KEGG   Rickettsia rickettsii Iowa: RrIowa_1295
Entry
RrIowa_1295       CDS       T00643                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein B
Organism
rrj  Rickettsia rickettsii Iowa
SSDB
Motif
Pfam: rOmpB_passenger Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABY73039
UniProt: B0BUX9
LinkDB
Position
complement(1014072..1019036)
AA seq 1654 aa
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVASFAGSAMGAAIQQNRTTNGAATTVDGAGFDQTAA
PANVGVALNAVITANANNGINFNTPAGSFNGLLLNTANNLAVTVSEDTTLGFITNVAHNA
HSFNLTLNAGKTLTITGQGVTNAQAAATKNAQNVVVQFNNGAAIDNNDLKGVGRIDFGAP
ASTLVFNLANPTTQKAPLILGDNAVIANGVNGTLNVTNGFIQVSNKSFATVKAINIADGQ
GIIFNTDANNANTLNLQAGGTTINFTGTDGTGRLVLLSKHAAATNFNITGSLGGNLKGVI
EFNTVAVDGQLTANAGAANAVIGTNNGAGRAAGFVVSVDNGKVATIDGQVYAKDMVIQSA
NATGQVNFRHIVDVGADGTTAFKTAASKVTITQDSNFGNTDFGNLAAQIKVPNAITLTGN
FTGDASNPGNTAGVITFDANGTLESASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELR
LGNAGSIFKLADGTVINGKVNQTALVGGALAAGTITLDGSATITGDIGNAGGAAALQRIT
LANDAKKTLTLGGANIIGAGGGTIDLQANGGTIKLTSTQNNIVVDFDLAIATDQTGVVDA
SSLTNAQTLTINGKIGTIGDNNKTLGQFNIGSSKTVLSNGNVAINELVIGNDGAVQFAHD
TYLITRTTNAAGQGKIIFNPVVNNGTTLAAGTNLGSATNPLAEINFGSKGVNVDTVLNVG
EGVNLYATNITTTDANVGSFVFNAGGTNIVSGTVGGQQGNKFNTVALENGTTVKFLGNAT
FNGNTTIAANSTLQIGGNYTADCVASADGTGIVEFVNTGPITVTLNKQAAPVNALKQITV
SGPGNVVINEIGNAGNHHGAVTDTIAFENSSLGAVVFLPRGIPFNDAGNTMPLTIKSTVG
NKTAKGFDVPSVVVLGVDSVIADGQVIGDQNNIVDLGLGSDNGIIVNATTLYAGISTLNN
NQGTVTLSGGVPNTPGTVYGLGTGIGASKFKQVTFTTDYNNLGNIIATNATINDGVTVTT
GGIAGIGFDGKITLGSVNGNGNVRFADGILSNSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIGD
SDTPVASVRFTGSDSGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGIVNSNIILGGGATAINGKIDLVTN
TLTFASGTSTWGNNTSIETTLTLANGNIGHIVILEGAQVNTTTTGTTTIKVQDNANANFS
GTQTYTLIQGGARFNGTLGSPNFAVTGSNRFVNYSLIRAANQDYVITRTNNAENVVTNDI
ANSPFGGAPGVDQNVTTFVNATNTAAYNNLLLAKNSANSANFVGAIVTDTSAAITNVQLD
LAKDIQAQLGNRLGALRYLGTPETAEMAGPEAGAISAAVAAGDEAIDNVAYGIWAKPFYT
DAHQSKKGGLAGYKAKTTGVVIGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDVNG
FSFSLYGAQQLVKNFFAQGSAIFSLNQVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGGN
LTVGYDYNAMQGVLVTPMAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKVA
GSTMNITDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTPCINQPDRTTKTSYNLGLSAS
IRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq 4965 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttccgcagggttggtaactgcttct
acagctaccatagtagccagttttgcaggttcagctatgggtgctgctatacagcagaat
agaacaacaaacggcgctgctacaactgttgatggtgcgggatttgaccaaactgccgct
cctgcaaatgttggagttgctctaaatgcagttattactgctaatgctaataatggtatt
aatttcaatactccagccggtagttttaacggtttgttgttaaatactgcaaacaattta
gcagtgacagtgagtgaagatactaccttagggttcatcactaatgttgctcataacgct
cactcctttaaccttacgcttaatgccggtaaaactcttactataacaggtcaaggtgtt
actaatgcacaagctgctgctacaaaaaatgctcaaaatgttgttgtacaatttaataat
ggtgctgctattgacaataatgatcttaaaggtgtaggaagaatagacttcggtgctccg
gcttctacattagtatttaatttagcaaatcctacaactcaaaaagctcctcttatactt
ggagataatgctgtaatagctaatggtgttaacggtacattaaatgttactaatggattt
attcaagtttcaaataaaagttttgctactgttaaggcaattaatatcgctgacggtcaa
ggtatcatattcaatactgatgctaataatgctaatactttaaatttacaagcaggtggt
actactattaattttactggaacagacggtacgggtagattagtattattaagtaagcat
gctgctgctaccaactttaacattacaggaagtttaggcggtaatctaaaaggtgttatc
gaatttaacactgttgcagtagacggtcaacttacagctaatgcaggcgctgctaatgca
gtaataggtactaataatggcgcaggtagagctgcaggatttgttgttagcgtagataat
ggtaaggtagcaacaatcgatggacaagtttatgctaaagacatggttatacaaagtgct
aatgcaactgggcaagtaaattttagacacatagttgatgttggtgcagacggtactact
gcctttaaaacagcagcttctaaagttacaataacccaagactcaaactttggtaatact
gattttggtaatcttgcagcacagattaaagttcctaatgctataacccttaccggtaat
tttacaggtgatgctagcaatcccggtaacactgcaggtgtgataacttttgatgctaac
ggtactttagaaagtgctagtgcagatgcaaatgttgcggtgacaaataatattacagca
attgaagcatcaggtgccggagttgtccaattatcaggaacacatgctgccgagttacgt
ttaggaaatgccggttctatctttaaacttgctgacggtacagttataaacggtaaagtt
aaccaaactgctcttgtcggcggtgctcttgcagccggtactattaccttagacggtagt
gctacaattaccggcgatatagggaacgctggcggtgctgctgcgttacaacgcattact
ttagctaacgatgctaaaaaaacattaacacttggtggggcaaatattatcggtgctggt
ggtggaacgattgatttgcaagctaacggtggtactattaaattaacaagcactcaaaat
aatattgtagttgattttgatttagctatagctactgatcaaacaggcgttgttgatgcg
agtagcctaacaaatgctcaaactttaactattaacggtaaaatcggtactattggagat
aataataaaactcttggacaatttaatattggctcaagtaaaacagttttaagtaacggt
aatgttgctattaacgagttagttattggaaatgacggtgcagtacaattcgctcatgat
acttatttaataacaagaactacaaatgctgccggtcaaggtaaaataatatttaatcct
gttgtcaataatggtacaactcttgcagccggtacaaatttaggtagtgctacaaatcca
cttgcagaaattaattttggatctaaaggggttaatgttgatactgtattaaatgttggt
gaaggtgtaaatttatatgctactaatattactactaccgatgctaacgtaggttctttc
gtctttaatgccggtggaacaaatatagtaagcggtacagtcggtggacagcaaggtaat
aagtttaatactgtagcattagagaacggtactactgttaagttcttaggtaatgcaaca
tttaacggtaacactacaattgcagctaattctaccttacaaatcggtggtaactatact
gcagactgtgttgcatctgccgatggtaccggtatagtagaattcgttaacaccggtcct
attaccgtaacattaaacaaacaagctgcacctgttaatgctttaaaacaaataacggtt
tctggtcccggtaacgtagtgattaatgagataggtaatgcaggtaatcatcatggtgcc
gtgactgatacgattgcttttgaaaattcaagtttaggtgcagttgtattcttacctaga
ggcattccattcaatgatgcaggcaacacaatgcctttaacaattaaaagtaccgtaggt
aataaaacagctaaaggttttgatgttcctagcgtggttgttttaggtgttgatagtgtc
atcgctgacggtcaagtaatcggtgatcaaaataatatcgtagatctaggtcttggaagc
gataacggcataatcgttaatgctactacattatatgcaggtatcagtactctaaacaat
aatcaaggtactgtcacacttagcggtggtgttcctaatacccctggtacagtttatggc
ttaggcacaggtattggcgcttcaaagttcaagcaagtaacgtttactacagactataac
aacttaggtaatattattgcaactaacgcaacaattaatgacggtgtaactgttactaca
ggcggtatagccggaataggttttgacggtaaaattactcttggaagtgttaacggtaac
ggtaatgtaagatttgctgacggtatattgtctaattctacaagtatgattggtactact
aaagctaataatggtactgtaacttatttaggtaatgcattcgtcggtaatataggtgat
tcagatactcctgtagcttctgttagatttacaggtagtgatagtggtgcaggattacaa
ggaaatatttattcacaagtcatagactttggtacttataacttaggtattgtaaattct
aatataattttaggcggcggtgctactgctattaacggtaaaatcgatcttgttacaaat
actttaacatttgcaagtggtacttcaacatggggaaacaatacttctattgaaactact
ttaacattagcaaacggtaatataggtcacatcgttatcttggaaggtgcgcaagttaat
acaacaaccacaggaactacaaccattaaagtacaagataatgccaatgcaaatttcagt
ggtacacaaacttatactttaatccaaggtggtgctagatttaacggtactttaggaagt
cccaactttgctgtaaccggaagtaatcgtttcgtaaattacagtttaatacgtgctgct
aaccaagattatgtaataacacgtactaacaatgcagaaaacgtagttactaatgatatc
gcaaatagtccgtttggaggtgcaccgggtgtagatcagaacgttacaacatttgtaaat
gcaactaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaatagtgctaattctgct
aactttgttggagctatcgttaccgatacaagtgcggccataactaatgtacaattagat
ttagctaaagatatccaagctcaacttggtaacagattaggtgctcttagatatttaggt
actcctgaaactgctgaaatggctggacctgaagctggagcaatatcggctgcggttgct
gcaggtgacgaggctattgataatgtagcttacggtatatgggcaaaacctttctatact
gatgcacatcaaagtaagaaaggtggtttagctggttataaagctaaaaccaccggtgtc
gtaatcggtttagatacgctagctaacgataatttaatgatcggtgctgctatcggtatc
actaaaactgatataaaacatcaagattataagaaaggtgataaaaccgacgttaacggt
ttctcattctctctatatggtgcccagcagcttgttaagaacttctttgctcaaggtagt
gcaatatttagcttaaaccaagtgaagaacaaaagtcagcgttacttcttcgatgctaac
ggtaatatgagcaagcaaattgctgccggtcattacgataacatgacatttggtggtaac
ttaacagtcggttatgattacaatgcaatgcaaggtgtgttagtaactccaatggcagga
cttagctacttaaagtcttctgacgaaaactacaaagaaaccggtacaacagttgcaaac
aagcaagttaacagcaaatttagcgatagaaccgatttaatagtaggtgctaaagtagcc
ggcagtactatgaacataactgatcttgcggtatatccagaagttcacgcttttgtggtt
cacaaagtaaccggtagattatctaaaactcagtctgtattagacggacaagttactccg
tgtatcaaccagcctgacagaaccactaaaacatcttataatttaggtttaagtgcaagc
ataagatctgatgctaagatggagtacggaatcggttacgatgctcagatttcaagtaaa
tatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa

DBGET integrated database retrieval system