Rickettsia prowazekii Madrid E: RP776
Help
Entry
RP776 CDS
T00018
Symbol
RP776
Name
(GenBank) DNA POLYMERASE I (polA)
Organism
rpr
Rickettsia prowazekii Madrid E
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
HHH_5
HHH_2
HTH_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAA15203
UniProt:
O05949
LinkDB
All DBs
Position
967183..969786
Genome browser
AA seq
867 aa
AA seq
DB search
MTKKNTLLLIDGYGFVFRAYYAQKSLSSAKGEPVGALYGFTSMLLKLLSDFKPQYVAIVF
DSGGKNFRHKIYQNYKANRPLPPKDLIAQLPLVRDVASNFKFAILEKNGYEADDIIATFA
TKTVSLGEEVIIISSDKDLLQLMSKNIKIYDPIKCKYITEDNVVTKFGTTPDKLREVMAL
IGDRSDNIPGVPSIGPKTASSLITKFGSVENIFNSLDQISSIKQRKTLQNAREAALISWK
LIGLDSNVDLDFDLNNLKWSPPNSKKLTGFLQEYGFKSLYKRVENLFDIKINDHEEIVDN
KVTEAKEISNASELANFAKEAERIGIFGIYLLQQKGENRALILSLQNQSYIIKITNNNYN
IKNNNDWFSHIILNLLTNKSIKKITYSLKHLLKFYANQSHQITAIEDLELMQYALSAGLV
QKNLFTKTLTKDNIINESARIVINFISLYKQTLLELQKNKAFRLYREIDLPTCFILDKME
KVGIKVDANYLNRLSDEFGTEILKIEEEIFALSGTKFNIGSQKQLGEILFKKMQLPSGNT
LAKTSSYSTRAGILKKLSEDGYHIATLLLRWRQLTKLKNTYTDSLPKQINNITKRIHTTF
LQTSTTTGRLSSQEPNLQNVPIRSSDGNKIREAFIAEEGYKLISADYSQIELRILSHIAN
IDVLKQAFINKEDIHTQTACQIFNLKKHELTSEHRRKAKAINFGIIYGISAFGLAKQLNV
SNSTASEYIKQYFAEYKGVQEYMTQTKACASRNGYVTNFFGRKCFIPLIHDKKLKQFAER
AAINAPIQGTNADIIKIAMIKLDKEIEERKLKTRLILQIHDELLFEVPEIEVEIVIPIIK
KIMEHSTNMNVPIITEIKAGNNWKEIH
NT seq
2604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaaaaaaaataccttattgcttatagacggatacggattcgtttttagagcatat
tatgcacaaaagtctttaagttcagcaaaaggtgaacctgttggagctctttatggtttc
acctcaatgctactaaaattactgagcgactttaagcctcaatatgttgcgatagtgttt
gacagcggcggcaaaaattttcgccataagatttatcaaaattataaagctaatcgcccc
ctacctcctaaggatttaattgcacaattacctttagttcgtgatgttgcaagtaacttt
aaatttgctattctagaaaaaaacggttatgaagccgatgatattattgcaacctttgct
actaaaacagtttcacttggtgaagaggtaataattatctcgtcagataaagatttatta
cagttaatgagtaaaaatatcaaaatatatgatcctataaaatgtaaatatattacagag
gataatgttgttacaaaatttggtactactcctgataaattacgtgaagttatggcttta
atcggtgatagatcagataatattccaggtgtcccatctattggaccaaaaacggcaagt
agtcttataacaaaatttggttctgtagaaaatatatttaactctttagaccaaatctca
agcataaaacaacgtaaaactttacaaaatgcaagagaagctgcattaatttcatggaag
ttaattggtcttgattctaatgttgatctagattttgatctgaataatttaaaatggtca
cctccaaatagtaaaaaattaacaggatttttacaagaatatggttttaaatctttatac
aaaagagtagaaaatttattcgatattaaaattaatgatcatgaagagatagtagataat
aaagtaactgaagcaaaagaaattagtaatgctagtgaattagcaaattttgctaaagaa
gctgagagaatagggatatttggaatatatttactacagcagaaaggagagaatcgtgca
ttgattctatcactgcaaaaccaaagctatattattaaaattacaaacaataattataat
attaaaaataataacgattggttttcgcatataatcttaaatttactaacaaataaatcc
attaaaaaaattacttactctctgaaacatttattaaagttttatgcaaaccaatctcat
caaattacagctatagaagatttggaactaatgcaatatgcgttatcggcaggtttagta
cagaaaaatctatttacaaaaactttaacaaaggacaatataattaatgaatcagcaaga
atagtaataaactttatctcactttataaacaaactttattggaacttcaaaagaataaa
gcttttagactatatcgtgaaattgacttacctacctgttttattttagacaaaatggaa
aaagtaggtattaaagtagatgctaattacttaaatcgcttatctgatgaatttggaaca
gaaattctaaaaattgaagaagaaatttttgcgcttagcggaactaaatttaatatcggt
tcacaaaaacaactaggtgagattttatttaaaaaaatgcaattaccttccggtaacact
ttagctaaaacaagctcttactcaacaagagctggaatactcaaaaaacttagtgaagat
ggatatcatatcgccactttattactaagatggaggcaactgacaaaattaaaaaatact
tatactgatagtttaccaaaacaaataaataatataactaagcggatacatacaacattt
ttacaaacttctaccactacaggaagacttagctcacaagaacctaatctgcaaaacgtc
cctattcgatctagtgatggcaataaaatcagagaagcctttattgcagaagagggttat
aaattaatatctgccgattattctcaaattgagctcagaatattaagccatattgcaaat
atagatgtactaaaacaagcatttattaataaagaggatattcatactcaaaccgcttgt
cagatttttaatttaaaaaaacatgaactgactagcgaacatagacgtaaagcaaaggca
ataaattttggtattatttatggtatcagtgcttttggccttgctaagcaattaaacgtt
agtaacagtacagcatccgaatatattaaacaatattttgctgaatataaaggagtgcaa
gaatatatgacgcaaacaaaagcttgcgcaagtagaaatggctatgtcaccaatttcttt
ggcaggaaatgttttatacctctaattcatgataaaaagctaaaacaatttgcagagcgt
gcagctattaatgctccaattcaaggaactaatgccgatataattaaaattgctatgatc
aagctagacaaagaaatagaagagcgcaaactaaaaacaagactaatactacaaattcat
gatgaattattattcgaagttccagagattgaagtagaaatcgtaattcctattattaaa
aaaatcatggaacattctactaatatgaatgtaccgattataaccgaaattaaagcaggt
aataactggaaagaaatacactaa
DBGET
integrated database retrieval system