KEGG   Ruminococcus sp. FMB-CY1: LCN94_03530
Entry
LCN94_03530       CDS       T10118                                 
Name
(GenBank) carbohydrate-binding domain-containing protein
Organism
ruc  Ruminococcus sp. FMB-CY1
SSDB
Motif
Pfam: Cthe_2159 DUF3540
Other DBs
NCBI-ProteinID: WBX58187
LinkDB
Position
699579..701411
AA seq 610 aa
MSFNLKRKGKFAALLVALIISVSVTGCANTDEKTSSTNSSTVTKDSVSTASIASDESLDS
DMFTDRDKEVGYDESSAVMIAFSSSGATASSDSVSVSGSKVTIKSEGTYIVTGTTSDGQI
IVDADNKTKVQIVLKNASVTCKSSAALYVKQADKVFVTTAKDTENTLASTGDYVQTDDNN
VDAAVFAKDDITFNGEGKLTVTSEKGHGIVSKDDLKLTSGEYNITAASHALSGKNSIRIA
SGTYTLTSGKDGLHAENTDDTSKGFVYIADGKFTVNCKGDGIDAGTTVQIENGTFNITSN
RDSSSSSSTDSASVKGIKAGGDITISGGTFILTCEDDGLHSNSNVTVSGGTFTISTGDDG
IHADSKTSISGGTINITESYEGIEGTEVEISGGTINLKSSNDGFNAAGGKDESGFGGGFD
RDNFGSSDASITISGGKITIDADGDGVDSNGSLTVTGGETYVFGSTSGDNGAVDYDGEAT
ITGGIFIATGSSQMAQNFGENSTQGSMLVNTNSSGEITVKNSDGDVLVSFTPTKTYACVV
ISCPGITTGQTYTVTTGDSTTEVEMTSIIYGSGGMGGPGSMGGRNMGNGDMNGNEMGDPG
GDMRGGPQMR
NT seq 1833 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagctttaatttaaaaagaaaagggaaatttgcagcattgcttgtggcacttattata
tccgtaagtgtaacaggctgcgcaaatacagatgaaaaaacatcctcgacaaattcttca
actgttacaaaagacagtgtttctactgcttcaatcgcttcggatgaatctcttgacagc
gatatgttcaccgaccgtgacaaagaggtagggtatgatgaaagttcggcggtaatgatt
gctttttcatcatcaggtgcaaccgcaagctctgacagcgtttctgtcagcggaagtaag
gttactattaaaagtgagggcacatatatagttacgggtacaacatccgacggtcagatt
attgtagatgccgacaataaaacaaaagtgcagattgtacttaaaaacgcctctgtaacc
tgtaaatcaagtgccgctttatatgtaaaacaggcagataaggtatttgtaacaactgca
aaagacacagaaaatacacttgcgtcaacaggtgactatgttcagacagatgacaacaat
gtagatgcggcggtatttgcaaaagatgatattacctttaacggagagggaaaattgact
gtaacttccgaaaaaggtcacggcattgtttctaaagatgatttaaaacttacaagcgga
gaatacaatattacagccgcaagccatgcattaagcggtaaaaacagtatcagaattgca
agcggtacttatactttaacttcgggtaaagacggtttgcacgcagaaaatacagacgat
acttcaaaaggctttgtgtatatagcagacggtaaatttaccgttaattgcaaaggtgac
ggcattgatgccggtacgacggtccaaattgaaaacggcacatttaatattacttcaaac
agagattcatcatcttcaagttcaacagattctgcaagtgtaaaaggaataaaagcagga
ggagatattacaatcagcggaggtacttttattcttacttgcgaagatgacggtttacat
tcaaattcaaatgtaaccgtatcaggaggtacttttacaatttcaacaggagatgacggt
atccacgccgacagcaaaacaagcatcagcggaggaacaattaatattaccgaaagctat
gagggaatagagggaacggaagttgaaatttcaggcggtacaattaatctgaaatcgagc
aatgacggatttaatgccgcgggcggaaaagacgaaagcggattcggtggcggatttgac
cgtgacaattttggttcatcagatgcttccattacaatatcgggtggcaaaataacaatt
gacgctgacggtgacggagttgattcaaacggttcgcttaccgttacaggcggggaaacc
tatgtttttggctcgacaagcggagataacggagcggttgattatgacggagaagctacc
ataacaggtggcatattcattgccacaggttcatctcaaatggcacagaactttggagaa
aattcaactcaaggttcaatgcttgtaaatacaaattcgagcggtgaaatcacagtcaaa
aacagtgacggcgatgttcttgtatcgttcacacctaccaagacatacgcttgtgtggtt
atcagttgcccgggtattacaacaggtcagacatatactgtaacgacaggcgacagtaca
acagaagttgaaatgacttctatcatatacggttcaggcggtatgggtggtcccggaagt
atgggcggcagaaatatgggcaacggcgatatgaacggaaacgaaatgggtgacccgggc
ggagatatgcggggcggtcctcaaatgagataa

DBGET integrated database retrieval system