Ruminococcus sp. FMB-CY1: LCN94_07100
Help
Entry
LCN94_07100 CDS
T10118
Name
(GenBank) HAMP domain-containing histidine kinase
Organism
ruc Ruminococcus sp. FMB-CY1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HATPase_c_3
HATPase_c_5
HAMP
HATPase_c_2
LcrV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX56700
LinkDB
All DBs
Position
complement(1432413..1433552)
Genome browser
AA seq
379 aa
AA seq
DB search
MKKLSLQWRITLMTTVLICITCVLMNCLIGYSGKRYMDSIGNGISAYSEIDKGKPSSFNP
ENENPDSELTIIISGAQDSFNTTNWYITIAVSVLGGILAYFVSGRALKPLKSFASQVENV
QPNNLADMKISDDVLPEFKQFCQSFNNMLDRLDNGFAAQRQFTGNAAHELRTPLALIQAQ
IELFSVEHPNMSNDTAEFLALLQEQNERMSQMTKTLLEMSELRTVECKDTIEIAPMIEEI
FTDLAPLAEKKNIRLEYNGNGMMIGSDTLIYRLLFNLTENAIRYNRENASVIITVDEKNN
QLYIRVKDNGYGIPEQYRESIFQPFFRVDKSRSRAYGGVGLGLSLVWEIVLLHNGTVKAE
KSDKNGTVMLVTLPQKTNK
NT seq
1140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactttctttacaatggcgaataaccttaatgaccacagttttaatttgcata
acttgtgtgctaatgaattgtttaatcggttattcaggcaaacgatatatggattcaata
ggcaacggaatatcagcatatagtgaaattgataaaggaaaaccgagttcatttaatccg
gaaaatgaaaatcccgacagtgagcttaccattattatcagtggtgcacaagattcattc
aatactactaattggtacataacaattgccgtaagcgtacttggtggtatacttgcatat
tttgtcagtggtcgtgctttaaagccgctaaaaagttttgcctctcaagtagagaatgta
cagcccaacaatttggcagatatgaaaataagcgacgatgttttgcctgaatttaaacag
ttttgtcaatcatttaacaatatgcttgaccgactcgacaacggttttgctgctcaacgg
caattcacaggaaatgcagcgcacgagttaagaacaccacttgccttaattcaagcacaa
attgaacttttttctgttgagcacccaaatatgagcaacgatacagcagaatttcttgca
ctgctacaagagcaaaacgaaagaatgtcacaaatgacaaaaactctgcttgaaatgagt
gagcttcgtacagttgagtgcaaagatacaatagaaattgcccctatgattgaagaaata
tttaccgaccttgctccccttgcagaaaaaaagaatattcgccttgaatacaacggcaat
ggtatgatgataggcagtgacaccttaatttatcgtttattatttaatttaactgaaaac
gcaatacgctacaacagagaaaatgcttctgtaattataactgttgacgaaaagaataat
cagctttatatacgagttaaagataacggttatggtatacccgagcagtacagagaaagt
atctttcaaccatttttccgtgttgataaatctcgtagcagagcatacggcggtgtaggt
cttggactatcacttgtatgggaaattgtacttttgcacaacggtacggtaaaagctgaa
aaaagcgacaaaaatggaacagtaatgcttgtaacacttccccaaaaaacaaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system