Rodentibacter pneumotropicus: NCTC8284_00410
Help
Entry
NCTC8284_00410 CDS
T05800
Name
(GenBank) Uncharacterised protein
Organism
rpne
Rodentibacter pneumotropicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MG2
Big_6
Inhibitor_I42
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEH65275
UniProt:
A0A448MJF7
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(262232..269593)
Genome browser
AA seq
2453 aa
AA seq
DB search
MSTTLKVLSAKKVIASHQINQGDTLVIDARDKSNYQLIDDQTGFGPQNIIAKREGKDLKI
FLEDGDMNPDVLIKGYYGDENSEEVTNLIVGQHENGGIYAYVPESGLKSDAVSMLAEEVA
APQALGGEELASAFWAFNPWWLLALVPLAAGIAIAASSGGSNGDSNNGNADNTADKPTLD
AKSDGSVTVAPGADNTKVVVKYTDESGNKKAATLTKDANGNWSSDNPDVTPNANGTFSIP
ANKVKDGSKVTATGTDDKGNTANVDATAANNPTTSRVPGDVDGNGNADANDNDATTENGG
PKVSVPEAADGVNKTEASDGVQVNVTLPKNTKAGDTVTVTVTKPDGSTVTVDHVVTDADE
TAGKAAVTIPTTEITADGDYKVVAKVTTPDGQESKPSAEVPFTFDQTPPATPDVQAPADG
SITVEPKDENPVTIKYTDENGNEKEFTVKKDDNGNWVSDDKPANVSIDSNTGKTTIPATE
VKDGEKVTATAKDPAGNTAEKTADAGNNPTTPRVPGDVDGDGDADANDNDATTENGGPKV
SVPEAADGVNKTEASDGVQVNVTLPKNTKAGDTVTLTVTKPDGSTVTVDHVVTDADETAG
KAAVTIPTTEITADGDYKVVAKVTTPDGQESKPSAEVPFTFDQTPPATPDVQAPADGSMT
VEPKDENPVTIKYTDENGNEKEFTVKKDDNDNWVSDDKPANVSIDPNTGKTTIPATEVKD
GEKVTATAKDPAGNTAEKTADAGNNPTTPRIPGDVDGDGDADADDNDATTEKGGPKVTIP
EAENSVNAEEAKDGVQVDVTLPKNTKEGDTVKLSVIKPNGQQFEIDYTVNKADETSNKAT
VTIPALDVGIDGNYDVAARVVTPDGQESRVSDSVPFTVDNGADQPTITSANNDGKVIVEP
GEDNNKVEIKFKDEDGNDKTVVAEKGADGNWTVTADDGTGATIENGKVLIPSDKVKDGEP
VNATGTDASGNTADADTVNAGTNPTVNNTADKPLITPENDGSVTVKPGDDNVGVVVDFKD
EKNQPQQVSAKKDDNGKWIISNNSGVDGAEVDPDTGIITIPAEALKDNEPVNAVGFDEIF
NRANADPKNAGTDPKNAGVDNTNGDGVVSAPVSADEGTSIVTTVKLNNNNGNEKLPFSLP
SGTGNGQLTADDFEQPTFSNGVTLNSDGTLNIPAGVKEFTITTPVKADNTTEGEEKGKFT
VGGVEGNEVTVNDTSATPADPADKPTITSPDNDGKVTVEPGADNNKVEVTFKDEDGNDKT
VVAEKGQDGNWTITNDDGTGATIEGGKVVIPADKVKDGEPVNAKGTNDAGNSENADAVNA
GTDPKDAGVDNTNGDGVVSAPVSADEGTSIVTTVKLNNNNGNEKLPFSLPSGTGNGQLTA
DDFEQPTFSNGVTLNSDGTLNIPAGVKEFTITTPVKADNTTEGEEKGKFTVGGVEGNEVT
VNDTSATPADPADKPTITSPDNDGKVTVEPGADNNKVEVTFKDEDGNDKTVVAEKGQDGN
WTITNDDGTGATIEGGKVVIPADKVKDGEPVNAKGTNDAGNSENADAVNAGTDPKDAGVD
NTNGDGVVSAPVSADEGTNIVTTVKLNNNNGNEKLPFSLPSGTGNGQLTADDFEQPTFSN
GVTLNSDGTLNIPAGVKEFTITTPVKADNTTEGEEKGKFTVGGVESNEVTVNDTSKQDEQ
PKIDINNIAGQAQVAEGTEGYAQFLPSNIATEEISNTTENGVTKVVKGFVVKGTTTSIPA
DSEVDVTITANGENYFTGKAKVGADGAWEIKVPTSTVTTTVTGSGEDEVTEVVTEFNNPK
FDVSYDVTAKVTVNGQEITDTDKTESAPVVTDIYLQDNLTDDAQNVADFYTDNGEYVGRI
DGMADSDATKAISRQTGLTNDPSAELHFTLDKEPKAGQVVKVLRYTIVDGNEGRVEDLTD
QMTNNGLNYTVKPTTPQAETTNTLYRYKVVVEDQNGTDLSEKVFNYRLDTIVESMDVKEL
NSDTNTMVLKADGVSEIGATIKYKYHTGSGESALKDAVDNGDGTYTIDLANWNRKVPQSI
TLQVIDAAGNVSETKINAVRNLFTSYTAEEGPDPNGTRFDRQLVTGFAQSSTRAENGAFV
STDGNDTLIVGLDNFGGMGVSNGSVGRNINVGSKIHIEMGKGDDHIQVRGSVQSMGSATD
GYFDMGEGNDKLTFAETFVVGNYNIRMGEGNNTINFSGTTVQAAGLDISYGDGNDVLRAD
VNKDFAGTKTISFGNGDNYMEVGSMYDKNTITFGNGNDVFIAKSVGTKAPSSGVIDMGDG
NDTFSVSGLFARQEAKLGAGDDVAIMGDRIETGAAWARLDGGDGNDTLVLTKSDGKVSLQ
NVLNFEVIDLTTPTAQTIGISNSYITQANDTTKAIYIKGGTNDTVDFGDNGKYINGTKFK
DGGGAIKSNWNFWEKTESDVVHDGITYDKYTYRTASGEVNDEAIYIQQGVQII
NT seq
7362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgactacattaaaagtattaagtgcaaagaaagtaattgcatctcaccaaattaat
caaggtgatacattagtcattgatgcaagagataaatctaactatcaattaattgacgat
caaacaggttttggtccacaaaatattattgctaaacgtgaagggaaagatttaaaaatc
ttcttagaagatggtgatatgaatccggatgtgctaattaaaggctactacggtgatgaa
aattctgaagaagtaaccaatttaatcgttgggcaacacgaaaacggcggtatctatgct
tatgtgccggaatccggcttaaaatcggatgcggttagtatgttagcggaagaggtggct
gcaccacaagccttaggcggcgaagagctagcgagtgccttctgggcgtttaacccttgg
tggttattagcgttagttccgttagcagcaggtattgcgatcgcagcaagtagtggcgga
agcaacggtgacagtaataatggtaatgccgataacacagcggataaaccaacattagat
gccaaatcagacggttctgtaacggtagcaccaggtgcagacaacaccaaagttgtggtg
aaatataccgatgaaagtggtaataaaaaagcagcaaccttgacgaaagatgcaaatggt
aactggtcatcagataatccggatgtaaccccgaatgcaaacggaacatttagcatcccg
gcgaataaagttaaagacggttctaaagtaacggctaccggtacagatgataaaggcaat
accgctaatgtagatgcaacagcagctaataatccaactacgtcacgcgtaccaggcgat
gttgatggcaatggcaatgcagatgcgaatgacaatgatgcgactactgagaacggaggt
ccaaaagtcagcgttcctgaagcagcagatggtgtaaacaaaacagaagcgtctgacggc
gtacaagtgaatgtcactttaccgaaaaacaccaaagcaggtgatacagtaacagtaacg
gttacgaaaccggatggctccacagtaacagtcgatcacgttgtaaccgatgcggatgaa
actgccggtaaagcagctgtaacgattccaacaacagagataaccgcagacggtgattac
aaagtggtagcaaaagtgacgacaccggacggtcaagaaagtaaaccaagtgcggaagta
ccgtttacctttgaccaaaccccaccggcaaccccggatgttcaagcaccagccgatggt
tcaataaccgttgaaccgaaagatgaaaatccggtaactattaaatacacggatgaaaac
ggtaacgaaaaagaatttaccgtgaaaaaagacgataacggcaactgggtatcagacgat
aaaccggcgaacgtttcgattgactcaaacacaggtaaaacaacaatccctgcaacggaa
gtaaaagacggcgaaaaagtcactgcaacagcgaaagatccggcaggtaatactgcggag
aaaactgctgatgcaggtaacaacccaaccacgccacgcgtaccgggtgatgtggatggc
gacggtgatgcagatgcgaatgacaatgatgcgactactgagaacggaggtccaaaagtc
agcgttcctgaagcagcagatggtgtaaacaaaacagaagcgtctgacggcgtacaagtg
aatgtcactttaccgaaaaacaccaaagcaggtgatacagtaacattaacggttacgaaa
ccggatggctccacagtaacagtcgatcacgttgtaaccgatgcggatgaaactgccggt
aaagcagctgtaacgattccaacaacagagataaccgcagacggtgattacaaagtggta
gcaaaagtgacaactccggacggtcaagaaagtaaaccaagtgcggaagtaccgtttacc
tttgaccaaaccccaccggcaaccccggatgttcaagcaccagccgatggttcaatgacc
gttgaaccgaaagatgaaaatccggtaactattaaatacacggatgaaaacggtaacgaa
aaagaatttaccgtgaaaaaagacgataacgacaactgggtatcagatgataaaccggcg
aacgtttcgattgacccaaacacaggtaaaacaacaatccctgcaacggaagtaaaagac
ggcgaaaaagtcactgcaacagcgaaagatccggcaggtaatactgcagagaaaactgct
gatgcaggtaacaacccgaccacgccacgcataccgggtgatgttgacggtgacggcgat
gcggatgcggatgacaatgacgcaaccaccgaaaaagggggaccaaaagttaccattcca
gaagcagaaaatagtgtcaatgcagaagaagcgaaagatggtgtccaagttgacgtaact
ttaccgaaaaacactaaggaaggggacactgtaaaattaagcgtaattaaaccgaatgga
caacagtttgaaattgattataccgttaataaagcagatgagacttccaataaagcaaca
gtaactattccagcattagacgtagggatagatggtaattacgatgtagctgcaagagta
gttactccagacggacaggaaagccgtgttagtgatagtgtaccgtttaccgtggataat
ggagctgatcagccaactattacttcagcaaacaatgacggaaaagttatagttgaaccg
ggtgaagacaacaacaaagttgaaattaaattcaaagatgaagacggtaacgataaaact
gttgtagcagaaaaaggagctgatggtaactggactgtcactgctgacgatggcacaggc
gcgactattgaaaatggtaaagtgctcattccatcagataaagtgaaagacggagaaccg
gtgaatgcaacaggtacggatgcctctggtaatacagcagatgctgatacggtaaatgcg
ggaactaacccaaccgttaataatactgctgacaaaccgcttattacgcctgaaaatgat
ggttctgtgactgtaaaaccgggtgatgataatgtcggagtagtcgttgatttcaaggat
gaaaaaaaccaacctcaacaggtgtctgcaaaaaaagacgataacggtaagtggattatt
tcgaataattcaggtgttgatggtgcggaagttgatccggatacaggtattattactatc
ccagcagaagcattaaaagataatgaaccggtcaatgctgtaggtttcgacgaaattttc
aatcgggccaatgcggatcctaagaatgcaggcacagatccgaaaaatgccggagttgat
aatacaaatggcgatggcgtggtatctgcaccggtttctgctgatgaaggcacaagcatt
gttactacggttaaattaaacaacaacaatggtaacgagaaactgccattcagcttaccg
agcggtacaggtaatggtcaattgaccgcagatgatttcgagcaaccaacattcagcaat
ggtgtgactttaaattcggatggtacgttaaatataccggcaggcgtaaaagaatttact
atcacgacaccggtgaaagcggataacacaaccgaaggagaagaaaaaggtaaattcact
gtagggggtgttgaaggtaatgaggtaactgttaacgatacatcagcgactccggcagat
cctgccgataaaccaaccatcacttcaccggataacgatggcaaagttacagttgaaccg
ggtgcagacaacaacaaagttgaagtaaccttcaaagacgaagacggcaacgataaaacc
gttgttgcagaaaaaggtcaggatggtaactggactatcaccaatgatgatggcacaggt
gcaaccattgaaggtggtaaagttgtcatccctgccgataaagtgaaagacggtgagcct
gttaatgcaaaaggtactaatgacgcaggtaacagtgaaaatgcagatgcggtaaacgcg
ggtacggatccaaaagatgccggagttgataatacaaatggcgatggcgtggtatctgca
ccggtttctgctgatgaaggcacaagcattgttactacggttaaattaaacaacaacaat
ggtaacgagaaactgccattcagcttaccgagcggtacaggtaatggtcaattgaccgca
gatgatttcgagcaaccaacattcagcaatggtgtaactttaaattcggatggtacgtta
aatataccggcaggcgtaaaagaatttactatcacgacaccggtgaaagcggataacaca
accgaaggagaagaaaaaggtaaattcactgtagggggtgttgaaggtaatgaagtaact
gttaacgatacatcagcgactccggcagatcctgccgataaaccaaccatcacttcaccg
gataacgatggcaaagttacagttgaaccgggtgcagacaacaacaaagttgaagtaacc
ttcaaagacgaagacggcaacgataaaaccgttgttgcagaaaaaggtcaggatggtaac
tggactatcaccaatgatgatggcacaggtgcaaccattgaaggtggtaaagttgtcatc
cctgccgataaagtgaaagacggtgagcctgttaatgcaaaaggtactaatgacgcaggt
aacagtgaaaatgcagatgcggtaaacgcgggtacggatccaaaagatgccggagttgat
aatacaaatggcgatggcgtggtatctgcaccggtttctgctgatgaaggcacaaacatt
gttactacggttaaattaaacaacaacaatggtaacgagaaactgccattcagcttaccg
agcggtacaggtaatggtcaattgaccgcagatgatttcgagcaaccaacattcagcaat
ggtgtgactttaaattcggatggtacgttaaatataccggcaggcgtaaaagaatttact
atcacgacaccggtgaaagcggataacacaaccgaaggagaagaaaaaggtaaattcact
gtagggggtgttgaaagtaatgaggtaactgttaacgatacatctaaacaagatgaacaa
ccgaaaatcgatattaataacatagcgggtcaagctcaagtagctgagggtactgaaggt
tatgctcaattcttgccatcaaatatcgcaactgaagagataagtaatacaaccgaaaat
ggtgtaacaaaagttgttaaaggttttgttgtaaaaggtacaacaactagtattccagct
gattcagaggtcgatgttacgattaccgctaatggagaaaattatttcaccggtaaggct
aaagtaggtgctgatggtgcttgggaaatcaaagttccgacaagtacagtaacgacaaca
gtaacaggctctggcgaagatgaagttacagaggtagtgacagaattcaataatcctaaa
ttcgatgtttcttatgatgttactgcgaaagttactgttaatggtcaagaaattaccgat
acggataaaactgaaagtgcacctgttgtgactgatatttatcttcaagataatttgacg
gatgatgcacaaaatgtagctgatttctatacagataatggcgaatatgtgggtcgtatt
gatggtatggcagattctgatgcaactaaagcgattagccgccaaacaggtttaaccaac
gatccaagtgcagaattacactttacattggataaagaacctaaagcgggtcaagttgtt
aaggtgttacgttatacaattgttgatggtaatgaaggacgtgttgaagatttaacggat
caaatgacaaataatggtcttaattacactgttaaaccgaccacaccacaagcggaaaca
acaaatacactttatcgttacaaagtagttgttgaagatcaaaatggtactgatttatct
gaaaaagtctttaactatcgcttagataccattgttgagtcaatggatgttaaagagtta
aattctgataccaataccatggttcttaaagcagatggagtttcagaaattggcgcgacc
attaaatataaatatcatacaggtagtggagaaagcgcgcttaaagatgctgttgataat
ggtgatggcacttatacgattgatttagcaaactggaatcgtaaggtccctcaaagtatt
actcttcaagtaattgatgcggcaggtaatgtttccgaaacgaaaattaatgcagtgaga
aacttgtttactagttatacagctgaagagggacctgatccaaatggtactcgatttgat
agacagttagttaccggttttgcccaatcttctaccagagctgaaaatggcgcatttgtt
tctacagatggcaatgacaccttaattgtcggtttagataatttcggcggtatgggggtg
agcaatggctctgtaggtcgtaacatcaatgttggttcgaaaattcatattgaaatgggc
aaaggtgatgatcatatccaagttcgagggtctgtccaatctatggggtctgctaccgat
ggttattttgatatgggagaaggtaacgataagctgacttttgctgaaacatttgttgtt
ggtaactacaacatcagaatgggtgaaggtaataacactattaactttagtggcactact
gtacaagcagcaggtttagatattagttacggtgatggtaatgatgtgttacgtgccgat
gtcaacaaagatttcgccggaactaaaactatcagctttggtaatggcgataactatatg
gaagttggctctatgtatgataagaatacgattacctttggtaacggtaacgatgtattt
attgctaaatctgtaggtacaaaagcaccttcaagtggtgtcattgatatgggcgatggt
aatgatactttctctgtgagtggattatttgcacgacaagaagctaagttaggtgctgga
gatgatgtagccattatgggtgatcgtatcgaaaccggtgcagcttgggcaagactcgac
ggtggtgatggtaatgatactttagtcttaaccaaatcagatggtaaagtaagcttgcaa
aatgtattgaattttgaggtgattgatttaaccacaccaacggctcaaactatcggcatt
agcaatagttatattactcaagctaatgacaccacaaaagctatctacattaaaggtggt
acaaatgataccgtggacttcggtgataacggtaaatatattaatggtaccaaatttaaa
gatggcggtggtgctattaaatctaactggaatttctgggaaaaaaccgaatccgatgta
gttcacgatggtattacttatgacaaatatacttatcgtaccgcaagcggtgaggtaaat
gatgaggctatctatatccaacaaggagtccaaatcatctaa
DBGET
integrated database retrieval system