Rickettsia rickettsii Hino: RPJ_00650
Help
Entry
RPJ_00650 CDS
T01738
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rrn
Rickettsia rickettsii Hino
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sca2
Autotransporter
Drf_FH1
GntR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB27086
LinkDB
All DBs
Position
complement(107533..113091)
Genome browser
AA seq
1852 aa
AA seq
DB search
MTSSFLSTSARAASFKDLVSKTPAWAKHNSTQQQNIWKDLTPTEKIKKWQEAALVPSFTQ
AQNDLGIKYKETDLSSFLDNTRHKARQARAEILLYIERIKQQDFDTKKQAYINQGVVPTD
IEAATNLGISYDPSKIDHNVEHDQKVRRAEKDKKAVIELYISSINRDIKYKHYVDNDIIP
EMQEVRTALNMNKDDAQSFVASIRTEIMENAKGQYIADSHIPTEKELKKKFGISRDDNRD
GYIKSIRLKVMENAKGQYIADSHIPTEKELEQKFGADKGEATNYIASIATQMMLGKKSYY
IDNNIIPNTDELMNEFNIGPVKATSYINQIRAGIEAKQFLNNNDTTKPSTGHSQKKSGSK
NDHWYMSNQSINDTGTSSRIFTGREKKQRYFFDPISTFKTHFNTKASKGNLTQSQHTIKR
IIQQEENIAEFKNLIKTDPIAALTLQVGSSYKQEAVTTILSDFNDNTIQRVLFSNDKGQL
DFKTNIDVKNRPILQELLENSSSEEKTKFAERIQDYATRNISHSQFEEKARLDLIKLAAS
KDKRSVENFLTLQLELKNRMQPYIVNSAYILTPEIVKEINIELKNKGLIRDSLTKDYMIK
LAKEVNNHTLNSVIKVILSDSNILSNETNKILGLAVGNNANNLEQTQSGIPNPPPLPLNG
DIPNPPPLPLNGDIPNPPPLPLNGDIPNPPPLPLNGSMPPPPPLHSQGFSSNSKHFDLNQ
LQTEYPHIHSLYIQFTHNTTVQSKAPLQPTASSATSTGRSTPETAYAKLYAEYRTETGGT
KANDLQDQLIKRQADLTNVIRQILTESYANQGADEKTLVNLFSISTPEIAEKAKEAFNTL
AQDQYIKDITVNGKKTITSEEIIKNLFNEDTDDAVKRILLSSCKISEELKRPIKLEFNKS
ALIRELQGKQNPFEQLEFAYINAKNFDQDIFSNRVDELINNPNILTIVQQANFLITEDTN
LRKTINSDQAQAKLDDLRTAILNTIKFEELITTNLPQHDFIAIVKEKDPALLQEFLKATT
LKLTGNNNLDQLRLALPSFADMSNEQIRILANKLKMPIILKAIQELKAIQECSQEKAKQH
IHTENMPPPPPPPPLPNAHDLKLAYLTSLGITKFNANTSTFKTTPKTYHFSSDIALRYKE
FTLSGQKSAGYKAKYSDADLLQKAIVESVAFEHSKNLSKAYQNNKYFEQIQEAVDTMHPR
FIGPRTEIGQNIHNIYTSKLLELTKDKEFIKYVKDNIILSKKLTEVFTSADSDFIGPRTE
IGQKIHDIYIQQLTKYPEEAVKEAFNTAHPDFIGPRTEIGQEVHNIYKSQLLELAKDKEL
FLFVQQVLVDSAELEQKYGSDIQSENSNDEKKVGRLDKTKLRLFQQENEATNDESSTKDD
TQPEDSNKKSEQSDSKTALSPRLLSSNDSKNDKSSDYKKSLLALRSSDEDDQGYATGYTT
DEEELEESNSTTGEELKKDISDYKKSLLALRSSDEDDQGYATDEEELEEGNSTTGEELKK
DIVLESEDEAIDVSFKTEAITEQDKVTQRQQVSDDTSGKVAILVQATSTLHKPVHYNIND
RLTVAAIGAGDEETSINRGVWISGLYGINKQSIWKNIPKYQNRTTGITIGADAEFINSHD
VIGIAYSRLASQIKYNKKLGKTAVNGHLLSIYSLKELIKGFSLQTITSYGHNYIKNRSKN
INNIIGKYQNNNLSVQTLLNYKYRTKYDLHFIPNIGFQYDYSRASNYKEYNVDIENLMIQ
KKSNQLFESSLGGKIVFKPIVTTNNIVLTPSLYGNIEHHFNNKNTKVNAKATFKGQTLQE
TIITLKQPKLGYNIGSNILMSRKNINVLLEYNYYTHRKYQSHQGLMKLKVNL
NT seq
5559 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactagtagctttttaagtacaagtgctagagcagcaagctttaaagatttagttagt
aaaaccccggcatgggcaaagcacaattcaacacagcaacaaaatatttggaaagatttg
actccaactgaaaaaatcaaaaaatggcaagaagcagctttagttcctagttttactcaa
gcacaaaatgatctaggcataaagtataaggaaacagatttatcaagttttttagataat
actagacataaagcaagacaagcaagagctgaaattttattatacatcgaaagaataaaa
caacaggattttgatacaaaaaaacaagcatatattaatcaaggtgtagttcctacagat
atagaagcagcaacaaatcttggaataagttatgaccctagcaaaatagaccataatgta
gaacacgatcaaaaggtacgtcgtgcagaaaaagacaaaaaggcagtaatcgaactatat
atcagctcaataaacagagatattaaatacaaacattatgttgataatgatattatccct
gaaatgcaagaagtaaggactgctcttaacatgaataaagatgatgcacaatcttttgtt
gcttcaataagaactgaaattatggaaaacgcaaagggacaatatatagccgatagccat
attcctacagaaaaagagttaaaaaagaagtttggtatatctcgtgatgataatagagac
ggctatattaagtcaataagacttaaagttatggaaaacgcaaagggacaatatatagcc
gatagccatattcctacagaaaaagagctagaacagaaatttggtgctgataaaggtgag
gcaacaaattatatcgcatcaatagcaactcagatgatgcttggtaaaaaatcgtactat
atagataataatattatccctaacactgacgaattaatgaatgaatttaatataggacca
gtaaaagcaacttcttatataaaccaaataagagccggaatagaagcaaagcagtttcta
aacaacaatgatactactaaaccatctaccggacactctcaaaaaaagagcggaagcaaa
aacgaccattggtatatgtcaaatcaaagtataaatgatacaggaacatcttcacggatt
ttcacaggtagagaaaagaaacaacgatatttttttgatcctataagtacttttaaaact
cactttaatactaaagcaagtaagggtaatttaacgcagtctcaacacactataaagaga
ataatacaacaagaagaaaatattgcagaatttaaaaatcttattaaaacagatcctata
gcagcattaactcttcaagtaggtagtagttataaacaagaagcagtaacgactatctta
agtgattttaatgataatactattcaaagggtattatttagcaatgataagggacaatta
gatttcaagaccaatattgacgttaaaaatagacctattttacaagaattattagaaaat
agttcttctgaagaaaaaactaaatttgctgaaagaattcaagactatgcaacacgaaat
atatctcatagtcaatttgaagaaaaggcacgattagatcttatcaaactagcagcaagt
aaagataagcgttcagtagaaaactttttaactctgcaattagagttaaaaaacagaatg
caaccctatattgtaaacagcgcctatattttaacaccagaaatagtaaaagaaataaat
atagaactaaaaaataaagggctaataagagatagtttaactaaagactatatgattaaa
ctagccaaagaagtaaataaccacacattaaattcagtaattaaagtaatattatctgat
agtaacatactcagcaatgaaaccaataaaattttagggttagcagtaggtaataatgca
aataatttagaacaaacacaaagcggcattccgaatccacctcctctaccgctaaatggg
gatattccaaatccacctcctctaccgctaaacggggatattccaaatccacctcctcta
ccgctaaacggggatattccaaatccacctcctctaccgctaaacggaagcatgccacca
ccaccgcccttacattctcaaggctttagtagcaactctaaacattttgatttaaatcag
ttacaaacagaatatcctcacatacattcgttatatattcagtttactcacaatactact
gttcaatcaaaagcaccacttcaacctacagcttctagtgcaaccagcacaggcagaagc
acgccagagacagcttatgccaaactatatgcagaatatagaactgagacaggaggtaca
aaagctaatgatttacaagatcagcttataaaaagacaagctgatcttacaaatgttata
cgtcaaatattaacagaatcatacgccaaccaaggagctgacgagaaaactcttgtaaat
ttatttagcatttcaacccctgaaatcgcagaaaaagctaaagaagcttttaacaccctt
gctcaagaccagtatataaaagatataaccgtaaatggtaagaaaacaataacaagcgaa
gagataattaaaaatcttttcaatgaagacactgatgatgcagtaaaacgtattttatta
tcgtcatgtaaaatatctgaagaattaaagagacctattaaacttgaattcaataaatca
gcattgattagagagttacagggcaaacaaaatccgtttgaacaattagaatttgcctat
attaatgcaaaaaacttcgatcaagatatatttagcaatagagtcgacgagttaattaac
aaccctaatatattaactatagtacaacaagctaattttttaataacagaagatacaaac
ttaagaaaaacaattaattctgatcaagcacaggctaaacttgatgatttaagaacagct
attttaaacacaataaaatttgaagaattaattacaacaaatttacctcaacatgatttt
attgctatagtaaaggaaaaagaccccgcattattacaagagtttttaaaagctactact
ctcaaactaacaggtaataataatttagatcaattaagattagctttgccttcatttgca
gacatgagcaatgaacaaataagaattcttgctaataaattaaagatgcctataatatta
aaagctattcaagagttaaaagctattcaagagtgctcgcaagaaaaagctaaacaacac
atccataccgaaaacatgccaccaccaccaccaccaccgccactgcctaatgcacacgat
ttgaaattagcttatctaacaagtttagggattactaaattcaatgcaaatacatctact
tttaaaacaactccaaaaacttatcactttagctccgatatagctttaagatataaagaa
tttactttatcaggacaaaaatcagcaggatataaagcaaaatactccgatgccgattta
ttgcaaaaagctatagtggaatcagtagcatttgagcattcaaaaaatttatctaaagct
tatcaaaataataagtattttgaacaaatccaagaagcagtcgacactatgcaccctcgc
tttataggtcctagaactgaaataggacaaaacatacataatatttatacttctaaactt
ttggaattaacaaaagataaagaatttattaaatatgttaaagataatattatacttagc
aaaaaattaacggaggtgtttacttccgctgactctgattttataggtcctagaactgaa
ataggacaaaaaatacatgatatttatatacagcaattgacaaaatatccagaggaagcg
gtaaaagaggcatttaatactgctcaccctgattttataggtcctagaactgaaataggg
caagaagtacataatatttataaatctcaacttttagagttagcaaaagataaagaattg
tttctatttgttcaacaagtactagtagattctgctgaactagaacaaaaatatggtagt
gatattcaatcagaaaatagtaacgatgaaaagaaagtagggcgtttagataagacaaaa
ttacgattattccaacaagaaaacgaagctacaaatgacgaatcctcaacaaaggatgat
acacaacctgaagatagcaataaaaagtcagagcaatctgattcaaaaaccgctttatca
ccgagattattgagttctaacgatagcaaaaatgataaatcatcagattacaaaaaatca
cttctagcattaagatctagtgatgaagacgatcaagggtatgcaactgggtatacaact
gatgaagaagaattagaagaaagcaatagcaccactggcgaagaattaaaaaaagatata
tcagattacaaaaaatcacttctagcattaagatctagtgatgaagacgatcaagggtat
gcaactgatgaagaagaattagaagaaggcaatagcaccactggcgaagaattaaaaaaa
gatatagttttagaaagcgaagatgaagctatcgatgtatcattcaaaactgaagcaatt
acagaacaagataaggtgacacagagacaacaggtctctgatgatactagtgggaaagta
gcaatattagttcaggcgacttcaactcttcacaaacctgttcactataatataaatgat
agattaacggttgctgcaataggggccggtgatgaagaaactagtataaacagaggggta
tggattagcggcttatacggcatcaacaaacaaagcatttggaagaatattccaaaatat
caaaatcgtacaaccggcataaccatcggggctgatgctgaattcatcaatagtcatgat
gttataggaatagcttatagccgtttggcatcccaaattaaatataataaaaaactaggg
aaaacagcagttaacggtcatcttttaagcatttacagtctaaaagaactaattaaaggt
ttctcattgcagactataacatcttacggtcataattatattaagaatagatctaaaaat
attaataatataattggaaaatatcaaaacaataatttaagtgttcaaactttattaaat
tataaatatcgtacaaaatacgatttacattttattcctaatatcggttttcaatatgat
tattcaagagctagcaactataaagagtataatgtagatatagaaaatctcatgattcaa
aagaaatcaaatcaattatttgaaagtagccttggcggtaaaatagtgtttaagcctata
gtgaccacaaacaatatagtattaacaccaagtttgtatggtaatattgagcatcacttc
aataataaaaatacaaaagttaatgcaaaagcgacttttaaaggacaaacattacaagaa
acaattattacactaaaacaacctaagcttggatataatatcggtagtaatatacttatg
agtagaaaaaatatcaatgttctacttgagtataattattatacgcatagaaagtatcaa
agccatcaaggacttatgaaactaaaagtcaatttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system