Rhincodon typus (whale shark): 109912114
Help
Entry
109912114 CDS
T06055
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
rtp
Rhincodon typus (whale shark)
Pathway
rtp04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtp00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
109912114
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtp00536
]
109912114
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtp00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
109912114
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109912114
NCBI-ProteinID:
XP_048451085
LinkDB
All DBs
Position
3:10372709..10525617
Genome browser
AA seq
2293 aa
AA seq
DB search
MCLNGMCINEDGSFKCICKPGFALAPNGRYCIDTDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECP
PGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGICVRAFHGAVTKSMCCCASTDNGFGEPCQPCP
AKSSAEFQALCSSGIGITADGRDINECDLDPDICPHGICENLHASYRCICNIGYESDLSG
KNCVDIDECVVNSLLCDNGLCRNTPGSYTCSCPKGYLFKPDSEMCEVRFIFPDVDECESS
PCVNGECRNTVGSFSCECSTGSKLDQSRTVCIDSVKGTCWLNIQNSRCEVNINGATLKSE
CCATLGAAWGSPCERCELDTTCPRGYARVKGVACEDVNECSVFPGICPNGRCVNTQGSFQ
CECPEGLTRDSTGRICVDIRQEQCYLKWDEDECTEPVAGRFRMDACCCSIGSAWGLDCDE
CPRPGTKEYELLCPRGPGFTNRGDILTGRPFYKDVNECKVFNNLCSNGKCRNTIGSFRCK
CDNGFALDMEERNCTDIDECRISPGLCGNGTCVNTPGHFECECFEGFESGFMMMKNCMDI
DECERNPLLCRGGTCINTEGSYRCICPPGHELTPDGSACVDINECSLSDNLCRNGKCVNM
VGTYQCACNTGYQATPDRQGCVDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCIEGYALMPDKR
TCADIDECEDNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMRTCIDVNECDLNPNICLYG
DCENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCSDVDECEIGAHNCDMHASCVNIPGSFQCSCREGW
IGDGTECVDLDECINETHHCNLNAKCMNTPGSYRCLCSEGFSGDGFTCADLDECAENVNL
CDNGQCLNTPGGYRCDCEMGFTPASDSRSCQDIDECSFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDE
GYELDRSGGNCTDVNECADPVNCINGLCVNTPGDYLCNCPADFELNPTGIGCVDTRVGNC
FLEYGQRGDGGLSCSVDIGVGVTRASCCCSLGSAWGNPCEICPDVNTTEYKTLCPGGEGF
RPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPAGYYLNDETRICEDTDECVTY
PGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQINGGNNCMDMRKSLCYRHYNGTCENELSFNLTKK
MCCCSYNVGKGWNKPCEPCPTPATSDYQSLCGNQGPGFTIDFETGKPVDIDECRKIPGIC
ANGVCINQIGSFRCECPMGFSYNDLLLICEDIDECSNGDNLCQRNADCINIPGSYRCECS
AGYKLAPNGACIDRNECLEIPNVCSHGDCIDLEGSYRCTCHNGFKQTPDQTMCMDIDECE
RQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFEITHNNDCMDIDECATLFSQVCRNGQCFNSVGSFNC
FCQDGYELTPDKKNCIDINECLLVPGSCAPGTCQNLDGAYRCICPSGYEVQNENCIDINE
CEEDPNICLFGNCENTAGSFQCVCRPGFILSENGRRCFDTRKSFCFTKFENGKCSVAKPS
NTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKDGEVAFQDLCPFGHGTIPGIGDSREDVNECLENP
GICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYSGVNCADTDECSIGNPCGNGTCTNVIGGFECSC
DEGFEPGPMMTCEDINECAQNLLLCAFRCINTFGSYECTCPAGYTLREDRKMCRDLDECA
QELQDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMVRRPDGDGCMDDNECWSKPGICENGRCINIVG
SYRCDCGEGFRATPSGTECIDNRQAFCFAEVLQTMCQMSSSSRNLVTKSECCCDGGRGWG
NQCELCPLPGTAHYKKMCPHGPGYTTDGQDIDECKVMPNLCLNGQCINTLGSYRCLCKLG
YTTDITGTACIDLDECAQAPKPCNFICKNTEGSYHCSCPRGYILQEDGKTCRDLDECSTK
QHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECASQLSLCGSKGLCQNTPGSFSCEC
QRGFTLDNTGLNCEDVNECEGSHRCQHGCQNMLGGYRCSCPHGYMQHYQWNQCVDENECS
NPASCGSATCYNTLGSYKCACPSGYNFDEFANSCHDVNECSSYKNPCSYGCSNTEGGYLC
GCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYGPFGGAADDENLLSHETCYECKINGYSKSSGRNRR
SVNDTKSEQDQGISLASLDTDNPVEMNLTISELNYKKHILELVPAIEPLYNHVRYVISNG
NDNNYFRIHQKDGLSYLHLTKRRPLEGTYTLEITSIPLYKKKTLQKLEDKKDNDYLLGEL
GEALKMRLQIQLH
NT seq
6882 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcctcaatggtatgtgcatcaatgaagatggaagcttcaagtgcatctgcaaacct
ggctttgcgctcgcacccaatgggcgatattgcattgacactgatgaatgccaaactcca
ggcatctgcatgaatggtcgttgcatcaacaccgaaggctctttcaggtgtgagtgcccc
ccaggcctcgctgttggtgtggatgggcgggtttgtgtcgacacacatatgcgcagcacg
tgctacggaggaattaagaagggaatatgtgtccgtgcatttcatggggcagtgacaaag
tccatgtgctgttgtgccagtacagataatgggtttggagagccgtgccaaccttgccca
gcaaaaagctcagctgaattccaggcgctgtgtagcagtggaattggcatcacggctgat
ggaagagatattaatgagtgtgatctggatccggatatttgtccacatggaatatgtgaa
aatcttcatgccagctatcgatgtatctgtaacattggctatgaatctgacctaagtggg
aaaaattgtgtggacattgatgaatgtgtagtgaacagtctcctgtgtgataatggcctt
tgccggaacacacctggtagctacacctgcagctgcccaaagggctaccttttcaaacca
gactctgagatgtgtgaagtgcgatttatttttccagatgttgatgaatgtgagagcagc
ccttgcgtcaatggggagtgcaggaacacagtaggctcattctcgtgtgagtgctctact
ggtagcaaactggatcaaagcagaactgtatgcattgacagtgtgaaaggaacttgctgg
ttgaacatccaaaacagccgctgtgaggttaacatcaacggagccacactgaagtcagaa
tgctgcgctactttgggagctgcctgggggagtccttgtgaacgctgtgaactagatacc
acctgtccaagaggatatgcaagagttaagggtgtagcctgtgaagatgtgaacgaatgc
tcagtctttcctggcatttgcccgaatgggcgctgtgttaatactcaaggatccttccag
tgtgagtgtcccgaagggttgaccagagacagcacgggtcgaatttgtgtggatatccgt
caggagcagtgttatctcaagtgggatgaggatgaatgcacggaaccagtcgctggaaga
tttcgaatggatgcctgctgctgttcgattggatctgcctggggattggattgtgatgag
tgccccaggcctggtactaaggaatatgagctgctttgtccaagaggcccagggttcacc
aacaggggtgacattctaacaggaagaccattctataaagatgttaatgaatgtaaagtg
tttaacaacctctgcagcaatgggaagtgcaggaacaccatcggcagcttcaggtgtaaa
tgtgacaatggatttgccctggatatggaggagagaaactgcacagacattgatgaatgc
cggatctctcctggtctctgtggaaatggaacttgtgtcaatactcctggccattttgag
tgcgagtgttttgaaggctttgagagcggatttatgatgatgaagaattgcatggatatt
gatgagtgtgagaggaaccctcttctgtgccgtggtgggacctgtataaacacagaaggt
agttacaggtgtatatgccctccaggacatgagctgactccagatggtagtgcctgtgtt
gatatcaatgagtgttccctcagcgacaatctttgtagaaatggcaagtgtgtaaacatg
gttggaacatatcaatgtgcttgcaacactggataccaggctactcctgatcggcaaggc
tgtgttgatattgatgaatgtaccatcatgaatggtggctgtgacacacattgtacaaat
tccgaaggaagctatgaatgcagttgcatcgagggctatgctcttatgcctgataagaga
acctgtgcagatattgatgaatgtgaggataatcctgatatctgtgatggtggacagtgc
actaacatccccggggagtatcgctgcctgtgttttgatggattcatggcttctatggac
atgaggacctgcattgatgtgaatgagtgtgacttgaatcctaatatctgtctctatggt
gattgtgaaaataccaaaggttccttcatttgccattgccaactgggatattctgtaaag
aagggaacaactgggtgttcagatgtcgatgagtgtgaaatcggggcccacaactgtgat
atgcatgcttcatgtgtcaatattcctggaagtttccaatgcagctgccgtgagggatgg
attggtgatggcactgaatgtgtagatcttgatgagtgcatcaatgaaacacatcattgc
aatctcaacgctaaatgtatgaatacaccaggatcgtatcgctgcctttgttctgaaggt
ttcagtggtgatggttttacatgtgcagatttggatgagtgtgcagaaaatgttaatctg
tgcgacaatggccagtgcctcaacacacctggtggctacagatgtgactgtgagatggga
ttcacaccagcttctgacagcagatcctgtcaagatatcgatgaatgttcatttcagaac
atctgtgtgtttggcacctgccagaatttgccaggaatgttcaggtgtgtctgtgatgag
ggctatgaacttgacagaagtggaggcaactgtacagatgtcaatgagtgtgctgatcca
gtcaactgtatcaatggattatgtgtcaatacaccaggcgattacctgtgtaactgtccc
gctgattttgagcttaatccgacaggaattggatgtgttgatactcgtgttgggaactgc
ttcttggaatatggccaacgaggtgatggaggcctgtcctgcagtgtggacattggtgtt
ggagtcacccgtgcctcttgttgttgttctctgggaagtgcctggggtaacccttgtgaa
atttgccctgatgtcaatacaactgaatacaagacactttgtccagggggtgaaggattt
agacccaatcccatcactgtcatcttagaagatattgatgaatgccaggagctgccagga
ctgtgccaaggtggaaattgtgtcaacactttcggtagttttcaatgtgaatgtccggct
ggctattacttaaacgatgaaacccggatctgtgaagacactgatgaatgtgtcacctac
cctggtatctgtggacctgggacatgttacaacaccttgggtaactacacttgtgtgtgc
cctccagagtacatgcagatcaatggtgggaacaactgcatggacatgagaaagagctta
tgctatcgacactacaacgggacctgtgagaatgagctgtccttcaacttaaccaaaaaa
atgtgttgttgttcttacaatgtcggtaaaggatggaataaaccttgtgaaccttgccca
acacctgctacatctgattaccagtcgctgtgtggaaatcaaggtcctggctttaccatt
gactttgaaactgggaagcctgttgatatcgatgaatgcagaaaaattccaggcatttgt
gcaaacggtgtatgtatcaatcagattggcagcttccgatgtgagtgcccaatgggattt
agttacaacgacttgcttctcatctgtgaagatattgacgaatgcagtaatggagacaat
ctttgccaacgtaatgcagattgtattaacattcctggcagttaccgctgcgaatgttct
gccggatataaactagcacctaatggagcttgcattgatcgcaatgagtgtctggaaatt
ccaaatgtctgtagtcatggtgactgcattgatttggaaggaagttatcggtgcacctgc
cacaatggcttcaagcagactcctgatcagaccatgtgcatggatattgatgaatgtgaa
cgacagccttgtggaaatggaacttgcaagaacactgtgggatcatacaattgtctctgc
ttcccaggatttgagataactcacaataatgactgcatggatattgatgaatgtgccact
ctgtttagccaagtctgtagaaatggacaatgttttaacagcgttggctccttcaattgt
ttttgtcaggatggctatgagcttacacctgacaagaagaactgcatagatatcaatgaa
tgtttgttagttcctggatcatgtgcccctgggacctgccagaacctcgatggtgcgtac
agatgtatttgtccttcaggatatgaagtgcaaaatgaaaactgtatagatataaatgaa
tgtgaggaagatccaaatatctgtctatttggtaattgtgaaaacactgctggcagcttc
cagtgtgtttgccgaccaggctttattctgtcagagaatggacgtagatgcttcgataca
cgcaaaagcttctgtttcactaagtttgagaatgggaagtgttcagtggcaaaaccttcc
aatacaaccaaagcaaaatgttgttgcagtaaaatgccaggagagggatggggagatccc
tgtgaactgtgccccaaggatggagaagttgctttccaagatctttgtccatttggccat
ggtacaatccctggcattggagattctcgtgaagatgttaatgaatgtttggaaaaccct
ggaatctgttcaaatggccattgcatcaacacagatggatcgttccgatgcgagtgccca
atgggatacaacctggattacagtggagttaattgtgctgacacagatgaatgctccatt
ggtaatccttgtggcaatggcacttgcaccaatgtcattggtggattcgaatgcagttgc
gatgaaggttttgaaccaggtccaatgatgacttgtgaagacatcaatgaatgtgcccag
aacctactgctgtgtgctttccgctgcattaatacctttggttcttatgaatgtacatgt
cctgctggttacactttgagggaagacaggaagatgtgcagagaccttgatgaatgtgct
caggagctccaagactgtgaatcccgaggcatgatgtgtaaaaacctgattggtactttt
atgtgtatctgcccacctggaatggtacgcagacctgacggagatggttgtatggatgac
aatgagtgctggagcaagccaggcatctgtgaaaatgggcgctgtataaacattgttggc
agctacagatgtgactgtggtgaaggattccgagcaactccttcaggcactgagtgcatt
gacaatcgtcaggccttctgctttgcagaggttcttcaaactatgtgtcaaatgtcctcc
agcagccgcaacctggttacgaagtcagagtgttgctgtgatggtggccgtggttggggt
aaccagtgtgaactctgcccactccctggcactgcccactacaaaaagatgtgtccacat
ggtccaggctacacaactgatggacaagacattgatgaatgtaaggtgatgcctaaccta
tgcctgaatggacaatgtatcaacacactgggttcttaccgctgcctgtgtaagcttggt
tataccacagacattacaggcacagcgtgtattgatctggatgaatgtgctcaggctcca
aaaccatgcaacttcatctgtaagaacacagaagggagctatcactgttcatgtccaaga
ggctacattctgcaggaggatgggaaaacgtgtagagatcttgatgaatgctctacaaaa
cagcacaattgtcagttcctgtgtgttaatacgattgggggatttacatgcaagtgccca
cctggattcacacaacatcacactgcctgcattgataacaacgaatgtgcatcccagctc
tcactgtgtggatccaaggggctttgtcagaacacacctggaagtttcagctgtgaatgt
cagcgaggatttacccttgataacactgggttaaactgtgaggatgtgaatgaatgtgaa
ggaagtcacagatgccaacacggttgtcaaaatatgctgggaggttacaggtgcagctgt
cctcatggttacatgcagcactatcagtggaaccagtgtgtcgatgagaatgaatgttcc
aatccagcttcttgtggctcagcaacctgttacaacacacttggcagctacaaatgtgcc
tgtccttctggctataactttgatgagtttgccaatagctgtcatgatgtgaatgaatgt
tcatcttacaagaatccatgctcttatggctgttcaaacacagaaggtggctatctctgt
ggctgcccacctggatattacagagtaggacaaggccattgtgtctctggtatgggattc
aataaagggcaatatgggccttttggtggagctgctgatgatgaaaatcttttatcgcat
gaaacttgctatgaatgtaagatcaatggttactccaagagcagtggcagaaatcgaagg
agtgtcaatgataccaaatctgaacaggatcaagggattagtttggctagtctggataca
gacaaccccgtcgaaatgaatctaactatctcagagctgaactacaagaagcatatttta
gagcttgtgccggctattgaaccactctacaatcatgttcgttacgttatctccaacgga
aatgacaacaactacttccgtatccaccaaaaggatggcctgagctacctgcatttgacc
aaaaggaggcctctggaaggtacatacacactggaaatcaccagtattcctctgtataag
aaaaagactctacagaaactggaagataaaaaagacaatgactacctccttggtgagctg
ggagaagcactcaaaatgagactacagatccagcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system