Rana temporaria (common frog): 120913085
Help
Entry
120913085 CDS
T07929
Symbol
NUP62CL
Name
(RefSeq) nucleoporin-62 C-terminal-like protein
KO
K14306
nuclear pore complex protein Nup62
Organism
rtem
Rana temporaria (common frog)
Pathway
rtem03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtem00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
120913085 (NUP62CL)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
rtem03019
]
120913085 (NUP62CL)
Messenger RNA biogenesis [BR:
rtem03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
120913085 (NUP62CL)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nsp1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120913085
NCBI-ProteinID:
XP_040178715
LinkDB
All DBs
Position
9:11486052..11507461
Genome browser
AA seq
627 aa
AA seq
DB search
MGGATQPAIGGIAQSSMGGAMQSSMGGAMQSAMGGAMQSAMGGAMQSAMGGAMQSALGGA
MQSSMGGATQHAMGGGMQTMGGAMQSALGGAMQSSMGGATQNAMGGGMQSAMGGGMQSAM
GGGMQSAMGGGMQSAMGGAMQSAMGGAMQSAMGGGMQSAMGGAMQSAMGGGMQSMGGGMQ
SGMQSMGAGMQSMGGGMQSGMQSAMGGGMQSAFGGAMQSTLGGATQPALGGATQPAIGGA
SQPAIGGALQSALSGAMQSALGGATQPAIGGAAQNTGFSFGTTTAQSQPSLTGGFSFSGQ
PATTAPATANPASTAPTAQTGASSFTSAFSMAPTATSTAPTATLAPVQASAAQQTSTLFS
RPIETTSVSTAAAATSSASAISSLLATSAPSLFSLSSTTASASLNAKLPTTSAAQTIAAG
TIPSSNISAPAVMTYTQLENLINKWSLELEDQEKHFLTQATQVNLWDKTLISNGERITSL
HREMEKVKLDQKRLDQGLDFILSQQKELEDILSPLEDSVREQNGTIYLQHADEEREKTYK
LAENIDAQLKRMSQDLKDVIEHLNTSAGPGDSSNPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALL
QRKVEQVTKECENRRKEQERGFPITFD
NT seq
1884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtggagctacacagcctgctattggtggaattgcacagtcttctatgggtggggct
atgcaatcttctatgggtggagctatgcagtctgctatgggtggggctatgcagtctgct
atgggtggggctatgcagtctgctatgggtggagctatgcagtctgctcttggtggagct
atgcagtcttctatgggtggagctacccagcatgcaatgggtgggggcatgcagactatg
ggtggagctatgcagtctgctcttggtggagctatgcagtcttctatgggtggagctacc
cagaatgcaatgggtgggggcatgcagtctgcaatgggtggaggcatgcagtctgcaatg
ggtgggggcatgcagtctgcaatgggtgggggcatgcagtctgcaatgggtggagctatg
cagtctgctatgggtggagctatgcagtctgcaatgggtgggggcatgcagtctgctatg
ggtggagctatgcagtctgcaatgggtgggggcatgcagtctatgggtggtggcatgcag
tctggcatgcagtctatgggtgctggcatgcagtctatgggtggtggcatgcagtctggc
atgcagtctgctatgggtggtggcatgcagtctgcttttggtggagctatgcagtctact
cttggtggagctacccaacctgctcttggaggagctacccagcctgccatcggcggagct
tcccagcctgccattggaggagctttgcagtctgctcttagtggagctatgcagtctgct
cttggtggagctacccagcctgctataggtggagctgctcaaaatacaggtttctcattt
ggaactactacggcacagtcacagccatccctcactggaggcttctccttctctggccaa
ccagcgacgaccgcccccgcaaccgcaaacccagcgagcaccgcccccaccgctcagaca
ggcgcgtcctccttcacgtcagcattttccatggcaccaactgccacatccaccgcaccc
accgctaccctagccccagtgcaggcatccgctgcccagcagacttccactttgttttca
agaccaattgagactacatcagtatcgacagcagcagcagcaacatccagcgcttcagct
atcagttctctccttgcgacctctgcgccatcgcttttttcactcagctccacaaccgct
tcagcatccctaaacgcaaagctccctactacttcagcagcccagaccattgctgccggc
accattcctagttccaatataagtgcacctgccgtaatgacctacacgcaactcgaaaac
ctcattaataaatggagtttggagctcgaggatcaagagaagcatttcctgacacaagcc
acacaagtcaatctctgggacaagaccctgatcagcaacggggagagaatcacctcttta
catagagagatggagaaggtaaaattggatcaaaaaagactggaccaaggattagatttc
atcctctcccagcagaaagaactagaagatatcctgagccccctagaggactcggtcaga
gagcaaaatggaaccatctacctccagcatgcagatgaagaaagagaaaagacttacaaa
ctggcagaaaacatcgatgcccaactgaagcgaatgtcccaggatttgaaggatgtcatc
gaacatctgaacacatccgctggacccggagactccagtaacccgcttcaacagatctgt
aaaatcctcaatgctcacatggactccttgcagtgggttgatcagaattctgctcttctc
cagaggaaagtggaacaagtgacgaaggaatgtgagaatcggaggaaggaacaagagaga
ggatttcccattacatttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
