Candidatus Rhabdochlamydia porcellionis: RHAB15C_0000820
Help
Entry
RHAB15C_0000820 CDS
T07448
Name
(GenBank) Vitamin B12 import ATP-binding protein BtuD
Organism
rpor
Candidatus Rhabdochlamydia porcellionis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
DEAD
AAA_22
ABC_ATPase
RsgA_GTPase
AAA_29
MMR_HSR1
AAA_23
AAA_16
ATP-synt_I
DUF87
AAA_30
AAA_25
Rad17
Zeta_toxin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QZA58939
LinkDB
All DBs
Position
complement(926927..928846)
Genome browser
AA seq
639 aa
AA seq
DB search
MKLLLDAALRSRRHLYLFIITFFTLLCLTISSQMEMFALGVLSNNGADFFTLFSRENSQD
VVSLKEVQEKWDLIDKNYTGLITKQQAISFIAQKSEGNPLSWMLAKVKQKFRLSHNIKAL
VLVLISVAIFKAIWLFASRYTTQLLAIRVSRDLRQQYFEHIQSLPMSFYQQHNIGSLSAR
VVGDAGQIATSINSWLTNYLQTPFTIITCLSMCFYLSWRLSLVIFFGVPLIIIPIVFLAR
RVKRASRQLQKNQESFANILIEFLAGIQTVKIFSMEGFSLRKYKEQNERMAILESKTAKY
GLLTRPILHAITTLCLACVVLFGLYTIGMSLSQLIVFCGMLQLVYEPVKKFADENGNIQR
GIVAAERMFEVLHIKPDIQDHPDATELTGFFDSIEFDKVWFRYQGDWILKNISFTVRKGE
TIAIIGPTGAGKSTIVQLMPRLYDIQQGEVRIDGRSLKTYTQKSLREHIAFVSQKPFLFC
DTISANIAFGRPFTNQEIEEAAKKAHAEEFIIHLPNQYQSILAESGQNLSGGQQQRLAIA
RALVKKAPILILDEATSSLDSISEMHIKDAIISLKGEITQIIIAHRLSTIEHADKIIYLS
QGAKIAEGTKEQLLENCPEFRRMWEVHYNLKKTPEKSLS
NT seq
1920 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactacttttagatgctgctctaagaagtcgtcgccatctatatttatttatcatc
actttctttacactgctttgtctaacgatttctagtcaaatggagatgtttgctctaggt
gtattatcaaataatggagcagatttttttactttattttccagagaaaacagtcaagat
gtagtttctttaaaagaagtgcaagaaaaatgggatttaatcgacaagaattatacagga
ctgatcacaaaacaacaagcaatctcttttattgcacaaaaaagcgaaggtaatccatta
agttggatgcttgctaaagtgaaacaaaaattccgtctttctcataatattaaagcttta
gtcctagttctgatttctgttgctatttttaaagcaatttggctttttgcaagtcgttat
accacacaattacttgctattcgtgttagtcgggatctacgtcagcagtactttgagcat
attcaatccttaccgatgagtttttatcagcagcataatattggtagtctttctgcccgt
gttgttggtgatgcaggacaaatagctacttctattaattcttggttaactaattatctg
caaacgccttttaccattattacttgtttatctatgtgcttttatctctcttggcgttta
tctcttgtcatcttttttggagtacctttaattatcattcccattgtatttttagcccgt
agagttaaaagagcttctcgccaactacaaaaaaatcaagagagttttgccaatatatta
atcgaatttttagctggtatacagacggttaagattttttctatggaaggtttttctttg
agaaagtataaagaacaaaatgaacgtatggctattttagaaagtaaaacagctaaatat
ggccttttgactcgtcctatcttacatgcaattaccactttgtgtttagcttgtgttgtt
ttatttggtctttatacaattggaatgagcttatcgcaactaattgtattctgtgggatg
cttcagctcgtgtatgaacctgttaagaaatttgctgatgaaaatggaaatatccagcgc
ggtattgtagctgctgagaggatgtttgaagtattacacattaagcccgatattcaagat
cacccagatgcaactgaacttaccggattttttgattcgatagaatttgataaggtatgg
tttcgctatcaaggggattggattttaaaaaacatctcctttaccgttcgcaaaggggag
acaatagctattattggccccacgggagctggtaaatcaacgattgtacaattaatgcct
cgtctttacgacattcaacaaggagaggttcgtattgatggaagatccttaaagacctat
acgcaaaaatccttacgtgagcatattgcttttgtttctcaaaaaccttttttattttgt
gatacaattagtgctaatattgcctttggacgtccttttactaaccaagagattgaagaa
gcagctaaaaaagcgcatgctgaagagtttattatacatttacctaatcaatatcaatca
atacttgcagaatcaggacaaaacctttccggaggacagcaacagcgcctagctattgca
agagctcttgttaaaaaagcgcctattcttattttagatgaagcaacatcttcgcttgat
tccattagcgaaatgcatattaaagatgcgattatcagcttaaagggagagattacccag
attatcattgcacaccgtctttctacaattgaacatgcagataagatcatttatctttcc
caaggagctaaaattgctgaaggaactaaagaacagttattagagaattgtcctgagttc
cgaagaatgtgggaggttcattataatctaaaaaaaactccagagaaatctttatcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system