KEGG   Ruditapes philippinarum (Manila clam): 132730806
Entry
132730806         CDS       T09557                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC132730806
Organism
rphi  Ruditapes philippinarum (Manila clam)
SSDB
Motif
Pfam: LRR_8 TIR_2 TIR LRR_4 ThsB_TIR LRR_9 LRR_1 LRRNT Coiled Protocadherin Claudin_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 132730806
NCBI-ProteinID: XP_060572837
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1716 aa
MEKWKLLFLGITFVLKYVCSDADQPFIRKQGKSDHIGKALVFSGLFAKLDHCKWFHPCIC
RDESSYTNSVYQLMVNCTNAGLKSVPENIPVTTTVLTLNENRIEDIKPGAFKELINLKYL
DISKNRLTQIRDGVFTGLANLHTLEMSGNQVRYNSRCIPNNVFKPLEKLARLSLKQNLAD
IDINETYPIDALKKLTNLTQLLMDGLKVEKFDQPFASLNSVESLDLGSNIGRCKLDTIRA
DMFKNANNITILKLSYCNVQYVESGSFSKMKRLSTLDLSHNELLHFKSLPNITSGLKSHK
MKELKLAKIHQTFGDCTRLEQKHLSHLQYMTIESINLDTNRLAYIEKNAVDCIPPSIKTL
SLTGNMLLAGEYVERILHSQVFVNLQYLTLAELNLNFDPMKFFSDRTKEMIESMREKNDR
KSSEQDSLTASASGLHNENINNSVHLQQKQFCANCLEKGLNYETILSFPQSLTDLDLSGL
RIRNILRNICICEPNSLIRMNLERNLFWKWQGPLVGLSNLLNLNLAWNSCDSLTVDVFDQ
LRSLISLNLTRNFIEKFLREDTEGRIFRKLKNLQFMLLSDNKIRYLPLKIFSGLASLRGL
DLSNNFLTRFDVMLCHAAPLQVLNLNDNLLDYIGKNIRDKMDSVGTVNYAYQYNYMDLSD
NKLSCTCKTIDFVHWLSVSKVQFMQFDDYICKDKNGEIKKLKFAAEITLELDKECANYIT
LIICLSIGFVVCLVVIIHGIMYRYRWDLRYFYYSFKLKMKGSNHLLKHEGDVNDYEYDAF
VSYANENGNFVKNDLVPELEDKRGLRLLVHDRDFRAGEFVCDNIMSAITTSKKTLIIMSK
HFLKSDWCIFEMNMARMETIKTGRNVLCVIMLEEVPSKGLPLEILDIVRQQTYMEVPLND
EHMDLFWDRVHAAMIEDCERLYSSYKDRFISVKCAILCYIKKESKKIVFTILQKKTCLKE
YFRLVYEIMALLTTTFVFALLLVCVRWNLIKGTQQRQYCYREKSTTLKCNYIPRDIPFGI
DSVRLMDFKKLKEIFIVNSTQFQSENWGRLKSFEISYSGDESIVTVIFKTGCFKGLKHLR
ELHIHLVPIFILEGQVFEGLNSLKLLDLSGCLRMSIGVLLPGLTGHGILPQLENLKLAAM
NNYRKPVVINDKFAQSIGDKNITSLDLSYVRIEEINATALVNSVKTLKNVNVSFSFITTC
YTDKNSTINKFDQLNVLDIYHLSYFRVIPPSKMLNKSWNTSDFKTFWVSLIAPKVVNISG
LLQYPSSIWISNSTLNINSQFKMRSEEFIGTHNNLKHLDLVLQCNGFSAVTIKHIDLSEN
GLDFIHPSLLSCSPNLQHLDLSNNQLFKMVSTHSKLFQQLLISIQRLKVIKFSSNFFKDI
PRDVFIKNNKLEEIDLSYNELGQVTFALYQLGNLKVLNLRDNKIKILSESSMHNINSIST
KSPYFKSKKAAVYLDNNPISCSECKAKEFLQWLTSTKSVNVLTPKLTCVNEKGLTRNIND
KALQLVMEICKKRIVIVTTAVSVVVAAVLIMLVVVTIHKCRKRAVKKANKRTLLQNLQEG
HGEFEFVTFLSHSSEDKDFVNEYLVEQLNETLQLMTGIDRNLVCTGDDFLRPGFRILDEI
TNCIERSSVFIVVVSDHFCESMYCHHEVEMAFRLHKPIVLMIIGQVNEDLMKPLLKTLFK
STVRVLWTIHKDEYVMNKTWADFCRAMLDLIVENIK
NT seq 5151 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaagtggaaattactttttttaggaattacattcgttttgaaatatgtttgctcg
gacgctgaccaaccattcattcgaaagcaaggaaaatctgatcatataggaaaagcctta
gtcttttctgggctatttgcaaagttagatcactgtaaatggtttcatccctgtatatgt
agagacgaaagctcgtacacgaattctgtatatcaactgatggtgaactgcacaaatgct
ggtcttaaatctgtgccggaaaatattccagttaccacaacagtgttaacattgaacgaa
aaccgaatcgaggacataaaaccaggtgcgtttaaggagttaattaatctaaaatacctt
gacatttctaaaaaccgactaacacaaatcagagatggtgtatttacagggcttgcaaat
ctgcatacacttgaaatgagtggaaatcaagtacgttacaacagtaggtgtataccgaat
aacgtattcaaacccctagagaaactcgcacgtttgagtctcaagcagaacctggcggat
attgacattaatgagacatatcctattgacgctttgaaaaaactcacaaacttaacacaa
cttctaatggacggactaaaggttgaaaagttcgatcaaccattcgcttcattaaacagc
gtagaatcactcgacctaggtagcaatattggtagatgcaaactggatacaatacgtgca
gatatgtttaaaaatgcaaataatatcacaatcttgaagttaagttactgcaacgttcaa
tatgttgaatccggcagcttttcaaaaatgaaacgcctgagtacccttgatttgtctcac
aacgagcttttacattttaaaagtttaccaaacataacttctgggttaaagtcacataaa
atgaaggagttaaaacttgctaaaatccaccaaacatttggcgattgtactagacttgag
cagaaacatttatcacacctacaatacatgactatagaaagcataaatcttgatacaaat
agactagcgtatatcgaaaagaacgcagttgattgtattccaccatctattaaaacattg
tctttgacaggcaacatgctccttgctggtgaatatgtggagagaatattacatagtcaa
gtgtttgtaaatcttcaatatctcacattagcagagcttaacttgaattttgaccctatg
aaatttttcagcgacagaacgaaagaaatgattgagtcaatgcgagagaaaaatgacaga
aaatctagtgaacaagacagtttaacggcaagcgcaagtggtttacataacgaaaatata
aacaatagtgtccatttgcaacaaaaacagttctgtgcaaactgcttggagaaaggtttg
aattatgaaacaattttatcctttccacaatctctaacggatttagacttaagtggttta
cgtattagaaacattcttagaaatatttgtatatgtgaacctaattctctcataagaatg
aatttggaaagaaatttattttggaaatggcaaggtcctcttgtcggtttatctaatcta
cttaatttaaaccttgcatggaactcgtgtgattcattgaccgtagacgtatttgaccaa
ctaagaagtttgatatcattaaaccttacaaggaatttcattgagaaatttttacgggaa
gatacggaagggcgtatattcagaaagctaaagaatcttcaattcatgttgctttctgat
aataaaatacgttaccttccccttaagatattcagtggtctggcatcattacgaggactc
gatttatccaataactttttgacaagatttgacgttatgctttgtcacgcagctccattg
caagtcttaaatttaaatgacaatttactggattatataggaaaaaatattcgtgataaa
atggacagcgttggcactgtaaactatgcctatcagtataattatatggatctttcggac
aacaagctttcgtgtacttgcaaaaccattgattttgttcattggttgtccgtttcaaag
gttcagttcatgcaattcgacgactacatttgcaaagataaaaatggagaaataaaaaag
ttaaagtttgcagcggaaataacattggaattagataaagagtgtgctaattatatcacg
ttgataatatgtcttagcattggttttgttgtgtgcttagttgtaataattcatggaatt
atgtatagatatagatgggacctgcgatacttctactactcatttaaacttaaaatgaaa
ggaagcaatcatctccttaaacacgagggtgatgtcaacgactacgaatatgatgcgttt
gtttcgtatgcaaatgaaaacggaaattttgtgaaaaacgaccttgtgcctgagctcgaa
gacaaacgtggcttgcgactgttagttcacgatcgggatttccgtgctggggagttcgta
tgtgacaacattatgagtgcaattacaacatcaaaaaagacgctgataataatgagtaaa
catttcctgaaaagtgactggtgtatatttgaaatgaacatggcgaggatggagacaatc
aaaactgggcgaaatgttctatgtgtaatcatgctggaggaagttcctagcaaaggtttg
cctttagagatcctagatattgtgcgtcaacaaacttacatggaagttccgttaaacgat
gaacacatggatttattctgggacagagttcacgctgcaatgatagaagattgcgagaga
ctttattcgtcatataaggacaggtttatctccgtaaaatgtgcaattttgtgttatatc
aagaaagaatctaagaaaattgtgtttaccattttacaaaaaaaaacatgtttaaaagag
tattttcgtttagtttatgaaatcatggcattactaaccacgacatttgtgtttgcgctc
ttactcgtttgtgtgagatggaatttgataaaaggaacacaacagcggcagtattgttat
cgagaaaaatcaacaacgttaaagtgcaattacattccgagagacattcctttcggaatt
gattcagtgcgtctcatggattttaaaaaactaaaagaaatatttatagtgaacagtaca
cagtttcaatcagaaaattggggaaggttaaaatcatttgagatatcctacagtggtgac
gaatccattgttactgttatatttaaaacaggctgttttaaaggtttaaaacaccttcgt
gagttacacattcacctcgtacctatctttattcttgaagggcaagtctttgaggggctt
aactcgctgaaactgctggaccttagcggatgtcttcggatgtctatcggagtattattg
ccaggtctaacaggacatggaatattacctcaattagaaaacttaaagctagcagcgatg
aataattatagaaaaccagttgttattaacgataaatttgctcaatcaataggtgacaag
aatattacttccctagatttgagttatgtacgtattgaagaaataaatgcaacggctctc
gttaattctgttaagactctgaaaaacgtgaacgtgtctttttcttttattactacgtgt
tacacggacaaaaacagtactattaataaattcgaccagctcaatgttttggatatttat
catctctcttatttcagagtaattccaccctcgaagatgttaaataagtcgtggaatact
tcggactttaaaaccttttgggtttctctcattgctccaaaagttgtaaacatcagcggt
ttgttgcaatatccgtcctcaatttggataagtaatagcacattaaacatcaattcacaa
tttaaaatgagaagtgaggaattcataggcacacacaataatttaaaacatctagacctg
gtgttacagtgcaacggtttctcagcagtaacgataaaacatatcgatttgtcagaaaat
gggctagacttcatacaccctagtttgttatcatgttcacctaacctccaacacttagat
ctgtccaataatcagcttttcaaaatggtatcaacacacagtaaattatttcagcagcta
ctgatttctattcaacgtctaaaagtaatcaaattttcgtcaaactttttcaaagatatt
cctcgtgatgtgtttatcaagaataataaactggaagaaatagatttatcatacaatgaa
ctcggccaggtgacttttgctctttatcagcttggaaatctcaaagttctcaatctccgc
gataataaaattaagattttgtcagagagttctatgcataacataaactctataagcaca
aagtcgccatacttcaaaagcaagaaagcggccgtgtatctggacaataatccaatttca
tgttctgaatgtaaagctaaagagtttttacagtggcttacaagtacaaaatctgtaaat
gttcttacgccaaaactcacgtgcgtgaatgaaaagggcttaacacggaatataaatgat
aaagcattacaacttgtaatggagatatgtaagaagagaatagtgatcgtgactacagcc
gtgtctgtagttgttgcagctgtcctaatcatgttggtggtggtgacaatacacaaatgc
cgaaagcgtgctgtgaagaaagcaaacaaaagaacacttctacaaaaccttcaagaaggt
cacggcgagtttgaattcgttacattcttatctcatagtagtgaagacaaagattttgtc
aatgaatacctggtggaacagttaaatgaaactctgcaactaatgacaggtatagataga
aacctagtatgcacgggtgatgacttccttcgaccaggcttcagaatcctagacgagata
acaaactgtattgaaagatcttcggttttcattgtggtcgtatcggatcatttctgtgag
agcatgtattgtcatcatgaagtggagatggcctttcgtcttcacaaacctattgtgcta
atgatcatcggacaagttaatgaagacttaatgaaaccactgctgaaaacattgttcaaa
agcactgttcgggttctttggacaatacacaaagatgagtatgtaatgaacaaaacatgg
gccgatttttgccgtgctatgctagaccttatagtggaaaatatcaaataa

DBGET integrated database retrieval system