Rissa tridactyla (black-legged kittiwake): 128902937
Help
Entry
128902937 CDS
T09443
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
rtd
Rissa tridactyla (black-legged kittiwake)
Pathway
rtd04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtd00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
128902937 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtd00536
]
128902937 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtd00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
128902937 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
FBN_EGF_st1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128902937
NCBI-ProteinID:
XP_054042676
LinkDB
All DBs
Position
Z:30207034..30381857
Genome browser
AA seq
2900 aa
AA seq
DB search
MGRRRWLWLQPCLLWLGCLALWAQGAAGQQKPPPVRPAGGASGIYPAAAYREDGAHPAVA
AAGRVRRRGGQQELLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPN
MCTCASGQISPTCGSKSIQQCSIRCMNGGTCTDDRCQCQKGYVGTYCGQPVCENGCQNGG
RCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWG
HPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINTVGSYECKCPAGHK
QNEATQKCDDIDECSIIPGVCEGGECSNTVGSYFCICPRGYVTSVDGSRCVDQRASTCFS
NLVSGRCAQELPGRFTKRQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEHRRLCVDGASAGGGSR
GGGTGGNGFLPSGNGNGYGPGGAGFIPIPGSNGFSPGVGGAGIGTGGQSPTGNGPIITGL
TILNQTIDICKHHLNLCLNGRCIPTLSSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCSNGD
CVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFEL
TTDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDIDECQTSGIC
MNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGACVRPFPGAVTKSEC
CCANPDYGFGEPCHPCPTKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICENLR
GSYRCNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFSTETD
TCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFNCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDSRCE
VNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGVCPN
GRCVNSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQPVPGKFRMDACCCA
VGAAWGSDCEECPKTGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGK
CRNTIGSFKCRCNNGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDGYES
GFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPSREECIDVNECSLSD
SLCRNGKCVNMVGTYQCSCNSGYQATPDRQGCIDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSC
SDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNE
CDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHALCVNVP
GSFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGFTCS
DVDECAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSRSCQDIDECSFQNICVFGTCNN
LPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTG
VGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTE
YNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSEETR
ICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTS
CENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNICGNIPGFTFDIHTGKAVD
IDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCI
NSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKASQD
QTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNG
RCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYE
VKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNF
ENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDT
REDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTDECSIGNPCGNGTC
TNVIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELRED
QKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCTDENECRTKPGI
CENGRCMNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKS
ECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRNGQCINT
MGSFRCFCKVGYTTDISGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGK
TCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSKGIC
QNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQ
WNQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNPCNY
GCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDGDADEENALSPEACYECKIN
GYSKKDNRRKRSANDTIEQISLESLDMDSPLKMRINISRLDNKEHILELMPAIEPLTNHV
RYVISHGNNDGIFQIYQRDGLSYLHTVKKKSVPGTHTLEITSISLYKKKELKKLEDSNED
NYLLGELGEALRMRLWIDLY
NT seq
8703 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggcggtggctgtggctgcagccctgcctgctgtggctgggctgcctggcc
ctgtgggctcagggagctgccgggcaacaaaagccgccgccggttcgcccggcgggagga
gcgagcggcatctaccccgccgccgcgtaccgggaggacggggcccatcccgccgtcgcc
gccgccggccgggtccgcaggcgaggaggacagcaggagctgctccgcgggccaaatgtg
tgtggctctagattccattcgtattgttgccctggatggaaaactcttcctggaggaaat
cagtgcattgttccgatttgtagaaatagctgtggtgatggattttgttcccgtcctaac
atgtgcacttgtgcaagtggacaaatatcacctacttgtggatcgaaatctatacaacag
tgcagcatcagatgcatgaatgggggcacctgcacagatgaccggtgccagtgccagaag
ggctatgtgggaacttactgcggccagcctgtctgtgaaaatggctgccagaatggagga
cggtgtattggacctaatcgctgtgcatgtgtctacggatttactggccctcagtgtgaa
agagattacagaacaggcccgtgtttcacacaagttaacaaccagatgtgtcagggccag
ctaactgggattgtttgcacaaaaaccctctgctgtgcaaccattgggcgtgcatggggt
cacccctgtgaaatgtgccctgctcagcctcagccatgtcgtcgtggcttcatccctaat
attcgcactggagcatgtcaagatgttgatgaatgtcaggctatccctggagtctgccaa
ggaggaaactgcattaatacagtaggttcatatgagtgcaagtgtcctgctggtcacaaa
cagaatgaggcaactcaaaaatgtgatgatattgatgaatgcagcatcatcccaggagtc
tgtgaaggtggtgaatgctctaacaccgtgggaagttatttctgcatctgcccacggggt
tatgtcacatctgtggatggctcccgctgtgttgatcaaagggcaagtacatgtttctct
aacctagtgagtggccgctgtgcacaggagcttcccggtagattcaccaaaaggcagtgc
tgctgtgagtctggccggtgctgggccattgggtctgttccagagatgtgtcctgtcaga
ggatctgatgaacaccgcagactttgtgtggatggtgcttctgctggaggtggttccaga
ggtggtgggacaggaggaaatgggttccttcccagtggcaatggcaatggctacggccca
ggaggagcaggattcattcccatccctggaagcaatggtttctccccaggtgtaggcgga
gcagggatagggacaggtggtcaaagtcccactggaaatggcccaataattacagggcta
acaatactcaatcagacaatagacatctgtaagcaccacctcaacctttgtttaaatgga
cgttgtataccaaccctttctagttaccgatgtgagtgcaacatgggatataagcaagat
gcaaatggagattgtattgatgttgatgaatgcacatcaaacccatgctctaatggagat
tgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccacacaggtttccagagaactcct
accaagcaagcttgcatagatatagatgagtgcatccagaatggtgttctttgtaaaaat
ggccggtgtgtaaacactgatggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaactg
actacggatggaaaaaattgtgtggaccacgatgagtgtaccactacaaacatgtgttta
aatgggatgtgcataaatgaagatggaagttttaaatgcatctgcaaaccaggatttgtt
ctggctccaaatggacgttactgtactgatattgatgaatgtcagacatcaggaatttgc
atgaatggtcattgcataaatactgaaggatcctttcggtgtgagtgtccacctggcttg
gctgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcacatgctatgga
ggcatcaaaaaaggagcatgtgtccgtcctttccctggtgctgtgacaaagtctgaatgt
tgctgtgccaatcctgactatggttttggagagccatgtcacccctgccctactaaaaat
tcagctgaattccatggcctgtgtagcagtggaataggtattactgtggatggacgagat
attaatgagtgtgcattggatcctgatatttgctccaatggaatttgtgaaaacttacgt
ggcagctatcgttgtaactgtaacagcggctatgagcctgatccttctggaaggaattgt
gtggacattgatgaatgttcagtgaatgggctgctgtgtgataatgggctctgtcgaaac
acccctggaagttacagctgcacttgtccaaagggctatgtattcagcactgagacagac
acatgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccgtgtgtcaatggtgcctgcaggaac
aatttaggatctttcaattgtgaatgttcacctggcagcaagttggactctacaggactg
atttgtattgatagcctgaaggggacttgctggcttaacatccaagacagtcgctgtgaa
gtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtgctaccttaggagcagcttgg
ggcagcccgtgtgaacgatgtgaattagacacagcttgctcaagaggatttgccagagtt
aaaggcgttacctgtgaagatgtaaatgagtgtgatgttttcccgggggtttgtcccaac
gggcggtgtgttaacagcagaggttcatttcactgtgagtgccctgaaggactgaccctg
gatggaacagggcgagtgtgcttagatattcgcatggagcaatgctacctgaaatgggat
gaagatgagtgcattcagcctgtgcctggcaagtttcgtatggatgcctgctgctgtgct
gtgggggctgcctggggctctgactgtgaggagtgtcctaagactggcaccaaggaatat
gaggctctgtgccccagaggtcctggcttttccaacaggggagatattctaactggcagg
ccattttataaagatatcaatgaatgtaaagtattccctggtatgtgcatgaatggtaaa
tgcagaaacacaattggaagtttcaaatgtagatgtaacaatgggtttactttagatatg
gaggaaagaaactgtacagacattgatgagtgccggatctcaccagacttatgtggaagt
ggtacttgtgtcaacactcctggaagctttgagtgtgaatgctttgatggttacgaaagt
ggatttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaaccccctgctg
tgtagaggtggcacatgtgtgaacaccgaagggagttttcagtgtgactgtcctttggga
catgagctgtcaccatcacgtgaggaatgcatagatgtaaatgagtgctcgttaagtgac
agtctctgcagaaatggcaagtgtgtgaacatggttggaacataccagtgttcctgtaac
tctgggtatcaggccactcctgacagacaaggctgcatagatattgatgaatgtatgata
atgaatggaggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgaatgtagctgc
agtgatggctacgcactaatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaa
aacaatccagatatctgtgatggtgggcaatgtactaatattccgggcgaatatcgctgt
ctctgttacgatggatttatggcttctatggacatgaaaacctgtattgatgtgaatgaa
tgtgatttgaattccaacatctgtatgtttggggagtgtgaaaacactaaagggtccttc
atttgtcactgtcaactaggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgcacagacgta
gatgagtgtgaaattggtgctcacaactgtgacatgcatgccttatgtgtcaacgtacca
ggaagttttaaatgtagttgcagagaaggatgggttggaaatggcattaaatgtattgat
cttgatgaatgctccaatggcacccaccagtgcagtgtgaacgctcagtgtgtgaacacc
ccagggtcataccgctgtgcctgtgcggagggattcactggggatggatttacttgttct
gatgttgatgagtgtgcagaaaacgttaatctgtgtgaaaatggacagtgcttgaatgtc
cctggtgcctaccgttgtgagtgtgagatgggattcactcctgcctcggacagcaggtcg
tgccaagatatcgatgaatgctccttccagaacatatgtgtatttggtacctgtaataat
ctaccaggaatgtttcattgtatctgtgatgatggctatgaactagatagaaccggggga
aattgcacagatatcgatgaatgtgccgatcccattaattgcgttaatggtctttgtgta
aatactcccggaaggtatgagtgtaattgccctccagacttccagctgaatcctactgga
gtgggttgtgtggataatcgtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggagat
gggagcctctcctgcaacactgaaattggggttggagtcagtcgttcctcctgctgctgc
tccttgggaaaggcttggggaaatccctgtgagacgtgtccccctgtaaacagcacggaa
tataataccctctgtccagggggagaaggattcagaccaaatcctatcactattatttta
gaagacattgatgaatgtcaggaactgccaggtctctgccaaggtggaaattgcatcaat
acttttggcagcttccagtgtgaatgtccgaaaggctactacctcagtgaagagacaaga
atctgtgaagatattgatgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcctggcacctgc
tataataccttggggaactacacctgcatttgcccacctgaatatatgcaagtgaacgga
ggacataactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacctcc
tgtgagaatgaactgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgttgctgcacatacaatgtt
gggaaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaactccaggaacggctgaattcaag
aacatatgcgggaatattcctggcttcacttttgacatccatactggaaaagctgttgac
attgatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgcgaatggtgtttgcatcaatcagatt
ggcagcttccgctgtgaatgccccactggattcagctacaatgacctgctcttggtctgt
gaagatatcgacgaatgcagcaatggtgacaatctctgtcagagaaatgcagactgtatc
aacagtcctggtagttaccgctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccaatggt
gcttgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcatggtttatgt
gtggacatgcaaggaagttaccagtgcatatgtcacaatggttttaaggcatcccaagac
cagacgatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgt
aaaaacacggttggatcgtataactgtctgtgttatccaggatttgaattaactcataat
aatgattgtatggatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaacgga
cggtgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaactcact
ctggatggcaagaattgcattgatactaacgagtgtgtggcactacctggttcatgctct
cctggtacctgtcaaaatttggaaggatcattcagatgcatctgtccaccaggatatgaa
gtaaaaagtgaaagttgtattgatattaatgagtgtaacgaggatcccaacatctgtctc
tttggctcttgtacgaacactccgggaggtttccagtgcatctgtcctacaggttttgtg
ctgtctgataatggacggagatgttttgatactcgccagagcttctgtttcactaacttt
gagaacgggaaatgctcagtgccaaaggctttcaacaccacaaaggcgaagtgttgctgc
agtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctttgtccaaaggaagaagaa
gttgcttttcaggatttgtgtccatatggccatggaactattcctggaattgatgataca
cgtgaagatgtcaatgaatgccttgaaagcccagggatttgctcaaatggccactgcatc
aatactgatggatcgttccgctgcgagtgccccatgggatacaacttagattacactgga
gtacattgcatcgatactgatgaatgttcgattggcaacccgtgtgggaacggtacatgc
actaacgtgatcggcagttttgagtgcaactgtcatgaaggatttgagcccggcccaatg
atgaattgtgaagatataaatgagtgtgctcagaatcccttgctgtgtgcttttcgttgt
atcaacacttacggtttctatgaatgcacgtgtccagtcggctatgaactaagagaagac
caaaagatgtgcaaagatctagatgagtgtgctgaaggtcttcatgactgtgaatcaaga
ggtatgatgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcctggaatgaca
cggagacctgatggagaaggctgcacagatgaaaatgaatgccgcaccaagccaggtatc
tgtgaaaatggtcgttgcatgaacgttattgggagctaccgatgtgaatgtaacgaagga
ttcctgtcaagtccatcaggcattgagtgtcttgataatcgccaagggttttgctttgct
gaagttttacagacaatgtgtcagatggcttcaagcagccggaatcttgtcactaaatct
gagtgctgctgtgacggaggccggggctggggtaaccagtgtgagctgtgtccacttcct
ggaaccacccaatataagaaactctgtccacatggaccaggctatactacagatggaaga
gatattgatgaatgtaaggtcatgccaaacctatgtagaaatggacagtgtattaacact
atgggttccttccgatgcttttgcaaagttggctataccactgatataagcggcacatct
tgcattgatcttgatgagtgctcccagtctcctaaaccatgcaattttatctgcaagaac
tcagaagggagctatcagtgctcatgtcctcggggctacatccttcaagaagatggaaag
acatgtaaagatcttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtc
aatacccttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagct
tgtattgataacaatgaatgcggttctcagccatcactttgtggatcaaaaggaatttgc
caaaacacccctggaagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattctact
ggattaaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaaccacaggtgccagcatggctgt
caaaacatcctgggtggatacagatgtggatgcccacaaggatatattcagcattaccag
tggaatcaatgtgtcgatgaaaatgaatgctccaatcctaacacatgtggctctgcttct
tgctacaacacacttggaagttacaagtgtgcctgcccatctggattttcttatgaccaa
ttctccagtgcatgccatgatgtgaatgagtgttcttctaccaagaacccctgcaattat
ggttgttccaacaccgaaggtggttatctttgtggctgtccacctggctattacagagtg
ggacaaggccactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctgccactggat
ggagatgccgatgaagagaatgctttgtcccctgaagcatgttatgagtgcaaaatcaat
ggctattccaaaaaagacaacaggaggaagagaagtgctaatgacactattgagcagatt
agcttggaaagtctggacatggatagtcctttgaagatgagaatcaacatttccaggctt
gacaacaaggagcacatcctagaactcatgccagccattgagccccttaccaaccacgtg
cgctacgtcatctcacatggcaacaatgatggcatctttcaaatctatcagagggatgga
ctgagttatttgcacacagttaagaaaaagtcagtgcctggaactcacacactggaaatc
actagcatttctctatataagaaaaaggagctaaagaaactggaagacagcaatgaggac
aactacctcctaggagagcttggggaagctctcagaatgaggctgtggatagacctctac
tag
DBGET
integrated database retrieval system
