Raoultella terrigena: NCTC13098_01107
Help
Entry
NCTC13098_01107 CDS
T06046
Name
(GenBank) putative glycosyl transferase
Organism
rtg
Raoultella terrigena
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glycos_transf_2
Glyco_tranf_2_2
Glycos_transf_1
Glyco_tranf_2_3
Glyco_trans_1_4
Glyco_transf_4
Glyco_transf_7C
Glyco_trans_4_4
Glyco_transf_5
Glyco_trans_2_3
GT4-conflict
Glyco_transf_21
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VDR24808
UniProt:
A0A3P8JDH0
LinkDB
All DBs
Position
1:907723..909945
Genome browser
AA seq
740 aa
AA seq
DB search
MKKVLIMTPDIEGPVRNGGIGTAFTALATTLAKKGYDVDVLYTCGDYSESSVSKFSDWSR
IYSTFGINLLSTGLVKEINIDAPYFRRKSYSILLWLKENNIYDTVISCEWQADLYYTLLS
KKNGTDFENTKFIVNTHSSTLWADEGNYQLPYDQNHLELYYMEKMVVEMADEVVSPSQYL
IDWMLSKHWNVPEERHVILNCEPFQGFETRIDVIVKTNEKPTSGVELVFFGRLETRKGLD
IFLRALRKLSDEDKETISGVTFLGKNVTMGKTDSFTYIMNQTKNLGLAVNIISDYDRTNA
NEYIKRKNVLVIIPSLVENSPFTVYECLINNVNFLASNVGGIPELIPQEHHSEVLFTPTP
VDLYGKIHYRLKNINIKPGLVESQGNIKEAWFSAVERKNNYVFKKIDEANSPLVSVCITH
FERHHLLQQALASIKSQTYQNIEVILVDDGSTTEESHRYLNLIENDFNSRGWKIVRSSNN
YLGAARNLAARHASGEYLMFMDDDNVAKPFEVETFVTVALNSGADVLTTPSDLIFGEEFP
SPFRKMTHCWLPLGPDLNIASFSNCFGDANALIRKEVFEKVGGFTEDYGLGHEDWEFFAK
VSLQGYKLQVVPEPLFWYRVANSGMLLSGNKSKNNYRSFRPFMDENVKYNYAMGLVPSYL
EKIHELESEVSRLRSINGGHSVSNELQLLNNKVDGLISQQRDGWAHDRFNALYEAIHVQG
AKRGTSLVRRVARKVKLMLK
NT seq
2223 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaagttcttataatgacgccggacattgaggggcctgtccgtaacggcggcatt
ggtactgctttcactgcccttgccactactttggcaaaaaaagggtatgatgtcgatgta
ttgtatacatgtggtgactattcggaatcatctgtatcaaaatttagcgactggtcacgt
atttatagtacctttggtatcaatctgctaagcaccgggctggtaaaagagattaatatt
gatgcgccttattttagaaggaaaagctattcaattttgctgtggttgaaagaaaataat
atctatgacactgttatttcttgtgaatggcaggcagatctctattacactttattaagt
aaaaagaatggtactgattttgaaaacacgaagttcattgtaaatactcacagctcaacg
ttatgggctgatgaaggtaattaccagctcccatatgatcagaatcatcttgaactctat
tatatggagaaaatggtggttgagatggcagatgaagttgttagtccgtctcagtattta
attgactggatgttaagtaagcactggaatgttcctgaagaacgccatgtaattttaaat
tgtgagccatttcaagggtttgaaacgagaatcgatgttatagttaaaacaaatgaaaaa
ccaacttctggcgttgagcttgtatttttcggccggcttgaaacccgtaaagggcttgat
atattcctccgcgcattaagaaaactatctgacgaagataaagagaccatctctggtgta
accttcctcggaaaaaatgtcactatggggaaaactgattcatttacctatattatgaat
cagactaaaaatttgggactcgcagttaatatcatcagcgattatgatcgtaccaatgct
aacgaatacataaaaagaaaaaatgtattagtcatcatcccatcgcttgtagaaaactca
ccctttaccgtttatgaatgcttgattaataacgttaattttctcgcctcaaacgttggc
ggaattccagagcttattcctcaggaacatcattcggaggttttatttactcctacacct
gtcgatttatatggtaaaattcactatcgcttaaaaaatataaatatcaaaccagggctt
gttgaatcacaaggaaatatcaaagaagcctggttttccgcagttgaacgaaaaaacaac
tacgtattcaagaaaatcgatgaagctaacagcccgttagttagcgtgtgtatcactcac
ttcgaacgtcaccatttgctccagcaagcactcgcctcaataaaatctcagacgtaccaa
aatattgaggtcatcctggtcgatgatggaagcacgacagaagagtctcatcgttatttg
aatctcatcgagaatgactttaactcacgaggctggaaaatcgtccgtagttctaataac
tatctgggcgctgcaaggaatttggctgcgcgacacgcctccggcgaatatctgatgttt
atggatgatgataatgttgctaagccttttgaagtggaaacgtttgttacggtagcatta
aactccggggccgacgtgttaaccactccaagcgatcttatttttggtgaggagtttcct
tctccgttccgtaaaatgacgcactgctggcttccgttaggacctgatttaaatatcgct
agctttagcaactgctttggtgatgctaatgcgctgatcagaaaagaagttttcgaaaaa
gtgggcggatttactgaggattacggtttaggtcatgaagactgggagttttttgccaaa
gtatcgttacagggatataaattgcaagtcgtcccggaacctctattttggtatagagtt
gcaaactccggtatgttgttaagtggaaataagagcaaaaacaactaccgtagttttcgt
ccatttatggacgagaatgttaaatataactatgcaatgggcttggtgccttcctacctc
gaaaaaattcatgagcttgagagcgaagtgagtcggttgcgcagcattaatggcggtcat
tctgtcagtaatgagttacaacttttaaataataaggttgatggtcttatttctcagcag
agagatggttgggcccatgaccgctttaatgctctctatgaagcaattcatgtccagggc
gcaaaacgaggcaccagtctggttcgccgggtagcccgaaaagtgaagttaatgttaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
