctgcatctgcctcc
tcctcaaccatctctgccagtacagtagggaccacacagagtgtcagtgtcccctcagct
ccaaccatcacccatacactgccctcctcacctgagtccacccagacgcccacagccctc
acaacactcacaactcccacctctgtagagacttcccttcctccctcggctgtgactggg
acagatcaacaccctatccccagcctcgctgccacttccactgggaaaaccacagagaat
gctgccacaggccttcctacagactcactcacgacgtacacagccgggcgttccccagtc
acatcctcggtcactgtcactgtcacaggcccactcacctatggcagatccacagtgcct
tcccatgtcacctccaatatggggacctcacacacgagtacaacactgtcctctatgtct
gtctctggttcacagtcagatgccactggcagtgtgtccagctccccattgtctgccttg
gtgacctcactcccaagcactaatgccacatctgcagctacacctcaggtcacctttccc
aactcttttagtagctctgttacacaatcaccttcccacatcacttcacccacctccacc
ttaggtacaagttccccagacacctctgccccaccctcatggccctccacgctcccttca
gaaacaagcaccacacagatgaccaccatggccaccactcccagctggcccagcctcacc
tccttaaacagctaccccactgtcagcttgtccacgactgacatctctttacctcctgcc
actacagagaccatgaggactctcacatccaccattccatcttcacatagctcaggcctg
cccaccatgacagacacagctctcacctcctcatccatgggcttcacggagcccttgacc
acagcgtcacacactgccaccctcacagttcccagcctgtctcctacttactccacccca
tctaatcccaccagcgggcacaccgtaaccactcttgtctacacagcccacaccacgagc
agtgtgacagctgtccccgtcagtactggaaactctccacctccccttgcctcgagctcc
cctgctgcatctgcctcctcctcaaccatctctgccagtacagtagggaccacacagagt
gtcagtgtcccctcagctccaaccatcacccatacactgccctcctcacctgagtccacc
cagacgcccacagccctcacaacactcacaactcccacctctgtagagacttcccttcct
ccctcggctgtgactgggacagatcaacaccctatccccagcctcgctgccacttccact
gggaaaaccacagagaatgctgccacaggccttcctacagactcactcacgacgtacaca
gccgggcgttccccagtcacatcctcggtcactgtcactgtcacaggcccactcacctat
ggcagatccacagtgccttcccatgtcacctccaatatggggacctcacacacgagtaca
acactgtcctctatgtctgtctctggttcacagtcagatgccactggcagtgtgtccagc
tccccattgtctgccttggtgacctcactcccaagcactaatgccacatctgcagctaca
cctcaggttacctctcccaactctgttagtagctctgttacccattccccatcccacatc
acttcacccacctccaccttaggtacaagttccccagacacctctgccccaccctcatgg
ccctccacgctcccttcagaaacaaggagtgctgtcaccacacagatgaccaccatggcc
accactcccagctggcccagcctcacctccttaaacagctaccccaccatcagcttgtcc
acgactgacatctctttacctcctgtcagttcagacaccacagggaccctcacacacaaa
attccatcttcacatagctcaggcctgcccaccatgacagacacagctctcacctcctca
tccatgggcttcacggagcccttgaccacagtgtcacacactgcatccctcacagttccc
accctctctcctactgactccaccccttctaatcccaccagcggggacactgtaaccact
cttgtctacacagcccacaccacgagcagtgtgacaggtctccccgtcagtactggaaac
tctccacctccccttgccttgagctcccctgctgcatctgcctcctcctcaaccatctct
gccagtacagtagggaccacacagagtgtcagtgtcccctcagctccaaccatcacccat
acactgccctcctcacctgagtccacccagacgcccacagccctcacaacactcacaact
cccacctctgtagagacttcccttcctccgtcgacagtggtaacctcttttgctaccttg
atctcttctacacccacagtgataatgtctgcctcccagtcttttccggctactagacca
gtgctaagtactactgctaggtctctttctcccttcccccttagctccagtacagaagct
ataacctcctctctagcgacatcctttcctccttcttcaaccaccagaacatctccaacc
acctccctgctctccacagctcagacccaatcaacccctttctcttatatctctctccct
tctactacaccctgtccagaaaccatcaccatcaccatagtccccagctctccctcgact
ccgtgtgttgacatcaatcctagtaccggggtgacatctgctcccatcaccccgttctca
atcattccctcttccaccaaaatggttacctcctccagttataccagtgaaagaccattc
ctccccacgcatttggatacccctactatgacaccagaaacagagcccccagacaccgtc
acggatgctcctagctcgacggacacgagggcaatagttacagacacagttagcacctca
gcatccacctgggacaaccagttgagtgccacctctgtcaccaccccaaatatgctcgac
tccatcagcgtcccctcaagcctgaaaccaagcaacagtgttccaacgaccgcaacgtca
agcaaggtgatctaccctgttcggtcgaccataaagacgccagagacatcggtgtccacc
acgaagccccctaccactcttacatcgagatcaacctcaacctctactccgacgactaca
ccggcgagcttgaccacgaccccaggcgtttgtgacaatggtggcacttgggagaaggac
cggtgcatttgccttcctggcttctctggagaccactgtcaagatctggataacagatgc
cagaatgggggttcatggaatggcatcaggtgtgtctgccccagcaccttccagggctct
ttctgtgagctgccagtggagcagttagaaataggtgagtggccagagccacgagctccg
gtctcctccttagagaagccctgtgcgctctgctcccctctctctcatccactcctgact
tctctcccatgccctctgctactccacatacacacgcccttcaccctaaacctccggcag
gcttcccctaccttctttgagctctga
DBGET
integrated database retrieval system