Rickettsia rickettsii Iowa: RrIowa_0400
Help
Entry
RrIowa_0400 CDS
T00643
Name
(GenBank) sensory box/GGDEF family protein
Organism
rrj
Rickettsia rickettsii Iowa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABY72295
UniProt:
B0BWR9
LinkDB
All DBs
Position
334189..335409
Genome browser
AA seq
406 aa
AA seq
DB search
MIHMAMSELSTNYKDLQDAIDKLEKGVCFACRLVNYDEIEFIEQGKHFIIEDLDQIIEDV
SKELNIFSKFKKIKKDRILFILNTTDSDLIKNFARKLYLFLQLYINEQKPAIYMNCYIAS
IKFPKKGSNNATEIEKTLNMLLSQNNNYYYREYSSTEHDLENIRKSNLQLNLLRQALAKK
TMRFAYQPIIDRNTMKIHYYECLLRIPDENGVYISVGPIIPIAENKGLIFIIDQIVLEMT
VNELVRNPNLMLAVNISNIGTGDEALWEIAENLLKAHNVRDRLIIEITETSFNQHYDKIT
LFINKLHKYGCKFALDDFGAGFTSFKQLQSLPIDIIKIDGKYVRSITSDVQSRYFVERLI
KISEDLGIATVAEFVENGEIAKFLIDLKVDGLQGNFYSEAKFDRVD
NT seq
1221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacacatggcaatgtcggaattaagcacgaattataaagatttacaagatgcgata
gataaattggaaaaaggcgtatgttttgcttgtagattagttaattatgatgaaatagaa
tttatagagcagggtaagcattttataattgaagatttagatcaaatcattgaagatgta
agcaaagaacttaatattttttcaaagtttaagaaaataaagaaagatagaatattattt
atcctaaatactactgattctgacttaattaaaaattttgctagaaaattatatttattt
ttgcagctttatattaatgaacagaagccggcaatttatatgaattgttatattgctagt
attaaatttccaaaaaaaggtagtaataatgctacagaaattgaaaaaacattaaatatg
ttactttcacaaaataataattattattaccgtgaatatagcagtacagaacatgatttg
gaaaatataagaaaatctaatcttcagcttaacttactacgacaagccttagcaaaaaag
actatgcgatttgcttatcagcctataatagatcgtaatactatgaagattcattattat
gaatgtctgcttcgtatacctgacgagaacggtgtttatatttccgtaggtcctataatc
cctattgctgaaaataaaggattaatttttataattgatcaaattgttttagaaatgact
gttaatgaacttgtccgcaacccaaacttaatgttagccgttaatatttcaaatatagga
acaggcgatgaagctttatgggaaatagcagaaaacttattaaaagctcataatgttcgg
gatcgtttaattattgaaattacggaaacttctttcaatcagcattacgataaaataact
ttatttattaataaactacataagtacggatgtaaatttgcattagacgattttggtgcg
ggttttacttcttttaaacaacttcaaagtttaccaattgatattatcaaaattgacggt
aaatatgtgcgtagtattacaagtgatgtacaaagtaggtatttcgtagaaagattaatt
aaaatttcagaagatttaggtattgcaacggtagctgaattcgtagaaaacggagaaata
gctaaatttttaattgatctaaaagtcgatgggctacaaggaaacttctattccgaagca
aaatttgatagagtggattaa
DBGET
integrated database retrieval system