Rickettsia typhi B9991CWPP: RTB9991CWPP_02670
Help
Entry
RTB9991CWPP_02670 CDS
T01810
Name
(GenBank) penicillin-binding protein
KO
K05515
penicillin-binding protein 2 [EC:
3.4.16.4
]
Organism
rtb
Rickettsia typhi B9991CWPP
Pathway
rtb00550
Peptidoglycan biosynthesis
rtb01100
Metabolic pathways
rtb01501
beta-Lactam resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtb00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
RTB9991CWPP_02670
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
RTB9991CWPP_02670
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
rtb01011
]
RTB9991CWPP_02670
Enzymes [BR:
rtb01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.16 Serine-type carboxypeptidases
3.4.16.4 serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase
RTB9991CWPP_02670
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
rtb01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
DD-Transpeptidase (Class B PBP)
RTB9991CWPP_02670
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transpeptidase
PBP_dimer
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFE55237
LinkDB
All DBs
Position
complement(716446..718230)
Genome browser
AA seq
594 aa
AA seq
DB search
MLNKKILHGELISRRAFIIGLGKLWFLSLLGIRMFYLQLIKSEEYRTLSDKNRINFVVLP
PIRGKIYDLDGNILATNKPCYQLVIDKSINNNYRDELEIISNILNFSPDKYNYIKQKIKK
SSRHTILTILDHLDWEQVSMIEEQKHKLAAIFIDVGYLRFYPFSSTTSHLIGYLGQINEQ
EKQELNIRSLSDFNIGKSGIEKYYDNKLRGEFGYKKVEVNAYGKQVRTISETPTQSGADM
HLNIDASLQKKIQQYLNPKGSSAIVMDIRTGNVLICVSTPGFESNNFSKLSENYWQSLIS
DPHKPLINKVIQNSYPPGSVFKIITVLAALEVGINPNKTVFCDGSSILGTNSFRCWNHRG
HGTLDMMSALKYSCNIYMYELARIVGPDKILAVAREFGFGSKTGIDISPESSGFVPSKEW
KKKKLKLPWSIGDSFNLAIGQGFLGVTPIQLARFITAIASNGKLYTPRILKNASEFYNVN
IKTENIKIIQESLYNTVNVAGGTAYYNRIFAENRKLAGKTGTAQVQSKLNAKDDLNRDSI
AWARRNHALFLGFAPYSDPRYSVTVFVDHGGGGSIAAAPVARKIMSDVLDKYMR
NT seq
1785 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaataaaaaaatactacatggtgagttgatttcacgaagagcctttataattgga
ttaggtaaactctggtttttatcactgctgggcataagaatgttttatttacagcttatt
aaaagtgaagaatataggactttatcagataaaaatcgcattaattttgttgtacttccg
ccgattagagggaaaatttatgatttagatggtaatattttagctactaataaaccatgt
tatcagttggtaatagataagagtattaataataattatagagatgaattggaaataatt
agtaacattttaaatttctctccagataaatataattatattaagcaaaaaattaaaaaa
tctagtcgtcacactattttaacaatactagatcatcttgattgggaacaagtttcgatg
attgaagagcaaaagcataaactagctgcaatatttattgatgtagggtatttaagattt
tatcctttttcaagcactacttctcatttaataggttatcttggccagatcaatgagcaa
gagaagcaagagttaaatatacgtagtttaagtgattttaatataggtaaatccggtatt
gaaaaatattatgataataaattacgaggagaattcggttataaaaaagttgaagtcaac
gcttatggtaaacaggtaaggacaatatcagagacgcctacccaatcaggggctgatatg
catttaaatattgatgcgtctcttcagaaaaaaatccagcaatacttaaatcctaaaggt
tcttctgcaatagttatggatattagaactggaaatgtgctaatttgtgtttctactcca
ggttttgaatcaaataatttcagtaaattatcagaaaattattggcaaagtttaattagc
gatccgcataaacctttaattaataaggtaatacaaaattcttatcctcctggttcggtt
tttaaaataattaccgtacttgcagcacttgaagtaggaattaatcctaataaaacagtt
ttttgtgatggtagctctattctcggtactaatagttttcgatgttggaatcatagaggg
catggtacgctcgatatgatgtctgctttaaagtattcctgtaatatttatatgtatgaa
cttgctagaatagtaggcccggataaaattcttgcagttgcaagagaatttggttttggt
tcaaaaactggtattgatatatcacctgaaagtagtgggtttgtaccttcaaaagaatgg
aaaaagaaaaaattaaaacttccttggtcaataggtgatagttttaatttagcaattggg
caagggtttttaggggtaacaccaattcagttggcaagatttattacagctattgcaagt
aatggtaagctatatacgcctagaatattaaaaaatgcttcagagttttataatgtgaat
attaagactgaaaatattaaaataatacaagaaagtttgtataatactgtgaatgttgct
ggaggtacggcgtattataatagaatttttgctgaaaataggaagttagctggtaaaaca
ggcactgctcaggtgcaaagcaaactaaatgctaaagatgatttaaatcgtgattctatt
gcatgggcaagacgtaatcatgctttattcttaggatttgctccatattcagatcctcgt
tattctgttaccgtttttgtcgatcatggaggaggtggtagtattgcagctgcacctgta
gctcgtaaaatcatgtccgatgttcttgataagtatatgcgctaa
DBGET
integrated database retrieval system