Rana temporaria (common frog): 120929392
Help
Entry
120929392 CDS
T07929
Symbol
COL2A1
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(II) chain isoform X1
KO
K19719
collagen type II alpha
Organism
rtem
Rana temporaria (common frog)
Pathway
rtem04510
Focal adhesion
rtem04512
ECM-receptor interaction
rtem04518
Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtem00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
120929392 (COL2A1)
04518 Integrin signaling
120929392 (COL2A1)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
120929392 (COL2A1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtem00536
]
120929392 (COL2A1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtem00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
120929392 (COL2A1)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
VWC
VWC2L_2nd
TILa
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120929392
NCBI-ProteinID:
XP_040196723
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(114378343..114443742)
Genome browser
AA seq
1491 aa
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DB search
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NT seq
4476 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tttggtgttgacattggcccagtctgcttcttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
