Ruminococcus sp. FMB-CY1: LCN94_06430
Help
Entry
LCN94_06430 CDS
T10118
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ruc Ruminococcus sp. FMB-CY1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX56579
LinkDB
All DBs
Position
complement(1275564..1280192)
Genome browser
AA seq
1542 aa
AA seq
DB search
MKTNFKRIGKQSISIVLAVMMMLSTMLVGMVTSNAANETGYTYNQDYMYVDLSAVSKTMS
GKNSGVNYYWDDHFTNYGGWITNKKDLGNYTYKFDFSAIGSHEYFRGFKIVWDGSAGTNI
AVLENNTYNCVKVNSDYTLSWTTYSSTEPTTKYTVTVDKNITNGTVTPSATSLEAGKTFT
VTATPDDGYELDAITVTTADGKSVAATDESTHTYTMPASNVTVSATFKVKTDAKYSVTYT
APTGEGVVDSSINPTETTLAAGTTVKVTVTVNEGYTASLAVDGATVTTSTSGNTYTFTFS
MPAQNITVAPKVTKAGENTGTLIPNLYLIYSDSSSKPSDFTQYLNLYYNSDNQVYAYFDE
SNFDDSKEYCFMISNSKGESTSWEYAYDHYNNSKTLSDSEQLACGSSDNWLPKAGQSQYV
QAVFAKFKVRDAYVGTISSVKINLGYYDGKDIVESSTDSSKATTYEVIPTSGVEGMVRVF
AKDGTVRATYQKYADMADTVLTAENTADLTKYAKKDYYDTAYAKVGTKLKITTTIGDDYK
GTYFVKAFSINGYSYGIIDASQADTTDGVYTCEYTIPEDFKGSRIEITPIYYYIDDTDTV
TFYVEGFDEIVQAKWGNTVAVQAWYTNGVEKDEFNSLTKNALGGYPGQPLVYEGGKYSMQ
IPKYLNGNKANTVSGITLNNYFWDDIHKQSFSDTSDKSESNCQTYDYDDFYKLSETADVD
NIIFDFRYRTTIDNAPKDNLTNSTYNPDELEPLKDYSGNIVDIFGNILSKDWTAEYDSEY
LTVISDGYKNNENIGKYATEWSVYAHDGTYITTINCSSLIDETKVDPAYQVAYNKLKQQY
AGLPVKIAYEMSKFDGYDKGTRADGRWYFSKKAQKISANVKIEYRADDTSPFIEDAFVAD
SNVGEKTGAKAYFTNADYNGKTTCQGEVDGGNFSVHAQTDANANYYFLGWYLKTSDGYSF
ITNESDTDIPMTNNATYVARFINTPSGTLTLSHTLLDGSAYGKTFIKADIIDSANNVKAS
IDETSGNLVIPSKYVTYTSTYIIRLTLRTVPYGNDTVEGFYEGYSSDKPVRYNKDFTGTG
EQTYSVERAISSLFEEIKNADGSISYKLKKSNIPFYSNITSNPLEYTITYTYKTRLNGEQ
SYVIKDKVSGIELEEMWAENVVAGLTKEQLSKAFIIRKAPFVSNFREVITWDMDKATINS
YVATVSANTTTVDLNISALTVDGQWTLPAKVKYGELAKSSDGDYLYKTGTTEFPEKFNYS
GTTKYDFSFWAIFDNKDEAQKYSDAVKAYMLGNPDPDMSKRLTALTKLDGYKNLISKSYS
KEYNYISYQNYYIVPVYAGRFAKNEIKEAQASIRLLEYTRNQWTNANGVKGDGSLNVDGS
KTDYLYTDFALSFDKDQKLIKNNANIKVGVTFEVVAKYNDINDLKSYETTSNKDAIGNLV
KDATANGKVGTYTMDGAERNVYKYEINNSNISVKNRIEYYLRFKNSETSQQNVMKVYSYI
YDTVSGKIYLSDPVYMNMYDIGNLTYITSDLANINLDPDATV
NT seq
4629 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacgaatttcaagcgtattggcaaacagtcgatttctattgtgcttgctgttatg
atgatgctttcgactatgcttgtcggtatggttacttcgaatgcggctaatgaaacagga
tacacatataatcaagattatatgtatgttgatttatctgcagtaagtaaaacaatgtcg
ggtaaaaattcgggtgtaaactattattgggatgatcacttcacaaactatggtggttgg
attactaataaaaaagaccttggaaattatacttataaatttgatttttctgctataggt
agtcacgaatatttcagaggttttaaaattgtatgggatggttccgcaggaactaatata
gctgttcttgaaaacaatacttataactgcgttaaggttaattcagattatactctttct
tggactacatatagcagtacagaacctaccactaaatacactgtaactgttgataaaaat
atcacaaacggtacagttactccttctgcaacctcacttgaggcaggcaagacatttaca
gtaacagccacacctgatgacggttatgagcttgatgctattactgtaacaactgctgac
ggtaagagtgttgcggctactgacgaatcaacacatacttacacaatgcctgcaagcaat
gtaactgtttctgctacatttaaggtaaagacagatgccaaatactctgttacatacaca
gctcctacaggtgagggcgtagtagattcaagtattaatcctacagaaactacattagcc
gcaggtacaactgtaaaggtaactgttacagtaaacgagggctacacagcttctcttgct
gttgacggtgcaacagtaacaacttctacaagcggcaatacttatacatttacattctca
atgcctgcacagaatatcacagttgctcctaaggttacaaaagccggagaaaataccggt
acattgattccgaatctttacctcatttacagcgacagcagttcaaaaccgagtgatttc
acacagtatcttaacctttactataattcagataatcaggtgtatgcttactttgacgag
tcgaactttgacgactctaaagaatattgttttatgatttctaattcaaaaggtgagtca
acatcatgggaatatgcgtatgatcattacaataattctaaaactttatctgatagtgaa
caacttgcatgcggaagtagcgataattggttgcctaaggcaggtcaaagccaatatgta
caagcagttttcgcaaagtttaaagtacgtgatgcttatgtaggtactatttcaagtgta
aagattaacctcggttactacgacggtaaggacattgttgagagttcaactgactcttca
aaggctacaacttacgaggtaattcctacaagtggtgtagagggaatggttcgagtattt
gctaaagacggtactgtcagagctacatatcagaagtatgctgatatggcagacactgta
cttacagcagaaaatacagctgatttgactaaatatgctaaaaaagattattacgataca
gcatatgcaaaagtcggtactaaactcaagattacaactactattggcgatgactacaaa
ggtacatattttgtaaaggctttctcaatcaacggttattcatacggtattatcgatgct
tcacaggcagataccacagacggtgtatatacttgtgaatataccattcctgaagatttt
aagggtagcagaatagaaattacacctatttactactacattgatgatactgataccgtt
acattctatgtagagggctttgacgaaatagtacaggctaagtggggcaacacagttgct
gttcaggcttggtacacaaacggcgtagaaaaggacgaatttaattctctaacaaagaat
gcgcttggcggttatcccggtcagcctttggtatatgagggtggtaaatattcaatgcag
attcctaagtaccttaatggtaataaagccaatacggtatccggtattacattgaacaac
tacttctgggacgatatacataaacagagtttctctgatacgagtgataaaagtgagtct
aactgccagacatacgactacgatgacttctataaactttctgaaactgcggatgtagat
aatattatcttcgacttccgttacagaactacaatagataatgcccctaaggacaattta
accaactctacttataatccggacgaacttgaaccgcttaaggattactccggtaatatc
gttgacatctttggaaatattctttcaaaagattggactgctgaatatgacagcgagtat
cttacggtaatatctgacggttataagaataatgaaaatattggtaaatatgctactgag
tggtcagtatatgcccatgacggtacatacattactacaatcaactgttctagccttatt
gatgagaccaaggttgaccctgcttatcaggtagcttataacaaacttaagcagcaatat
gccggtttacctgtaaagattgcttatgaaatgtcaaaatttgacggttacgataagggt
actcgtgctgacggtcgttggtatttctctaagaaagctcagaagatttccgctaatgtt
aagattgagtacagagcagacgatacttctccgtttatcgaagacgcatttgtagcagac
agcaatgtcggtgaaaaaacaggtgctaaggcttactttacaaatgccgattacaacggc
aagacaacttgtcagggtgaagtcgatggcggtaacttcagtgttcatgctcaaacagac
gccaatgctaattactatttccttggctggtaccttaagacctctgacggttattcattc
attactaatgagtccgatactgacatcccaatgacaaacaacgcaacttatgttgctcgt
ttcattaatactccaagcggcacattaacactttcacacacattgcttgacggttctgct
tatggcaaaactttcattaaagcagacatcatagacagcgcaaataatgttaaggcttct
attgatgaaacatcaggtaaccttgtaattccttcaaaatatgttacttatacaagcaca
tatatcattcgtcttacacttagaaccgtaccttatggtaacgatactgtagaaggcttc
tatgaaggttacagtagtgacaaacctgtacgttataataaagattttacaggtacaggt
gagcaaacttacagtgtagagcgtgcaattagctcattgtttgaagaaatcaaaaacgcc
gatggcagtatttcttacaaacttaaaaagtcaaacattccgttctattcaaatatcaca
tcaaatccactcgaatacacgattacttacacttataaaacaagacttaacggtgaacag
agttatgttattaaggataaagtatcaggtattgagttagaggaaatgtgggctgagaat
gtagttgccggtcttacaaaagaacagcttagcaaagcattcatcataaggaaagctccg
tttgtttcaaacttcagagaagtaattacgtgggatatggataaggcgactattaacagt
tatgttgcaacagtatcggctaacacaaccactgttgatcttaatatttctgctttgaca
gttgatggtcaatggacactgcctgctaaggttaagtatggcgaattagctaagtcgtcg
gacggtgattatctctacaagacaggtacaactgaattccctgaaaaattcaattattcc
ggcactaccaaatatgatttcagcttctgggctatctttgataacaaagatgaggctcaa
aagtacagcgacgcagtaaaagcttatatgttaggtaatcctgatccggatatgtcaaag
agattaactgctcttacaaaacttgatggttataagaatcttatttctaagtcatattct
aaggaatataactacatcagctatcagaattattatatagttcctgtttatgcaggcaga
tttgcaaagaatgaaatcaaagaggctcaggcaagcatcagacttcttgaatacaccaga
aaccagtggactaatgctaacggtgtcaagggtgacggtagtcttaatgtagacggttca
aagaccgattacctctacacagactttgctctcagctttgataaggatcagaaactcatc
aagaataatgctaatatcaaggttggagttacctttgaagtcgttgcaaaatataacgat
attaatgatctcaagtcttatgaaacaacttctaataaagatgctattggcaatttggta
aaggatgcaactgcaaacggtaaggtaggcacttacacaatggacggtgctgaaagaaat
gtttacaaatatgagattaataactcaaatatttctgtaaagaacagaattgagtattat
ttaagattcaagaacagtgaaacatcacagcagaatgttatgaaggtttactcatatatt
tatgatacagtttcaggaaagatttacttaagtgatcctgtttatatgaatatgtatgat
atcggtaaccttacatatattacttctgacttagcaaacatcaacttagatcctgacgcc
acagtttga
DBGET
integrated database retrieval system