Rickettsia slovaca 13-B: Rsl_474
Help
Entry
Rsl_474 CDS
T01671
Symbol
mutS
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
rsv
Rickettsia slovaca 13-B
Pathway
rsv03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rsv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
Rsl_474 (mutS)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rsv03400
]
Rsl_474 (mutS)
DNA repair and recombination proteins [BR:
rsv03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
Rsl_474 (mutS)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_II
MutS_IV
MutS_C
AAA_14
AAA_29
Tp0624_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV92045
UniProt:
A0ABM5MNC9
LinkDB
All DBs
Position
complement(405173..407833)
Genome browser
AA seq
886 aa
AA seq
DB search
MNLQELKQKYNYDVATKMMQQYLDIKFAHLDCLLLFRMGDFYEMFYEDAILASNVLGIAL
TKRGKNGEEEIAMCGVPYHALENYLTKLIEANYKVAICDQLETPEEAKNRGGYKAVVTRD
VTRIITPGTIIEENLIASAEPNYLASLVIPKNKETASLCYVDLSTSEIVVVNVPETEILN
ELARLKPREILLSENLRSSNLADSIFKQLNFRITYQVDSFFAINKCEKIILDFYKMKDIK
GIGEISSSQICAIGSVLEYLSLTQKQNIPHLPIPRIIKFHSYMTIDFSTRHNLEIVTNSQ
DGSQGSLLSTLNHTVTKQGGRLLYNFLSSPLTNIAKINHRLNITEFFYSNLEIVKKIREL
LKKTSDIERCLTRITMNRSSGRDLLSIKYTLETATIIKGVFFDAYGFNLPDFIEKIIKPL
SGDAELYNLIDETIREDAPNNLNDGGIIKHEYHPKVAQLHDLINNGKLYIEKLQDQYRKE
TGIDSLKISHNNVIGLFIDITAKNVNKILDPKFIHRQTTVNHVRYTTAELQKLESELVNA
KTLVISLEKELYADICSQVIEKASYLRMLASSLSGLDVFCNFAYIADEYDYVKPEFTDDL
SFDIVKGRHPVVEKALQRESKSFVYNDCHLSELERIWLITGPNMAGKSTFLRQNAIIAII
AQIGSFVPAKSAKIGVVDKIFSRIGAADDLIKGQSTFMAEMLETSAILAQSTKNSLIILD
EVGRGTSTYDGVSIAWSVLEYIHDKLKCRCLFATHYHELTVMSNFLPALQNYTIAIEESG
KDILFLHNIISGAADRSYGLHVAALAGLPASVINRAEQILLKFEKTSTGKGKNILSTESN
NLSLFYLEPNKTTISSKLDKKFSTIDPDKLSPKEALELIYELKKLV
NT seq
2661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcttcaagagttgaaacaaaaatataattacgatgttgcaacgaaaatgatgcag
caatatctagacattaaatttgctcatttagattgtttactactatttagaatgggtgat
ttttatgaaatgttctatgaagatgcaattctagcaagcaatgtacttggcattgcttta
acaaagcggggcaaaaacggcgaagaagaaattgcgatgtgcggggtaccttatcatgcc
cttgagaattatttaactaagttaattgaagcaaattataaggttgctatttgtgatcaa
ctagaaacacctgaagaagcaaagaatagaggcggttataaagcggtcgttactagggat
gttacacgtattataactccgggaactataattgaagaaaatttaattgcttcagccgaa
cctaattatttagcaagtctcgtaataccgaaaaataaagaaacagctagcctttgttat
gttgatctttctacttccgaaattgttgtagttaatgtaccggaaacggaaattcttaat
gagctggctcgtttaaaacctcgtgaaattctgcttagcgaaaatctgagatcttctaat
cttgcggatagtattttcaaacaattaaattttcgtattacctatcaagttgatagtttt
tttgcgattaataaatgcgaaaaaatcattttagatttttataaaatgaaagatattaaa
ggaatcggcgagatatctagtagtcaaatttgtgccataggtagcgttttagaatattta
tcgttaacgcaaaaacaaaatattcctcatttgccaatccctagaattatcaaatttcat
agctatatgactattgatttctctactagacacaaccttgaaattgtcacaaactcacaa
gacggctcgcaaggaagtttattaagcacccttaatcatacggttactaaacaaggtgga
cgtttactatataattttctttcaagtcctttaaccaacattgctaaaataaatcatcgt
ttaaatattaccgagttcttttattccaacttagaaatagtaaaaaaaattagagaactt
ctaaaaaaaactagtgatatagaacgctgcttaacacgtattacgatgaacagaagttca
ggtcgtgatttacttagcattaaatatactttagaaacggcaacgattattaaaggagta
ttctttgacgcttacggttttaatttacctgattttatcgaaaaaattattaaacctcta
tcaggtgatgcagaattatataatttaatagacgaaacaatacgagaagatgcaccgaat
aatttaaatgacggaggtataataaaacatgaatatcatccgaaagtagcccaattacat
gatttaattaataatggaaaattatatattgaaaagctacaagatcaatatcgcaaagaa
acgggaatagacagtttaaaaatatctcataataatgttatagggctttttatcgatatc
accgctaaaaatgttaataaaatccttgatcccaaatttattcaccgtcaaacaacggtt
aatcatgttcgttacactactgctgaactacaaaagcttgaaagtgagttagtcaatgct
aaaaccttagtaataagcttagaaaaagaattatatgcggatatttgtagccaagtaatc
gaaaaagcttcctatttacgaatgcttgcaagctccttaagcgggcttgacgtattttgt
aattttgcttacatcgctgatgaatatgattatgttaagcctgagtttaccgatgattta
agctttgatatcgttaaaggacggcatcctgtagtagagaaagcactacagcgagaaagc
aaaagctttgtatataatgattgtcatttatcagagcttgagcgtatttggttaattacc
ggtcctaatatggcaggtaaaagtacttttttacgtcaaaacgccattattgcaatcatt
gctcaaataggttcgtttgtgccggcaaaaagtgctaaaataggggtagtcgacaaaata
tttagccgaataggtgctgccgatgacttaattaagggacaatcgacctttatggcagag
atgcttgaaacctcggcaattcttgctcaatctacaaaaaactcactaatcatacttgat
gaggtaggtagaggcacatccacttatgacggggtatctatagcatggtcggtgcttgaa
tatattcatgataagctgaaatgtcgctgtttatttgcaacgcactatcatgagctaacc
gttatgagtaatttcctgccggctttgcaaaattatactattgctattgaggagtcaggt
aaagatattctatttttacataatattatatcaggtgctgccgataggtcctacggtctt
catgttgcggctcttgccggtcttcctgcgagtgttataaacagagctgagcagattctg
cttaaatttgaaaaaacttctacaggtaaaggaaaaaatattttatcaacggaatcaaat
aatttgagtttgttttatcttgaacctaataaaactactataagcagcaaattagataaa
aaattcagcactatcgatcctgataaactatcccctaaagaagcacttgagttaatttat
gagttaaagaagttggtttga
DBGET
integrated database retrieval system
