Rickettsia prowazekii NMRC Madrid E: H374_6730
Help
Entry
H374_6730 CDS
T02544
Name
(GenBank) Soluble lytic murein transglycosylase
KO
K08309
peptidoglycan lytic transglycosylase [EC:
4.2.2.29
]
Organism
rpn
Rickettsia prowazekii NMRC Madrid E
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rpn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
rpn01011
]
H374_6730
Enzymes [BR:
rpn01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.29 peptidoglycan lytic transglycosylase
H374_6730
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
rpn01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
Lytic transglycosylase
H374_6730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLT
TPR_6
TPR_8
TPR_2
TPR_1
Lysozyme_like
TPR_12
TPR_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15150460
NCBI-ProteinID:
AGJ01958
LinkDB
All DBs
Position
complement(806788..808743)
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MKIKLFIAIFLLLALKINANSDSIDNVQQVFTYIDQKKWSQAKDLALAINIKVLTKIVLS
QAFLDNKCSDNSFQEIIKFLQKNPDWPQNKLIAKRAEEYLNNHTNKKVIFDWFSTHPPLT
GKGYKFYAVAAISLVKDYKILLPIIKKAWVYGNFTPEEENIYYNKWSKYLTVNDHLERIE
EHLWLNDIKTAKRSLKYVDQGYRNSFKAQIAIISTAPNAEKLFKNVPEKYYTSGLLYRYL
DFKKMQKPTKEMIALFKKAKNNRKHFAKWCRLQSYYARAFIDYKDFANSYRMATMRFPAC
HKTIREQEWLAGWLSLSFLKKPDQALMHFNKFIKVVKTPISLARGFYWLGRTYEAKGDKQ
TARKFYEQASRYSFTFYGQVANIELNRTKLVLPNIPVITSEVRKTIENKEIIKAIRLFVK
YNKNHLAMIYSKEAIKNTRNQAEIQIIANIIKECNNTHYMVDVAKIAAQKHAFIPDCAFP
TPYNLTGLPISSSLTYGIIRQESVFDHKAISCSNAMGLMQLIKGTACDIAKSINMKCDVG
QLIKNPSYNIKLGSHHFKKLLDDHKGSYVLSIASYNAGSNNVMKWIEKFGDPRDIKDTRK
IIDWIELIPYKETRNYVQRVLENVQIYRVILNKNSNLYFKRDLHACTIVRN
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaaattatttattgctatattcttgttattagctttaaaaataaatgctaat
tctgattctatagataatgtacaacaagtttttacttatattgatcaaaaaaaatggtca
caagctaaagatttagctctagcaataaatattaaagttttaacaaaaattgtattgtcg
caagcatttttagataataaatgttcagataatagttttcaagagataataaagttttta
caaaagaatccagattggcctcaaaataagctgattgcaaaaagagcagaagaatatcta
aataatcatacgaataaaaaagtaatttttgattggtttagtacccatccgcctcttact
ggtaaaggttataaattttatgcagttgcagcaattagtttagttaaagattacaaaata
ttgttgcctattattaagaaagcttgggtatatggcaattttacgcctgaagaagaaaat
atatattacaataagtggagtaaatatttaacggtgaatgatcatttagagcggatagaa
gagcatttatggctaaatgatattaaaactgccaaacgatcactaaaatatgtagatcag
ggttatcgtaattcttttaaagcacaaattgctattatatctacagcgccaaatgctgaa
aagctttttaaaaatgttcctgaaaaatattatacttccggtttattatatcgttatcta
gattttaaaaaaatgcaaaaaccaacaaaggaaatgattgctttatttaagaaagctaaa
aataatcgtaaacattttgcaaaatggtgtcgtcttcagtcttattatgctcgtgcattc
atagattataaggattttgcgaatagttatagaatggcaacaatgcgattccctgcttgt
cacaaaaccataagagagcaggagtggttagccggatggctttctttaagctttttaaaa
aaacctgatcaagcattaatgcattttaataagtttattaaagttgttaagactcctatt
agtctagcacgaggattttattggcttgggcgtacttatgaagcaaaaggtgataagcaa
acggccagaaaattttacgagcaggcatccagatattcttttaccttttatggacaggta
gcaaatattgaattaaataggaccaagttagttttacctaatattcctgtaataacttct
gaagtaagaaaaactattgaaaataaagagattattaaagcaataaggttgtttgttaaa
tataataaaaatcatctagctatgatttattctaaagaagcaattaaaaatactagaaac
caagctgaaattcaaataattgcgaatattattaaggaatgtaataatacccattatatg
gttgatgtagcaaaaattgctgctcaaaagcatgcttttattccggattgtgcttttccc
actccgtataatttaactggtttgccaatttcatcctctttaacttatggaataattaga
caagaatcagtctttgatcataaggcaattagttgttcaaatgccatggggttaatgcaa
cttattaaaggtactgcttgtgatattgcaaaatctatcaatatgaaatgtgatgtaggg
cagcttattaaaaatccatcatataatattaaacttggttcacatcatttcaaaaaatta
ttagatgatcataaaggttcttatgttttatcaattgcttcttataatgccggaagtaat
aatgtaatgaaatggatagaaaagtttggtgatccaagggatataaaggatacaagaaaa
attattgactggatagaacttattccttataaagaaacacgaaattacgttcaaagagta
cttgaaaatgttcaaatttatagggtaattttaaataagaatagtaacttgtactttaag
cgtgacttacatgcttgcactatagtcagaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system