Rufibacter radiotolerans: TH63_00700
Help
Entry
TH63_00700 CDS
T03996
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
ruf
Rufibacter radiotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ruf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ruf02000
]
TH63_00700
Transporters [BR:
ruf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
TH63_00700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CILP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKQ47396
UniProt:
A0A0H4WA84
LinkDB
All DBs
Position
185999..189028
Genome browser
AA seq
1009 aa
AA seq
DB search
MKKALLFSFALMLTLLTQAWAQNRTVTGRVTDTATGEGMPGVTVLLKGSSTAAPTDVNGA
YSINVPSAGGTLVFSFIGYTNQEVAIGSQSTVNVRMVTDARQISEIVVTGYGVQEKREVT
GAIAQVSGASIQNQPIPSLDKALQGRAAGVVVQSSNGIPGGAINVQIRGIGSVNANTSPL
YIVDGVQINTATARVAYTSSNPLSAINTNDIESIEVIKDAATAAVYGSQAANGVVIITTK
KGKAGRTNFTANYYTGFAKELSKFDVLNTQQYFALRTEAYRNANSPAVARANVISEMGLP
STITDAQIAALPTYNWQDEAFRRGVVNNYELSARGGNDKTTFYLSGAYQEQSAILTSADF
KRASMRLNLNHAASDKLSFETTINLSNVDQAAPFSTSGSSLGNPAFSASLILPQNKVRNE
NGTYFGLPGSGQVFGGVLNQNIVAVNEYSTGNQQTNSVIGSFAATYKILPGLSFRSSYSL
DYSNINADFYYDPRTNDGYANSGSGFKASDWNTNIQTVQLLNFGRTFADLHKVEAQVGFE
YRTDQRRSFSANAQGFATPEFRTLGTASTPVSIGEGFTGYKRAGGFGSINYVFNGKYTLR
GILSYNGSSRFGKSTQYGFFPGVAAAWNISDENFLKGTDWLNTLKLRASWGQNGRDGIGD
FTSRSLYAGAGVYTGAPAIAPAGLANTDLKWEVRTMLDMGIDFAFFGNRVSGTLGGFIEK
NDDLLFQQPLQSSTGFSSVWNNVGALEQKGLEIELNTVNLDFGGFQWRTNFNYTYIHNEI
TRLYNDLNRLPDNSLIVGEDIGVIWSYEYAGVNPATGRPMWYDGNGNPTYVVSAANDGRI
IGSTRPKHTGGLDNAFTYKGFDLNFLFQYQYGRRQLDSQHNFLLENGNRALNGLTEVYNE
RWTTPGQITSVPRPYHGGAESQGNNHVIGSTRNYLKTDYIRLKTVQVGYNLSNALLTRSR
FLTSARVYVQGTNLYTYSDFPGYDPEFYGTALGIIPQSKNVTFGVQLGF
NT seq
3030 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaagctttactattcagcttcgctttgatgcttacgcttctcacccaggcgtgg
gctcaaaaccggactgtaacaggacgagtgactgacaccgcaacaggagagggaatgcct
ggtgtgacagttctactcaaaggtagcagtacagccgctccaacggatgtaaacggtgcc
tattcgatcaacgtccccagcgcgggcggaactttggtgttctcctttataggctacacc
aatcaggaagtggctattggtagccaatcaaccgtgaatgtacgcatggtcacagatgcc
cgtcagatctctgagattgtagtgactggttacggtgttcaggaaaagcgcgaggtaact
ggtgcaattgcacaggttagcggagcttctatccaaaatcagcctattccttcattggat
aaagcattgcaaggtagagccgcaggggttgtggttcaatcaagtaatggtatccctggg
ggagctatcaatgtgcagatccggggtataggttcagttaatgctaacacttcgcctctt
tacattgtggatggggttcagataaacacggctactgctcgggttgcttatacctcttct
aacccattgtctgccatcaatacaaatgatattgagtcaattgaagtaatcaaagatgcg
gcaactgctgcagtttatggttctcaggcggcaaacggggtagtgattatcactacaaaa
aaaggtaaggctggaagaaccaactttacagctaactactatactggctttgctaaagaa
ttaagcaagtttgatgtgcttaatactcagcaatattttgcgttaagaaccgaagcctat
agaaatgcaaattctcctgcagtggccagagcaaacgtgatctcagagatggggcttcca
tctactatcactgacgcgcaaattgctgctttgcctacttataactggcaagatgaagcg
tttagaagaggcgtggtgaataattatgaattatctgccagaggaggtaatgacaaaact
accttctacctttcaggagcttaccaagagcaaagcgctatccttacgtctgctgatttc
aagagagccagcatgagattgaacctgaaccatgcagcttcagacaagcttagctttgaa
actactatcaacttaagtaacgttgaccaagcagctcctttctcaacttctggttcatct
ttaggtaacccagctttctctgcgagtttgattcttcctcagaacaaggttagaaacgaa
aacggaacttattttggcttaccaggcagtggccaggtatttggtggtgttctaaaccag
aatattgtagcagttaatgagtattcaactggtaaccagcagactaactctgttattggt
tcatttgcagctacttataaaatcttgccaggtttgtctttcagatctagctacagctta
gattatagcaacatcaacgcagacttttactatgacccaagaaccaatgatggttatgcc
aacagcggtagcggatttaaggcaagtgactggaatactaacatccagactgtgcagttg
ttaaactttggtagaacattcgctgatctgcacaaagtagaggcccaggttggatttgag
tacagaacagatcaaagaagatctttctctgctaacgctcaaggatttgcaactccggaa
ttcagaaccttgggtacagcaagtactccagtttctattggtgaaggctttacaggatat
aagagagctggtggatttggatccattaactacgtattcaacggaaagtacacgttgaga
ggtatattatcttataacggttcttcccgctttggtaagtctacgcaatatggcttcttc
cctggggttgcggctgcctggaatatctctgatgagaatttcctgaaaggaactgattgg
ttaaataccctgaagttaagagcaagctggggacaaaatggtcgtgatggtattggtgac
tttacctctcgttcactttatgccggagctggcgtttataccggtgctcctgctattgct
ccagctggcttagctaacacagacttgaagtgggaagtgcgtaccatgcttgatatgggt
attgactttgccttcttcggaaatagagtttcaggtacattgggaggtttcattgagaaa
aacgatgacctgctattccagcaaccacttcaatcatcaaccggctttagctctgtttgg
aataacgtaggtgcattggagcaaaaaggtttagaaattgagttaaacactgtaaacctt
gattttggtggattccagtggagaactaacttcaactatacctacatccacaatgaaatt
acccgtctgtataatgacctgaaccgtttaccagataactcacttattgtaggggaagat
attggagtaatttggtcatatgagtatgctggtgttaaccctgctacaggaagaccaatg
tggtatgatggaaatggaaaccctacatatgtagtttctgctgccaatgatggtagaatc
attgggtctacccgtccgaagcatacaggtggtttagacaacgcctttacttataaaggc
tttgatttgaacttcttattccagtatcaatatggaagaagacaacttgactcacagcat
aacttcctgttagaaaatggtaaccgtgcgttgaatggtttgacagaagtatacaacgaa
agatggactactcctggtcaaattacttctgttccaagaccttaccatggcggtgctgag
tctcaaggtaacaaccacgtaattgggtcaacccgcaattaccttaaaacagattacatc
agattgaaaactgttcaggtaggatacaacctgtcaaatgctcttctaactagaagccgg
ttccttaccagcgccagagtttatgttcaaggtactaacctttatacctactcagatttc
ccaggatatgatccagagttttatggaactgcccttggtatcatcccgcagtctaagaac
gttacatttggtgttcaactaggattttaa
DBGET
integrated database retrieval system