Rickettsia rickettsii Morgan: RRM_00675
Help
Entry
RRM_00675 CDS
T03662
Symbol
sca2
Name
(GenBank) surface cell antigen Sca2
Organism
rrm
Rickettsia rickettsii Morgan
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Drf_FH1
GntR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJG33947
LinkDB
All DBs
Position
complement(107471..113044)
Genome browser
AA seq
1857 aa
AA seq
DB search
MSTCLLTSSFLSTSARAASFKDLVSKTPAWAKHNSTQQQNIWKDLTPTEKIKKWQEAALV
PSFTQAQNDLGIKYKETDLSSFLDNTRHKARQARAEILLYIERIKQQDFDTKKQAYINQG
VVPTDIEAATNLGISYDPSKIDHNVEHDQKVRRAEKDKKAVIELYISSINRDIKYKHYVD
NDIIPEMQEVRTALNMNKDDAQSFVASIRTEIMENAKGQYIADSHIPTEKELKKKFGISR
DDNRDGYIKSIRLKVMENAKGQYIADSHIPTEKELEQKFGADKGEATNYIASIATQMMLG
KKSYYIDNNIIPNTDELMNEFNIGPVKATSYINQIRAGIEAKQFLNNNDTTKPSTGHSQK
KSGSKNDHWYMSNQSINDTGTSSRIFTGREKKQRYFFDPISTFKTHFNTKASKGNLTQSQ
HTIKRIIQQEENIAEFKNLIKTDPIAALTLQVGSSYKQEAVTTILSDFNDNTIQRVLFSN
DKGQLDFKTNIDVKNRPILQELLENSSSEEKTKFAERIQDYATRNISHSQFEEKARLDLI
KLAASKDKRSVENFLTLQLELKNRMQPYIVNSAYILTPEIVKEINIELKNKGLIRDSLTK
DYMIKLAKEVNNHTLNSVIKVILSDSNILSNETNKILGLAVGNNANNLEQTQSGIPNPPP
LPLNGDIPNPPPLPLNGDIPNPPPLPLNGDIPNPPPLPLNGSMPPPPPLHSQGFSSNSKH
FDLNQLQTEYPHIHSLYIQFTHNTTVQSKAPLQPTASSATSTGRSTPETAYAKLYAEYRT
ETGGTKANDLQDQLIKRQADLTNVIRQILTESYANQGADEKTLVNLFSISTPEIAEKAKE
AFNTLAQDQYIKDITVNGKKTITSEEIIKNLFNEDTDDAVKRILLSSCKISEELKRPIKL
EFNKSALIRELQGKQNPFEQLEFAYINAKNFDQDIFSNRVDELINNPNILTIVQQANFLI
TEDTNLRKTINSDQAQAKLDDLRTAILNTIKFEELITTNLPQHDFIAIVKEKDPALLQEF
LKATTLKLTGNNNLDQLRLALPSFADMSNEQIRILANKLKMPIILKAIQELKAIQECSQE
KAKQHIHTENMPPPPPPPPLPNAHDLKLAYLTSLGITKFNANTSTFKTTPKTYHFSSDIA
LRYKEFTLSGQKSAGYKAKYSDADLLQKAIVESVAFEHSKNLSKAYQNNKYFEQIQEAVD
TMHPRFIGPRTEIGQNIHNIYTSKLLELTKDKEFIKYVKDNIILSKKLTEVFTSADSDFI
GPRTEIGQKIHDIYIQQLTKYPEEAVKEAFNTAHPDFIGPRTEIGQEVHNIYKSQLLELA
KDKELFLFVQQVLVDSAELEQKYGSDIQSENSNDEKKVGRLDKTKLRLFQQENEATNDES
STKDDTQPEDSNKKSEQSDSKTALSPRLLSSNDSKNDKSSDYKKSLLALRSSDEDDQGYA
TGYTTDEEELEESNSTTGEELKKDISDYKKSLLALRSSDEDDQGYATDEEELEEGNSTTG
EELKKDIVLESEDEAIDVSFKTEAITEQDKVTQRQQVSDDTSGKVAILVQATSTLHKPVH
YNINDRLTVAAIGAGDEETSINRGVWISGLYGINKQSIWKNIPKYQNRTTGITIGADAEF
INSHDVIGIAYSRLASQIKYNKKLGKTAVNGHLLSIYSLKELIKGFSLQTITSYGHNYIK
NRSKNINNIIGKYQNNNLSVQTLLNYKYRTKYDLHFIPNIGFQYDYSRASNYKEYNVDIE
NLMIQKKSNQLFESSLGGKIVFKPIVTTNNIVLTPSLYGNIEHHFNNKNTKVNAKATFKG
QTLQETIITLKQPKLGYNIGSNILMSRKNINVLLEYNYYTHRKYQSHQGLMKLKVNL
NT seq
5574 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacatgtttgttgactagtagctttttaagtacaagtgctagagcagcaagcttt
aaagatttagttagtaaaaccccggcatgggcaaagcacaattcaacacagcaacaaaat
atttggaaagatttgactccaactgaaaaaatcaaaaaatggcaagaagcagctttagtt
cctagttttactcaagcacaaaatgatctaggcataaagtataaggaaacagatttatca
agttttttagataatactagacataaagcaagacaagcaagagctgaaattttattatac
atcgaaagaataaaacaacaggattttgatacaaaaaaacaagcatatattaatcaaggt
gtagttcctacagatatagaagcagcaacaaatcttggaataagttatgaccctagcaaa
atagaccataatgtagaacacgatcaaaaggtacgtcgtgcagaaaaagacaaaaaggca
gtaatcgaactatatatcagctcaataaacagagatattaaatacaaacattatgttgat
aatgatattatccctgaaatgcaagaagtaaggactgctcttaacatgaataaagatgat
gcacaatcttttgttgcttcaataagaactgaaattatggaaaacgcaaagggacaatat
atagccgatagccatattcctacagaaaaagagttaaaaaagaagtttggtatatctcgt
gatgataatagagacggctatattaagtcaataagacttaaagttatggaaaacgcaaag
ggacaatatatagccgatagccatattcctacagaaaaagagctagaacagaaatttggt
gctgataaaggtgaggcaacaaattatatcgcatcaatagcaactcagatgatgcttggt
aaaaaatcgtactatatagataataatattatccctaacactgacgaattaatgaatgaa
tttaatataggaccagtaaaagcaacttcttatataaaccaaataagagccggaatagaa
gcaaagcagtttctaaacaacaatgatactactaaaccatctaccggacactctcaaaaa
aagagcggaagcaaaaacgaccattggtatatgtcaaatcaaagtataaatgatacagga
acatcttcacggattttcacaggtagagaaaagaaacaacgatatttttttgatcctata
agtacttttaaaactcactttaatactaaagcaagtaagggtaatttaacgcagtctcaa
cacactataaagagaataatacaacaagaagaaaatattgcagaatttaaaaatcttatt
aaaacagatcctatagcagcattaactcttcaagtaggtagtagttataaacaagaagca
gtaacgactatcttaagtgattttaatgataatactattcaaagggtattatttagcaat
gataagggacaattagatttcaagaccaatattgacgttaaaaatagacctattttacaa
gaattattagaaaatagttcttctgaagaaaaaactaaatttgctgaaagaattcaagac
tatgcaacacgaaatatatctcatagtcaatttgaagaaaaggcacgattagatcttatc
aaactagcagcaagtaaagataagcgttcagtagaaaactttttaactctgcaattagag
ttaaaaaacagaatgcaaccctatattgtaaacagcgcctatattttaacaccagaaata
gtaaaagaaataaatatagaactaaaaaataaagggctaataagagatagtttaactaaa
gactatatgattaaactagccaaagaagtaaataaccacacattaaattcagtaattaaa
gtaatattatctgatagtaacatactcagcaatgaaaccaataaaattttagggttagca
gtaggtaataatgcaaataatttagaacaaacacaaagcggcattccgaatccacctcct
ctaccgctaaatggggatattccaaatccacctcctctaccgctaaacggggatattcca
aatccacctcctctaccgctaaacggggatattccaaatccacctcctctaccgctaaac
ggaagcatgccaccaccaccgcccttacattctcaaggctttagtagcaactctaaacat
tttgatttaaatcagttacaaacagaatatcctcacatacattcgttatatattcagttt
actcacaatactactgttcaatcaaaagcaccacttcaacctacagcttctagtgcaacc
agcacaggcagaagcacgccagagacagcttatgccaaactatatgcagaatatagaact
gagacaggaggtacaaaagctaatgatttacaagatcagcttataaaaagacaagctgat
cttacaaatgttatacgtcaaatattaacagaatcatacgccaaccaaggagctgacgag
aaaactcttgtaaatttatttagcatttcaacccctgaaatcgcagaaaaagctaaagaa
gcttttaacacccttgctcaagaccagtatataaaagatataaccgtaaatggtaagaaa
acaataacaagcgaagagataattaaaaatcttttcaatgaagacactgatgatgcagta
aaacgtattttattatcgtcatgtaaaatatctgaagaattaaagagacctattaaactt
gaattcaataaatcagcattgattagagagttacagggcaaacaaaatccgtttgaacaa
ttagaatttgcctatattaatgcaaaaaacttcgatcaagatatatttagcaatagagtc
gacgagttaattaacaaccctaatatattaactatagtacaacaagctaattttttaata
acagaagatacaaacttaagaaaaacaattaattctgatcaagcacaggctaaacttgat
gatttaagaacagctattttaaacacaataaaatttgaagaattaattacaacaaattta
cctcaacatgattttattgctatagtaaaggaaaaagaccccgcattattacaagagttt
ttaaaagctactactctcaaactaacaggtaataataatttagatcaattaagattagct
ttgccttcatttgcagacatgagcaatgaacaaataagaattcttgctaataaattaaag
atgcctataatattaaaagctattcaagagttaaaagctattcaagagtgctcgcaagaa
aaagctaaacaacacatccataccgaaaacatgccaccaccaccaccaccaccgccactg
cctaatgcacacgatttgaaattagcttatctaacaagtttagggattactaaattcaat
gcaaatacatctacttttaaaacaactccaaaaacttatcactttagctccgatatagct
ttaagatataaagaatttactttatcaggacaaaaatcagcaggatataaagcaaaatac
tccgatgccgatttattgcaaaaagctatagtggaatcagtagcatttgagcattcaaaa
aatttatctaaagcttatcaaaataataagtattttgaacaaatccaagaagcagtcgac
actatgcaccctcgctttataggtcctagaactgaaataggacaaaacatacataatatt
tatacttctaaacttttggaattaacaaaagataaagaatttattaaatatgttaaagat
aatattatacttagcaaaaaattaacggaggtgtttacttccgctgactctgattttata
ggtcctagaactgaaataggacaaaaaatacatgatatttatatacagcaattgacaaaa
tatccagaggaagcggtaaaagaggcatttaatactgctcaccctgattttataggtcct
agaactgaaatagggcaagaagtacataatatttataaatctcaacttttagagttagca
aaagataaagaattgtttctatttgttcaacaagtactagtagattctgctgaactagaa
caaaaatatggtagtgatattcaatcagaaaatagtaacgatgaaaagaaagtagggcgt
ttagataagacaaaattacgattattccaacaagaaaacgaagctacaaatgacgaatcc
tcaacaaaggatgatacacaacctgaagatagcaataaaaagtcagagcaatctgattca
aaaaccgctttatcaccgagattattgagttctaacgatagcaaaaatgataaatcatca
gattacaaaaaatcacttctagcattaagatctagtgatgaagacgatcaagggtatgca
actgggtatacaactgatgaagaagaattagaagaaagcaatagcaccactggcgaagaa
ttaaaaaaagatatatcagattacaaaaaatcacttctagcattaagatctagtgatgaa
gacgatcaagggtatgcaactgatgaagaagaattagaagaaggcaatagcaccactggc
gaagaattaaaaaaagatatagttttagaaagcgaagatgaagctatcgatgtatcattc
aaaactgaagcaattacagaacaagataaggtgacacagagacaacaggtctctgatgat
actagtgggaaagtagcaatattagttcaggcgacttcaactcttcacaaacctgttcac
tataatataaatgatagattaacggttgctgcaataggggccggtgatgaagaaactagt
ataaacagaggggtatggattagcggcttatacggcatcaacaaacaaagcatttggaag
aatattccaaaatatcaaaatcgtacaaccggcataaccatcggggctgatgctgaattc
atcaatagtcatgatgttataggaatagcttatagccgtttggcatcccaaattaaatat
aataaaaaactagggaaaacagcagttaacggtcatcttttaagcatttacagtctaaaa
gaactaattaaaggtttctcattgcagactataacatcttacggtcataattatattaag
aatagatctaaaaatattaataatataattggaaaatatcaaaacaataatttaagtgtt
caaactttattaaattataaatatcgtacaaaatacgatttacattttattcctaatatc
ggttttcaatatgattattcaagagctagcaactataaagagtataatgtagatatagaa
aatctcatgattcaaaagaaatcaaatcaattatttgaaagtagccttggcggtaaaata
gtgtttaagcctatagtgaccacaaacaatatagtattaacaccaagtttgtatggtaat
attgagcatcacttcaataataaaaatacaaaagttaatgcaaaagcgacttttaaagga
caaacattacaagaaacaattattacactaaaacaacctaagcttggatataatatcggt
agtaatatacttatgagtagaaaaaatatcaatgttctacttgagtataattattatacg
catagaaagtatcaaagccatcaaggacttatgaaactaaaagtcaatttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
