Rufibacter tibetensis: DC20_15040
Help
Entry
DC20_15040 CDS
T04099
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rti
Rufibacter tibetensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Cadherin_4
Big_9
Por_Secre_tail
PepSY
BppU_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALJ00051
UniProt:
A0A0P0CRK2
LinkDB
All DBs
Position
3683442..3686180
Genome browser
AA seq
912 aa
AA seq
DB search
MLSTALGTVGIKSIHNTGTGGSITNFKITELPDAASQGVLYINGTAQTSVTATEFPYNAT
LSFDPNENFSGTAVFKYQVENSEADNTYGNTAYYFVQVNKAPSVPTDANTAGNTVSENAA
NGTEVGITASATDPEGATITYSLSNNSGGRFAIDASTGVVTVANGSLLNYESAIAHSISV
QASDGHFTSSQTFTIVVTDVNEAPSTSTDANATANAVPENSANGTLVNITASSADPEGAP
ISYTLTDNAGGRFAIHASTGVVTVANGALLDFETATSYSITVQASDGGLTSTQTFTIAVT
NDNEGPSVPIDVNTAANTVAENSAGGTLVGITASSTDPDAGTTLTYSLSVNPENRFAINS
STGVVSVASGAVIDFETTPSLDITVQVSDGSLTSSQTFTIEVTNVNEAPVITSASAVFMP
ENTTYVITVTATDPENGTLEYFLDANSFSSPDYTKFNVKSNTGELSFVNYIPNYEAPGSA
AGTNVYTVGVLVGDGNLFKSQTITVTITDVVDENPPSTPTDVNAETNTIPENAVTGTVVG
VTAYATDAEARVSYSLSDDAGGRFAIDASTGVVTVANGALLNFEAATSHTIRVLASDGTH
TTSQIFTIAVTNVNEAPVFTSASSVSVPENTTSVMTVAATDPENNTIVYSISTSPDQSSF
RIDPATGALSFMKAPDYEAPGSAANSNVYTVAVIVSDGVLSKEQTITVTVTEVTEETPLP
VALLNFKATRNKKNALLTWQTATEQENETFEVERSTNGRNFSKIGQVAGAGNSLNLLNYS
FTDNNPLEGINYYRLRQVDFNGESETSAIVAVKYVTTITEVSMLSYPNPTSAAFTLEISM
TNPENIIVEIRDIAGKLVRASSYAATAGLNKIKYDLNQEVDGMYIITVKGKDFQKANRII
KSGSAAAKNSGR
NT seq
2739 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgctttccaccgcattaggtactgtcggaataaaaagtatacataataccggaactggg
ggttctattacaaattttaaaatcacagaactgccagatgctgctagccagggagtgctg
tatattaatggtacggctcagaccagcgtaacagcaacagaattcccttacaacgcaaca
ctttcttttgaccccaatgaaaatttctcaggtaccgctgtgttcaaatatcaggttgaa
aattcagaagctgacaacacatacgggaatactgcctactattttgttcaggtaaacaag
gcgccttctgttccgacggacgccaacacagctggcaacaccgtttcggagaatgcagct
aatggtacagaggtaggtattactgcttcagcaacagatccggaaggagcaaccattact
tattctttatctaacaattctggggggcgctttgctatagacgcctcaactggggtggtt
acagtggcaaacggctcattgttgaattacgaatcggccattgcccattcaattagtgtg
caagcttctgatggccactttacttccagccagaccttcaccattgtggttactgacgtt
aacgaggcaccttcaacttccacggatgctaatgctactgccaatgcagtgcccgaaaac
tccgctaacggtacgctggtaaatatcacggcttcgtctgccgacccggaaggagcacct
attagttatactttaaccgataatgctggcggtcgcttcgctatacatgcctctacagga
gttgttaccgtagccaacggtgcgctactggatttcgaaactgccacttcttatagcatt
acagtacaggcttcagatggcggtttaacttccacccagacctttaccatagctgtaacc
aatgataacgaggggccttcagttcctatagatgtaaatacggctgctaataccgtggcc
gaaaactcggcaggaggtaccctggttggcataacggccagttccacagacccggatgcc
ggtactacgcttacctattccctgtctgtaaatcctgagaatcggtttgccatcaattcc
tccacaggggtagtttcagtggcaagcggtgcggttatcgactttgagacaactccttct
ttagacattaccgtgcaagtttcagatggtagtttaacttccagccaaacctttaccatt
gaggttaccaatgttaacgaagcaccagttattacatctgcctctgcggtttttatgccg
gaaaatacaacctatgtgattacagttactgcaaccgatccagaaaatggtacccttgag
tatttcttagatgctaattctttcagttctccggattatactaaattcaacgtcaagtct
aatactggtgaattatcctttgtaaattatattcctaattatgaggcaccgggttcagct
gccggtactaacgtatatacagtaggagttttggtaggtgatggtaacctgtttaaaagt
cagacaattaccgtaaccataactgatgtggtggatgagaacccgcctagcactccaaca
gatgtaaatgcagagactaacacaatacctgagaatgctgttacaggcacggttgtagga
gtaactgcttatgcaacagatgcggaagcaagggtaagttactccttatctgacgatgct
ggtggccgctttgctatagatgcctcaaccggcgtagttacggtagcaaatggcgcttta
ttgaattttgaagcagctacttcccacaccatccgggtgctagcttcagacggaacccat
accaccagccagatttttacaattgccgtgaccaacgtaaacgaagctccggttttcacc
tctgccagttcagtttcagtaccagaaaatactaccagtgtgatgaccgtagcggcaact
gacccggaaaataatacaatcgtgtattctatttccaccagcccagaccaaagtagtttc
agaatagatcctgccactggtgctttatcctttatgaaagccccagactatgaagcacct
ggttcagcagctaattcaaacgtgtatactgtagccgttatagtaagcgatggggtattg
tctaaagagcaaaccatcacagttacagtgacagaagtaactgaagaaacacccctgccg
gttgctcttttaaactttaaggccacaagaaacaagaagaatgcccttttaacgtggcaa
actgctacagagcaggaaaatgaaacttttgaggtagaacgtagcaccaatggccgaaac
ttctctaaaataggccaggtagcaggtgcaggaaatagcctcaacttacttaactattcc
ttcactgataacaatccactggaaggtattaactattaccggttaaggcaggtagatttc
aacggtgaatctgaaaccagcgccattgttgcagtaaaatatgtaacaacaataactgag
gtaagcatgctttcctatcctaatccaacctccgctgcttttactttggaaatctcaatg
acaaatccggaaaatataattgttgaaatcagggacattgccgggaagttggttcgtgcc
agttcttatgcggctacagcaggtttgaataaaataaagtatgatctaaatcaggaggta
gatggtatgtatatcattacggtaaaagggaaggattttcaaaaagctaaccgaatcatc
aaaagtggatctgctgctgccaaaaatagcgggcgctag
DBGET
integrated database retrieval system