Rissa tridactyla (black-legged kittiwake): 128900367
Help
Entry
128900367 CDS
T09443
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
rtd
Rissa tridactyla (black-legged kittiwake)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Ig_2
ig
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128900367
NCBI-ProteinID:
XP_054037408
LinkDB
All DBs
Position
21:complement(1138368..1178983)
Genome browser
AA seq
3135 aa
AA seq
DB search
MSSNRPVKSFKKSAVPGVLITQFVDDVPKGCSTPDFEQKPVSLTLQEGKNAVFRAVVKGV
PSPDVKWARAQGGLDDPEKYETFFNNATNEFILQVNKITVGDSDLYRCFAVNEYGEASCS
AGLRILQVGFKRKVRYVPVHAADDLKKKLQDSRRLLRKRAPAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICLKYGIVDFRGMLRRLQEIRKDTESEQGEFINSVKNFEHIKVNKEGKATFSL
EMDLKSSKSKVHLLKDGVRLRYGMGDGYRKHYLRRIGKKYNFVINDVQPEDAGLYQVRVE
DVPVFSTELEAEAIPVRFERPLSDMRCPEDEDAVFECILRTPCYDAVWLHKTHVLEASEK
HQISVTPDGLNHQLIIKNIVPSDNGMYTLDTGLCSSNAWLIVEYAKGKRRQDKGGEREKF
EWQKETLPDIDGAKKLRHREHLGDEDHLMDTGMENDGWYRNDQDGSLGHYTDDDGSHRFL
GKERLRKVDRNEKMGLGQFSGADLDGESVENAGSIFGFKGFGGKSGLKPIHGKDSMTGSA
DTGDELQGAGERYSVGGRDHGMLDAVNIDMDDGEGVGSQHDKDGKLGDTSYRAGFGGIGR
LGATDGSSELDGLDPDSTGVGHGKGDQFSRTGPGTGARKNAAGTETAGRMGFPYGRDGLP
TEVDMNGASLNREGQIGTPYGKDGLPLHASSHLGRSGRSGLLYGPGGLPAGDGVITGAGD
STIGEMEALYGPDGQHVGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGVGVPY
GKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDDLPAGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVG
GGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDDLPAGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGAGV
AGAGGVGFPYGKDGLPVGSGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGVGS
PYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGVGVPYGKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGIGSPYGKDGLP
VGGGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGGGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGA
GVAGAGGVGVPYGKDGLPVGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGV
GSPYGKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGVGVPYGKDG
VPAGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGVGVPYGKDGLPVGGGIG
GAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAG
GVGSPCGKDGLPAGAGFGGAGVAAAGGVGSPYGKDGLPAGGGFGGAGVAGAGGVGSPYGK
DGLPVGGGIGGAGVAGAGGVGVLYGKDGLPAGAGFGGGGIGGAGGVGSPYGKDGLPAGAG
IAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGIAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGV
GSPYGKDGLPAGAGFDGVGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFDGAGVARAGGVGSPYGKDG
LPVGSGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGVPAGAGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFG
GAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGSGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGFGGAGVAGAG
GVGSPYGKDGLPAGAAFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGGGIGGAGVAGAGGVGSPYGK
DGLPAGGGFGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGGGIGGAGVAGAGGVGVPYGKDGLPVGGS
IGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGSGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGAGVAG
AGGVGSPYGKDGLPVGGSIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGIGGAGVAGAGGVGVPY
GKDGLPVAGGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGGGIGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAG
AGIAGVAGAGGVGVPYGKGGLPAGAGIAGVAGAGGAGYPYGKDGLPAGADFAGTGGFSSV
YGKDGLPVGGGIGGAGVALSGGIGSPYGKDGLPAGALDGVAGARGVGSFYGKDGLPTGPV
AGGARFPFEAEEVMGSRHGRDAMLSRGQGYRGGAGGDGFSSEGGGLGGSAIRGAGSPYGK
GSGSDGARAGAGGVGRLGGDERDFHGKEGVVGGRGGERGLDSHPGKSFMGGETGKGTASD
FRGSGHKGSSADRDSLSGQGDGRGKGRDLGQLGSLHGKNSAFEGEGSNYHNRAADGRNSG
GFSQGSLDYGQMSDLYGGPPSINQRKEEPGLDMKANDFLINAESIGKRRRYCLDDLKAPR
CRLDKHLFDVRVLKGEPAELSCTVSKHDVTGTWFKDGLKLTSMDGVYFEKEGLVHKLIIN
KVEDIHAGRYRFEGGDVKTEASIFVEDPPQVDKVLLKNLSSVPTVAKAGEKVKIKIPFEG
RLPVRATWLKDRMELIDDTRIRVDKTETFTMLSIASSERKDCGDYKVRLKNDSGVLEIDL
KLVVTDKPQPPAGPIKIVESSANDITIQWNPPKDDGGKPVQSYIIERQQVGKSDWVTLGE
TPKSCTTFTTNKVEQDVSYYFRVRAVNAEGTSDALESDEVKAVSKASPGAPDPPEIVSAS
RDTITISWKMPRKTGSSRIVGYIVQKRKKGTTTWLPVNNVPIADRKLKMTSLKKGLQYEF
RVAAVNAAGIGDASEPSQPAFARDSTKSPGQVQDLKVSSSDSTSVTLTWKRPEAKEGSDV
NGYEVEMRSSNNLNWTKCNALPIEVTTYTVKGLLAKERYFLRVRALNDSGPGEAAELEAF
IEAAAPVVPPRFLIDDTVKSFLVIKARSTIRVNIPFEASPDPVVTWLKDGLPLPDQAAVH
TKDGTTQLLIGAAEYTDTGTYTIELQNGLGKRETFSFQIQVTDIPQPPGPIQLQENVPNT
VTVTWMPSASEKWESNLYYTVLKRESQKGLWHVVGDLIYTNKFTFTKLIPGRDYYFRVVA
KNSLGASGPSETVQPWRIRKPKVECQVKPQIYKGVNQNQPPRFLVPLKPHVVTTGSECHM
SCAVGGHPPPKVTWYKDNRDLSSDPSYFCTNSFGVCSLVVLGVTKHDEGEYMVEATNEVG
RAFTKAFLTIKDSTL
NT seq
9408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaagtaatcggccagtaaaatccttcaagaaatctgctgtcccaggggttcttatc
acccagtttgtggatgatgttccaaaaggatgcagtacacctgattttgagcagaaaccg
gtttctctgacattgcaggaaggtaaaaacgccgttttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccaagccctgacgtgaaatgggcacgtgcacaaggaggactggatgatcctgaaaaatat
gaaacattcttcaataacgctacaaatgaattcattctgcaggtaaacaagatcactgta
ggtgacagtgatctgtatcgttgcttcgctgtgaatgagtatggggaagcttcatgctct
gctggcctcaggatcctacaagttggctttaagaggaaagtgagatatgttcctgttcat
gctgctgatgacttaaagaagaagcttcaggactccaggaggctgctgaggaagcgggcc
ccagcaccaaaaccaaaacccttggacaaagaagcagtctggcaactgttgctgcatgca
gacaggagagattatgagaaaatctgtttgaaatatggaattgttgacttccgtgggatg
ctgagaaggctgcaggagataaggaaggacacagagagtgaacaaggagagtttataaac
agtgtcaaaaactttgaacacatcaaagtcaacaaggagggaaaagctacattctctctg
gagatggacctgaaaagcagtaaaagcaaagttcatctgcttaaggatggtgtgaggctc
agatatggaatgggggatggatacagaaagcactacctgaggcgaattggcaagaagtac
aatttcgttatcaacgacgtgcagccagaagatgcaggcttgtatcaagtcagagtggag
gacgtacctgttttctcaactgaactggaagctgaagccatccctgtgagatttgagcgg
ccactcagtgacatgcgttgtcctgaggatgaagatgctgtctttgagtgtatcctgcgc
acgccctgctacgatgctgtgtggctacacaaaacccacgtcctcgaggcaagtgagaag
caccagatctccgtaacacccgacgggctgaaccaccagctcattatcaaaaacattgtg
ccctctgacaacggcatgtacacgctcgacactggactctgctcctcaaatgcctggctt
atcgtagagtatgccaaaggaaagaggagacaggataaaggaggtgaaagagagaaattt
gagtggcaaaaagaaacattgccagatatagatggggctaagaaacttcgacacagagag
catcttggtgatgaagaccatcttatggacactggcatggaaaatgatggctggtacaga
aacgatcaagacggcagtctaggccactacactgatgatgatggaagccatagatttttg
ggaaaagagaggctacgcaaagtcgacaggaatgaaaagatggggcttgggcagttttct
ggagcagacctagatggagagtcagtggaaaatgctggtagtatctttgggtttaagggc
tttggaggcaaaagtggattaaagcctatccatggcaaggattctatgacaggcagcgca
gatactggtgatgaattacaaggagcaggtgaaaggtattctgtgggtggcagagatcat
ggtatgctggatgctgttaacattgacatggatgatggagaaggtgtgggctctcagcat
gacaaggatggtaaattaggtgatactagttacagagctggctttgggggtattggaaga
ttaggtgctactgatggaagttctgagttagatggacttgatccagattcaactggagtg
ggacatggtaagggtgatcaattcagtaggactggtccagggactggagctagaaagaat
gctgcaggtacagagactgcgggaagaatggggttcccctatggcagggacggtctgccg
actgaagtcgatatgaatggagcaagtttaaacagagagggacaaatagggacaccctat
ggcaaggatggcctgccacttcatgctagcagtcatttaggtcggtcaggaaggtctggc
ttgctgtatggcccaggtggtcttccagctggagatggggtgataactggtgcaggtgac
agtactataggggaaatggaggccttatatggtccagatggtcagcatgttggagcaggt
ggtgctggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccctatggcaaggatggtctccca
gttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggggttccatat
ggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcagga
ggagttgggtctccctatggcaaggatgatctcccagctggagcaggctttggtggtgct
ggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggc
ggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaag
gatgatctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagtt
gggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgta
gctggtgcaggaggagttgggttcccctatggcaaggatggtctcccagttggcagtggc
attggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggaaaggatggt
ctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtct
ccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggt
gcaggaggagttggggttccatatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggt
ggtgctggtgtagctggtgcaggaggaattgggtctccctatggcaaggatggtctccca
gttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctat
ggcaaggatggtctcccagctggcggtggctttggtggtgctggtgtagctggtgcagga
ggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgct
ggtgtagctggtgcaggaggagttggggttccatatggcaaggatggtctcccagttgga
gcaggctttggtggtgctggtgtagccggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaag
gatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagtt
gggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgta
gctggtgcaggaggagttggttctccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggc
tttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggggttccttatggcaaggatggt
gtcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtct
ccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggt
gcaggaggagttggggttccatatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggt
ggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctccca
gctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggttctccctat
ggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcagga
ggagttgggtctccctgtggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgct
ggtgtagctgctgcggggggagtaggatctccctatggcaaggatggtctcccagctggc
ggtggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaag
gatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagtt
ggggttctatatggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtggtggcatt
ggtggtgcgggaggagttggttctccctatggcaaggatggccttccagctggggctggc
attgctggtgtagctggtgcaggtggagttgggtctccctatggaaaggatggtcttcca
gctggggctggcattgctggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccctatggcaag
gatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagtt
gggtctccctatggcaaggatggtcttccagctggagcagggtttgatggtgttggggta
gctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggg
tttgatggtgctggtgtagctcgtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggt
ctcccagttggcagtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggttct
ccctatggcaaggatggtgtcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggt
gcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggt
ggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccg
gttggcagtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctat
ggcaaggatggtctcccagctggagcaggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggg
ggagttggttctccctatggcaaggatggtctcccagctggagcagcctttggtggtgct
ggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagctggc
ggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaag
gatggtctcccagctggcggtggctttggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagtt
gggtctccctatggcaaggatggtctcccagctggcggtggcattggtggtgctggtgta
gctggtgcaggaggagttggggttccatatggcaaggatggtctcccagttggcggtagc
attggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggt
ctcccagttggcagtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtct
ccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctggt
gcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtagcattggt
ggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtctccctatggcaaggatggtctccca
gctggggctggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggggttccatat
ggcaaggatggtctcccagttgctggtggcattggtggtgctggtgtagctggtgcagga
ggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgct
ggtgtagctggtgcaggaggagttggttctccctatggcaaggatggccttccagctggg
gctggcattgctggtgtagctggtgcaggaggagttggggttccatatggcaagggtggt
ctccctgctggcgctggcatagctggtgtagctggtgcaggtggagctgggtatccttat
ggcaaggatggtctcccagctggtgctgattttgctggtacaggtggattcagctctgta
tatggcaaggatggtctcccagttggcggtggcattggtggtgctggtgtagctctttcg
ggaggaattgggtctccctatggaaaggatggtcttccagcaggtgcccttgatggtgta
gctggtgcaaggggcgttggttctttctatggaaaggatggtcttccaactgggcctgtg
gcagggggtgctcgttttccttttgaagctgaagaagtaatgggatctcgccatggcagg
gatgcgatgctgagcagaggtcaagggtatagaggtggagctggaggagatggcttttcc
tcagaaggtggtggtcttggtggctctgcaattcggggagctgggtctccctatggcaag
ggcagtgggtcagatggagccagggctggtgcgggtggtgttggcaggttgggaggtgat
gaaagggatttccatggtaaggaaggtgtggtaggtggacgaggtggtgaacgtgggctg
gattcacatcctggcaaatcttttatgggaggtgaaactggaaagggcactgccagtgat
ttcagaggatcagggcacaaaggttcatctgctgacagagattcactttcaggtcaagga
gatggcagagggaagggcagagatttaggacagttaggctcccttcatggcaaaaattct
gcctttgaaggggaagggagtaattatcataacagagctgctgatgggaggaattcaggt
ggttttagtcaaggttcattggattatggtcagatgtcagatctttatggtggacctcct
tcaataaaccagagaaaagaggaacccggccttgatatgaaagcaaatgatttcttgatc
aatgcagaaagtattggaaaaagaagacgttattgcctagatgatctgaaagcaccacgc
tgtcgtctcgacaaacacttatttgatgtcagagtcctgaaaggcgaaccagctgagctg
tcttgcactgtcagtaaacatgacgtgacaggaacctggtttaaagatggattaaagtta
accagcatggatggagtttatttcgaaaaagaaggtctagtccacaaactaattattaac
aaagtggaagatattcatgctgggagatacaggtttgaaggtggagatgtaaaaacggaa
gcttcaatttttgttgaagatcctccacaggttgacaaagttctcctcaaaaacttatcg
agtgtgcctactgtggccaaggcaggggagaaagtaaagatcaaaatccctttcgagggc
cggctgccagtcagagcgacgtggctaaaggacagaatggagctaatagatgacacaagg
attcgcgttgataaaacagagacctttaccatgctgtccatcgccagcagtgagagaaag
gactgtggggattacaaagtcaggctgaagaatgacagtggggtcctggagatcgactta
aagcttgtggtaacagacaagccacagccgcctgcaggacccatcaaaattgtggaaagc
tctgcaaacgacatcaccattcagtggaatcccccaaaggatgacgggggcaaaccagtg
caaagctacattatcgagaggcagcaggtaggcaagagcgactgggtgactttgggagaa
acccccaagagctgcactaccttcactactaacaaagtggaacaagacgtgagctactac
ttcagggtgagagctgtgaatgccgagggcactagtgacgcgctggaatcagatgaagtg
aaggctgtcagtaaagcttcacctggtgccccagatccccctgagattgtcagtgccagc
agagacaccatcacaatatcctggaaaatgcctcgtaaaactggcagttcccgaattgtg
ggatacatcgttcagaaacgcaagaagggtaccacgacctggctgccagtcaacaatgtg
cctatagcggacaggaagctgaagatgaccagtctcaagaaaggtctgcagtatgaattt
cgcgtggcagctgtcaatgctgctggcataggagatgccagtgaaccatcacagcctgcg
tttgcacgggattccacgaaatccccaggtcaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagt
gacagcactagtgtcaccttgacatggaagagacctgaagcaaaagaaggaagtgacgtg
aacggctacgaggtggagatgcggtcttctaacaacctcaactggaccaaatgcaacgct
cttcccatagaggtgaccacttacacagttaaaggcctcctagccaaggagaggtacttc
ctacgggtgagagccctcaatgacagtggtccaggagaagctgcagagcttgaagctttc
atcgaagctgctgcccctgtagttcctcccaggttcctaatagatgacactgtgaaaagc
ttcctagttataaaagcaagaagtaccatccgagtgaatattccctttgaagcatctcca
gatccagtggtgacctggttaaaggatgggcttcctcttccagaccaggctgcagtacac
accaaagatggtaccacccagctgctgattggagctgccgagtacactgacaccggcacc
tacaccattgagctccagaacgggttagggaaaagagaaacattcagcttccaaattcaa
gttacagacatcccgcaaccgcctggacctattcaattgcaagagaatgttccaaataca
gtaacagtgacctggatgccgtcagcgtctgagaaatgggaaagtaatctctactacaca
gtcctgaaacgcgaatcacagaagggcttgtggcatgtggtgggtgacctcatctacacc
aacaagttcacattcaccaaactgatcccaggccgggactactactttagggttgtggct
aaaaatagcttgggagccagtggtccgtctgaaactgtgcagccttggagaattcgaaaa
ccaaaggttgaatgtcaagtcaaaccacagatatacaaaggagtgaatcaaaaccagccc
ccgagattcctcgtcccattgaagcctcatgtggtgaccactgggagcgagtgccatatg
agctgtgcagttggaggccacccacctccgaaggtcacgtggtacaaggacaatagagac
ctctccagtgatccttcctatttttgcacaaacagctttggcgtctgctccctggttgtc
ctaggtgtcacaaaacatgatgaaggagaatatatggtagaagccactaatgaagtgggc
cgtgcattcaccaaagccttccttactattaaagactccaccctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
