KEGG   Rickettsia typhi B9991CWPP: RTB9991CWPP_02165
Entry
RTB9991CWPP_02165 CDS       T01810                                 
Name
(GenBank) cell surface antigen Sca3
Organism
rtb  Rickettsia typhi B9991CWPP
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFE55136
LinkDB
Position
556814..563809
AA seq 2331 aa
MKKSKILRKFLATASLCGTLFTNSNATGAIIPNSGSVSLNTGAGLVGGVFQNGDIIQIVN
GGREIKISADKANAVIGGISALRELPDFGGVEVSQNVSIGPLSAGENLNTNFGPLKFISN
NVTSIITGVDTQTFSNIDFAGKNATLQINKDLNITTKIDNTVAGNNGTITFEGSGVISNH
IGFTNSLLGINVGNGEAKIDASRANNITINAKNINLTHNNSIFTLCDCNITTLKGNINNT
TGIDGQGILNLAYDPDSSNIITGDIGNIGSLDTINVLRGSATLNSTIVKATNINLQHDTA
TLNLGDNIIVIGNIKGINNEEERLNLKVNDQIDNEMIIPINKGMSGKLNLQGNATLNGNI
DNLRILKFSGGHDKILNLQGNTEVEHIIFEDSILNSGTITVNGLLNTHVVTFNKSNANGG
TLIINAKNTISASLLNAIKAKIQINANLTINHPSAGHIGDIRIADNTTYTINADIGHVNL
LQNGAKIMFEGADAMLALINTSFTDRTFTIYNNLNQSGNDEYGIVKIEAITKGITISNHS
EPYTIGQDNTHRLKELIVEGGGNIIVDNTVFTKLLSINSTGQITFNRTLDLGAGGNIAFG
KNGTLVVHGVAGSITTSENNQGILTINSGNVTGTIGANGLGLKLVNIGAGSVTCSANVFA
PVALTNPSSILILADGVTLTGTVTTHNNTKGILSLGIGSNVTGLIGENNATLEKINIGAG
ASNIDNNIYAGSMVLTDKTSELILNTNVVVNGNITTIAGNNSGKLVFTGNGDITGNIGAN
GAALQEVVFNGTTNIGGTANSQNFTVAHSEANVVITGLTTGSLKYKDTGTIIANGGLVGD
IDFNNKAGKFILGDGTTIDGSVLCTGGIAGTLHFIGDGNVTQNIGSDTENSISTINIQGD
NTKNVTITNDIFVNNIYFTNGGVLQLGGNLTTHNIDFGANGGTLEFNGNNTYNLNAIIVN
GQNGILNAFTNLKATDDTIGTVKIINIGQIGTPQNFTIQVNNKNLTLVSNINSSINFCDS
NSQLILSAPVDQTIKFINNLNGTGGGIITLDGNGNNLTISGNNGIKLGSRDNELSSLNIK
GKVTVTHNLDVQNIHQLNINNGAFFNDHSLTSAKIKNINIGEETGEATYTLDAINCDFDL
NTSGMVFKHQDSVLELKNSSNTNDRIITLTSVLDPGNGQSGIIKLITDTNKLTIDNNGNV
AYTLGTANHMLKQLTFTSINNGAIALKVGINVENITLNIKDIELNEVNANVLFNKNVTYT
ATGNINGHVDFQGNAGVINLDDGIKIDGSVTSTNDVNGTLNLNGSGEVTGLITNIAMLQA
GAGDVSLSASGNYSITEIQGNGNNNLTFAANSHLTTDINKTDGQAVNLVFINGGSVSGSV
GLSKAVGDIIIHAGNVTFNNTVKSSNVVISDGSTMQVNNNITANDISGKNINNGTLKLNN
HTPIIITSTLGHNNSIGTIEVANNDVTITGALKAQNIHFSNAAQETTLTLGAASQVTNIT
TAGNNIHTLEITDLDTGNDGTIGTENNRLKSIELTGNGTITINSKHVYSSITTANNEQGN
VKLNIEGGIAYDLGSEIRSLANVQISEDSTVKGDVYSKYLNIDAGKTINFDRGDNNMNPK
NLDIPDAIIDLDVLPRSLSLFNYFTDIKADNLNFVDGTATANFKDAVVIDARIDNGGTLK
FNNNVWLTQEIKNANSIEIASNKFMLLQKNIKAATLIADKANLVLLDNVEINTNLNVRDI
VLDLANYELKYTGNVTHNGLLTIITYFDTALQKGGHILVGQGSNVDMSDLDNLIIKIKSR
SDITNITSDTKHQVVKLEAGAIYNPVPQTKVIIDASGEQNKFVKWVTDANGFVLLTNTDT
IGQNNTDNGSLDNGYVGNSSNNNSSNGVVGPSKDKDHGITDIAPIFDPSPILDYTKNNYV
ASSIANQLINHVKGFGNTTDAGKLLNDLGFMLPNRVTETLDRLSHRTNINGLNEGVAGLN
GIEIENFLTDIAINMDNFTAEGIGNRLEELIDAGTVNGLNRTNASLNNNNLNLRRLAANN
QTVIAAGDEDNTVTGIWGMSFYSKIKQNSKNSASGYQSNTGGGIIGFDYNIDNSIVIGAA
YTMADSKVKHKNDKSGDKTKAKSNIYSIYGLYHWLNNNFFVEAIGVYGRNKIKNYEKRIT
AITDQTAIGKFINTFYSYELLGGYNYLVSNRTTITPMFGIRYTTLKNNSYKENNTTFQNL
SIKKNYHDKFETILGLNGATHYLAQDIIIKPELHWFINYQYKNKLPNIDARLDGIDEPLT
TIRFKSAKITYNLGGGISTKNNMIEFGIRYNLSLAKKYTAHQGSLKIKVKL
NT seq 6996 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaatcaaaaattttaagaaaatttttagcaacggcatcactatgcggaacatta
tttactaactctaatgcaacaggagcaataattcctaatagtggtagtgtaagcttgaat
actggcgcaggtcttgttggaggagtattccaaaatggtgatattattcaaatagttaat
ggagggcgtgaaattaaaatatctgcagataaagcaaatgctgtgattggaggaatcagt
gcattaagagagctacctgattttggtggtgttgaagtaagtcaaaatgtttcaataggc
cctcttagtgcaggagaaaatcttaatactaattttggtcctctgaaatttattagtaat
aatgttacgtcaattattacaggagtcgatactcaaacatttagtaatatcgattttgca
ggtaaaaatgctactttacaaattaataaagatttaaatattacaactaaaatagataat
acagtagccggaaataatggtacaataacatttgaaggtagcggcgttatatcaaatcac
ataggcttcactaactctcttttaggaataaatgtaggaaacggagaagccaagattgat
gcatcaagagcaaataatattacaattaatgctaaaaatataaatcttactcacaataac
tctatattcactctttgtgactgtaatataactacattaaaaggtaatatcaataatact
acaggcattgacggtcaaggtatattgaatctagcgtatgatcctgatagtagtaacata
ataacaggtgatataggtaatataggctcattagacacaataaatgttttgcgtgggtct
gcaacattgaattctacaatagtaaaagcgactaatattaatttacaacatgatactgca
acgctcaatttaggtgacaacataattgttattggtaatataaaaggtattaataacgaa
gaagagagattaaatttaaaagtgaatgatcaaatagataacgaaatgattattcctatt
aataaaggtatgagcggtaaattaaatttgcaagggaatgctacacttaatggaaatata
gataatttaaggatacttaagtttagtggaggtcacgataaaattttgaatttacaaggg
aatactgaagtagagcatattatttttgaagatagtattttaaattcaggtactataact
gttaatggtttattaaatacacacgttgtgacttttaataaaagtaatgctaacggaggc
acattaataataaatgccaaaaacacaatcagtgcatcattattaaatgctataaaagca
aaaatacaaatcaatgctaatttgacaattaatcatccaagtgctggacatataggtgat
attagaatagcggataacacaacatacacaataaatgcagacatagggcatgtaaatttg
ctacagaacggtgcaaagataatgtttgaaggagctgatgctatgttagctttaatcaat
actagttttacagatagaacctttacaatatataataatctaaatcaatctggcaatgat
gaatatggaatagtaaagatagaagcaattacaaaaggaatcactatatcaaatcacagt
gaaccttatactatagggcaggataatacacatcgtcttaaggaattgatagtcgaagga
ggtggtaatatcatagtggataatacggtatttacgaagttacttagtataaacagtaca
ggacaaataacatttaatcgtactttagatttaggtgcaggcggtaatattgcatttgga
aagaatggcacgttagtagtacacggtgtagcaggttcaatcacgacttctgaaaataat
caaggaatattaacaatcaatagtgggaatgttactggtacaattggtgctaatggactc
ggcttaaaacttgtaaatattggcgcaggttctgttacgtgttcagcaaatgtatttgca
ccggtagctttaactaatccaagttctatattaattttagcggatggtgttacgctaaca
ggtacagtaaccacacataataatacaaaaggtatattatcgcttggaataggaagtaat
gtaacaggtctaatcggtgagaataacgcaactcttgagaaaataaatattggggccggc
gctagtaatattgataataatatatatgcaggttctatggtactaacagataaaacatcg
gaattaattttaaacactaatgtagtcgttaacggtaacatcacgactattgctggaaac
aatagtggaaagttagtatttacaggtaatggtgacataacaggaaacataggcgcaaat
ggtgcagctttgcaagaagtggtatttaacggtactaccaatataggcggtacagcgaat
tcacaaaactttactgttgcgcattctgaagcaaatgtagtgattacaggacttactact
ggttcattaaaatacaaagatactggtacaattatagctaatggaggattggtaggagat
attgattttaataataaagctggtaaattcattttgggtgatggtactacgattgatggc
tcagtgttatgtactggagggattgctgggacattgcattttataggtgacggtaatgta
actcaaaatataggttcagatactgaaaatagtatttcaactatcaacattcaaggagat
aatacaaaaaatgtaactataacaaatgatatatttgtaaataatatttattttacaaac
ggtggggtattacaacttggtgggaatctcacaactcataatatagattttggagcaaat
ggtggtactttagaatttaatggtaataatacatataacttaaatgctattattgtaaac
ggacaaaatggtatattaaatgccttcacaaacttaaaagctactgatgatactattggt
acggttaaaataattaatataggacaaataggaacgccacaaaactttactattcaagtt
aataataaaaatttaacgctagtaagtaacataaatagtagcattaatttttgtgattct
aattcacaattaatattatctgcaccggtagatcaaacgattaaatttattaataattta
aacggaactggaggtggtattatcactttagacggtaatggtaataatttaactataagt
ggtaataatggaataaagcttggtagtagagataatgagttatctagcttaaatatcaaa
gggaaagttactgtaactcataatttagatgtacaaaatattcatcaattaaatataaac
aatggtgcattctttaatgaccacagtctaacatctgctaaaatcaaaaatataaatatc
ggtgaagaaacaggtgaagctacttatactttagatgctataaattgtgacttcgattta
aatacaagtggtatggtatttaaacatcaagattcagtattagaattgaaaaatagttca
aatactaacgaccgcattataacactaacatctgttttagatccaggtaatggtcaatcc
ggtataattaaactaataacagatactaacaaattaactatagataataatggtaatgtg
gcttatacactcgggacagcaaatcatatgttgaaacaattaacttttactagtatcaat
aatggggctatagctttaaaagtagggatcaatgttgaaaatattaccttaaatattaag
gatatagagttgaacgaggtaaatgcaaatgttctgtttaacaaaaatgtaacatatacc
gcaacaggtaatataaatggtcatgtagattttcaaggtaatgcaggtgtaataaatctt
gatgacggtataaaaattgacggtagtgttacaagtaccaatgatgtaaacggtacatta
aatttgaatggatcaggtgaagtaactggtttaatcactaatatagcaatgctgcaagca
ggagcgggtgatgtatcgctatctgctagcggtaattattctattactgaaattcaaggt
aacggtaataataatttgacatttgctgctaattcacacttaacaactgatattaacaaa
acagatggtcaagctgtaaatttagtcttcattaatggtggtagcgttagcggttctgtc
ggcttaagtaaagcagtgggtgatattatcatacacgcaggaaatgtaactttcaataat
actgttaaaagcagtaatgttgttatatcggatggttctacgatgcaagttaataataat
ataactgctaatgatatctcaggcaaaaatataaataacggtactttaaaactaaataat
catacacctattattattacaagtacacttggtcataataattctatagggacaatagaa
gttgcaaataatgatgttacaattacaggagcactaaaagcacaaaatattcatttttca
aatgctgctcaggaaaccaccttaactttaggtgcagcatcacaagttactaatattacc
acggcaggaaataatattcatactttagaaataacagatttggataccggtaacgacggc
acaataggaactgaaaataatagattaaaatcaatagaattaacaggaaatggtacaata
actattaattctaaacatgtttattcatctattactactgcaaataacgagcaaggtaat
gtcaaactcaatatagaaggcggtattgcttatgatttaggaagtgaaataagaagttta
gcaaacgtacaaattagtgaggatagtactgttaaaggtgacgtatattctaaatatctt
aatatagacgcaggtaaaactataaattttgatagaggtgataataacatgaatccaaaa
aatttagatataccagatgctataatagatttagatgtattacctcgctcactctcacta
tttaattacttcactgatattaaagcagataatttaaattttgtagatggtactgctaca
gcaaattttaaagatgctgttgtaatagatgcgcgtattgataatggtggtactttaaaa
tttaataacaatgtgtggttaacacaagaaattaaaaatgctaacagcatagaaattgca
tctaataaatttatgttgcttcagaaaaacattaaagcagctactttaatagctgataag
gcaaacttagtattattagataatgtagaaataaatactaatctaaatgttagagatatt
gtattagatttagctaattatgaattaaaatataccggcaatgttacgcataacggacta
ctgactattatcacttattttgatactgcattacaaaaaggtgggcatatattagttggt
caaggatctaatgtcgatatgtctgatttagataatttaataattaaaattaaatcacgc
tccgatatcactaacattacctcagatactaaacaccaagtagtaaaactggaagcaggt
gcaatatataatccagtaccgcaaactaaagtcattattgatgcaagcggggaacaaaat
aaatttgtaaaatgggtcactgatgcaaacggttttgtattactgactaatactgatact
atagggcaaaacaatactgataatggtagtctggataatggttatgtaggaaatagcagt
aataataatagtagtaatggagtagtgggaccaagtaaagataaagatcatggcataact
gatatagcaccaatttttgatccatctccgatcttagattatactaaaaacaattatgta
gcttctagtatagcaaaccaacttattaatcatgttaaaggttttggtaatactactgat
gcaggtaaattattaaatgatttaggttttatgctaccgaatagagttactgaaacatta
gatagacttagtcatagaacaaatattaatggacttaatgaaggagtagcagggttaaat
ggtatcgagattgagaattttttaacagatatagcaataaatatggataattttactgct
gaagggattggtaatagattagaagaattaatcgacgcaggtactgtaaatggtctaaat
agaacaaatgcatcgcttaacaataataatcttaatctaagaagacttgctgctaataat
cagacagtaattgctgcaggtgatgaagataatacagtaacaggcatttggggcatgtca
ttttatagtaaaataaaacaaaactctaaaaatagtgcaagcggttatcaatctaataca
ggtggcggtataataggttttgactataatattgataattctatagttataggtgctgct
tatactatggctgatagtaaagttaagcacaaaaatgataaaagtggtgataaaaccaaa
gctaaaagtaatatatattccatctatgggctttatcattggcttaataataactttttt
gttgaagctataggtgtgtatggtagaaataaaatcaaaaattatgaaaagcgtataact
gctattactgatcaaaccgcaattggtaaatttattaatactttttatagctatgaatta
ctaggtggatataactatctagtatctaatcgtactactataacgccaatgtttggtatt
cgttatactacattgaaaaataatagttacaaagaaaataatactactttccaaaattta
tctataaagaaaaattatcatgataaatttgaaactatattaggtttaaatggggcaact
cattatttagcacaagatataataataaaacccgaattacattggtttataaattatcaa
tataaaaataagttaccaaatattgatgcgcgtcttgatggcatagatgaaccgctgaca
acaattagatttaaatctgcaaagatcacatataatttaggtggtggtatttctactaaa
aataatatgatagaatttggtattagatataacttatctcttgcgaaaaaatatacagca
catcaaggatctttaaagattaaagtgaaactataa

DBGET integrated database retrieval system