Ruminiclostridium papyrosolvens: P0092_17820
Help
Entry
P0092_17820 CDS
T08965
Name
(GenBank) DUF5011 domain-containing protein
Organism
rpay
Ruminiclostridium papyrosolvens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Bact_surface_Ig-like
Big_13
Big_3_2
DUF4625
MVL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WES33606
LinkDB
All DBs
Position
complement(4020971..4026451)
Genome browser
AA seq
1826 aa
AA seq
DB search
MKKVKKIISIIVVMAMFISIVQINSVQKVQAYTQNQNALLNTTPTSASNWNLSGMYFKDN
YFQGFGSATQSVYLTENDKTRANLGQLIVSGSHQMYSYLWAWGTNERWGKLGIAFYNSSN
GLLSLKETEEDSKSSGWMTFTIPDTTIPAGTARIDYIVSIRGKGAHSETRNFNMVIKDST
APFFSVLAPVSGQGTYKAGDKVYFDIKFSEPVNVTNGGYLEMNPTGTALYSSQPAPDTLR
YIYTIPSSGMPLSDSNVVSPKKIVNTSVSDDSGNSLSLNGKTDGVSVNGFFMDNRPPETA
IGSMTVEGASQNSVLNEGKVLKFNVQFHENVYSDGTSYIQLSNGKKAMANVINSGNTSTK
TVVFSYTVARGDDIGNVAVTGVDFNGIKDYVGQSATLYTGYSQSMFNSKLDGYNMKIDTN
PPAVTFSGVPDSWQNASLNVKVTATDNIVPEVAGSGVKELYSKWTATSSGQPAFGSVPDI
GSDGKVLVPCTSGIYSLWIKAVDNSGNQSVTKSGFTYKIDTDNPGITVTPSYAGGTGFIA
GMKAAITDITSGIFSKKFSWKDSSNLEVLSGDVQDNGVIPYPDIDGVFSMLVTAFDYAQN
KTESQTPNLSIDATSPTVEFAPNGSEGYIRSINVNPTVADAKSGVDKWYYQWLGSSIAPD
SNSADWNVGTAVIKAPEGLTGNYYLHVKAVDKCGNTSITTSSPYLFDNTPPTIVIVPNGN
ADNIGRAVYEIGINYSDNISIKSEITTVYAFSSLETAETLNFKPYPEEGLTLSNFKQTTY
LYVKATDKLGNVSVLKSAPFVADTAAPTGIITRTSSGEINVATASFAFDASDNHSTRGKI
EMQIAVDGTEEEWEPFIDSKAVTIPATNGTHTISVKYRDESGNISEAYSAEVIYDDVAPE
IKILYSPETDTNSNVVATATTDNPKDEIMGADTYTFTQNGEEVTFYAKDNAGNTSQKTAK
VTWIDKVLPVIDISTAELDNKPHKSVEVTVNATDNKQLTKLEYRFVKSGDSSGEWKEISS
GDNVILSATDGLFNIETRATDHVGNVAAKTYGPFMLDNTSPEAVITYTPSKRTANNVEAK
ISFNEKTFVTNNSASETYLFSENGEFTFEYTDEAGNTASKAAVVDWIDRSKPQSRLEITD
ESGQNKINPEQWVNYNLKVTIVPPAQCVVENLTYNGKKVEDSDEIERLDAISDVYLVKDY
GLLSYTVRDTDTQMASENENTIRIDKQLPQVSQVIRTTENWTNKDVVVTLKATDDLSSIT
YLDSDTYTFTKNGTHTFRFKDSAGNMDEYTVEVSNIDKDVPIAEVNYYLPDGSKWDGEWT
NQSVKAVVTLESLSPAHTNGEDSYTFNGNGLYNFTFYDEAGNTGSITAAVDKIDKIAPTG
FLTYNSQTWTNKDVVVTLHASDNMSGTEDMTYTYTENGSYTFVLYDKAGNSTLFSSGVSR
IDKTPPVVSLTYTPPVKTPFNVFVRAEADEAVTWFNNINSYKFISNGSYEFVATDRAGNI
TRQTAKVDYINNSLPEVELEYSAKEMTNENVYVTIKTKDPQENIYMLNNKGSSVHQFTQN
GEFTFQYTNSAGTKGEVTAQVSNIDKTIPEIAVSYSTTEVTNQPVTVTFIANKQVVWPNG
MNVNKDGSASLVFDENRSISVKIPDLLGNIATVEVYVLNIDSQAPVITSDNMYVALEKGK
VFDPMLGVSATDNKDKTVKIKVEGKVNTNTPGDYELVYSSTDSAGNEAQYIRYVTVYDPT
KFNVAVNGKMPLAGAVTLGSKKMEITAINSAEIVNVQILPGKKLMGDFKSINEFVGLTYN
FSERGWYSVYITDVECNNILVYVFAE
NT seq
5481 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaggttaaaaaaattatttcaataatcgttgttatggcaatgtttatttccatt
gtgcaaattaattctgtacagaaagtacaggcatatacgcaaaatcaaaatgcactattg
aataccacccccacaagcgccagcaattggaacctgtcgggaatgtattttaaagataac
tactttcagggttttggatcagcaacgcaaagtgtatatttgactgaaaatgataaaaca
agagctaaccttggtcaattgatagtaagcggaagccatcagatgtattcatatctttgg
gcatggggaacaaatgagcgttggggaaagctgggaatagcattttacaattcctctaac
ggccttttgtcattgaaagaaacagaggaagacagcaaaagctccggttggatgactttt
acaattcctgatacaactatacctgccggaactgcaagaattgactacatagtttccata
agaggaaagggtgcacattctgaaacaagaaatttcaatatggttattaaagacagtacc
gctccttttttctcggtattagcacctgtttcgggtcagggtacctataaagcaggtgat
aaggtttactttgacataaagttttcagagcctgttaatgtaacaaatggaggttatctg
gaaatgaatcctacgggaactgctttatatagcagtcagcctgctcctgatactttgcgg
tatatatatactattccttcgagtggaatgcccctcagtgattcaaacgtagtgagtcca
aaaaaaatagtaaatacatctgtttcagatgacagcggaaattccctttcgctaaatggt
aaaactgatggtgtttcagtaaacggcttctttatggataatcgccctcctgaaacagca
atagggtcaatgaccgtggagggtgccagtcaaaactctgtactcaatgaaggtaaggtt
ttgaaatttaatgtgcaattccatgagaatgtgtattcggacggtacttcatatatacag
ctttcaaacggtaaaaaagcaatggcaaatgttataaacagcggcaatacaagtaccaaa
acagtagttttttcatataccgtggcaaggggcgatgatatcggtaatgtggctgttaca
ggtgtagactttaacggtatcaaagattatgtgggacaaagtgcaactctatataccggc
tacagtcaaagcatgtttaacagtaaattagacggatacaatatgaaaattgatactaat
cctccggctgtcactttttcaggtgtaccggacagttggcagaatgcttctttaaatgta
aaagtaactgcaaccgataatatagtacctgaagtagcaggaagcggagtaaaagaactt
tactctaaatggactgcaacctccagcggtcagcctgcttttgggagcgtaccggacatt
ggaagtgacggtaaggttttagttccgtgtacaagcggcatctatagtctttggataaag
gccgttgataattcgggaaatcaaagtgtcacaaaatcaggttttacatataaaatagat
acagataatcccggtataacggttacaccatcctatgccggcggaacagggttcattgca
ggaatgaaagcggcaattaccgatataacctcaggtattttttcaaaaaaattcagttgg
aaggattcttcaaatctggaagtgttgagtggggatgtgcaggataacggcgttatacca
tatcctgatattgacggtgttttttcaatgcttgttacagcatttgactatgcacagaac
aaaactgaatcacagactccaaatctaagtattgatgcaacctctccaaccgtagaattt
gcaccaaacggaagtgaaggatatatccgctctataaacgtaaatccaactgttgccgat
gccaagtcaggtgttgacaagtggtattatcaatggctcggttcgtcaatcgctcccgat
agcaacagtgcagactggaatgtgggaactgctgtaattaaagctcctgagggtcttacc
ggcaattactatctgcacgttaaagcagttgacaaatgcggaaatacaagtattacaacc
tccagtccatatctttttgacaatacgccgcctactattgtaattgtaccaaacggaaac
gctgataatataggaagggcagtttatgaaataggtataaactatagtgacaatatatcc
ataaagtctgaaataactacagtttatgcattttcatctctggaaacagcggagaccctt
aacttcaaaccgtatccagaggaagggcttacgctttcaaattttaagcagactacttat
ctttatgtaaaagcaacagataaactgggaaatgtatctgtattaaaatcagctccattc
gtagcggatactgcagctccaacaggaataattaccaggacaagcagtggggagataaat
gtagccacagcttcatttgcatttgatgcgtcggataatcacagtacacggggcaaaatt
gaaatgcaaatagccgttgacggtacagaggaagaatgggagccattcatcgattccaaa
gctgtaaccatacctgccaccaacggcactcatacaatatcggtgaaatatcgtgatgag
agcggaaatataagtgaggcttacagtgctgaggttatatatgatgatgtagcccctgaa
attaaaattttatacagtcctgaaacagataccaactctaatgtagttgcaaccgcaacc
accgacaatcccaaagacgaaattatgggagcagatacttatacctttactcagaatgga
gaggaagtaaccttttatgcaaaagacaatgccggaaatacttctcaaaaaactgcgaag
gtaacgtggattgataaggtcttacctgtgattgatatatcaactgccgagttggacaac
aaaccccataaatctgttgaggttactgtaaatgcaacagataacaaacagctcactaag
ttggaatacaggtttgtaaaaagcggagacagcagcggagaatggaaagaaatttcttca
ggtgataatgtaattcttagtgctacagacgggttatttaatattgaaacaagagcaaca
gaccacgtaggtaatgttgctgccaaaacatacggaccgtttatgctggacaacacgtca
ccggaagcagtcattacctatactccttcaaaaagaacggcaaacaatgttgaggccaaa
ataagttttaatgagaagacatttgtaacaaataatagtgcttcagaaacataccttttt
tctgaaaatggcgagttcacttttgaatatacagatgaagcaggaaatacggcaagtaag
gctgccgtggttgattggattgaccgctccaaacctcagtccagattggaaattactgat
gaaagcggacaaaataagataaatcccgaacaatgggtaaattacaatcttaaagtaacc
attgtaccacctgcacaatgtgtggttgagaaccttacctataacggaaaaaaggtggaa
gacagtgatgaaatagagcgcttggatgctatttccgatgtatatttggttaaagactat
gggttgctttcctacacggtcagggatactgatacacagatggcaagcgaaaatgaaaat
actatacgtatagacaagcagttacctcaggtttcacaggttataagaactactgaaaac
tggacaaataaggacgtagttgtaacattaaaagcaaccgacgatttaagcagtataacc
tatttggacagtgatacatacacctttacgaaaaacggaactcatactttccgttttaag
gacagcgcaggaaatatggatgaatatacagtggaagtttcaaacattgacaaggatgtg
ccaatagctgaggtcaattattatctgccagatggcagcaaatgggatggcgaatggaca
aatcaaagcgttaaagcagtagttacattggaaagtctgtctcctgcacatacaaacggg
gaggacagctatacctttaacggaaatggtttatataatttcaccttctatgatgaggca
ggaaatacaggaagcattacagctgccgttgacaaaattgataaaattgcacctacaggg
tttttgacatataacagtcagacctggacaaataaagatgtagttgtcactttgcacgca
tcagataatatgagcggtacggaagatatgacttatacctacacagagaatggaagctat
acttttgtgctttatgataaggccggaaattcaaccctgttctcatccggcgttagcaga
attgataagacaccccctgtagtttcacttacatatacaccgcctgtaaaaactccgttt
aacgtatttgtaagggctgaagctgacgaagccgtgacttggttcaataatattaattcc
tataagtttatttcaaacgggagttacgaatttgttgcgactgacagagccggtaatata
acaaggcaaacagcaaaggttgattatattaataactctctgcctgaggttgaacttgag
tattctgcgaaagagatgaccaatgaaaatgtatatgtaacaattaagaccaaggatcct
caagagaatatatacatgctgaacaacaaaggctcatcggtgcaccagtttactcaaaac
ggagagtttacattccagtatacaaattcagcgggtacaaagggtgaggttactgctcag
gtttcaaatattgataagactattcctgaaatagcagtaagttattcaacaactgaagtt
acaaaccaacctgttacagttacctttatagcaaacaaacaggtagtttggccaaatggt
atgaatgtaaataaagatggcagtgcgtctctggtttttgatgaaaataggagcatatcg
gtaaaaataccagatttgctgggcaatattgctacagtagaggtttatgttctgaatata
gattctcaggcacctgtgataacatctgacaacatgtatgttgctctggaaaagggtaag
gtctttgacccaatgctgggagtaagtgcaactgataataaagataaaaccgtaaagatt
aaagttgaaggaaaagtaaatacaaatactccgggtgattatgaattagtgtattcttca
acggattcagccggcaatgaagcacagtatatacgttatgttacagtatatgatcccaca
aaattcaatgttgccgttaacggtaaaatgcctttggcaggggctgtaactcttggaagt
aaaaaaatggagattacggcaattaacagtgctgaaatagtgaatgtgcagattctgccc
ggtaaaaagcttatgggtgactttaagtcgataaatgaatttgttggcttgacttacaat
ttctcagaaagaggctggtattcggtgtacataacagatgttgaatgtaacaacatcctt
gtatatgtatttgcagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
