Rickettsia philipii: RSA_02215
Help
Entry
RSA_02215 CDS
T01759
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
rph
Rickettsia philipii
Pathway
rph03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rph00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
RSA_02215
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rph03400
]
RSA_02215
DNA repair and recombination proteins [BR:
rph03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
RSA_02215
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_II
MutS_IV
AAA_29
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB26034
UniProt:
H6PT37
LinkDB
All DBs
Position
complement(401906..404566)
Genome browser
AA seq
886 aa
AA seq
DB search
MNLQELKQKYNYDVATKMMQQYLDIKFAHLDCLLLFRMGDFYEMFYEDAILASNVLGIAL
TKRGKNGEEEIAMCGVPYHALENYLTKLIEENYKVAICDQLETPEEAKNRGGYKAVVTRD
VTRIITPGTIIEENLIASAEPNYLASLVIPKNKETASLCYVDLSTSEIVVVNVPETEILN
ELARLKPREILLSENLRSSNLADSIFKQLNFRITYQVDSFFAINKCKKIILDFYKMKDIK
GIGEISSSQICAIGSVLEYLSLTQKQNIPHLPIPRIINFHSYMTIDFSTRRNLEIVTNSQ
GGSQGSLLSTLNHTVTKQGGRLLYHFLSSPLTNIAKINHRLNITEFFYSNLEIVKKIREL
LKKTSDIERCLTRITMNRSSGRDLLSIKYTLETATIIKGVFFDAYGFNLPDFIEKIIKPL
SGDAELYNLIDETIREDAPNNLNDGGIIKHEYNPKVAQLHDLINNGKLYIEKLKDQYRKE
TGIDSLKISHNNVIGLFIDITAKNVNKILDPKFIHRQTTVNHVRYTTAELQQLESELVNA
KTLVISLEKELYADICSQVIEKASYLRMLASSLSGLDVFCNFAYIADEYDYVKPEFTDDL
SFDIVKGRHPVVEQALQRESKSFVYNDCHLSELERIWLITGPNMAGKSTFLRQNAIIAII
AQIGSFVPAKSAKIGVVDKIFSRIGAADDLIKGQSTFMAEMLETSAILAQSTNNSLIILD
EVGRGTSTYDGVSIAWSVLEYIHDKLKCRCLFATHYHELTVMSNFLPALQNYTIAIEESG
KDILFLHNIISGAADRSYGLHVAALAGLPASVINRAEQILLKFEKTSTGKGKNILSTESN
NLSLFYLEPNKTTISSKLDKKFSTIDPDKLSPKEALELIYELKKLV
NT seq
2661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcttcaagagttgaaacaaaaatataattacgatgttgcaacgaaaatgatgcag
caatatctagacattaaatttgctcatttagattgtttactactatttagaatgggtgat
ttttatgaaatgttctatgaagatgcaattctagcaagcaatgtacttggcattgcttta
acaaagcgcggcaaaaacggcgaagaagaaattgcgatgtgcggggtaccttatcatgcc
cttgagaattatttaacgaagttaattgaagaaaattataaggttgctatttgtgatcaa
ctagaaacacctgaagaagcaaagaatagaggcggttataaagcggtagttactagggat
gttacacgtattataactccgggaactataattgaagaaaatttaattgcttcagccgaa
cctaattatttagcaagtctcgtaataccgaaaaataaagaaacagctagcctttgttat
gttgatctttctacttccgaaattgttgtagttaatgtaccggaaacggaaattcttaat
gagctggctcgtttaaaacctcgtgaaattctgcttagcgaaaatctgagatcttctaat
cttgcggatagtattttcaaacaattaaattttcgtattacctatcaagttgatagtttt
tttgcgattaataaatgcaaaaaaatcattttagatttttataaaatgaaagatattaaa
ggaatcggcgagatatctagtagtcaaatttgtgccataggtagcgttttagaatattta
tcgttaacgcaaaaacaaaatattcctcatttgccaatccctagaattatcaattttcat
agctatatgactattgatttctctactagacgcaaccttgaaattgtcacaaactcacaa
ggcggctcgcaaggaagtttattaagcacccttaatcatacggttactaaacaaggtgga
cgtttactatatcattttctttcaagtcctttaaccaacattgctaaaataaatcatcgt
ttaaatattaccgagttcttttattccaacttagaaatagtaaaaaaaattagagaactt
ctaaaaaaaactagtgatatagaacgctgcttaacacgtattacgatgaacagaagttca
ggtcgtgatttacttagcattaaatatactttagaaacggcaacgattattaaaggagta
ttctttgacgcttacggttttaatttacctgattttatcgaaaaaattattaaacctcta
tcaggtgatgcagaattatataatttaatagacgaaacaatacgagaagatgcaccgaat
aatttaaatgacggaggtataataaaacatgaatataatccgaaagtagcccaattacat
gatttaattaataacggaaaattatatattgaaaagctaaaagatcaatatcgcaaagaa
acgggaatagacagtttaaaaatatctcataataatgttatagggctttttatcgatatc
accgctaaaaatgttaataaaatccttgatcctaaatttattcaccgtcaaacaacggtt
aatcatgttcgttacactactgctgaactacaacagcttgaaagtgagttagtcaatgct
aaaaccttagtaataagcttagaaaaagaattatatgcggatatttgtagccaagtaatc
gaaaaagcttcctatttacgaatgcttgcaagctccttaagcgggcttgacgtattttgt
aattttgcttacatcgctgatgaatatgattatgttaagcctgagtttaccgatgattta
agctttgatatcgttaaaggacggcatcctgtagtagagcaagcactacagcgagaaagc
aaaagctttgtatataatgattgtcatttatcagagcttgagcgtatttggttaattacc
ggtcctaatatggcaggtaaaagtacttttttacgtcaaaacgccattattgcaatcatt
gctcaaataggctcgttcgtgccggcaaaaagtgctaaaataggggtagtcgacaaaata
tttagccgaataggtgctgccgatgacttaattaagggacaatcgacctttatggcagag
atgcttgaaacctcggcaatccttgctcaatctacaaacaactcactaatcatacttgat
gaggtaggtagaggcacatccacttatgacggggtatctatagcatggtcggtgcttgaa
tatattcatgataagctgaaatgtcgctgtttatttgcaacgcactatcatgagctaacc
gttatgagtaattttctgccggctttgcaaaattatactattgctattgaggagtcaggt
aaagatattctatttttacataatattatatcaggtgctgccgataggtcctacggtctt
catgttgcagctcttgccggtcttcctgcgagtgttataaacagagctgagcagattctg
cttaaatttgaaaaaacttctacaggtaaaggaaaaaatattttatcaacggaatcaaat
aatttgagtttgttttatcttgaacctaataaaactactataagcagcaaattagataaa
aaattcagcactatcgatcctgataaactatcccctaaagaagcccttgagttaatttat
gagttaaagaagttggtttga
DBGET
integrated database retrieval system
