Ruditapes philippinarum (Manila clam): 132724931
Help
Entry
132724931 CDS
T09557
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
rphi
Ruditapes philippinarum (Manila clam)
Pathway
rphi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rphi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
132724931
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rphi00536
]
132724931
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rphi00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
132724931
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Cu2_monoox_C
Plasmod_Pvs28
Cu2_monooxygen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132724931
NCBI-ProteinID:
XP_060565901
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
3188 aa
AA seq
DB search
MAFHFCIKILCTVFLVFILFNGQSDARRRRLRQYQNDGSSLTGSNVCGGSRSRQCCRGWS
AHPGGRRCIVPICVAGCGSGGICMRPGMCLCGTGQISPYCGSKTSGGGTSSLCNPPCKNG
GVCVARNLCRCPSGFSGGSCDNDLRTGPCYTQLSNNMCRGALPGVICTKHLCCSTLGMAW
GDPCEQCPANPHPCKRGYILNIQKNTCQDIDECKAIPGLCPSGNCINTVGSYACQCQDGQ
TLNRITGVCEDINECLTQRDICGAGHCTNTEGSYFCTCEPGYELSPDKTTCIAVRRKYCF
TRVISGRCSNALSTQQSLTDCCCGAGKGWGDDERCQICPEKNSEAHVKLCQRPEPQTRVC
SLFPNLCKNGRCVDTTYSYRCECYEGFRISDDGSECLDVDECSIQSGLCLNGECINLPGS
YECQCREGFVLAPGGRYCTDMNECAEKNMCPNGVCINMDGTYKCQCNRGFKQSANQQVCT
DIDECTENGRVCLNGQCLNTPGSFRCICDEGYRLSPDGAFCLDDNECQTSGMCANGMCKN
LRGSYKCICNTGYILSPGGEVCIDIDECSSQPGICVNGECINNQGSFRCRCAQGFSLGPD
RRTCLDTKKDLCFMQYSRGVCSSPSRMLATKSQCCCMVDSMDPPGIAWGRDCEQCLSMSD
PGYKILCPNGPGTDHNGGDINYCAMRGDLCQNGACENIPRGYRCRCNPGYRPDSSERRCL
DIQECTENTRLCEGGQCRNTPGSYYCVCPDGTRLNVGNQMCEDIDECASSPCIDGTCLNI
AGSFRCKCRHGFMLDSTGKICIDNRKGSCWMEIRNGECESNVKQRMTMAECCSTIGKGWG
SPCQECSTLPPSPCRPGYKLEVSGCEDVNECHLFQGLCRGGGTCVNTEGSFTCTCPPGME
IDSSRRTCIDKRKSTCYLDYSRGRCHRGLEGLFSRSVCCCSVGKAWSQQCEPCPVAGSED
YKALCEEGGTIIGPDHPVDINECQEIPGICTNGECRNTVGSFTCTCNPGFALDARGINCT
DIDECRISFGICANGRCVNTPGAFRCDCNSGYNAVMMEQMCMDINECEENPSLCRGGACI
NEQGAYRCQCPDGLELSRDGTECHDVDECSASSSICSHGFCENFMGGYQCTCSQGFRPNT
LRTTCLDIDECSERNGGCEMLCINSPGSFACGCEQGYILQPDGRTCKDFDECIDDSEICS
GGKCTNIPGGYRCTCVGGLRPSDDLKQCIDVDECSEQRRMCERGRCENTHGSYKCLCDNG
YAVQGSSTTCTDIDECKTGDDLCADDAFCYNTQGTYKCDCKSGFEGDGFSCRDINECRRD
RVCAAEAVCMNVPGSFNCVCGDGFTGDGYRCQDIDECTLNSNLCEHGRCYNLPGSFRCTC
NMGFALSEDEKACEDIDECIMFPNLCVNGVCQNLDGSFQCNCRQGYEPDVTGGNCTDINE
CDNPENCLYGYCINSIGSYTCECPPNFVLNPSGTGCIDDRRGFCYLDVRQQRRSGRCSKV
IANDVTRATCCCSIGRGWGESNGFCDLCPRNGTDEYKKLCIAENGFEPNPDTLLPEDIDE
CNDFIGVCKNGECINTFGSYTCVCPDGYRLDDNTLDCVDIDECVDFPDYCGLGTCVNSPG
NFSCLCPDGYMPMPGEGCMDMRKDICYAAVFNGTRRGDPPRCEYQLSTQVTKRQCCCKDN
IGQGWGTPCELCPVKNSREYLDLCKPLPIREDTNECAIYQFLCENGRCIDTNTDEGYLCE
CGQGFVYNKISKRCDDEDECRGRRNPCQGNAVCTNTVGSYRCDCIPGYELSSDERRCTDI
NECEDVAGICANGECINLDGSFSCRCKQGFRLTSSRDACIDVDECTLQPGLCRNGTCDNK
IGGYECNCNPGFKLSVNQDCEDIDECRNYIGICMNARCLNTQGSFLCECLPGYTHASDRM
NCRDIDECSEISGICRNGFCSNNDGSYQCTCFDGYRLSSNGESCRDINECRTIPNICANG
RCINEEGSFRCQCPSGYVLSEDGRSCIDLRQGNCFRVFERGVCQDPIPVNMTKYQCCCTT
GAAWSHIGSEFCEVCPIKGEAGFEDLCEDMGRGKGPSGALKVDYQDECLTRDVCGDGTCA
NTEGSFKCTCNNGFEPGPQEICEDIDECSGPLNQCAFRCFNTKGSFRCICPMGYQVASDG
KHCEDVDECSTPANKCRYACKNLIGSFMCICPEGFRETGRDQCTDIDECRENRDLCKPGF
CRNAQGGYRCNCPRGYRPSTDGKRCEDHREDYCYMELISGRCRPSRDTPRSTHTSCCCGG
GKAWGRRCEICPQPGTAEYKSLCPRGGGYDPDGTDIDECRMYPNLCQNGRCLNTAGSYRC
VCTQGYKSDSVTGQCVDMNECEDGQASCTHLCQNTEGSYRCTCRPGYVLNMDGRTCRDID
ECATGQHNCPHECTNTEGGFDCGCPEGYTQDRNKQCIDIDECSEQRHLCSPGGQCRNTKG
GYMCVCNRGYKLDSTGQKCIDINECEDGHCENLCENSEGGFFCGCPEGYTEYLLQCVEID
VCNIQPCVFECVPAGGEFMCGCPPGYQMIGQGHCIQTISPADYSSMFPPGTELPHDNALG
TGELPTGEGCYSCNIEDAPLDVPLSKRSKRSANGNGVERIINIEEFTEWRGDDDDNDDDD
DDESYESLLQRTGDVVVTDIRGSPHKFRPSILKVVKREAVRQKGNQLRRHKSRKHNLVQD
IPVVSAQRSVPVFLNLTDVSRKTKLIKMLPALAALQGNVEYKITNREDKLFFLKERKGIN
SLHARRKKLNKGMSYHIDIEAQPIHDESEVNGHEMHLGKSIFRFYIYVLNKPCLAELGYY
IETRIKIHFVICSGTCDLFRIYKKNTIDMEILRHFNLRRCFPRNGRKIDTCMAALLLLTA
CLSLTLAAPTENEAKTKVKSETKHVNLLMPEVQPKKADTYLCTPMRMGPKPTYLVGFEPH
ANMEIAHHMLLYGCKSPGSKGDVWNCGEMASKGSSYERGPVCGSGAKILYAWAMDAPALS
LPEEVGFKVGGDTDIDYLVLQVHYKNVDSFLPPINGKDSSGITLSVTNTPQRRRAGVYLL
GTSGIIRPHTVTYMETACTYDNDFAVYPFAFRTHAHTLGQVTSGYRIRDGQWTEIGRKSP
QKPQMFYNATTPGLVVQKGDILAARCTMKNDLNRPVSIGSTQNDEMCNFYMMYYTEEGDK
TMPSTYCF
NT seq
9566 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattccatttctgtataaagattctatgtacagtgtttttggtatttatactcttc
aacggacaatcggacgcccgacgacggcggctacgacagtatcagaacgacggatcctct
ctgacagggtcgaatgtctgtggaggcagtagaagtcgacagtgttgtaggggatggtcg
gcacatccgggcggtaggaggtgtatagttccaatatgtgttgcgggatgtggtagcgga
ggtatatgtatgaggccgggcatgtgtttatgcggaactggtcagatatctccgtattgt
ggctctaagacgtcgggaggaggaacatcgtctttatgtaatccaccgtgtaagaacggt
ggcgtatgtgtggcacgaaacctctgcagatgtccttccggtttctccggcggatcatgt
gacaacgatttaagaacaggtccatgttatactcaactctcaaacaacatgtgccgaggt
gcgcttcctggcgtcatctgtacgaaacatctatgttgctccactctcggcatggcatgg
ggagatccctgtgagcaatgtccagccaatccgcacccttgtaagagaggttacatattg
aatatacagaaaaacacgtgtcaagatatagacgaatgtaaagctatccctgggttgtgt
ccgagtggtaattgtataaatacagtcggctcgtacgcctgccagtgtcaggacggacag
acgttaaacagaattactggtgtatgcgaagatataaatgagtgtttgacacaaagagac
atttgcggcgctggtcattgtactaacacagaagggagctatttttgcacatgcgaacct
gggtacgagctctctccagataaaacaacatgtatagctgtgagacggaagtactgtttc
acacgtgtgataagtggcagatgttcgaacgctttgtcaacccaacaatctctgacagac
tgttgttgtggtgccggcaaaggttggggtgatgacgaacggtgccagatatgccctgag
aaaaattcagaagcccatgtgaaactttgccaaagacccgaacctcagaccagagtgtgt
tcgttgtttcccaacttgtgcaagaatggccgctgtgtcgacacaacatattcctacaga
tgtgaatgttacgaggggtttcgaatatccgatgatggttcggaatgcttggatgtggat
gagtgttccatacagtctggtctttgtctgaatggagaatgtatcaatctacccggaagt
tacgaatgtcaatgtcgtgaagggttcgtactagcacctggtggaagatactgtaccgat
atgaatgaatgtgcagagaagaatatgtgtccaaatggagtttgtataaatatggatggg
acgtataagtgccagtgtaacaggggcttcaaacagtcggcaaaccagcaagtctgcacg
gacatagatgaatgtacagagaatgggcgtgtatgtctaaatggacaatgcttgaataca
ccaggcagctttagatgcatttgtgatgaaggctataggttatcaccagacggagctttc
tgtctcgatgacaatgaatgccagacctcaggcatgtgtgctaatgggatgtgtaagaat
ctcagaggaagttataaatgtatctgtaacacaggctatatcctatcaccaggtggagaa
gtttgcatagatattgatgaatgtagtagccagcctggtatctgcgttaatggagaatgt
atcaacaaccagggtagctttaggtgccgctgtgctcaagggttcagtctcggaccagac
agacgcacatgccttgacacaaagaaagatttatgtttcatgcaatacagtcgaggtgta
tgtagcagcccatctcgcatgttggccaccaaatcacaatgttgctgtatggttgattcc
atggatccacctggtatagcttggggacgggattgcgagcagtgcctgtccatgtctgat
cctgggtacaaaattttatgtcctaatggacctgggactgatcataatggaggagatata
aactattgcgcaatgagaggagatctgtgccagaatggagcctgtgagaatataccacgt
ggatataggtgtcgctgtaaccctggttaccgtcctgattcatcggaaagaagatgcctt
gatattcaggaatgtacagaaaatacccgactatgtgaaggtggtcagtgtaggaacacg
cctggttcctactattgtgtttgtccagatggtaccagacttaatgttggaaatcagatg
tgtgaagatattgacgagtgtgcatcttcaccatgtattgatggaacctgtcttaacatt
gctggtagcttccggtgtaaatgtaggcatggtttcatgctagattcaaccggaaaaatc
tgtatagacaatagaaagggttcatgctggatggagataaggaatggcgaatgtgaatct
aatgtaaagcagagaatgaccatggccgagtgttgtagcactataggaaaaggttgggga
agtccgtgccaggaatgttctaccttaccaccatcgccatgcaggccaggatataaactg
gaagttagtggttgtgaagatgtgaatgagtgtcacttattccagggattatgtagagga
ggtggcacctgtgtgaacacagaaggatcatttacctgtacttgtccaccaggcatggag
atagattcatcaagaagaacatgtatagataaaagaaagtcaacctgttaccttgactac
agtcgtggtagatgtcaccgaggactagagggattgtttagtcgttctgtgtgctgctgt
tctgttggtaaagcctggagccagcaatgtgaaccgtgcccggtagccggctctgaggac
tataaagcattatgtgaggagggtggaactattattggaccggatcatccggttgacatt
aatgagtgtcaggaaataccaggtatctgtacgaatggagagtgtcgtaatactgtcggg
agcttcacatgtacatgcaacccaggtttcgctctagatgcacggggaataaattgtact
gatattgatgaatgtaggatatctttcggtatttgtgcaaatgggcgatgtgttaataca
cctggagctttccgctgtgactgtaactcgggatacaatgctgtcatgatggaacaaatg
tgcatggatataaatgaatgtgaggaaaacccatctctatgtagaggaggggcatgcatc
aacgagcaaggggcctacagatgtcagtgtcctgatgggctagagctctccagagatggt
acagagtgccatgatgttgatgagtgttcagcaagcagtagtatctgctcccatggtttc
tgtgaaaacttcatgggtggttaccagtgtacatgtagtcagggattcagaccaaatact
ctcagaacaacttgccttgatattgatgaatgttcggagagaaatggcggatgtgaaatg
ttgtgtataaactcacctggcagttttgcttgtggctgtgagcaggggtacatactgcaa
ccagacggacggacatgcaaagattttgatgaatgcatagatgactctgagatttgtagt
ggtggtaaatgtacaaatataccaggtggatatagatgtacctgtgttggtggtctgaga
ccgtctgatgatctgaaacaatgtatagatgtagatgagtgttctgaacagaggagaatg
tgtgaacgtggacgttgtgaaaacactcatggatcatataaatgtttatgtgacaatggc
tatgctgtacaggggtcatctactacatgtacagatatagatgagtgtaaaacaggagat
gatctatgtgctgacgatgctttctgttataacacacagggtacatacaaatgtgactgt
aaatctggatttgagggggatggattctcttgtagagatatcaatgaatgtagaagagac
agagtttgtgcagcggaggctgtgtgtatgaatgtacctggcagtttcaactgtgtctgt
ggtgatggtttcaccggtgatggatacagatgtcaagatatagatgagtgtacattgaac
agtaatctgtgtgaacatggtagatgttataatttacctggaagttttagatgcacttgt
aatatgggctttgcactgtcagaggatgaaaaggcttgtgaagacatagatgaatgtata
atgttcccaaacctgtgtgtaaatggtgtgtgtcagaatcttgatgggtctttccagtgt
aactgtagacaaggctatgaacctgatgttactggtggtaactgtacagatataaatgag
tgtgataacccagagaactgcttgtatggttactgtattaacagtataggaagttatact
tgcgagtgcccaccaaactttgtactcaatccatcagggactggatgtattgatgacaga
cgtggattctgttaccttgacgtaagacagcagcgaagatcaggccgttgtagcaaggtt
atagccaatgatgtaactagggcaacctgctgctgctctataggtagaggctggggtgaa
tctaatggattttgtgatctttgtccaagaaatggcacagatgaatataagaagctgtgt
attgcagaaaatggttttgaacctaatccagacactcttctacctgaagatattgacgag
tgtaatgattttattggtgtgtgtaagaatggggaatgtattaacacatttggaagttac
acatgtgtgtgtcctgatgggtacagactggatgacaatacacttgactgtgttgatata
gatgaatgtgtagatttcccagattattgtggacttggtacatgtgtaaacagtcctggt
aatttctcctgtctctgtccggatggatatatgccaatgcctggagaaggctgcatggat
atgaggaaagacatttgctatgcagctgtatttaatggtacaagacgtggtgatccacca
agatgtgagtaccagttgtcgacacaggtcactaaaagacaatgctgctgtaaagataac
ataggtcagggatggggaacaccctgtgaactttgtccggtgaaaaattctcgtgaatac
ttagatctatgtaaaccattgccaataagagaggatacgaatgaatgtgctatctaccag
ttcctgtgtgagaatggacgatgtatagataccaacacagatgagggatatttgtgtgaa
tgcggacaggggtttgtgtacaacaaaatcagcaagagatgtgatgatgaagatgaatgc
aggggtagaaggaatccatgtcaaggaaatgctgtctgtacaaacacagtgggtagttac
aggtgtgactgtataccgggctatgaactctcgtctgatgaaaggagatgcactgacatt
aatgagtgcgaggacgttgcaggtatatgtgcaaatggagaatgtatcaatctggacgga
agtttcagttgtcgatgcaaacaaggcttccgtctcacctcgtcaagagatgcttgcata
gatgttgatgaatgtacattacaaccaggattatgtagaaatggaacatgtgacaataaa
attggaggttatgagtgcaactgcaatccaggatttaaattgtcagtcaatcaggattgt
gaagatatagatgaatgtaggaattatatagggatatgtatgaatgctagatgtttgaat
acacagggtagtttcctatgtgaatgtttacctggatacactcatgcttcagacaggatg
aattgtagagatattgatgagtgttccgagatatctggtatatgtaggaatggattttgt
tctaacaacgacggctcgtaccagtgtacatgttttgatgggtacaggttgtcatctaat
ggggaatcgtgcagagatataaacgaatgccgtacaataccaaatatttgtgctaatgga
agatgtataaatgaagagggtagtttcagatgtcagtgtccctctggctatgtcttgtct
gaagatggaagaagctgtattgatttacgtcaaggaaattgtttccgtgtatttgagaga
ggagtgtgtcaggacccgatacctgtcaacatgaccaagtaccagtgttgctgtacaaca
ggtgccgcatggtcacatattggctcagagttctgtgaggtgtgcccaattaaaggagaa
gctggatttgaagacttgtgtgaggatatgggaagaggaaaaggtcccagtggagctctg
aaggtagattaccaagatgaatgtttgactagagatgtttgtggggatggtacctgtgcc
aatactgaaggcagctttaaatgtacatgtaacaatgggtttgagccgggcccacaagaa
atatgtgaagatatagatgagtgttccggaccactgaatcagtgtgctttccgatgtttc
aacactaaagggtcattccggtgcatttgtccaatgggatatcaggtagcttccgatggc
aaacactgtgaagacgtagatgagtgttccacacctgccaataaatgcagatatgcatgt
aagaacttgattggctcatttatgtgtatttgtcctgaaggcttcagagaaactggcaga
gatcagtgtacagatatagatgaatgtagagagaaccgagatttgtgtaagcctggattt
tgtcggaatgcacagggtggttacagatgtaattgtcctcgaggttacagaccaagtaca
gatgggaaacggtgtgaggatcatagagaggattattgctacatggagttgatatctggc
agatgtagaccttctagagatactccacggtccacacacaccagttgttgctgtggtggt
ggtaaagcatggggtcggaggtgtgaaatctgcccacaacctggaactgcggaatacaaa
agtctgtgtccaagaggtggaggatatgatcctgatggtactgatattgatgagtgccgt
atgtacccaaatctatgtcagaatggcagatgtttgaatactgcaggatcttatagatgt
gtctgtacacaaggctataaatctgacagtgttactggacagtgtgttgatatgaatgaa
tgtgaagatggtcaagcttcgtgcacacatttgtgtcagaatacagaaggttcttacagg
tgtacttgtcgcccaggttacgtccttaacatggatgggagaacatgtagagacatagac
gagtgtgccactggacagcacaactgcccacatgaatgtacaaacactgagggaggattt
gactgtggatgtcctgagggttacacacaggacaggaataaacagtgtatagatattgat
gagtgttcagaacagcgccatctatgttcccctggtggtcaatgtaggaatacaaaggga
ggctacatgtgtgtatgtaaccgagggtacaaactggattccactggacaaaaatgtata
gacatcaatgagtgtgaagatggccattgtgaaaacttatgtgaaaatagtgaaggtgga
tttttctgtggatgtccagagggttacacagaatacttgttacagtgtgttgagatagat
gtctgcaatattcagccatgtgtatttgaatgtgtaccagctggtggtgagtttatgtgt
ggatgccctcctggctatcagatgattggacaagggcattgtatacagactatctcacca
gcagattacagctccatgtttccaccggggacagagctaccacatgataatgccctgggt
actggagagctacccacaggagagggctgttattcttgtaacattgaagatgctccgcta
gatgtacctctgtctaaaagaagtaaacgaagtgccaatggaaatggagttgagcgtatc
atcaacattgaggaatttacagaatggagaggtgatgatgacgacaatgatgatgatgac
gatgatgaaagttatgaatctcttctacagcgtactggagatgttgtagtaactgatata
agaggaagtccacataaattccgaccaagtattcttaaagtagtcaaacgggaggctgtg
cgccaaaagggtaatcagttaaggcgccacaagtcaaggaaacacaatctggttcaggac
atcccagtggttagcgctcagaggtctgttccagtattcctcaacttaacggatgtcagt
cgtaaaacgaaacttataaaaatgttgccggccttggcggcccttcaaggaaatgttgag
tacaaaataaccaatcgtgaagacaagcttttctttctcaaggaaaggaagggaataaat
tcattgcacgcaagacgtaaaaagttaaacaagggaatgtcttaccacattgatattgag
gctcagccgatacacgatgagtcggaagtgaacggacacgaaatgcatttagggaaatct
atttttagattttatatttatgtgttaaataaaccatgtttagcagaacttggatattac
attgaaactcggataaaaatacattttgtaatttgtagcggcacgtgtgatttgtttaga
atatataaaaaaaacaccattgatatggaaattctacgtcacttcaatttaaggcgctgt
tttccacgaaatgggcggaaaatagacacgtgcatggctgcactgttgctactcactgcc
tgcttaagcctgaccttagcagccccaactgaaaatgaggccaagacaaaggtcaaatcc
gaaaccaagcatgtaaatctgctcatgccggaagtccagcctaaaaaggcggacacgtac
ttatgtacacctatgagaatgggaccaaaaccaacatatcttgtcgggttcgagccccat
gctaatatggagattgctcatcatatgctgctgtatgggtgcaaatccccagggagtaaa
ggcgatgtttggaactgtggtgaaatggcatcaaaaggctcaagttatgaacgaggtccg
gtgtgtgggtcgggtgctaaaatcttatatgcatgggctatggatgcacccgccctctca
ttgcccgaggaagttggatttaaagttggtggagatactgatattgactacttagtactg
caagtgcattataagaatgtggactcatttttaccaccaataaacggaaaagacagttct
ggtataacattgtcagttacaaataccccacaacggcggcgtgctggagtatacctttta
ggaacttccggtataattcgacctcataccgtcacatacatggaaacagcttgtacatat
gataatgattttgcagtgtacccatttgcttttagaactcacgcacatacgctaggtcag
gtgacatcaggctatagaataagggatggacaatggacagagattggtcgaaaatcgcca
caaaaaccacagatgttttataatgcaaccacgccaggacttgtggtacagaaaggtgat
atactggctgcaagatgtacaatgaagaatgatttgaacagaccagtatctatagggagt
acacagaatgatgagatgtgtaatttctacatgatgtactacaccgaggagggggacaag
actatgcccagcacatactgtttcag
DBGET
integrated database retrieval system
