Rickettsia typhi TH1527: RTTH1527_00070
Help
Entry
RTTH1527_00070 CDS
T01802
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rtt
Rickettsia typhi TH1527
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
BSMAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFE53881
LinkDB
All DBs
Position
14663..18055
Genome browser
AA seq
1130 aa
AA seq
DB search
MNKLTEQNLLKKSRFLKYSLLASISVGAVMAMPVEGIAMGIDKKAFCTELNTKLLLKFSQ
SSVNKDTISTTQETNNNLSNNVQSNKSDMTEEVANVTTESLCKVSKMQAPEFKASENKFL
NTLDFQTLSQELDRNSYTTKPIPQKPEIMLTTSSTTTSMGSNSFVNISSASSLKPVTPQQ
SAPDFKPNYSLGSNTPINIKELSFSSEQQQIAQHSNSTIPLMPTTSLVLPVKKSSVEIAP
EMVNNISRVDDTVSIKSSEVTEDIKGTKGKKNKKILANQFNKSIGSWSKKTGKNKYELNK
DSSKIEKFRKDLTTKNKDTDRLSAEIDISETKVSAFQAQQARIDEAHRDLLNPNQQKAPG
KRLEENKTKGKVIKAAVDGVQKIFNNAKKKISRTKLKKLQDQVGNHVIIGTSTIPNPLLI
SKPTMQFSNKLNGTLLEDEDGYLVPCEAQPQIYTVILPGQEIENHKSMDSDLLSLSTKTL
GKEIDEVHPNIGLSSEKEIEAKLVEDETTYSQDVQNAINILNTTNDKNTARLFGQHNNKL
TLDLHDNDRKKYYETHKQLSNSIRSPKSDLTTNSSLASSLNIFGSNEDLSWDNAGDIGVG
YRYGDEYSCPTPDDKSSSKLIDISDKNTTKVKGLEEGITMYDSIDLVADSLKSNAVSFKE
RNEALKQLSTAISETVISLSESNVQEDAEDILDGSILQAMLNSNNDKSIESLSLGSKEQE
ETEAGIRKAGDKQLLPVPVLLSDCKENEYLSLDNYNKGEKNYDSDFKEEEETIEQLSNSD
WYKMTKADTAILLEQEAKQEMQTQISENAPTLNQAKVINTIVNNMIRNRLDTFINMVVVG
AGDEEESNIKRGLWMRAMYGTNNHGRVNNMTGYRGINKGATVGFDAKINNNIIGIAYSNV
HSVFKFKNSKNNDKELIGSKVISIYGQKELQQNFTLQVLVSASKNFIKDKINYSYGDTKI
RSNVKHHNHSYNAEALLNYNYLVKNSIIVTPNIGLRYGKSRDGIYNETGINVQKIALTMK
ENNILSGILGTKVQVSLRDVLKFNNLGLTFQAAVEHNFEEKTQRINRVVKIFDNIFKQDY
LIPKQPKTSYNLGTGIIFGINNTNISVDYNYYLNKHYRSHQGSVKIKVNL
NT seq
3393 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagttaacagagcaaaatttactaaaaaaatcaagatttttaaaatattctttg
ctcgcctctatttcagtaggagcggtaatggcaatgcctgttgaaggaattgctatgggc
atagataaaaaggcattttgtaccgaattaaatacgaaattattgctcaaattttcacaa
tcaagcgtgaataaagatacaatcagtacaacacaggaaactaacaataacttatctaac
aatgtgcaaagcaataaaagtgacatgacagaagaggtagctaatgtgactaccgaatcg
ttgtgcaaagttagcaagatgcaagcaccagaattcaaagccagcgaaaataagtttctt
aataccttggattttcaaacactctcacaagagttagaccgcaattcttatacaacaaag
ccaatacctcaaaaaccagaaattatgctaacaacatcttcgactactactagcatgggt
tcaaatagttttgtgaatatttctagtgcttcatcattaaaacctgtgactccgcaacag
tctgctccagattttaaaccaaattatagtttaggatctaataccccaataaatataaag
gaactatcatttagtagtgagcagcaacagatagcacagcatagtaactcaacgattcct
ctgatgcctacaacatctctagtattgcctgtaaaaaaaagcagtgttgaaattgcgcca
gaaatggtaaataatatatcacgagttgatgatacggtaagcatcaaatcatctgaagtc
acagaggatattaaaggtacgaaaggtaaaaaaaataaaaaaatattagcaaatcaattc
aataagagcataggcagttggagcaaaaagacagggaaaaataagtatgaattgaataaa
gatagttcaaaaatagaaaaatttagaaaggacttgaccactaaaaacaaggatacagat
aggttatctgcagaaatagatatttcagaaacaaaagttagtgcgtttcaagcacagcaa
gcaagaattgatgaagctcatcgagatttattaaacccaaatcaacaaaaagcaccaggc
aaaagactcgaagagaataaaacaaaaggaaaagttataaaagcggcagtggatggagtt
caaaaaatctttaataatgcaaaaaagaaaataagtagaacaaagctaaaaaaactgcaa
gaccaagtaggtaatcatgttataattggcacttctactattcctaatcctttgctaata
tcgaagccaacaatgcaattcagtaataagcttaatgggactttgttggaagatgaagat
ggatacttagtaccatgtgaagctcaaccacaaatttatacagtaattttgccaggtcaa
gaaatagagaaccataaaagtatggattcagatttattgagcttatcaaccaaaacttta
ggtaaagaaatagatgaagttcatcctaacataggattatcaagcgagaaagagatcgaa
gctaaactagtagaagatgaaactacatatagtcaagatgttcaaaatgcaataaacatt
ttaaatactactaatgacaaaaatacagctaggttgtttggtcaacataataataaatta
acactagatctgcatgataatgatagaaagaaatattatgagacacataaacagttgtct
aattccattagatcaccaaagtcagatttgactacaaattcatctttagctagtagttta
aacatatttggtagtaatgaagatttatcatgggataatgcaggagatataggagtaggt
tacagatatggagatgagtatagttgtccaactcctgatgataagtcaagttctaagcta
attgatattagcgataaaaacaccacgaaggttaaagggctggaagaaggaataactatg
tatgattctatcgatttagtagcagactcattaaaatcaaatgctgtttcttttaaagaa
agaaatgaagcgcttaagcagttgagtacagcgatttctgaaacagttattagtttaagt
gaatctaacgtacaggaggatgctgaagatattttagatgggtcaatattacaagcaatg
ttaaattcaaataatgataaatctatagagtctttatcattaggaagtaaagaacaagaa
gaaacagaagctggtattcgaaaagcaggagataagcagttacttcctgtacctgtatta
ttaagcgattgtaaagaaaatgaatatttatcattagataattataataaaggtgaaaaa
aattatgattcagattttaaagaggaagaagaaacaatagagcaattatcaaattctgat
tggtataaaatgactaaggctgatacagctattctgcttgaacaggaagcaaaacaagaa
atgcaaacacaaatttcagaaaatgcacctactttaaatcaagcaaaagttattaatact
attgtcaataatatgattcgtaacagattggatacatttataaatatggtagtagtagga
gccggtgatgaagaagagtctaatataaaaagaggtttatggatgcgtgctatgtacggt
actaataatcacggacgtgtaaacaatatgacgggttatagaggtattaataaaggcgct
actgttgggttcgatgctaaaatcaataataatattataggtatagcttatagtaatgtt
cattcagtatttaaatttaaaaatagtaaaaataatgataaagaacttattggtagtaaa
gttatttctatttatggacaaaaagaattacaacagaattttacactacaagttttagta
tctgcttctaaaaactttattaaagataagataaattattcatatggtgatactaaaatt
aggagtaatgtaaaacatcataatcatagttataatgcggaagcattactaaattataat
tatcttgttaaaaacagtattattgttactccaaatattggcttaaggtatgggaagtca
cgagatggtatatataatgaaactggtattaacgtacaaaaaatagctcttacgatgaaa
gagaataatatattgtccggaattttaggtactaaagtccaagtatctttaagagatgtt
cttaaatttaataatttaggtctcacatttcaagcagcagtagaacataattttgaagag
aaaacacaaaggataaatagagttgttaaaatatttgataatatattcaaacaggattat
ctaataccgaagcaaccgaaaacatcctataatttaggaactggtattatattcggtatt
aataatactaatatttctgtggattataattattatctaaataaacattatagaagtcat
caaggtagtgttaagattaaggtaaacctataa
DBGET
integrated database retrieval system
