Romboutsia sp. CE17: HF520_04805
Help
Entry
HF520_04805 CDS
T06535
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
roc
Romboutsia sp. CE17
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
AAA_11
SWI2_SNF2
ARPP-1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJA08307
UniProt:
A0A6H1WYL1
LinkDB
All DBs
Position
1007929..1011096
Genome browser
AA seq
1055 aa
AA seq
DB search
MDFKIVNNILLDNTEKSRLSRGKIYYEDGYVEEVRYSNEGKVLTIDGHVASEFQNRIYNS
SIVIDLENKRVITGMCDCQDCMSRSTTEHLSICKHIVAITLYVINLLKSDVISSLKQTTF
TVKNKSKIKRDKNYINKDLLNYFKSNPKEQINLYIKLEFIGANSISADFKIGIDKMYVLK
NLRDFAYARLNSNDLVYGVDFIYNPLNNYFCEDDEKVVDMIEEYGMGLSYIAPQRELRYM
TVKGPNIRRLMESLQYRNFEFKFGKLYYNPKIIKGELPISVNLELDDNEVILKSNGQLPT
PISQKGDVVFYKGDIYLLSGENGIYYNKIYKILDEFKEISFNRDEVSEVLTNIIPKLENI
CSEVILDEQIKKNISNNLIVKYYFDLEDSKVTCKVEFEYEGQEEGKFIIKDIDKEQQAIY
RLYTNYFEEDKNRYVFKGNDVQLYDFLSNEINRLKNIGEVYYSDKLKEKKIYNSTNIRIG
LGEEVNHYLDFNFEIEGVDENEYKKIIDAFKVNKRFYKLGNGSFINLEEEKTKEVFKLME
SLGFTSSMKEMKIHSSKALFINDLFTEEKLPYISGIENTKEIVERFKYISSLKIDIPNNL
NATLRDYQVDALNWFETLDYCGFGGILADEMGLGKTIQTITFLLKKENKKTLIITPTSLI
HNWKNEFEKFAPSIKVGIAHGLKKERDMVIKNIKEFDIILTTYGSIRNDLEKYEEINFDY
CIIDEAQNIKNPTALSTDAVKAIKSKNKFALTGTPIENNLLELWSIFDFIMPGYLYNLTK
FNAVFIRDESHIEHLKRMIKPFILRRTKKQVIKELPDKIERQFLIELSKEQRKIYGVYVE
DIQKKLKEKKAIKDKITVFAYLTKLRQLCLDPSIIVDDYKGKSAKIEACLEIIKEYGEEN
NKILVFSQFTSVLKNIGKKLSRNKIEYYYLDGQTKAIDRIKLVDEFNEGNEKKVFLISLK
TGGTGLNLTSANTVIHFDPWWNPSVEDQASDRAHRYGQKNVVEVIKLIAKGTIEEKIVKL
QESKKELIDDIINGNLSDGGVLKSLTDEEILNLFK
NT seq
3168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactttaaaatagtaaataatatactactagataatacagagaaaagtagattaagt
agagggaaaatatattatgaagatggatatgtagaagaagttagatacagcaatgaaggc
aaagtactaacaatagatggacatgtagcttcagaatttcaaaatcgtatatataatagt
tctatagttatagatttagaaaataaaagagtaataacaggaatgtgtgactgtcaagat
tgcatgtctagaagtacgactgagcatttatctatatgtaaacatatagtagcaataaca
ttatatgtaataaatttattaaaatcagatgtaataagtagtttaaaacaaactacattt
acagttaaaaacaaaagcaaaataaagagagataaaaactatataaataaagatttattg
aattatttcaaaagtaaccctaaggagcaaattaatttatatataaaactagagtttata
ggtgcaaatagtataagtgcggactttaaaataggtattgataaaatgtatgttttaaag
aatttaagagattttgcatatgcaagattaaattcaaatgatttagtatacggagtagac
tttatatataatcctttaaataactatttttgcgaggatgatgaaaaagtggtagacatg
attgaagagtatggaatgggactatcatatatagcacctcaaagagaacttagatatatg
acagtaaaaggacctaatataagaagattaatggaatcattacagtatagaaattttgaa
tttaaatttggaaaattgtattataatcccaaaattataaaaggagaattacctataagc
gtaaatttagaactagatgataatgaagtaatacttaaaagtaatggtcaattaccaact
ccaatatctcaaaaaggagatgtagtgttttataaaggtgatatatatttattaagtgga
gaaaatggaatttattacaataaaatatacaaaatactagatgaatttaaagaaatttca
tttaatagagacgaagtaagcgaagttttaactaatattataccaaaacttgaaaatatt
tgcagtgaagtaatattagatgaacagattaaaaaaaatattagcaataacctaattgta
aagtattactttgatctagaagatagcaaagtaacttgtaaggtagaatttgaatatgaa
gggcaagaggaagggaaatttataattaaagatatagataaagaacaacaagctatatat
agactttatacaaattattttgaggaagataaaaatagatatgtatttaaagggaatgat
gtgcagttgtatgactttctgagcaatgaaataaacagattaaaaaatataggggaagtt
tattactcagataagttaaaagaaaaaaagatttataattcaacaaatataaggattggc
ttaggagaagaagttaatcattacttagattttaattttgaaatagaaggtgtagatgaa
aatgaatataaaaaaataatagatgcatttaaagttaataaaagattttataagctaggg
aatggaagttttataaatttagaagaagaaaaaacaaaagaagtatttaaattaatggaa
agtttaggctttactagtagtatgaaagaaatgaaaatacatagtagtaaagctttattt
ataaacgatctttttacagaggagaaattaccgtatataagtggaattgaaaatacaaaa
gaaatagttgaaaggtttaaatatataagtagcttaaaaatagatataccaaataactta
aatgcaacattaagagattatcaagtagatgcattaaattggtttgaaaccctagattat
tgtggatttggaggtatacttgctgatgaaatgggtcttggaaaaacaatacaaactata
acctttttattaaaaaaagaaaataagaaaacattaattataacacctacatctcttata
cataattggaaaaacgagtttgaaaaatttgcaccaagcattaaagttgggattgcgcat
ggattaaaaaaagaaagagatatggtaataaagaatataaaagaatttgatataatctta
actacatatggatctattagaaatgatttagaaaaatatgaagaaataaattttgattat
tgtatcatagatgaggcacaaaatataaaaaatcccacagcattaagtacagatgcagtg
aaagctataaaatctaagaataagtttgctcttacaggaacaccaatagaaaataattta
ttagaactttggtcaatttttgattttattatgccaggttatttatataatttaactaaa
tttaatgcagtttttataagagatgaaagccatatcgaacacttaaaaagaatgattaaa
ccatttatacttagaaggactaaaaaacaagttataaaagaattaccggataaaatagaa
agacaattcttgattgaattaagcaaagaacaaagaaaaatttatggtgtttatgtagaa
gatatacaaaaaaaactcaaagaaaaaaaagctataaaagataaaataactgtatttgca
tatttaactaaactaagacaactttgcttggacccaagtataatagtggatgattacaaa
ggaaaaagtgcaaaaattgaagcttgtttagaaataataaaagaatatggtgaagaaaat
aataaaatattagtattttcacaatttacaagtgtattaaagaatataggtaaaaaactt
tcaagaaataagatagaatactattatttagatggtcagactaaagctattgatagaata
aaattagtagatgaatttaatgaaggaaatgagaaaaaagtgtttttaatttccttaaag
actggaggtacaggcttaaacttaacgtctgctaacactgttatacactttgatccatgg
tggaatccttcagtagaagatcaagctagtgatagagctcatagatatggtcaaaaaaac
gtggttgaagttataaagcttatagcaaaagggaccatagaagagaaaatagttaaacta
caagaaagtaaaaaagaattaattgatgatattataaatggtaatttatctgatggtggt
gtattgaagagtttaactgatgaagaaatattaaatctatttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system