Rickettsia rickettsii Colombia: RPL_06075
Help
Entry
RPL_06075 CDS
T01722
Name
(GenBank) outer membrane protein B (cell surface antigen sca5)
Organism
rrc
Rickettsia rickettsii Colombia
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
rOmpB_passenger
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB24012
LinkDB
All DBs
Position
complement(1014196..1019160)
Genome browser
AA seq
1654 aa
AA seq
DB search
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVASFAGSAMGAAIQQNRTTNGAATTVDGAGFDQTAA
PANVGVALNAVITANANNGINFNTPAGSFNGLLLNTANNLAVTVSEDTTLGFITNVVHNA
HSFNLTLNAGKTLTITGQGVTNAQAAATKNAQNVVVQFNNGAAIDNNDLKGVGRIDFGAP
ASTLVFNLANPTTQKAPLILGDNAVIANGVNGTLNVTNGFIQVSNKSFATVKAINIADGQ
GIIFNTDANNANTLNLQAGGTTINFTGTDGTGRLVLLSKHAAATNFNITGSLGGNLKGVI
EFNTVAVDGQLTANAGAANAVIGTNNGAGRAAGFVVSVDNGKVATIDGQVYAKDMVIQSA
NATGQVNFRHIVDVGADGTTAFKTAASKVTITQDSNFGNTDFGNLAAQIKVPNAITLTGN
FTGDASNPGNTAGVITFDANGTLESASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELR
LGNAGSIFKLADGTVINGKVNQTALVGGALAAGTITLDGSATITGDIGNAGGAAALQRIT
LANDAKKTLTLGGANIIGAGGGTIDLQANGGTIKLTSTQNNIVVDFDLAIATDQTGVVDA
SSLTNAQTLTINGKIGTIGANNKTLGQFNIGSSKTVLSNGNVAINELVIGNDGAVQFAHD
TYLITRTTNAAGQGKIIFNPVVNNGTTLAAGTNLGSATNPLAEINFGSKGVNVDTVLNVG
EGVNLYATNITTTDANVGSFVFNAGGTNIVSGTVGGQQGNKFNTVALENGTTVKFLGNAT
FNGNTTIAANSTLQIGGNYTADCVASADGTGIVEFVNTGPITVTLNKQAAPVNALKQITV
SGPGNVVINEIGNAGNHHGAVTDTIAFENSSLGAVVFLPRGIPFNDAGNTMPLTIKSTVG
NKTAKGFDVPSVVVLGVDSVIADGQVIGDQNNIVDLGLGSDNGIIVNATTLYAGISTLNN
NQGTVTLSGGVPNTPGTVYGLGTGIGASKFKQVTFTTDYNNLGNIIATNATINDGVTVTT
GGIAGIGFDGKITLGSVNGNGNVRFADGILSNSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIGD
SGTPVASVRFTGSDSGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGIVNSNIILGGGTTAINGKIDLVTN
TLTFASGTSTWGNNTSIETTLTLANGNIGHIVILEGAQVNTTTTGTTTIKVQDNANANFS
GTQTYTLIQGGARFNGTLGSPNFAVTGSNRFVNYSLIRAANQDYVITRTNNAENVVTNDI
ANSPFGGAPGVDQNVTTFVNATNTAAYNNLLLAKNSANSANFVGAIVTDTSAAITNVQLD
LAKDIQAQLGNRLGALRYLGTPETAEMAGPEAGAISAAVAAGDEAIDNVAYGIWAKPFYT
DAHQSKKGGLAGYKAKTTGVVIGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDVNG
FSFSLYGAQQLVKNFFAQGSAIFSLNQVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGN
LTVGYDYNAMQGVLVTPMAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKVA
GSTMNITDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTPCINQPDRTTKTSYNLGLSAS
IRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq
4965 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttccgcagggttggtaactgcttct
acagctaccatagtagccagttttgcaggttcagctatgggtgctgctatacagcagaat
agaacaacaaacggcgctgctacaactgttgatggtgcgggatttgaccaaactgccgct
cctgcaaatgttggagttgctctaaatgcagttattactgctaatgctaataatggtatt
aatttcaatactccagccggtagttttaacggtttgttgttaaatactgcaaacaattta
gcagtgacagtgagtgaagatactaccttagggttcatcactaatgttgttcataacgct
cactcctttaaccttacgcttaatgccggtaaaactcttactataacaggtcaaggtgtt
actaatgcacaagctgctgctacaaaaaatgctcaaaatgttgttgtacaatttaataat
ggtgctgctattgacaataatgatcttaaaggtgtaggaagaatagacttcggtgctccg
gcttctacattagtatttaatttagcaaatcctacaactcaaaaagctcctcttatactt
ggagataatgctgtaatagctaatggtgttaacggtacattaaatgttactaatggattt
attcaagtttcaaataaaagttttgctactgttaaggcaattaatatcgctgacggtcaa
ggtatcatattcaatactgatgctaataatgctaatactttaaatttacaagcaggtggt
actactattaattttactggaacagacggtacgggtagattagtattattaagtaagcat
gctgctgctaccaactttaacattacaggaagtttaggcggtaatctaaaaggtgttatc
gaatttaacactgttgcagtagacggtcaacttacagctaatgcaggcgctgctaatgca
gtaataggtactaataatggcgcaggtagagctgcaggatttgttgttagcgtagataat
ggtaaggtagcaacaatcgatggacaagtttatgctaaagacatggttatacaaagtgct
aatgcaactgggcaagtaaattttagacacatagttgatgttggtgcagacggtactact
gcctttaaaacagcagcttctaaagttacaataacccaagactcaaactttggtaatact
gattttggtaatcttgcagcacagattaaagttcctaatgctataacccttaccggtaat
tttacaggtgatgctagcaatcccggtaacactgcaggtgtgataacttttgatgctaac
ggtactttagaaagtgctagtgcagatgcaaatgttgcggtgacaaataatattacagca
attgaagcatcaggtgccggagttgtccaattatcaggaacacatgctgccgagttacgt
ttaggaaatgccggttctatctttaaacttgctgacggtacagttataaacggtaaagtt
aaccaaactgctcttgtcggcggtgctcttgcagccggtactattaccttagacggtagt
gctacaattaccggcgatatagggaacgctggcggtgctgctgcgttacaacgcattact
ttagctaacgatgctaaaaaaacattaacacttggtggggcaaatattatcggtgctggt
ggtggaacgattgatttgcaagctaacggtggtactattaaattaacaagcactcaaaat
aatattgtagttgattttgatttagctatagctactgatcaaacaggcgttgttgatgcg
agtagcctaacaaatgctcaaactttaactattaacggtaaaatcggtactattggagct
aataataaaactcttggacaatttaatattggctcaagtaaaacagttttaagtaacggt
aatgttgctattaacgagttagttattggaaatgacggtgcagtacaattcgctcatgat
acttatttaataacaagaactacaaatgctgccggtcaaggtaaaataatatttaatcct
gttgtcaataatggtacaactcttgcagccggtacaaatttaggtagtgctacaaatcca
cttgcagaaattaattttggatctaaaggggttaatgttgatactgtattaaatgttggt
gaaggtgtaaatttatatgctactaatattactactaccgatgctaacgtaggttctttc
gtctttaatgccggtggaacaaatatagtaagcggtacagtcggtggacagcaaggtaat
aagtttaatactgtagcattagagaacggtactactgttaagttcttaggtaatgcaaca
tttaacggtaacactacaattgcagctaattctaccttacaaatcggtggtaactatact
gcagactgtgttgcatctgccgatggtaccggtatagtagaattcgttaacaccggtcct
attaccgtaacattaaacaaacaagctgcacctgttaatgctttaaaacaaataacggtt
tctggtcccggtaacgtagtgattaatgagataggtaatgcaggtaatcatcatggtgcc
gtgactgatacgattgcttttgaaaattcaagtttaggtgcagttgtattcttacctaga
ggcattccattcaatgatgcaggcaacacaatgcctttaacaattaaaagtaccgtaggt
aataaaacagctaaaggttttgatgttcctagcgtggttgttttaggtgttgatagtgtc
atcgctgacggtcaagtaatcggtgatcaaaataatatcgtagatctaggtcttggaagc
gataacggcataatcgttaatgctactacattatatgcaggtatcagtactctaaacaat
aatcaaggtactgtcacacttagcggtggtgttcctaatacccctggtacagtttatggc
ttaggcacaggtattggcgcttcaaagttcaagcaagtaacgtttactacagactataac
aacttaggtaatattattgcaactaacgcaacaattaatgacggtgtaactgttactaca
ggcggtatagccggaataggttttgacggtaaaattactcttggaagtgttaacggtaac
ggtaatgtaagatttgctgacggtatattgtctaattctacaagtatgattggtactact
aaagctaataatggtactgtaacttatttaggtaatgcattcgtcggtaatataggtgat
tcaggtactcctgtagcttctgttagatttacaggtagtgatagtggtgcaggattacaa
ggaaatatttattcacaagtcatagactttggtacttataacttaggtattgtaaattct
aatataattttaggcggcggtactactgctattaacggtaaaatcgatcttgttacaaat
actttaacatttgcaagtggtacttcaacatggggaaacaatacttctattgaaactact
ttaacattagcaaacggtaatataggtcacatcgttatcttggaaggtgcgcaagttaat
acaacaaccacaggaactacaaccattaaagtacaagataatgccaatgcaaatttcagt
ggtacacaaacttatactttaatccaaggtggtgctagatttaacggtactttaggaagt
cccaactttgctgtaaccggaagtaatcgtttcgtaaattacagtttaatacgtgctgct
aaccaagattatgtaataacacgtactaacaatgcagaaaacgtagttactaatgatatc
gcaaatagtccgtttggaggtgcaccgggtgtagatcagaacgttacaacatttgtaaat
gcaactaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaatagtgctaattctgct
aactttgttggagctatcgttaccgatacaagtgcggccataactaatgtacaattagat
ttagctaaagatatccaagctcaacttggtaacagattaggtgctcttagatatttaggt
actcctgaaactgctgaaatggctggacctgaagctggagcaatatcggctgcggttgct
gcaggtgacgaggctattgataatgtagcttacggtatatgggcaaaacctttctatact
gatgcacatcaaagtaagaaaggtggtttagctggttataaagctaaaaccaccggtgtc
gtaatcggtttagatacgctagctaacgataatttaatgatcggtgctgctatcggtatc
actaaaactgatataaaacatcaagattataagaaaggtgataaaaccgacgttaacggt
ttctcattctctctatatggtgcccagcagcttgttaagaacttctttgctcaaggtagt
gcaatatttagcttaaaccaagtgaagaacaaaagtcagcgttacttcttcgatgctaac
ggtaatatgagcaagcaaattgctgccggtcattacgataacatgacatttggtggtaac
ttaacagtcggttatgattacaatgcaatgcaaggtgtgttagtaactccaatggcagga
cttagctacttaaagtcttctgacgaaaactacaaagaaaccggtacaacagttgcaaac
aagcaagttaacagcaaatttagcgatagaaccgatttaatagtaggtgctaaagtagcc
ggcagtactatgaacataactgatcttgcggtatatccagaagttcacgcttttgtggtt
cacaaagtaaccggtagattatctaaaactcagtctgtattagacggacaagttactccg
tgtatcaaccagcctgacagaaccactaaaacatcttataatttaggtttaagtgcaagc
ataagatctgatgctaagatggagtacggaatcggttacgatgctcagatttcaagtaaa
tatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system