Rhincodon typus (whale shark): 109916504
Help
Entry
109916504 CDS
T06055
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
rtp
Rhincodon typus (whale shark)
Pathway
rtp04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rtp00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
109916504 (fbn2b)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtp00536
]
109916504 (fbn2b)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rtp00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
109916504 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109916504
NCBI-ProteinID:
XP_048469861
LinkDB
All DBs
Position
29:complement(14319151..14512313)
Genome browser
AA seq
2898 aa
AA seq
DB search
MGVWWIAKFVLGCTALISPSLEDALSQQESQFGAPRFAGAGDRDLQSRVRRRGQDNLRGP
NVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNTCGDGFCSRPNMCTCANGQLSPVCGSGSI
QQCNVRCMNGGSCSEDSCICQKGYTGTHCGQPVCKNGCQNGGRCIGPSRCACVYGFTGPQ
CERDYRTGPCFTQVENQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFI
PNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSENTQKCEDIDECSTIS
GVCDGGECSNTVGSYVCTCPRNFVTSLDGSRCIDQRSGTCFSSLLSGRCAGDLHGHYTKM
QCCCDSGRCWSAGHTPEMCPVRGSDEYRRLCIEGVPFGPGYPSIGFPGFSDRIRPIGLGP
GGVGPGGVGPGGVGPGGVGPGGVGPGGVGPGGVGSGVVGPGGIGTGFSGLPGTGPGIATL
NQTIDVCKHFTNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGFKQDVRRECIDVDECSSSPCVNGDCIN
TPGAYHCKCHDGFQSTATKQACIDIDECIQNGVLCRNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTPN
GKNCIDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKNGFVLAPNGRYCVDIDECQTPGICMNG
RCINSEGSFRCECPPGLAIGVDGRVCVDTHMRSTCYGAIKKGTCTRPFSGAVTKSECCCA
SPDHGFGEPCQPCPARTSAEFQALCSSGIGITADGRDINECALDPDICANGNCENLRGSY
RCICNIGYESDVSGKNCVDIDECSVNVLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPTGYIFKPDTETCE
DVNECESSPCVNGYCRNMAGSFICECSLGSKLDPTRTICIDSMKGTCWLNIQDGRCEVNI
NGATLKSECCATLGAAWGSPCEHCELDPTCPRGYARVKGVTCEDVNECDVFPGVCTNGRC
VNTQGSFKCDCPGGLTLDGTGRTCVDVRLEHCYLKWEEDECTEPMANRFRIDTCCCSIGR
AWGGDCEECPQPGTQEYAAICPRGPGFANRGDVLTGRPFYKDINECKVFSSLCTYGTCRN
TVGSFKCRCDSGFALNMEERNCTDINECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFDGYESGFM
MMKNCMDIDECERDPLLCRGGTCVNTDGSYECICPPGHELTTEGDGCVDINECSLSDNLC
KNGRCVNMIGTYQCACDSGYQGTADRQGCVDIDECTIMNGGCDTHCTNAEGSYECSCSEG
YALMPDKRTCADIDECEENPDICEGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMRTCLDVNECDL
NPNICLHGDCENTKGSFICHCQLGYFVKKGTTGCTDIDECEVGAHNCDMHASCVNVPGSF
KCKCRDGWIGDGLECIDLDECATEEHQCNPSANCMNTPGSYRCACKDGFSGDGFSCSDVD
ECAENVNLCENGQCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPG
MFRCICDDGYELDRSGGNCTDINECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPTDFELNPTGVGC
VDTRVGNCFLETLPRGDGGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCEFCPLVNSTEYKT
LCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPAGYYLNEDTRICE
DIDECTTHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNFNDTCENE
LSFNMTKKMCCCSYNVGKGWNKPCEPCPTPATSHYQLLCGNQAPGFIIDIHTGKPVDIDE
CREIPGICANGVCINQIGNFRCECPMGFSYNNVFLICEDIDECTNGDNLCQRNADCINIP
GSYRCECSPGFKLSLSGACVDRNECQEIPNVCSHGECIDTEGSYRCLCHNGFKATEDQTM
CMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFDLTHNNDCMDIDECSTQIGQVCRNGQCI
NSIGSFQCLCQDGYELPPDGKNCVDINECISFPGTCAPGTCQNLDGSFRCICPLGYEVQN
DHCIDINECEEDPNICLFGFCTNTPGSFQCNCALGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTRFDNG
KCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGDPCELCPQEEEVAFQELCPYGHGAIPGIGDTRED
VNECVENPGICVNGHCINTDGSFRCECPFGYSLDFTGVNCVDTDECTIGNPCGNGTCSNV
IGGFECACDDGFEPGPMMTCEDINECSLNPLLCAFRCINTYGSYECTCPGGYTLRDDRKM
CKDLDECSEGLHDCESRGMICKNLIGTFMCICPPGMMRRPDGEGCMDENECRTKPGICQN
GRCINTVGSYRCDCNEGFLESPSATECLDNRQGFCFIEVLQTMCQMSSTNRNMVTKSECC
CNGGRGWGNQCEICPLPGTTRYKKMCPHGPGYATDGRDIDECRVVPNLCKNGQCINTMGS
FRCFCNIGYTTDLTSTSCVDFDECAQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCK
DLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSFACKCPPGFTQHHTSCIDNNECMGQPTICGSKGTCQNT
PGSFSCDCQKGFSLDGTGFNCEDIDECDGNHRCQHGCQNMLGGYRCSCPQGYMQHYQWNQ
CVDENECSNPTACGAASCYNTLGSYKCLCPSGFDFDQYSGGCQDVNECSVSGNPCTYGCS
NTDGGYLCGCPGGYFRVGQGHCISGMGFGNGQYLPLEEEEGDAENVLSPETCYECKINGY
PKRGRNRRSTNGTVSHEISLASLDIDAPIPLNVNISDMGIHEHIMEFLPAIEPLENHVRY
IISSGNEANFFRIHQKNGLSYLHLSRRKAMRGKYVLEISSMPLYGKKDLLKLEDENDVDY
LVGDLGEALHMKLQIHLL
NT seq
8697 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtatggtggatagccaagtttgtactgggatgcacggctctgatctctccttcc
ctggaagatgcactgagccaacaagaaagtcagttcggagcaccgcgcttcgcaggagcc
ggggacagagatttgcaatcgcgggtcaggaggcgaggtcaagacaacttgagagggcca
aatgtgtgcggatctcgatttcattcctactgttgtcctggatggaaaacgttgcctggt
ggtaaccaatgtattgtgccaatttgtcggaacacgtgtggtgatgggttctgctccaga
ccaaacatgtgcacctgtgccaatgggcaactctctccagtttgtggatctggttcaatc
cagcagtgtaatgtcaggtgtatgaatggtggctcttgctcagaggacagctgtatttgc
cagaaaggatacaccgggacacactgtgggcaacctgtttgtaagaatggctgccagaat
ggaggccgatgcattggaccaagtcgctgtgcgtgtgtgtatgggttcactgggccacag
tgtgaacgagattaccggactggaccatgcttcactcaagtcgaaaatcaaatgtgccaa
ggacaactgagtggtattgtctgtaccaaaaccctctgttgtgccaccattggtcgtgca
tggggtcatccttgtgagatgtgtcctgctcagcctcatccctgtcgccgtggtttcatc
cccaacattcgcagtggtgcttgtcaagatgtggatgagtgtcaggcaatcccaggcctg
tgtcaaggaggaaactgcatcaacaccgtgggatcctatgaatgcaaatgtccagctggg
cacaaacagagtgagaacacgcagaagtgtgaagacattgatgaatgcagcaccatttct
ggagtctgtgatgggggtgaatgctcaaacacggttggtagctacgtctgcacctgtccc
cgcaactttgtcacaagcctggatggctctaggtgtattgaccaacgatctgggacctgt
ttctccagtctgctgagtggccgatgtgcaggagatctccatggacattacactaagatg
cagtgctgctgtgattctgggcgttgctggtcagcaggacacacaccagagatgtgtcct
gtcagggggtctgatgaatatcgcagactgtgcattgagggtgttccttttggaccgggt
taccctagcataggatttccaggattttctgatagaatcaggcctataggccttggtcct
ggtggagtcgggcctggtggagtcgggcctggtggagtcgggcctggtggagtcggacct
ggtggagtcgggcctggtggagtcggacctggtggggttggatctggtgtagttggacca
ggtgggattggaacaggtttctcaggactacctggaactgggcccggcattgccacccta
aatcagacgattgatgtctgcaagcatttcactaacctgtgtctgaatggacgttgtatt
ccaacaccatccagctaccgctgtgaatgtaacatgggtttcaaacaggatgtacgtagg
gaatgtatagatgttgatgaatgctccagcagtccttgtgtgaatggggattgcattaac
acccctggtgcttaccattgcaagtgtcatgatggtttccagagtactgccaccaagcag
gcctgtattgatatcgatgagtgtatccagaatggtgttttatgcaggaacggccgatgt
gttaacactgatggaagcttccagtgtatctgcaatgctggcttcgagctcactcccaat
ggaaagaactgcattgatcatgatgaatgtgcaaccaccaacatgtgcctgaatggaatg
tgcatcaacgaggatggcagcttcaagtgtatttgcaagaatggctttgttctcgctcct
aatggacgttactgtgtggacattgatgaatgtcagacacctggtatctgcatgaatggc
cgctgcattaattcagaaggttcctttaggtgtgagtgccctccaggtctggctattgga
gtagatggacgtgtctgtgttgatacccatatgcgaagcacttgttatggagccatcaaa
aagggcacttgtacccgacctttctctggtgccgtgaccaaatcagagtgttgttgtgcc
agcccggaccatggctttggagagccctgccagccctgcccagccaggacttctgctgag
ttccaggctctatgcagcagtggcatcgggatcacagctgatggacgagatatcaatgag
tgcgctcttgatcctgatatttgtgccaatgggaattgtgagaacctacgtggcagttac
cgctgtatctgtaatattggctatgaatctgacgtcagtggcaagaattgtgttgatatt
gacgagtgctcggtcaatgtgcttctgtgtgacaacggactgtgtcgtaacactccaggc
agctacacatgcacctgccccacaggttacatcttcaaacctgatactgagacctgtgaa
gacgtgaatgagtgtgaatccagtccatgtgtgaatggttactgcaggaacatggcaggc
tcattcatctgtgaatgttcacttggcagcaaattggatccaaccagaaccatctgtatc
gacagtatgaaggggacgtgctggctgaatattcaggatggacgctgcgaggtgaacatc
aacggagcgacactgaagtcggagtgctgcgctaccttgggagcagcctggggcagtccg
tgtgaacactgcgagctggatcccacctgtcccagaggctatgctagagtgaaaggcgtt
acttgtgaagatgtgaacgagtgtgatgtattccctggtgtttgcacaaatggacggtgt
gtgaacacacagggctcattcaagtgtgactgccctggaggactgactttggatgggact
ggaagaacctgtgtggatgttcgcctggaacattgctacctgaagtgggaggaggatgaa
tgtacagagccaatggcgaaccggttccgtattgatacttgctgctgttcgattggccgt
gcctggggtggagactgtgaggaatgcccacagcctggcacacaggaatatgcagctatt
tgtcccaggggaccaggatttgccaacaggggtgatgttctgacaggcagaccattctac
aaggatatcaatgaatgtaaggtattctccagtctgtgcacatatggaacatgccggaac
acagttggaagctttaaatgtcgctgtgatagtgggtttgccctaaacatggaggaaagg
aattgtacagatatcaacgaatgccgtatctcgccggacctctgtggccatggcacgtgt
gtgaacacaccaggcagttttgaatgtgaatgctttgatggatatgaaagtggttttatg
atgatgaagaactgcatggatattgatgagtgtgagagagacccattactgtgtcgggga
ggaacctgtgtaaacactgatggcagctatgagtgtatttgcccaccaggtcatgagttg
accaccgagggagacggctgtgtggatatcaatgaatgctcactgagtgacaacctatgc
aagaatggtcgctgtgtaaatatgattgggacttaccagtgtgcctgtgactcaggatat
cagggcacagcggacagacagggctgtgtggatattgatgaatgtacaatcatgaacggt
ggatgtgacacccactgcacaaacgccgagggaagctatgagtgcagctgcagcgagggc
tatgcactgatgcctgacaagaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaggagaatccc
gatatttgtgagggcggacagtgtaccaacatccctggggaatatcgctgcctctgcttt
gatgggttcatggcttccatggacatgaggacctgtctagatgttaatgaatgtgacctg
aaccctaatatctgtctccacggcgactgtgagaacaccaaaggctcttttatctgtcat
tgccagctgggatattttgtgaagaaaggaacaacaggatgcacagatattgatgagtgt
gaagttggagctcacaactgtgacatgcacgcctcttgtgtgaatgtgccaggaagcttc
aagtgcaagtgtcgtgatggatggatcggagatggactggagtgtatcgatctggatgaa
tgtgccaccgaggagcaccagtgtaatcccagtgccaactgcatgaacacccctggctca
taccgctgtgcctgtaaggatggcttcagtggtgatggtttcagctgctcagatgttgat
gagtgcgctgaaaatgtgaacctgtgtgagaatgggcagtgtctgaacgcccctggggga
tatcgctgtgaatgcgaaatgggattcacaccaaccgaggatagcaaagcatgccaagat
attgatgagtgcaccttccagaatatttgtgtttttggaacttgccagaacctacccgga
atgttccgctgcatttgtgatgatggttacgaacttgacagaagtggaggcaattgcaca
gatatcaatgaatgtgctgaccctgtgaactgcatcaatggcctctgtgtgaacacccca
gggagctacctgtgtaactgcccgacagattttgagctgaatcccacaggggttggctgt
gtggatacccgtgttggtaattgcttcctagaaaccttgccaaggggagatggtgggatt
tcctgcagtgcagagatcggtgttggcgtcactcgagcctcatgctgttgctcactggga
agggcttggggaaacccttgtgaattctgccctctagtcaactccactgaatacaagact
ctgtgtccaggaggagaaggtttccgaccaaaccctatcaccgtcattctggaggatatt
gatgagtgtcaggaattaccaggcctgtgtcagggtggaaactgtgtgaacacatttggc
agcttccagtgtgagtgcccagctggatactacctgaatgaggatactcgcatatgtgaa
gatatcgatgaatgcaccactcacattggaatctgtgggcctggaacatgctacaatact
ttgggcaactatacctgtgtctgccctccggagtacatgcaggtcaatggaggaaacaat
tgtatggatatgaggaagagtgtctgttaccgcaattttaacgatacatgtgagaatgaa
ctctccttcaacatgaccaagaaaatgtgctgctgctcatacaacgtgggcaagggatgg
aataaaccatgtgagccctgccccacaccagctacatctcactatcaactcctgtgtggg
aatcaggctcctggcttcatcattgatatacatacgggcaaaccagttgatattgatgag
tgtcgggaaatcccaggcatttgtgcgaacggcgtctgtatcaaccaaatcggtaatttc
cgctgtgagtgcccaatgggattcagctacaacaacgtgttcctaatttgtgaagacatt
gacgagtgcaccaacggagataacctgtgtcagcggaatgctgactgtatcaatattcca
ggcagttaccgctgcgagtgttccccaggctttaaactgtcactgagtggagcctgtgtg
gatcgtaatgagtgccaggagatccccaatgtctgtagccacggagagtgtattgacaca
gaaggaagttatcggtgcctttgccacaatggattcaaagcaacagaagaccagacaatg
tgtatggatatcgatgagtgtgaccggcagccctgtggaaatggaacctgcaagaacacc
gttggatcttacaactgcctctgtttccccggatttgatctcacccacaacaatgattgc
atggatatcgacgagtgctcaactcagattggtcaggtctgtcgaaatgggcagtgtata
aacagtatcggctccttccagtgcttgtgtcaggatggctatgagctgccacccgatggg
aagaattgtgttgatatcaatgaatgcatcagcttccctggcacctgtgcccctgggacc
tgccagaatttagatggttcattccggtgtatttgtccccttggctatgaagtacagaat
gaccactgcatcgatattaatgaatgtgaggaggatcctaacatctgtctgtttggcttc
tgtactaatacacctggaagcttccagtgtaactgtgccctaggatttgttctctcggaa
aatggaaggagatgcttcgataccaggcagagcttctgcttcaccagatttgataacggc
aagtgttcggtacccaaggccttcaatacaaccaaagcccgctgctgctgtagcaagatg
ccaggggagggctggggtgacccatgtgaactttgccctcaggaagaagaagttgctttc
caggagctgtgtccatacggtcatggtgcaatccctggcattggtgatacccgtgaagat
gtgaatgaatgtgtagaaaaccctggaatctgtgttaatggacattgtataaacactgac
ggttctttccgatgtgaatgtccatttggatatagcctagatttcacaggagttaactgc
gttgatactgatgaatgcaccattggtaacccgtgtggcaacggaacttgcagcaatgtc
attggagggtttgagtgcgcgtgtgatgatggatttgaacctggtccgatgatgacttgt
gaagatatcaatgagtgttccctcaatcccctgttgtgtgcatttcgctgcatcaacacc
tatggttcatatgagtgcacttgcccaggagggtacactctgagagatgaccgcaagatg
tgcaaagatttggatgagtgttcagaaggattacatgactgtgagtcccgaggaatgata
tgcaagaacttgatcggcactttcatgtgcatctgcccaccaggaatgatgcgaagacca
gatggagagggctgcatggatgaaaatgagtgtcgcactaaaccagggatatgtcagaat
gggcggtgtatcaacacagttggcagctacagatgtgactgcaatgaaggattcttggaa
agtccatcagctacagaatgtctggataatcgtcaagggttctgtttcattgaagttttg
caaaccatgtgccaaatgtcatccaccaaccgtaacatggtcaccaagtctgagtgctgc
tgcaatggaggcagaggatggggcaaccagtgtgagatatgtccactgcctggcactacc
cgttacaaaaaaatgtgcccacatggacctggatatgccacagatggtagagatatcgat
gaatgtagagtggtaccaaacttgtgtaagaatggacaatgcatcaataccatgggctcc
ttccgctgtttctgtaatattggatacaccactgatttgacatcaacctcctgtgttgat
tttgacgaatgtgcgcagtctcccaaaccatgcaacttcatctgcaagaacacggaaggt
agctaccagtgctcttgtccacgaggctacatcctgcaggaagatggaaagacgtgtaaa
gatcttgatgaatgttcaacaaaacagcacaactgtcagttcctgtgtgttaacacaatt
ggatcctttgcgtgcaaatgtccgcctggtttcacacaacaccacacatcatgcatcgac
aataatgaatgcatgggccagcctacaatctgtggttcaaagggcacgtgccagaataca
ccaggaagcttcagctgtgactgccagaagggtttctcattggatggcactggttttaat
tgtgaagatattgatgagtgtgatgggaaccatcggtgtcagcacggctgccagaatatg
ctgggtggatacagatgcagctgccctcaaggctacatgcaacactatcagtggaaccag
tgtgtggatgagaatgaatgcagcaatcccacagcctgtggagccgcctcctgttataac
actctcggcagctacaaatgcctctgtccatctgggtttgattttgaccagtactctggg
ggatgtcaggatgtgaatgaatgctcagtctctggaaacccctgcacatatggctgctcc
aatacagatggtggttacctctgcggctgccctgggggctacttcagggtgggccaagga
cactgtatatcaggaatggggttcggaaatggtcaatatctacctttggaggaggaagag
ggtgatgcagagaatgtgctgtcccctgagacatgctatgaatgcaagattaatggctac
cccaagagaggcaggaatcggagaagcacaaatggcactgtgtcacatgagattagtttg
gctagtttggacattgatgcaccaatcccattgaatgtgaatatctcagacatgggaatc
catgagcatatcatggaattccttccagccattgagcctctggaaaaccatgtacgttac
atcatctccagtgggaacgaagccaacttcttccgaattcatcagaaaaatggactcagt
tacctccatctaagccgcagaaaggccatgcgagggaagtacgtgctagagatttccagt
atgcctctgtatgggaagaaggatcttctgaagctggaagatgagaatgacgttgactac
ctcgtgggtgatctcggcgaggccctccacatgaaacttcaaattcatcttctttaa
DBGET
integrated database retrieval system