Rathayibacter toxicus WAC3373: APU90_08435
Help
Entry
APU90_08435 CDS
T04269
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rtc
Rathayibacter toxicus WAC3373
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALS57793
UniProt:
A0A0U1PW14
LinkDB
All DBs
Position
1831426..1836813
Genome browser
AA seq
1795 aa
AA seq
DB search
MDLGAIEEDVPFDNGTAEKLIAEFNAAAATLEGQGVSRSTAVTSALTEFRGRFAELFQSN
ARIAAQDSTELTERLRQVATAAGRLREEAQKEQERRRIAREWKHKHDNKNFFEKAGEALF
GEEHPPVGPAAQPLSLPVEAGSTGSRETPAPSGTGFGSGTSSARPADLRSFATTTVALND
DLKDKPTTLRGLLADFAANCRWGYLSADGVVAGLEQWLTANAHDATWATTLANAFAAAGG
EGVVSRVADSALAVALTSAGASLRRQDLTIDPPQAFGAPPTTGYADDPVNTATGNFLEAE
VDLGFSGGCASLEFSRSYNSLDDRSAAFGRGWSSIADERLRLADDGATWVLRDGREIFFP
REGDGWARAVGENCWLVSEGEHLVVSGNDGSRREFSSSGRWLSASTGPGTRVWADYDVQE
RLVRLRHERGRWIDIEWAQDRIVVVTASDGRRMEYEYEHDRLVAATGPLGSRRYGWNEDG
LLASVTDVGGVVEVANTYDARRRVVTQRSPFGRVTRYAYLPGRTTVVSDEDGTRSNTWIA
DARGRLVGVIDSHGRRQSMSFDARGNLLSVTERNGAVTAHAYDERGRRVRTVTESGADIT
YGYDSHDRVTTVVAEAGAVTSYEYPDDDSRNPCVLSDPEGGRTTLIWSAGLLTEAIDPVG
VAVRFHYDEHGELIATTNAEGQTARLERDAAGRVTAAVSPSGARTQLRYDDAGRLVSHRD
ALGATWRYEHDSGSRVSAIIDPLGARTVMEHGEHGEVTRTIDPLGRAVTRLFDDLGNVEA
AILPDGSAWRFAHDALSRLTAITDPTGEVWRREYDATGELAALIDPTGVRCSLSAQARRV
TVNDGVASARVECDPLGRPTSVESPDGSTSVTVYDRCGRPVELLDGEGSLTVLRRDAAGR
VVEHISPTGAVTRYEYDRCGRPQAVVDPSGARTTIEYDADGRPVRQVAANGEVEWTEYDV
VGRVTAQHTPGRGTARYRYDALGRVVFSRDSWYGTRRFRYDAAGQLVEAVNGLGGVTRYE
YDERGRTTAVIDPLGGVNRRAYDATDRAVAVTDPLGRTTTAGYDAAGRPLWQQDPDGHRA
QWRYDGSGREASSWVDGRCVSEIDRDVRGRRVVVTDHSAAEGPVAHTLVWNRRGQLVGRT
RGGRGVAWEYDAGGARVAMVDPDGVRTVYERDALGRVVAVEHPLLGRAECEYDAAGRLVS
SSAGGVVQRWEYRDGFPVVHEVVGSGVSVLDRDGEGRLVRVSGFEGVVEYGYDGACQLVE
SRGRVVSSWRYDVGGRVVSEMVAGRSVVNSYDVAGQLVRSVGGDGSVSEFVYDGLGRRVR
VRGADGGERCFAWSGGGWLESVTDRGGDGSVSVTRLSVDVLGELASVDGVEVWWDSAAVV
PAVVSVGGVSVVSAPGGVTGVGGRWLGSGWRGERGTGLWDPWGVVTVAAGGGGVPVGVSV
TAGGGVAVAGVEWLGFRVYDPGTRGFLSVDPLEPVVGSGWVGNPYSYAGNDPLHAVDPWG
LRPVTDEELRVYREGNNGVFAAQWDWSCKNWEYAAGVAMVGAGGFLMATGIGGPLGVMLI
GAGVDTIIQKATSGKVEWGEVAVSGALGAFGGAGVAAKAGFTGMKAAVVAGAASGGVSGG
VQNTYSYMTGPGPHDVGGALQSAAVGTASGALLGAGGGAAGQFASQKVMGALAHNPGAET
MAMGRSMPQRVTPYALKNDYGYYKALPDPVFRKGEKVLGKKINEKANVWVNKKWIDYQMK
QGKNLVDIGAPDELLRPQGLKPLDPSAYYSMELERVKGYPQYRQDPQPQWDLRNK
NT seq
5388 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatctgggcgcaatcgaagaggacgtgccgtttgacaatggcaccgcggaaaagttg
atcgcggagttcaacgccgcggcggcgaccctagaggggcaaggagtctcccgttccacc
gcggtgacgtcggcgctgacagaattccgcggacgtttcgcggagctgttccagagcaac
gcccggatcgctgcccaggactcgacagagctcaccgagcgtttgcgccaggtggccacc
gcggcaggacgtctgcgagaagaggcacagaaagagcaggagcggcgccggatcgcgcgc
gagtggaagcacaagcacgacaataaaaactttttcgaaaaggccggagaagctctgttc
ggggaggagcatcctcccgtaggtcccgcggcgcagccgctatccctgccggttgaggcc
gggtctaccggcagccgggagactcctgcgccctccggtactggcttcggcagcggcacc
tcttcggcgcgcccggccgatttacgttccttcgcgacgaccactgtggcactcaacgac
gatctgaaggacaagccgaccaccctgcgcgggctgctcgccgacttcgccgcgaactgc
cgctggggttacctctcggcagacggagtcgtcgccgggttggaacagtggctgacggcc
aatgctcacgatgcaacctgggcgaccaccctcgcgaacgcttttgctgccgccggtggt
gaaggcgtggtatccagggtggccgacagtgctctggcggttgcgctcacgtcagcgggc
gcctcgctccgccgccaggacctcaccattgatccgcctcaggcctttggggcaccgccc
accaccggctacgccgacgacccggtcaacacggctaccggcaatttcctcgaggcggag
gttgatctcggattcagtggcggctgcgcctcgctggaattcagtaggagctataactcg
ctcgatgaccgcagtgccgccttcgggcgaggctggtcctcgatcgcggacgaacggctc
cggctcgccgatgacggtgcaacctgggtgttgcgcgatggccgcgagattttcttcccc
cgcgagggcgacggctgggcgcgcgcggtcggcgagaattgctggctcgtttcagagggc
gagcacctggtcgtgtcgggtaatgacgggtcgcggcgggagttctcctcctccggacgc
tggctgagcgccagtacgggcccgggcacccgggtctgggccgattatgacgttcaggag
cgtctggttcgcctccgccacgaacgtggccgctggatcgatatcgagtgggcgcaggac
cgcattgttgtggtgacggcttcggacggccgtcgcatggagtacgagtacgagcacgac
aggctcgtcgcggccacaggcccgctgggttctcgccgctacggctggaacgaggacgga
cttctcgcgtcggtaacggacgtcggcggcgtggttgaggtcgccaacacctacgacgcg
cgccgccgggtcgtgacgcaacgttctccctttggacgggttactcgttacgcctatctg
ccgggtcggacaacggtggtttctgacgaggacggtacgcggtccaacacctggatcgcg
gatgcgcgtggccgacttgtcggggtgatcgattcccacggtcgacgtcagtcaatgagc
tttgacgcgcgcggcaatctcctctcggtgacggagcgtaatggggccgtcaccgcgcac
gcctacgacgaacgggggcgacgggtgcgtaccgtgactgagtccggcgcagacatcacc
tacggttacgacagccatgaccgggtcaccaccgtggtggcggaagcgggcgcggtgacc
agctacgagtatccggatgatgactcccgaaacccctgcgtgctgagcgatccggaggga
ggccgcaccacactcatctggtcggcgggtttgctcaccgaggccatcgatccggtgggc
gttgcggtgcgttttcactacgacgagcacggcgagctgattgccacaacgaatgctgag
ggccagacggcccgtctggagcgtgatgcggccggtcgagtgacggcggcggtgtctccg
tcgggcgcccgcacccagctgcgctacgacgatgccggtcgactggtgtcgcaccgtgat
gcgctcggggcgacctggcggtatgagcacgactccggcagtcgagtgagtgcgatcatt
gacccgcttggcgcacggactgtcatggagcacggcgagcacggtgaggtgacccgcacg
attgatcccctcggccgcgcggtgacgcggttgtttgatgacctcgggaacgttgaggcc
gcaattttgcccgacggttccgcctggcgtttcgcgcatgatgcgctttcccggttgacg
gcgatcacggatccgaccggtgaagtgtggcgacgggagtatgacgctactggtgagctt
gctgctcttattgatccgaccggagtgcgttgttcgctgagtgcgcaggctcgtcgtgtg
acggtgaatgatggtgtcgcttctgcgcgggtggagtgtgatcctctcggacggccgacc
tcggtggagtcgcctgatgggtcaacttctgtcaccgtgtatgaccggtgtggtcgtccg
gtggaactgcttgatggtgagggctcgttgactgttctgcggcgtgatgctgcgggcagg
gtggtagagcatatttctcccactggagcggtgactcggtatgaatacgaccggtgtggt
cgtcctcaggctgtcgttgatccgtccggcgcgcgaacaacgatcgagtacgacgcggat
gggcgcccggtgcgccaggtcgctgcgaatggtgaggtcgagtggacggagtatgacgtg
gttggtcgggttaccgcccagcacactcctggtcgggggacggcccgttaccgttatgac
gctctcggtcgcgtggttttcagtcgtgactcgtggtacggcacccggcgtttccgttat
gacgctgccggtcagttggttgaggccgtcaatgggctcggtggggtgactcgctatgag
tatgacgagcgtggtcgtacgacggccgtcatagatccgctgggtggggtgaatcggcgg
gcgtatgacgcgactgatcgcgcggttgcggtgactgatccgttggggcgtaccaccacg
gcgggttatgacgccgcgggtcggccgctgtggcagcaggatccggatggtcatcgtgcg
cagtggcggtatgacggttcgggtcgtgaggcgagctcgtgggttgatgggcggtgtgtg
tcggagatcgatcgtgatgtgcggggccgtcgtgtggtcgtgacggatcactctgctgcg
gagggaccggtggcgcacacgttggtctggaatcggcgtggtcagttggtggggcgcact
cgtgggggccggggtgtggcgtgggagtacgacgcgggtggtgcccgggtggcgatggtt
gatccggatggtgtccggactgtgtatgagcgtgatgcgctggggcgtgttgttgcggtg
gagcatccgttgttggggcgggcggagtgtgagtacgacgctgcggggcggctcgtgtcg
tcctctgctggtggggtggtgcagcggtgggagtaccgtgacggcttcccggtcgtgcat
gaggttgtggggtcgggggtgagtgttcttgatcgtgatggtgagggtcgtttggtgcgg
gtgagtggttttgagggggttgtggagtatgggtatgacggggcgtgtcagttggtggag
agtcggggtcgggtggtgtcgtcgtggcggtatgacgtgggtgggcgtgtggtgtcggag
atggttgctggtcggtcggtggtgaacagttatgacgtggcgggtcagttggtgcggtcg
gtggggggtgatggttctgtttctgagtttgtgtatgacgggttgggtcggcgggttcgg
gtgcggggtgctgatggtggggagcggtgttttgcgtggtcgggtggtggttggttggag
tcggtgacggatcgtggtggtgatggttcggtgtcggtgacgcggttgtcggtggatgtg
ttgggggagttggcgtcggttgatggggtggaggtgtggtgggacagtgctgctgttgtg
cctgctgtggtgagtgtgggtggggtgtcggtggtgtcggctcctggtggtgtgacgggg
gttggtggccggtggttggggtctggttggcgtggtgagcgtgggactgggttgtgggat
ccgtggggtgtggtgacggttgctgctggtggtgggggtgtgccggtgggggtgtcggtg
actgcgggtggtggtgttgctgttgctggggtggagtggttgggttttcgggtgtatgac
ccgggtactcgtgggtttttgtcggtggatccgttggagcctgtggttggttctgggtgg
gtggggaatccgtattcgtatgcgggtaatgatccgttgcatgcggtggatccgtggggt
ttgcgtccggtgacggatgaggagttgcgggtttatcgggaggggaataacggggttttt
gctgcgcagtgggattggtcgtgtaagaactgggagtatgcggctggggttgcgatggtg
ggtgctggtggttttttgatggccactggtattggcggtccgttgggtgtgatgcttatt
ggtgcgggggtggacacgattattcagaaggctacgtctgggaaggtggagtggggggag
gttgcggtgagtggtgctttgggggcgtttggtggtgctggggtggcggcgaaggcgggt
ttcacgggaatgaaagcggcggttgtggcgggtgctgcgtcgggtggtgtgagtggtggt
gtgcagaacacgtatagctatatgacggggccgggtccgcatgatgttggtggtgctctt
cagtctgctgcggtagggactgcgagtggtgctttgcttggtgctggcggtggtgcggcc
ggtcagttcgctagccaaaaagtgatgggtgccctggcccataatcctggtgcggaaact
atggctatgggacgatccatgccacaacgggtcacaccgtatgccctgaaaaacgactac
gggtattataaagcactacctgaccctgtctttcgtaaaggggagaaagttctcggtaaa
aagataaacgaaaaagcaaatgtttgggtcaataagaagtggattgattaccaaatgaag
cagggcaagaatcttgttgatattggtgcgccggatgagttgctccgtccacagggtctt
aagccgttagatcctagcgcttactattctatggagctagagcgggttaagggttatccc
cagtatcgtcaggatccgcagccccagtgggatctccggaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system