Rhincodon typus (whale shark): 109915787 Help Entry 109915787         CDS       T06055                                  Symbol col1a2 Name (RefSeq) collagen alpha-2(I) chain   KO K06236   collagen type I alpha Organism rtp  Rhincodon typus (whale shark) Pathway rtp04510   Focal adhesion rtp04512   ECM-receptor interaction rtp04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rtp00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     109915787 (col1a2)  09140 Cellular Processes   09144 Cellular community - eukaryotes    04510 Focal adhesion     109915787 (col1a2)   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     109915787 (col1a2)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:rtp00536]     109915787 (col1a2) Glycosaminoglycan binding proteins [BR:rtp00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    109915787 (col1a2) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Collagen COLFI Motif Other DBs NCBI-GeneID:  109915787 NCBI-ProteinID:  XP_020371053 LinkDB All DBs Position 2:71112679..71163639 Genome browser AA seq 1370 aa AA seqDB search MLSFVDTRILLLLAVTTFVARGQYEDEYAFESEAYQDELMGPQGPPGNRGPPGDRGPPGP DGKDGLPGTPGLPGPPGLPGDSFAAQYAKRDEMTPGILGPPGPRGPQGGPGAPGSPGPPG ISGIPGEPGGHGTAGPRGPQGVPGKPGEDGSNGKPGKAGDRGIIGAQGARGFPGTPGLSG RKGHRGFNGLDGIKGEPGVSGEKGETGNPGANGSPGLTGLRGSPGERGGIGLLGPAGARG SDGMTGPVGPPGPIGTGGPPGFPGSPGLKGEVGPVGARGPTGAQGVRGEPGAAGAVGPVG LPGNAGANGLTGAKGEIGTPGVAGAPGFPGPRGLAGPAGAMGPAGARGAPGDAGIQGVKG ETGGKGEPGDAGPVGAAGPSGEEGKKGPRGEIGAQGLPGPPGERGAPGNRGIPGRDGSAG SMGLPGSRGEAGPAGAKGPSGDIGRPGESGSPGARGHSGQPGRTGIAGNQGLPGTAGEEG RTGPPGPAGLRGQAGMMGFPGPKGAAGLPGKPGDRGNVGLAGPRGAPGKDGEVGAQGPPG VAGPTGPRGETGLAGSVGFQGMPGPSGAAGEPGKPGNQGLRGDAGSPGMIGPRGERGLPG ERGASGAQGLLGPRGTSGAPGLDGGKGEVGATGLPGAVGAPGAQGAPGERGAAGAAGIKG EKGDVGPSGPQGSPGPDGARGVAGPGGPPGPSGPPGDRGESGASGHHGPAGPRGAPGERG EAGRAGPPGFAGPPGADGHSGAKGEKGVTGPKGEGGPPGPAGLAGAAGPPGPAGASGLQG PVGSIGPAGMTGFPGPAGRAGAPGPAGPQGPQGPAGPIGNPGPQGPRGDSGPQGRSGSSG PSGVQGPAGERGASGESGPAGPAGTIGPQGFLGAPGTLGLPGARGEFGLPGVSGPGGLPG PTGLAGAPGQRGPAGAVGPSGLTGQHGENGRDGNPGSDGPPGRAGLPGSKGERGDAGRIG SAGAVGQPGAHGPAGPVGKAGNRGEAGAAGSTGHVGPLGPRGLAGPQGPRGEKGETGFAG VRGLKGLRGPGGLQGLPGVAGISGEPGGHGPAGPSGPRGPAGPAGPPGKDGAAGHAGPMG PVGHRGRAGDVGPMGPPGPPGPPGLPGLAGSHYEVSYNHEYYRADQPAAVREKNLEVDAK LKVLTNQVENIRSPEGSKKNPARSCRDLRLSHPEWKSGYYWIDPNQGCIMDAIRVYCDFV SGETCVHANPDIIERKNWWNSKNTKEQKHIWFGETIKDGVQFTYNDEHITPLVMGTQLTF LHLLSNEASQNITYHCKNSVAYMDEETGSLKKSVILLGSNDVELRAEGNSRFTYSVLEDG CTRHTGEWSKTVIEYTTRKTPRLPFIDIAPMDIGGPEQEFGLDIGPVCFK NT seq 4113 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgcttgcagtaacgacgttcgttgca agaggccaatatgaagacgaatatgcatttgaaagtgaagcctatcaggatgaattaatg ggaccacaaggaccccctggaaatcgaggcccacctggagacaggggacccccaggacca gatggcaaagatggattaccaggcactccaggccttcccggaccaccaggcctacctggc gatagttttgctgctcaatatgctaaacgggatgagatgacaccaggaatcttgggacca ccaggaccaagaggccctcaaggaggccccggtgctcctggctctcctggacccccagga atttcaggcattccaggagaacctggtggacatggtacagctggtcctcgtggtcctcaa ggtgtacctggaaaacctggtgaagatggttcaaatggcaaacctggtaaagctggtgac cgtggtattattggagctcagggtgctcgtggtttcccaggaacccctggtctctctggc aggaaaggacaccgaggttttaatggtttggatggaattaagggagagccaggtgtttct ggtgagaagggtgaaactggtaacccaggagcaaatggaagccctggactcacgggtctt cgtggttctccaggagagagaggtggtattggacttcttggcccagctggtgcccgcggc agtgatggtatgactggacctgttggccctcctggacccataggtactggtggtccccca ggcttcccaggcagccctggactcaagggtgaagttggacccgttggtgctcgcggtcca actggtgctcaaggtgttagaggtgagcctggtgctgcaggtgccgttggaccagtaggt cttcctggtaatgcaggtgcaaatggtctaactggagcaaagggtgaaattggtactcca ggtgttgctggtgctcctggtttcccaggtccacgtggtctcgctggtccagctggagca atgggtcctgcaggtgcccggggagcccccggtgacgcgggtattcaaggtgtcaagggt gagactggtggcaaaggcgagcctggtgatgctggcccagtaggtgctgctggtccatct ggtgaagaaggcaagaaaggtcctcgtggtgaaattggtgctcagggacttcctggacct cctggtgaaaggggtgcccctggtaaccgtggtatcccaggtcgtgatggatcagctggt agcatgggtcttcctggctcacgtggtgaagctggtcctgcgggtgccaaagggccttct ggtgatattggacgtcctggtgaaagtggttcacctggtgcacggggtcatagcggacaa cctggtaggactggtattgcgggaaatcaaggtcttccaggtacagccggtgaagaaggt cgtactggtccccctggtcctgctggcctaagaggtcaggctggtatgatgggcttccct ggtccaaagggtgctgcaggtctacctggcaagcctggtgacagaggaaatgtcggtctt gctggtccacgtggtgcacctggcaaagatggtgaagttggagcacagggtcctcctggt gttgcaggtcctacaggtccaagaggtgaaacaggtctagctggcagtgttggtttccag gggatgcctggaccttctggtgctgctggagaacctggcaaaccaggtaatcagggtcta cgaggtgatgctggcagtcctggtatgattggtccaagaggcgaacgaggtcttccaggt gaacgaggcgcttcaggtgcacaaggtcttcttggtcctcgcggtacctctggtgctcct ggtcttgatggtggaaagggtgaagttggtgcgactggtctgcctggtgctgtaggtgcc ccaggtgctcagggtgcaccaggtgagagaggtgctgctggcgctgctggtatcaaaggt gaaaagggcgatgtaggtccatcaggtcctcaaggaagtccaggtccagatggcgcacgg ggtgttgctggtcctggtggtcctcctggccccagtggtcctcctggtgataggggtgaa tctggtgcttctggtcatcatggtccagctggtcctcgtggtgctccaggtgaacgtggt gaagctggtcgtgctggtccccctggatttgctggtccacctggtgcagatggacattct ggagctaaaggtgagaaaggtgtcaccggtcccaaaggagagggcggtcctcctggtcct gccggtctagccggtgctgccggtcctccaggtcccgctggagcttctggtctacaagga cctgttggttccattgggccagcaggtatgacaggtttccctggcccagctgggagagca ggtgcacctggtccagcaggtcctcaaggtccacaaggtccagctggtccaattggtaat cctggcccacaaggtccaagaggtgattcaggtccacaaggccgttcgggttcatcaggt ccttctggtgtacaaggtcctgctggagagaggggtgcctctggtgaatcaggtcctgct ggtcctgcaggcactattggtcctcaaggcttccttggtgcaccaggtacacttggtctt ccaggtgctagaggtgaatttggtctcccaggtgtctcaggtcctggtggtctacctggt ccaactggtcttgcaggagcccctggacaacgtggtcctgctggtgcagttggtcctagc ggtctgactggtcaacatggtgaaaatggccgtgatggaaatcctggcagtgatggtcct cctggacgtgctggccttcctggatctaagggcgaacgcggtgatgctggtaggattggc tctgctggtgctgttggtcaacctggtgctcatggtcctgctggtcctgttggcaaggct ggcaaccgtggtgaggctggtgcagcaggttcaactggtcatgttggtccattgggtcca agaggtcttgctggcccacaaggtccacgtggagaaaagggtgaaactggctttgctggt gtcagaggcctgaaaggattacgtggacccggtggcttgcagggtcttcctggtgttgct ggtatttctggtgaacctggtggtcatggtcctgctggtccttctggcccaagaggccca gctggacctgctggtcctcctggtaaagatggtgcagctggacatgctggccctatgggt ccagttggtcatcgtggtcgtgctggtgatgttggtcctatgggtccccctggtccacca ggacctcccggtctcccaggccttgctggcagtcattatgaagtgagctacaatcatgaa tattatagagctgaccaaccagctgcagtaagagagaaaaatcttgaagttgatgccaaa ctgaaagttctgaccaatcaggttgagaacatccgcagtcctgaaggctcaaagaaaaat cctgctcgctcatgtcgtgacctgagactcagccatccagaatggaagtcaggatactat tggatcgatccaaatcaaggatgtatcatggatgccatcagagtttactgtgactttgta tcaggcgagacttgtgtacatgccaacccagacatcattgaacgcaagaactggtggaat agcaagaataccaaagaacagaaacacatttggtttggtgaaactatcaaagatggtgtg caattcacttacaatgatgaacatattaccccacttgttatgggtacccagctgaccttc ctgcacctcctctccaatgaagcttcacagaatatcacctaccattgtaagaacagtgta gcatacatggatgaggagactggaagcctgaaaaagtcagttatcctgcttggttccaat gatgttgaactccgagctgaaggtaacagcagattcacttacagcgttctggaagatgga tgcacgagacatactggtgaatggagtaagacagtcattgaatacactacacggaaaaca cctcgcctgccatttatagacattgcacctatggatattggtggccctgaacaagaattt ggtttggacattggcccagtctgtttcaaataa

DBGET integrated database retrieval system