Rickettsia rickettsii Iowa: RrIowa_1011
Help
Entry
RrIowa_1011 CDS
T00643
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rrj
Rickettsia rickettsii Iowa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pentapeptide_4
Pentapeptide
Pentapeptide_3
LD_SV2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABY72817
UniProt:
B0BY91
LinkDB
All DBs
Position
806107..807852
Genome browser
AA seq
581 aa
AA seq
DB search
MLKVISIITIYLLLSSCSESTRDANGLLTDSQSTVIRNYIISQNSKNLKVNLKEKFGSNL
KGVKLIGVQLINEDLSGIDLTSCEILRADFTGSNLEKAILTNAIIQESNFADSVIKNISG
YNSDFQGSIFHNITLQNTNFVQSNFSDTAFNKTTIINVNFENSKFRHVLWSNNTIDGVNF
QKATLQNNSFKNTNITNSIFYGTDLEKSIINNTNFTNNYFESSNLSQTTLTAVIIKDSNF
TQSIFNEVNFNNVQSNNSCFSYASFQDSTLQNISLTKCDLQNSTISSSVLKHFKINNAIL
NNMSLNDNKFNNLSIKNSNANFVRINKTKGSNITLDNISYTNNIFSNNDFKQFIVINTDL
NSSEIINSNITNGQFNNINFSKSLIQNVNFSDVKITLGNLNQVALINSTLTNTAVINSVL
SNSQINNINYQAYSGFINTNVSNNIILNSDNSSKILPNNIVINSVKDLQKITHLANMNLT
NFDLSNLIFDRVDFSNSIFKNANLTNTVIKNSILKEANFSAAILTKTDFSNSILTDSIFK
SAKIDQAGFNNSDLTNADFTEAAIKDTSFDKAKTSGMKGVE
NT seq
1746 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaagtcatatcaataattacgatttatttgttattaagcagctgctccgaatct
actcgtgatgcgaacggattacttacggatagccaaagcacggtaattcggaattatata
atatcgcaaaattctaaaaaccttaaagtgaaccttaaagagaagttcggttcaaattta
aaaggagtaaaattaataggagtacagctaatcaatgaagatttatcaggaatagatttg
acttcctgcgaaatattacgtgctgattttacaggtagcaatttagaaaaagcaatactt
acaaatgctataattcaagaaagtaattttgcagattcggtaataaaaaatatttccgga
tataattctgactttcaaggttcaatttttcacaatataacattacaaaatacaaatttt
gttcaatcaaattttagcgatactgcttttaataaaactactataataaatgtcaacttt
gaaaattctaaatttaggcatgtattatggagcaataatactatcgacggtgttaatttt
caaaaagctaccctacagaataatagctttaaaaatactaatataacaaattcaatattt
tacggtacggatttagaaaaaagtataataaataataccaattttactaataattatttt
gaatctagcaacctaagtcaaactacattaacagcagtaataattaaggattctaacttc
acacaaagtatttttaatgaagtaaattttaataacgtacaaagtaataactcttgcttt
tcatacgcttcctttcaagattcaacactacaaaatattagccttactaaatgtgattta
caaaatagtacaattagtagttcagttttaaagcattttaaaatcaataatgcgatatta
aataatatgagtctaaacgataataaatttaataatttatcaataaaaaatagtaatgct
aattttgtaaggattaataaaactaaaggctcaaatattactttagataatattagctat
actaataatatttttagcaataatgattttaaacaatttatagtgattaatactgactta
aacagcagtgaaataataaactcaaatataactaacggacaatttaataatataaatttt
tctaaatctttaatacaaaacgtaaatttttcagatgttaaaattactttaggcaattta
aaccaagtagctctaataaattccactctaacaaatactgcggttattaactccgtcctt
tctaattcgcaaataaataatattaactaccaagcgtattccggttttattaatactaat
gtttctaataatattattttaaatagtgataattcgagcaaaattctaccaaataatata
gtaataaattcggtaaaagatttgcaaaaaataactcacttagcaaatatgaatttaaca
aattttgacttgagcaacttaatatttgatagagtagatttttcaaatagtatctttaaa
aatgctaacctaacaaatacggtaataaaaaattctattttaaaagaggctaatttttct
gcagcaatacttactaaaacagatttttcaaactcaatattaacagatagtatatttaaa
tcagctaaaattgatcaggcgggctttaataactccgacctaacaaatgccgattttacc
gaagcagcaattaaagatacttcgtttgataaagctaagacaagcggaatgaaaggagta
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
