Ruditapes philippinarum (Manila clam): 132715768
Help
Entry
132715768 CDS
T09557
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
KO
K17307
fibulin 1/2
Organism
rphi
Ruditapes philippinarum (Manila clam)
Pathway
rphi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rphi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
132715768
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
rphi04147
]
132715768
Exosome [BR:
rphi04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
132715768
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
EGF_3
EGF
EGF_LRP2
hEGF
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132715768
NCBI-ProteinID:
XP_060554820
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1662 aa
AA seq
DB search
MTTMLLRIIIAFLCLSLGTARVCYYSGTCQRVCYYSSKDDDCWWGTCYKYSLKSKTCYVQ
CTENRCCVGWTGTSCSDDINECSTNNGGCQHNCRNTAGSYECYCSSGYSLMSDGQNCTDI
NECNTNNGGCQHNCRNTVGSYDCYCRSGYSLMSDGQKCTESDECLVNRGGCQHYCRNTDA
SFVCSCRSGYILASDERTCNDINECSTDNGGCQHNCRNTVGSYYCYCRSGYLLMSDEQKC
TDINECNTDNGGCQHNCRNTAGSYHCFCRLGYSLMSDGQKCIDIDECYTNNGGCQHDCSN
TVGSFSCNCRPGYLLTEDKTNCKDIDECRTNNGGCQHNCSNTGGSFSCYCRPGYILAGDE
RKCNDKNECSSSDHGCNQNCINTPGSYYCSCYAGYFLSSDNKTCNDIDECSTNNGGCQQN
CRNTDGSFNCHCRSGYSLMSDSKTCTDIDECRINKGGCQHDCRNVVGSFKCYCKSGYLLT
DDNATCTDIDECRINKGGCQHDCRNVVGSFQCYCRSGYLLTDDNNYCKEVDKCRTNNGGC
QHDCSNTDGSFECYCKSGYILAGDERNCNDINECSSNDHGCHQNCINTPGSYYCSCNKGF
SLSSDYKTCNEIMVAVNKIVATLMDHLTATVGQDILIMSDSKTCTEVDECRTNNGGCQHD
CSNTDGSFECYCKSGYILAGDERKCNDINECSSNYHGCNQNCINTPGSYYCSCSTGFSLS
ADNKTCNDIDECSTNNGGCQQDCRNTDGSFNCHCRSGYSLMSDSKTCTDIDECSTNNGGC
QQDCRNTDGSFNCDCRSGYSLMSDSKTCTDIDECRTNKGGCQHDCRNVVGSFQCYCRSGY
LLTDDNVNCNDANECISNDHGCNQICINTPGSYKCSCNAGFSLSTDNKTCNDIDECSSNN
GGCKQNCRNTDGSFNCHCRSGYSLMSDSKTCTDIDECRFNKGGCQHDCRNVVGSFECYCK
SGYLLTDDNANCNDANECSSRYHGCNQNCVDTPGSYHCSCYPGFSLSTDNKTCKDIDECS
TSNGGCQQNCRNTDGSFNCHCMSGYSLMSDNKTCTDINECSSDNGGCSHYCNNGNGTYEC
SCKDGYALDGDLTSCNDIDECSKANGGCDQICNNQNGSFACGCFDGFTLLKDSVSCLDKN
ECEIENGGCDHICTNNDGSFTCDCKRGYSIQGDNSTCVDIDECHINMTACDQLCRNERGE
YFCSCFDGFFLNNDNISCDDIDECKSANGGCEHICLNTNGSFICDCYNGYIVQANLCSDI
NECEIDHGLCDHNCTNLKGSYTCSCLNGFKLQGNNQTCKDVNECTDDNGGCEQICFNSVG
SYSCGCKNGFSLNPANNSACEDECAINNGNCSQTCNYNFGSVVCTCYAGYVLQTDGATCL
DFDECSKDNGGCQSLCSNTEGSFKCGCDEGKVLNEDGVSCNKTNIASIYMSLRLVVNEIT
TLATSTIFGAAKESLETYFKTLIGTPFTLAINEIRSSTKENGTLEIFVTYTVSYIRTALH
NIEKERLLRGTTKLTEWTDVQFNGKPAQAILILPEGGLCEVHIIINGDCEPGYHCQLNEN
VPRCRKTEHTDDLNQGRLVVYIVPVIVAIVFIGLAVMTGICIRRNRIHSGLSRVKYRREK
SATALHELAEKKQEHEKSYVNLKITNTRDATSITSHIYEDVM
NT seq
4989 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacaatgttattacgaattattattgcatttctctgtttaagtttaggtactgct
agagtatgctactattcaggaacttgccaaagggtttgctactattcgtctaaagatgat
gattgctggtggggaacatgctataaatatagtctgaaaagcaaaacttgctacgttcaa
tgtacagagaacaggtgctgtgtaggatggacaggaacttcatgctccgatgacataaat
gaatgcagcacaaataacggagggtgccaacataactgtcgtaatacagcagggtcgtat
gaatgctactgtagttcggggtattccttgatgtctgacggacagaattgtacagacata
aatgaatgtaacacaaataacggaggctgccaacataactgtcgcaatacagttgggtcg
tatgattgctactgtaggtcgggatattccttaatgtctgacggacagaaatgtacagaa
agcgacgaatgtcttgtcaatagaggtggctgtcagcattattgtaggaacacagatgct
tcgttcgtgtgctcctgcagatcaggatatatattagctagtgatgaaaggacatgcaat
gacataaatgaatgtagcacagataatggagggtgccaacataactgtcgcaatacagtt
gggtcgtattattgctactgcaggtcgggatatttattgatgtctgacgaacaaaaatgt
acagacataaatgaatgtaacacagataacggagggtgccaacataactgtcgcaataca
gcagggtcgtatcattgtttctgtaggttgggatattccttgatgtctgacggacaaaaa
tgtatagacatagacgaatgctatactaacaatggtggttgtcagcatgattgtagtaac
acagttggttcgttttcttgcaactgtagacctgggtatctgcttacagaagacaaaaca
aattgtaaagatatagacgaatgccgtactaacaatggcggttgtcagcataattgtagt
aacacaggtggttctttctcttgctactgtaggcctggatatatcctcgcaggtgacgaa
agaaaatgcaatgataaaaatgaatgcagtagcagtgatcatggttgtaaccaaaactgt
atcaatacacctggatcttattactgttcctgttatgcaggctactttctttcttctgat
aataaaacgtgtaacgatattgatgaatgtagcacaaacaatggtggctgtcaacaaaat
tgtcgcaacacagatggatcatttaactgccactgtaggtcaggatattctcttatgtca
gacagtaaaacttgcactgacatagacgaatgccgtattaacaaaggcggttgtcaacat
gattgtagaaacgtagttggttcattcaaatgttactgcaagtctggatatttgcttaca
gatgacaatgcaacttgcactgacatagatgaatgccgtattaacaaaggcggttgtcaa
catgattgtaggaacgtagttggttcattccaatgctactgtaggtctggatatttgctt
acagatgacaacaattactgcaaagaggtagacaaatgtcgtactaacaatggcggttgt
cagcatgattgtagtaacacagatggttctttcgaatgttactgcaagtctggatatatc
ctcgcaggtgacgaaagaaactgcaatgatataaatgagtgcagtagtaatgatcatggt
tgtcatcaaaactgtatcaatacacctggatcttattactgttcctgtaacaaaggcttc
tcactgtcttctgattataaaacgtgtaacgaaataatggtggctgtcaacaaaattgtc
gcaacactgatggatcatttaactgcgactgtaggtcaggatattctcataatgtcagac
agtaaaacttgcactgaggtagacgaatgccgtaccaacaatggcggttgtcagcatgat
tgtagtaacacagatggttctttcgaatgttattgcaagtctggatatatcctcgcaggt
gacgaaagaaaatgcaatgatataaatgaatgcagtagtaattatcatggttgtaaccaa
aactgtattaatacacctggatcttattactgctcctgtagcacaggcttctcgctttct
gctgataataaaacgtgtaacgatattgatgaatgtagcacaaacaatggtggctgtcaa
caagattgtcgcaacactgatggatcatttaactgtcactgtaggtcaggatattctcta
atgtcagacagtaaaacttgcactgatattgatgaatgtagcacaaacaatggtggctgt
caacaagattgccgcaacacagatggatcatttaactgcgactgtagatcaggatattct
ctaatgtcagacagtaaaacttgcactgacatagacgaatgccgtactaacaaaggcggt
tgtcaacatgattgtaggaacgtagttggttcgttccaatgttactgtaggtctggatat
ttgcttacagatgacaatgtaaactgcaacgatgcaaatgagtgcattagtaatgatcat
ggttgtaaccaaatctgtatcaatacacctggatcatataaatgttcctgtaatgcaggt
ttctcgctttctactgataataaaacgtgtaacgatattgatgaatgtagctcaaacaat
ggtggctgtaaacaaaattgtcgcaacactgatggatcatttaattgccactgtaggtca
ggatattctctaatgtcagacagtaaaacttgcactgacatagacgaatgccgttttaac
aaaggcggttgtcaacatgattgtaggaacgtagttggttcattcgaatgctactgcaag
tctggatatttgcttacagatgacaatgcaaactgcaacgatgcaaatgagtgtagcagt
agatatcatggttgtaaccaaaactgtgttgatacacctggatcatatcactgttcttgt
tacccaggcttctcgctttctactgataataaaacgtgtaaagatatagatgaatgtagc
acaagcaatggtggctgtcaacaaaattgtcgcaacactgatggatcatttaattgccac
tgtatgtcaggatattctctaatgtcagataataaaacttgcactgatataaatgagtgt
tcttccgataatggggggtgcagtcattattgtaacaacgggaatgggacatatgaatgc
agctgtaaagacggatatgctcttgatggagatttgacatcttgtaatgacatagatgaa
tgttccaaagctaatggcggatgtgatcagatatgtaacaatcaaaacggttcctttgca
tgcggctgctttgatggttttacgttattaaaagacagtgtttcatgtctggacaaaaat
gaatgtgagatagagaacggtggttgtgaccatatatgtacaaataacgatggttcgttt
acctgtgattgcaaaagagggtattcaatacaaggtgataattccacgtgcgtggatatt
gacgagtgccacattaacatgactgcgtgtgaccagttatgcagaaacgaacgaggtgaa
tatttttgctcttgttttgatggtttcttcctgaacaatgacaatatatcatgtgatgat
attgatgaatgtaaaagcgcaaatggtggatgcgaacacatttgtttaaacaccaacggc
tcgtttatttgcgactgttacaatggttacattgtgcaggccaacctttgttcagacata
aacgaatgtgaaattgaccatggactttgcgatcacaactgcactaatttaaaaggttct
tatacctgcagttgtttaaatggatttaaacttcaaggaaacaatcaaacatgcaaagac
gtgaatgaatgtactgacgataacggcggttgtgagcaaatatgttttaattctgttggg
tcatattcctgtggatgtaaaaatggattttcactcaaccctgccaataattccgcatgc
gaagatgaatgtgctatcaataacggcaactgtagtcagacttgcaattataactttggg
tcagtagtatgtacatgttacgctggttatgtactccaaacagatggtgcaacatgctta
gattttgatgaatgttcaaaagacaatgggggatgtcaatcgttgtgttctaacacagag
ggttcatttaaatgcggctgtgacgaaggaaaagtactaaacgaagacggggtcagctgt
aataagacaaatatagcatcaatatacatgtcattgagactagtagttaatgaaataaca
actttagcaacatctaccatttttggagcagcaaaggagtcgcttgaaacatacttcaag
acattaataggaaccccatttactctagcaataaatgagataaggtcatctacaaaggaa
aatggaacgctcgagatttttgtaacgtatacagtttcgtatatcagaaccgcattacac
aatattgaaaaagaacgtcttttgcgaggaacaactaaactaactgaatggactgatgtg
caattcaacggaaaacccgcccaagcgatactaattttaccggagggaggactctgtgaa
gtgcacattataataaatggcgattgtgaacctgggtaccattgtcagttgaatgaaaat
gtgcctcgctgtcggaaaacagagcacacagatgacctcaatcaaggtagactggtcgtt
tatattgttccagttattgttgccatagtctttattgggttagcagttatgaccggcatc
tgcatacgtcggaatagaatacattcaggactttcaagagttaaatacaggcgtgaaaag
tctgccacggctttacatgaactggcggagaaaaaacaggaacatgaaaagtcatatgtg
aatttaaaaatcacgaatacacgtgacgcaacttcaattacatcacatatatatgaggac
gttatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system