KEGG   Rickettsia slovaca D-CWPP: MC3_01170
Entry
MC3_01170         CDS       T01801                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein omp1
  KO
K07277  outer membrane protein insertion porin family
Organism
rsw  Rickettsia slovaca D-CWPP
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rsw00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03029 Mitochondrial biogenesis [BR:rsw03029]
    MC3_01170
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rsw02000]
    MC3_01170
Mitochondrial biogenesis [BR:rsw03029]
 Mitochondrial protein import machinery
  Outer membrane
   TOB/SAM complex
    MC3_01170
Transporters [BR:rsw02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   MC3_01170
SSDB
Motif
Pfam: POTRA Omp85 POTRA_2 POTRA_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFD19211
UniProt: H8LM33
LinkDB
Position
complement(213746..216052)
AA seq 768 aa
MTIRSISKLTILLLTIFYYHISLADSVIRKITIEGNHRVERSTIESYLKLKVGETYNNSK
EDEVIKRLYATSLFRNINMHITNDGNLIVNVTETPFISSVVFSGNSKIKTNMLAKEIYTM
SGESLSQAKIELDVKKILEIYKRSGRFATTVTPKIENLENNRVKVIFDIAEGPKTGINYI
YFSGNENYSDSELKSIVLTKESRWFRFLESNDTYDPDRMEYDKELLREFYQSVGFADFRV
ISASAELNNTKEYFTLTYSIEEGEKYSFGNITIDNKLTNIDITPLNKIVNIKQGKVFNMK
KVDDIAEKIGEYFTANGYPAVNVYPDIMKNANHTADIKFIIEKADKVYINKINIINNLKT
EDPVIRREFKIEEGDIINRSYIEKGERNLRNLDYFEKVAISLAPTKAKDKYDVNVEVDEK
STSSIGFDLGYNTAGGLFGRFSFLERNLVGTGKLLNAGVQVSKNTTSYYGGITAPHFLDR
DLSLGVNTFRNYTGRGASVLNTTDQSYKLHSIGVKTSLGYEIKEDLGHEIDYLIKRDILS
APTPSSSIFLKEQMGRFITSAIGHTITYDQTDNKIVPKNGYLVSGTQEFAGVGGDNKYIK
HEVDGKYYKSFIHNKLTLKLSASGGDIAGLGGKIIRISDRFNLGDYSLRGFASGGVGPRE
KVTNEGLGGERYYTFSTELNFPTPIPEEFNLTGTVFMDLGSVWGVGLNKKQYQTPNGFYN
DKSLRASIGFGFIWVTRFAPIRMDWGFPVKKKKYDDTQHFHLRFSTHL
NT seq 2307 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgacaatcagatcaattagtaagttaacaattttattattaacgattttttattatcat
atttcattagctgactctgtaattcgtaaaataactatcgaaggtaatcatagggttgag
cgttctactattgagagctatttaaagcttaaggtaggagaaacctataataattctaaa
gaagatgaggtaataaaacgtttatatgccacctcactttttagaaatataaatatgcat
ataacaaatgatggtaatttaatagttaacgttactgaaacgccttttataagtagtgta
gtatttagcggtaattctaaaatcaaaactaatatgctcgctaaagaaatttacacaatg
tcgggtgaatctcttagccaagctaaaattgaattagatgtaaagaaaatattagaaatt
tataaacgtagcggacgttttgctactacggtaacacctaaaatcgaaaatttagaaaac
aacagagttaaggttatttttgatatagcagaaggaccaaaaaccggtattaactatatt
tattttagcggtaatgaaaattatagtgattcagaacttaaatctattgttttaactaaa
gaatctcgttggtttcgttttttagaaagtaacgatacttacgatcctgatagaatggag
tatgataaagaattactgagagagttttatcaatctgtaggttttgcagattttagagta
atttcggcatcggcagaactcaataatactaaagaatatttcacccttacctattccatt
gaagagggagaaaaatatagcttcggtaatattacaatagacaataaattaactaatata
gatataacaccgcttaataaaattgttaatattaagcaaggcaaggttttcaatatgaaa
aaggttgatgatatagctgaaaaaatcggagaatattttacagcgaacggttaccctgcg
gtaaatgtttatccggatataatgaaaaatgctaatcatactgcagatattaaatttatt
attgaaaaagccgataaggtttatattaataaaattaatattattaataaccttaaaacc
gaagaccctgttataagaagagaatttaaaatagaagaaggtgatataattaatcgttca
tatattgaaaaaggtgagcgtaatcttagaaatttagattattttgagaaagtagcaatt
agcttagctccgactaaagctaaagataaatatgatgttaacgttgaagttgatgaaaaa
tctacttcctctataggttttgatttaggatataatactgccggcggtttattcggacgt
ttctctttcttagagcgtaatttagtcggtaccgggaaactgcttaatgccggtgtgcaa
gtaagtaaaaacactacaagctattacggtggtattaccgcaccgcactttttagatcgt
gatttatcacttggcgtaaacacatttagaaattataccggacgcggtgctagtgtatta
aatacaactgatcaaagctataagttacactctataggagtcaaaacttctcttggttat
gaaattaaagaggatttaggtcacgaaatagattatttaatcaaacgtgatattttaagt
gctccaactccatcaagctcaatattcttaaaggagcaaatgggaagattcattacttct
gctataggacatactattacttatgatcaaaccgataataaaattgttccaaagaacggt
tatttagtaagcggcacacaagaatttgccggcgttggaggtgataacaaatatataaag
catgaagttgacggtaaatattataaatctttcatacataacaagcttactttaaaatta
tctgcttccggaggcgatattgcaggccttggaggaaaaattattagaatttccgatcgc
tttaatttaggtgattatagtttaagaggctttgcaagcggtggtgtaggacctcgtgaa
aaggtcactaacgaaggacttggtggtgagcgatattacacattctcaacagagcttaat
ttcccaacacctatacctgaggaatttaatttaaccggtacagtctttatggatttagga
agcgtttggggagtaggcctaaataagaaacaatatcaaactccaaacggtttttataac
gataaatctcttagagcttccattggtttcggctttatttgggtaacacgttttgcacca
atcagaatggattggggtttcccggttaagaagaagaaatatgacgatacgcagcatttc
catttaagattttcgacgcatttataa

DBGET integrated database retrieval system