Roseburia sp. 499: BIV20_13910
Help
Entry
BIV20_13910 CDS
T11719
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain-containing protein
Organism
roq Roseburia sp. 499
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_9
LRR_EndoS
LRR_LRWD1
LRR_14
Choline_bind_3
Choline_bind_1
DUF6892
LRR_5
LRR_NXF1-5
Choline_bind_2
EF-hand_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVK69438
LinkDB
All DBs
Position
complement(2833954..2835741)
Genome browser
AA seq
595 aa
AA seq
DB search
MKKRSVFAMVTAIAVAGMTFSQSFPSLAAEETTSEKETTYIENDETGIPDKVLYDKLLSQ
SDKNGDGRLSVAEAEAQMWVMTGIAPEWEWGGERPEEKRIKSLKGIEYFKNLNMISLIDH
SITDITPLSGLTNLTSLCLYHNKITDITPLSGLTNLASLSLGRNEITDITVLSGMTNLTS
LSLDSNNIEDITAIEGLTILTSLELGKNRITDITALSGLTNITALELEENEITDITPLSG
MKNLKHLYLDSNKITDISPVKGATNLETLSLSDNAQIDIAQLKDFMSVKYLYLNNNRITD
ITPLSGLTNLELLGLENNEITDITPVKGLSILRVLQVANNNLTSLPDLTGLPLSVRLGKI
PIFTSFSGNKITVTEARTKLPSSLLNDEDEGEEWFNNQGFLADSGAGRVVPYYSLTSNGG
TWNGNQYTMADGTVATDAFFFDGSNTYYLQADGSPMRDTLTYHPDGEHIIYLDSNGHEVF
NSFQYCPSVGYTCYFDSNGYLYKDQITFVGDKTYYLNLNGKLENEGWFQFGNGMDYGYAN
WDGTLNTCGFSYDPWGRVVFYHWNGMVARGLITDGQWYYLMDETDGHYVGSFPVN
NT seq
1788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagagaagtgttttcgcaatggtaacagcgattgctgtagctggaatgacattt
agccagtcgtttccgagcttagcagcagaagaaactacaagcgaaaaagaaacgacttat
attgaaaacgatgagacagggataccggataaggtgttgtatgataaattgttgagtcag
tctgacaaaaacggtgatgggcgtctgagtgtggcagaagcagaggcacaaatgtgggtg
atgactggaatagctcctgaatgggaatggggaggagaaagacctgaagagaaacgtatt
aaaagtttaaagggaattgagtattttaagaatcttaatatgatttcgctgattgaccat
tcaataacagatattacaccattaagcgggttgacaaatctaacaagtttatgtttgtat
cataataaaataacagatattacaccattaagtgggttaacgaatttagcatctttaagt
ttgggaagaaatgaaataacagatattacagtgctaagcggaatgacgaatttgacatct
ttaagcttggatagtaataatatcgaagacattacagcaatagaagggttaacgatttta
acctctttggaattaggaaaaaatagaataacagatattacagcactaagtggattaaca
aatataactgctttagaattagaagaaaatgaaataacagatattacaccgttaagtggg
atgaaaaatttaaagcatttatacttagatagcaataaaataacggatatttctccggtg
aaaggtgctacaaacttagaaacattatccttaagtgataacgcacaaatagatattgca
caattaaaggatttcatgagtgtaaaatatttatatttgaataataatagaataacagat
attacaccactaagtggattaacaaatctagaactcttagggttagaaaataatgaaata
acagatattacaccagtgaaaggactttctatattaagggtgttacaggtggcaaataac
aatcttacatccttaccggatttgactggattgccacttagcgtgcggttgggcaaaatc
cctatatttaccagtttttccggaaataagattacagttactgaagcaaggacgaaactt
ccgtcttcacttttgaatgatgaagatgagggggaagagtggtttaataatcaaggattt
ttagcagattccggtgcaggtcgtgttgtaccatattatagccttacatcaaatggtggt
acatggaatggaaatcaatatacaatggcagatggaacggtagcaacagacgcatttttc
tttgatggttctaatacttattatttacaagcagatggaagcccaatgcgcgataccctt
acctatcatccggacggagaacacattatttatctggactctaacggacatgaggtattc
aattcattccaatactgtccgagcgtaggatatacttgctattttgattctaacgggtat
ctctataaagaccagattacctttgtgggagacaagacctattatttgaatctgaatgga
aaactagagaatgaaggatggttccaatttggtaatggtatggattatggatatgccaac
tgggatggaactttaaatacctgtggattttcctatgacccatggggaagagtggtattc
tatcattggaatggaatggtagcacgtggacttatcacagacggtcagtggtattatctt
atggatgagacagatggtcattatgtgggtagttttccggtgaactaa
DBGET
integrated database retrieval system