Ruoffia tabacinasalis: VQP54_00810
Help
Entry
VQP54_00810 CDS
T10899
Symbol
der
Name
(GenBank) ribosome biogenesis GTPase Der
KO
K03977
GTPase
Organism
rtf Ruoffia tabacinasalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
rtf03009
]
VQP54_00810 (der)
Ribosome biogenesis [BR:
rtf03009
]
Prokaryotic type
GTPases
VQP54_00810 (der)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
KH_dom-like
FeoB_N
GTP_EFTU
AIG1
Dynamin_N
RsgA_GTPase
Roc
PduV-EutP
MMR_HSR1_Xtn
Ras
ABC_tran
Nuc_deoxyri_tr2
cobW
AAA_24
SRPRB
NTPase_1
DUF1194
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WWL40499
LinkDB
All DBs
Position
163421..164737
Genome browser
AA seq
438 aa
AA seq
DB search
MSKVPVVALVGRPNVGKSTIFNRLIGERVSIVEDHPGVTRDRIYATGKWIGKEYRLIDTG
GIDMSNEPLMKQVRYQADLAMDEADVIVMVTSVREGVTLEDEEVAQRLHRTNKPVVLAIN
KADNPEQRQMIYDFYTLGLGDPIPISGSHGTGIGDLLDKIVEMFPEDSSDTDDDDSIKFS
FIGRPNVGKSSLVNSILKEERVIVSNIEGTTREAVDTKFKTADGKEYTMIDTAGIRKKGK
VWENTEKYSVMRALSAIERSDIVCMVLDAETGIIEQDKRVAGYAYEAGKGIIIIVNKWDA
VDKSNNKFDEFTKEIRKEFQYLRFAPILFVSAKTGQRLNKLPELINMIHENRARRVQSSV
LNNVVMDAVAMNPTPTDKGRRLKIYYMTQVAINPPTFVVFVNDVELMHFSYERFLENQLR
ESFYFEGTPVHIITRARS
NT seq
1317 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaagtgccagtagtcgctttagtaggtcgaccgaatgttggtaaatcaaccata
ttcaaccgactcattggagagagagtatcgattgtagaagaccatcctggagtaactcgt
gaccgtatttatgcgacaggtaagtggattggaaaagaataccgtttgattgatactggt
gggattgatatgagtaatgagccattaatgaaacaagtgcgttaccaagcagacttagcc
atggatgaagcggatgtcattgtaatggtgacgagtgttagagaaggtgtcactcttgag
gatgaagaagtagcccaaagattacatcgaacaaataaaccagttgttctagcgattaat
aaagcagataatcctgaacaacgccaaatgatttatgatttctataccttaggcttaggt
gatcctatcccaatatctggttcacatggtaccggaattggtgatttattagataagata
gtggaaatgtttccagaagattctagtgatacagatgacgatgattcaattaaattcagt
tttattggacgtcctaatgtaggtaaatctagtttagtgaattcaatattgaaggaagaa
cgtgtgattgtatcaaatattgaaggaaccacccgtgaggcagtagatactaagttcaag
acagctgatggtaaagaatatactatgattgataccgcagggattcgtaaaaaaggtaaa
gtttgggaaaacactgaaaagtatagtgttatgcgtgccttatcagcaattgaacgaagt
gatattgtttgtatggtactagatgctgaaactggaattatcgaacaagataaacgtgtc
gcaggttatgcttatgaagcaggtaaaggtattattattattgttaacaaatgggatgcc
gttgacaaaagtaataataagttcgacgagtttactaaagaaattcgtaaagagtttcaa
tatttacgttttgcacctatcctatttgtgagtgcaaaaacaggacaaagattaaataaa
ctacctgaactaattaatatgattcacgaaaaccgtgcaagacgtgttcaatcttctgta
ttgaataacgtagtaatggatgctgttgcgatgaatccaacaccaacggataaaggtaga
cgtttaaaaatctattatatgacacaagttgcgatcaacccaccaacctttgttgtgttt
gtgaatgatgttgagttaatgcacttcagttatgaacgctttttagagaatcagttacgt
gaaagtttctattttgaaggtactccggtacatataattacacgtgcgcgttcataa
DBGET
integrated database retrieval system
