Romboutsia sp. CE17: HF520_00905
Help
Entry
HF520_00905 CDS
T06535
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
roc
Romboutsia sp. CE17
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
roc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
roc02000
]
HF520_00905
Transporters [BR:
roc02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
HF520_00905
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJA07588
LinkDB
All DBs
Position
complement(195596..196990)
Genome browser
AA seq
464 aa
AA seq
DB search
MSKALNFTEGKVFSPLIKFIVPILLALFLQSMYGAVDLLVVGQFGNAADVSAVSTGSQVM
TTITVVITGLTMGVTILIGQKLGEGQPKEAGYAVGSGLCIFAILAIIITVFGISLAGPIS
KFMHAPAEAFDKTVDYVRICSGGAIFIVGYNIIGGIFRGLGDSKTPLITVTIACISNIIG
DLIFVAVFNMGVAGVAYATVIAQAISVVLSLFIIKRRGLPFEFSPKTSIKFHKGITSKIL
KYGTPIALQDGLVHLSFLVIMIIGNSMGVVASAGIGVAEKLVGFIMLIPMAFSQGSSAFV
AQNYGAKKYERAKKVLLYSISSSLFCGAIMFYITFFHGYILAGIFSTDTEVILASWDYLK
AYAIDCLFTAIMFSMVGFFNGCGKTTFVMIQGIVGAFLVRIPVSYMMSKIVPVSLFNVGL
ATPISTFVQVILCGIYFIFISKQLSNTKVEDVVIDNIACIDSVK
NT seq
1395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaagcattaaactttacagagggaaaagttttctctccattaatcaaatttatc
gtaccaatattacttgcattatttttacaatctatgtatggtgcagtggatttacttgta
gtaggtcagtttggtaatgcggctgatgtgtctgcagtatctactggaagccaggttatg
acaactataacggttgttataacaggacttacaatgggtgttacaatattaattggtcaa
aagcttggtgaagggcaaccaaaggaagcgggatatgctgtgggaagtggactttgtata
ttcgctattttagctataataattactgtatttggtataagtcttgcaggtcctatttca
aaattcatgcatgctccagcagaagcctttgataaaacagtagactatgtgagaatatgc
tctggtggagctatttttatagttggttataatataattggtggaatttttagaggactt
ggtgattcaaaaactccacttattacagttactatagcttgtatatcaaatattatagga
gatttaatatttgttgctgtatttaatatgggagttgcaggtgttgcctatgctactgta
attgctcaggctatcagcgttgttttatctttatttataataaaaagacgtggacttcca
tttgaattttctccaaaaactagtataaagttccataaaggaattacttcaaaaatatta
aaatacggaacacctattgcactacaagatggtctagttcatctatcattcttagtaatc
atgataataggaaactctatgggtgttgttgcatcagcaggtatcggtgttgcagaaaag
ctggttggatttattatgcttatacctatggcattttcacaaggttcatcagcattcgtt
gctcaaaactatggcgctaaaaaatatgaaagagctaagaaagttcttctatattctatt
tcatcatcattattctgtggtgctataatgttttatattactttcttccatggatatata
ttggctggaatattctcaacagacacagaagtaatcttagcatcttgggactatctgaaa
gcttatgctattgactgtttatttacagctattatgttctctatggttggtttcttcaat
ggttgtggaaagacgacttttgttatgattcaaggtatagtaggagcatttttagtaaga
atacctgtatcttatatgatgagtaaaatagttcctgtttcattatttaatgtaggtctt
gctactccaatatctacatttgtgcaggttatactttgtggtatttactttatattcatt
tctaagcagctatctaatacaaaggttgaagatgttgtaattgataatatagcttgtata
gatagcgttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
