Rapeseed phyllody phytoplasma: RP166_2770
Help
Entry
RP166_2770 CDS
T10382
Symbol
hflB
Name
(GenBank) ATP-dependent Zn protease
Organism
rphy Rapeseed phyllody phytoplasma
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
AAA_5
AAA_16
Viral_helicase1
AAA_22
TIP49
RNA_helicase
RuvB_N
TsaE
AAA_28
AAA_33
DUF7458
AAA_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKX95271
UniProt:
A0A859I8Y1
LinkDB
All DBs
Position
230455..232410
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MTIQELQQMMEDIIHGNNLHTLNDLINALANKNDPSKKQLQHIDKFPEGTRYFPMPLDEF
EGLPSFKKTIGMESVIDQLQGFLNYLSDPLSYVGVGKVKPPQGVLFYGVPGTGKTFFTRA
LAKEAGRQVGFYETNAAEFVYQTLVGDGPRFVKKLFEDVRLHNKKEGVKASIIFIDECEE
AFKYLNKTANSSSDLPNVVNQFKTELTSTKNDPKKPILIIGATNYFDKIDEAIKSRFTYH
IEIKVGHATARAKYLDLMINVLRKNPFHEEALEYLLKTVNPFLDKFDAESRSNRRLENMI
ESSVINMNNRLSAESRAKQKEIDDKTKKLQLEANTLSLSQEEKDQLQKDIQELKTQLHNR
KIKLEQIVENESQMAQIKQQETKIEKETAEKKAQQIILEEKIAKLNFEIEFLQEELNKLN
EKQSQPKPLQPPTSSTLQTSESNASSTPPQDVTPTPPNSEQQPQQPNPEAEKLKQQTKDK
QKEKEELLQKEDPLKLEEDITKLVQKLAQLDQEKKPFKAKVKQLQKDLEKEVRVVDLRAA
FYQVYGMKILNTPEERCNELQELAKVYNKRNTQVLYSTQAMHYFNQTLNPKINQLMEEAQ
CDKLIAYFVEASKRKFLETKQTLQQNDLDEVFKEVYGGLDELTQKLNNNYK
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactattcaagaattacaacaaatgatggaagatataattcatggaaataatctacat
actctaaatgaccttataaatgcattagctaataaaaatgatccatctaaaaaacaatta
caacacatagataaatttcctgaaggtactagatattttcctatgcctttagatgaattt
gaaggattacctagttttaaaaaaactattgggatggaaagtgttatagaccaattacaa
ggttttcttaattatttaagtgatcctttatcttatgtaggtgttgggaaagttaaacca
cctcaaggagtcttattttatggggttcccggaacaggtaaaacattctttactagagca
cttgctaaagaagctggtagacaagttggtttttatgaaactaatgctgctgaatttgtt
tatcaaactcttgtaggagatggtcctaggtttgttaaaaagttatttgaagatgtaaga
ttacataataaaaaagaaggagtaaaagcttctattatctttattgatgaatgtgaagaa
gcttttaaatatctaaataaaactgcaaattcatcttcagatctacctaacgttgtaaac
caatttaaaactgaattaacctcaacaaaaaatgatcctaaaaaacctattttaattatt
ggagcaactaactattttgataaaatagatgaagctattaaatcacgttttacttatcat
attgaaattaaagttggtcatgcaacagccagagctaaatacttagatttaatgattaat
gttttaagaaaaaatccttttcacgaagaagcattagaatatcttttaaaaactgttaat
ccttttcttgataagtttgatgcagaatcgcgttctaatagacgtttagaaaatatgatt
gaatcatctgttattaatatgaataatcgtttaagtgctgaaagtcgtgcaaaacaaaaa
gaaattgatgataaaactaaaaaattacaattagaagcaaatactttatctttatcacaa
gaagaaaaagaccaactccaaaaagacattcaagaattaaaaacacaattgcataataga
aaaattaaattagaacaaatagttgaaaatgaaagccaaatggcacaaatcaaacaacaa
gagacaaaaatagaaaaagaaacagccgaaaagaaagcccaacaaattatattagaagaa
aaaatagctaaattgaattttgaaatagagtttttgcaagaagaattaaacaaattaaac
gagaaacaatcccaaccaaaacccttacaacctcctacctcatcaactctacaaacatct
gaatcaaatgcttcttcaactccgccacaagatgtaacgccaactcctccaaacagtgaa
caacaacctcaacaaccaaatccagaggctgaaaaactaaaacaacaaacaaaagataaa
caaaaagaaaaagaagaactattacaaaaagaagacccattaaaattagaagaagacata
acaaaattagtacaaaaactggcacaattggaccaagaaaaaaaaccttttaaagcaaaa
gttaaacaattacaaaaggacttagaaaaagaagttagagtagttgatttaagagcagct
ttttatcaagtttatggtatgaaaatccttaatacaccagaagaacgttgtaatgaatta
caagaattagctaaggtttataataaaagaaatacacaagttctttattcaacacaagca
atgcattatttcaaccaaaccttaaatcctaaaattaatcaattaatggaagaagctcaa
tgtgataaattaattgcttattttgtagaagcttctaaaagaaagtttttagaaaccaaa
caaacattacaacaaaacgatttagatgaagtctttaaagaagtgtatggcggattagat
gaattaacacaaaaattaaataataattataaataa
DBGET
integrated database retrieval system