KEGG   Raphanus sativus (radish): 130510038
Entry
130510038         CDS       T06014                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC130510038
Organism
rsz  Raphanus sativus (radish)
SSDB
Motif
Pfam: RVT_1 zf-RVT DUF4283 Exo_endo_phos
Other DBs
NCBI-GeneID: 130510038
NCBI-ProteinID: XP_056862357
UniProt: A0A9W3DF49
LinkDB
Position
3:16964225..16969452
AA seq 1714 aa
MASTSLLPCVPPWPPDLCVVHRDPPAPDPGFSSSSLFFSHPDVRPVCEVSPRLEVAPVTL
ATAHPPSPSSALWVSKLQSSPHNLKKMASPTFSADGTPIVKAPESVLLRSAQIWKDHIVA
QFHGEPPSPAKVFNDLNPIWGKNGRIKVKQHSKGVYMIYIPCELTRRWVLDVAFWHSGNC
SFTVLQWKPNLVLTKMKLEFAPVWILFKNIPPELWSFEGFSSFASGVGFPVQSEFPQLKP
YSNGVIKLKVVIKLEGKKSRCVKVVDKLGNSVTIQVDYLKLPPKCGICSEFGHLALRCPN
PAQRSSVPRVEEAAPKSVLEVSSSGSKLSPKANLQRSPRASHSASSQGGILRRSVSLPGS
PVGSQKSATLNDPNGWILVNTKSSSARSSEKNPSSIPTKANRLSSGRLDSEEELISAAQK
IIRIRLAEEGFDLPPFSSVADRKRYRKLQRQTYRSLCEEDSGDPSSGSQPSVNNLSGQKD
FLAFGSLEAVLPRGLNGRNRRFEVQRWINTSRPMIGGLLETHVKQENLSSIISSSFPGWS
FDSNHCSEAENGRIVVIWNPILSVMVYLKTPQIMVCGVFNPASQIAFTVGFVYAFNERSD
RIALWNSIRQLSLSSILRNSPWIIMGDFNQVLDISEIYSLYQVDFSIGGMDDFRECLDDS
DLYDLSYQGCFHTWTNSSSDNPKSRKLDRALINEAFQDKFPNAGAIFDSPGGSDHSPCLV
TVAQDTHFRRSRFMFFSFFSYHSDYSRLLSDAWSSNGLFGSPMATLYQKLRAAKSLCKSL
NRSAFSDIEKRTKETFEKLQNIQLQLLSNPTPALFIEERQARDSWLVFAAAEQSFFRLKS
RVRWTSKGDLNTGFYHKCVKANLSKNILHFLTDANNTRVFDLNVMKNMAVQFYSRLQGHS
NVAVTPYSVDQIKSIHPFRCSDHHVVLLSAIPSDADIKNTLFALPKDKAPGPDGFSAEFF
TSSWDLVGEDFIKAVKQFFLDPSMSRQTNATVISLIPKTPGASSLSDFRPISLCNTVYKV
IAKLLAARLKLITPKAVQRNQVGFVKGRQLCENVFLASELVADFHKDGATNRGCLQVDIT
KAYDSIEWEFVLNILQAFDLPAVFISWIRECITTPHYSVSLNGELAGFFPGKKGLRQGDP
ISSSLFVMAMDILSKDLDTAAREGGFGIHPQCSNPLITHLSFADDLLIFFDGSSDSLRGI
LYVLRDFQRRSGLALNLRKTCVFVDGNNNHLASDLAMEFGLVQGALPVKYLGVPLLPHKM
RSEDYQPLIDKVKARVNTWTAKRLSFAGRLQLIQSVIYSMINFWSSIFPLPKECLEALEQ
ICNAFLWTGASGSARGAKVSWEVVCSPKQCGGLGLKRLLGLNEVYGVKLIWLIFAGTDSL
WVAWIRNHVIAERLFWIADFSSVGSWIWRRLMKLRFLAKPRLLCHVNSGTTASFWHDNWT
ELGSLIDIIGPLGPLLSGIPIESSVAEAVTTGAWRSSRSRNPVLLHLRQSLPAQIPDVTS
FDDDYYLWRNAVDDPPSSFSASKVWLSINPLPPLVSWYKAIWFPQKIPKHSFIAWLVLKN
RMLTRDRMRSWGLVVPAECLLCGHAAETVEHLFFDCQFSVSVWNYLMSRCRMIYPSSLHQ
IITWLIDIPVRKKIRVILKLLFQALVYFLWKERNSRLHSGARKPVVQIAKEVQLQIRAKL
LSLDRDAASNSRTTQPARHPSQSYLSTWFDRFQH
NT seq 5145 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgtcgacatctctgcttccttgcgttcctccctggcctccggatctatgtgttgtt
catcgggatcctcccgccccagatcctggtttttcgtcttcgtctctgttcttctctcac
ccggatgtgcgtccggtctgtgaagtcagtcctcgtctcgaggttgctccggtgactcta
gctacggcccatcctccttcgccttcctcggcattatgggtatctaaacttcagtcttca
ccgcataatctcaagaaaatggcttctccgaccttctcagcggatggtactccgattgtg
aaagctccggaatctgttctacttcgctcagctcaaatctggaaagaccatatcgtagct
caatttcacggcgagccaccgtccccggcaaaggttttcaacgatttaaaccctatttgg
gggaaaaatggaagaatcaaggtcaagcaacactctaaaggagtctacatgatttacatt
ccctgtgagcttacaaggagatgggttcttgatgttgctttttggcattctggtaattgc
tccttcacggttctacagtggaagccgaaccttgttcttacaaaaatgaaactagaattt
gctccggtttggatcctgttcaagaacatacctccagagttgtggtcttttgaaggtttt
agctcttttgcttctggtgtgggttttccagtacagtcagagttccctcagctaaagcca
tattcaaatggagtcatcaaattgaaggttgtcatcaagttggaagggaaaaaatccaga
tgtgttaaagttgttgataagcttgggaactcggtcactattcaggttgactacttgaag
cttcccccaaaatgtgggatttgttcagagtttggtcatttggctttgcgctgtcccaat
ccagctcaaagatcgtcggtaccaagagtcgaggaggcggctcctaagtcggttctagag
gtttcatcttcgggttccaagctgtcgccaaaagcgaatcttcagcgatctcctcgagct
tctcactcagcttcttctcagggtggcatcttaaggcgttcggttagtttgccgggttct
ccggtgggttctcagaagtctgctaccttgaatgatccaaatggatggattcttgtgaat
acgaagtcttcaagtgctcggtcgtcggagaaaaatccttcttctattcctactaaggca
aatcgtctttcttctggtcggctagattctgaagaagaactgattagtgcagctcagaaa
attataagaattcgccttgctgaagaaggatttgacctacctccgttttcctctgttgct
gataggaagagatatcggaagctccaacgtcaaacctataggagcttgtgtgaggaggat
agtggagacccatcttcaggttctcagccttctgttaataatctcagtggtcagaaagat
tttttggcttttggttctcttgaggctgtgctccccaggggccttaacggcagaaatcgg
agatttgaagttcaaaggtggattaacaccagccgacctatgattggcggccttttggaa
actcatgtgaaacaggaaaatctttcttctatcatttctagttcttttccaggttggtca
ttcgactcgaaccattgctcggaggcggaaaatggtcgtattgtggtgatttggaatccc
atactttctgttatggtttatctaaagacaccacaaataatggtgtgtggtgtgttcaat
ccggcttcgcaaattgcttttactgtggggtttgtctatgcgtttaatgaacgaagtgat
cggattgcgctctggaactctattcggcagctctctctttcttctattttgaggaattct
ccttggattatcatgggtgatttcaaccaagtgctggatatttctgaaatctattctctt
tatcaggttgatttttccataggagggatggatgacttccgagaatgcttggatgatagt
gatctatacgacctctcctatcaaggctgctttcacacatggaccaacagtagctcggat
aaccccaaatctaggaagctggaccgagctctaattaatgaggccttccaagacaagttt
cccaatgctggtgcaatttttgactccccgggaggctcagatcattctccttgtttggtt
acggttgctcaggacacacactttcgaagatctcggttcatgtttttctccttcttctct
taccactcggattactcgcgactcttgagcgatgcttggtcatccaatggcctgtttggc
tctccaatggccacgctctatcagaagttgagagcagctaagtctctttgcaagtcttta
aatcgatccgctttcagtgatattgagaagagaactaaggagacctttgagaagcttcag
aacatccagcttcagttactttcgaatccgacaccggctctttttattgaggaacgacag
gctcgtgattcttggttggtttttgctgcagcagagcaaagttttttcaggcttaagtct
agagttcgttggactagtaagggagaccttaacacaggtttttaccataaatgtgttaag
gcaaatttgtcaaagaacattttgcacttccttactgatgccaataatactcgtgtgttt
gatttgaacgtgatgaagaatatggcggttcagttctactcaaggcttcagggtcattca
aatgttgctgttactccctattcagttgatcagattaagtctattcatcccttcagatgt
agtgatcatcatgtagttcttctttcagctattccttcagatgcagatataaagaatact
ttatttgcgttgcctaaggataaggctccgggccccgacgggttttcggctgagtttttc
acttcatcttgggatctggtgggagaggattttattaaggctgtaaagcaatttttcctg
gatccaagcatgagtaggcaaacaaatgccacagttatttcgttgattcccaaaacacct
ggtgcatcttctctctcggattttagaccaatttccctttgcaatacggtgtacaaggtt
attgcgaagctactggctgcgaggcttaagcttattacaccaaaggctgttcaacggaat
caagtgggtttcgtcaagggtcgccaattatgcgagaatgtctttcttgcttcggagttg
gttgcagattttcacaaggatggagctactaataggggttgtctccaagtagatataacc
aaagcctatgacagcattgaatgggagttcgttcttaatattcttcaggcttttgacctt
ccggcggtcttcatctcgtggataagagaatgcataactactccgcattattcggtctcg
ctcaacggagagttggcaggtttctttcccgggaaaaaaggccttcgccaaggtgatcca
atatcttcttccctctttgttatggctatggacatcctctcgaaagatctggatacagca
gccagagaaggaggttttggtatccatcctcagtgttctaatcctttgattactcatttg
agttttgccgacgatctccttattttctttgatgggtcatctgattctcttcgtggaatt
ttatatgtccttcgggacttccaaagaaggtccggcctggccctgaatctcaggaagacg
tgtgtgtttgttgatggaaataacaatcacttggcttcagatttggctatggagtttgga
ttagttcagggagctctgccggtgaaatatctaggagttccgcttctgcctcacaaaatg
cggagtgaagactatcagccattgattgataaagttaaggctcgggtgaatacttggact
gcaaaacgactctccttcgccggaagacttcagttgattcaatctgtaatctacagcatg
attaacttttggtcatctatcttccctcttcctaaggagtgtttggaagctttagagcaa
atttgtaatgcttttctttggacgggagcttcaggttcggcgagaggggcaaaggtttcc
tgggaggttgtctgttccccgaaacagtgcgggggtttgggccttaaacgacttctgggt
cttaatgaggtatatggagtgaagttaatttggctcatttttgctggaacagattccttg
tgggttgcctggattaggaatcatgttatagcggagagactgttttggatagctgatttt
tcaagtgtgggcagctggatatggcgccggttaatgaagttaagattcttggcgaagccc
cggcttctttgtcatgttaactcgggaacaactgcgtctttttggcatgataattggacg
gagttagggtctcttattgacattatcggtcctctcggaccgttgctatctggtattcca
attgagagctcggtggcggaggctgttactacaggagcgtggagatcgtctcgtagtcgt
aaccctgttttgctgcaccttcgtcagtcattaccagctcaaattcccgacgttacctct
ttcgatgatgactattacttatggaggaacgcggttgatgaccctccatcctccttttca
gcttccaaagtctggctttctattaatccactcccacctttggtttcttggtacaaggct
atctggtttcctcaaaaaattccgaagcattctttcattgcctggcttgttttgaagaat
agaatgttaacccgagataggatgagatcttggggtttggtggttcccgcagagtgcctt
ctttgtggtcatgcagcagagacggtggagcatctgttttttgattgtcagttctcggtt
tcggtctggaattatttgatgtcgaggtgtagaatgatctacccctcgtctctgcatcag
ataatcacttggttgattgatattccagtaaggaagaagatcagagttatcctcaagcta
ttgtttcaggctttggtttacttcttatggaaggaacggaactctcgcctgcactcggga
gcccgtaagccggttgttcaaattgcaaaagaagtacagcttcagattagagcaaagctt
ctgagtcttgatagggacgcagcatcaaattcccgcaccactcagcctgcccgccatcca
tcgcagtcctacctctctacttggtttgatagatttcaacattga

DBGET integrated database retrieval system