Ruminococcus bovis: E5Z56_01320
Help
Entry
E5Z56_01320 CDS
T05998
Name
(GenBank) RNA helicase
Organism
ruj
Ruminococcus bovis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCT06088
UniProt:
A0A4P8XZ07
LinkDB
All DBs
Position
272206..274359
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MARSFKTKDTRRIIKTHTKISSQLNYVINLSENYKNAIKDNVNNYISNKINETLSNIPVD
ELNRNKQGIRVKSLHDSGYNNISDIAYKTVLELKEINGISLESAYAIRETVDKMVNQIVD
VTKLALSVDNKTPETTAIVRCVDIYRKIFPCAGRCTQLLNTYSEKVNTEIENVATAKNGV
KWLFSSKENKDKAEKAYEFLTYLAKSEYGAFADESSKSAIDVEKITDEECWSDFEKYSIQ
FYNILEEITPNALGNNKALGLPDELAKQVESQEVDLTGLACELRKYQLTGVKYAFLQQKV
LLGDEMGLGKTIQAIALMVALRNIGATRFMVVCPASVIANWCREITEKSDLIVVKIHGQD
KSVALENWMQNGGVAVTTYETTGYIDLEDSFRFENLIVDEAHYIKNPEARRSRNVRNIAD
HAKRILFMTGTALENRVNEMIELISILQPQIAYEVDGMEYLSSAPEFREKVAPVYYRRKR
EEVLTELPQLIENKEWLDMNPVEKEAYYNAVMSDNMQAPRRVSWNVANIADSSKAKRLKE
IVDEATDDGRKVIVFSYFLDTIKKVKLVLGDKCVDHINGAVSPQRRQEIIDEFNNAKAGA
VLPAQIQAGGTGLNIQSASVVIICEPQFKPSIENQAISRAYRMGQTRNVLVYRLLCEDSI
DEQMMKMLNKKQNIFNEFADKSSAKDTIEINEETFNNMMKVEYERVKNLVNNSNTEK
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaggtcatttaagactaaagatactaggagaattattaagacacatacaaaaatt
tcaagtcagcttaattatgttataaatctttcagagaattataaaaatgcaattaaggat
aatgtaaataactacatttccaacaaaataaatgaaacattaagcaatattcctgttgat
gaacttaatcgcaacaaacaaggaattagggtaaaatcacttcatgacagtggttataat
aatatttcagatattgcctataagacagttttggagcttaaagaaattaacggtatcagc
cttgaaagtgcttatgctattcgtgaaactgttgataaaatggttaatcaaattgttgat
gttacgaaacttgcactatctgttgacaacaaaactcctgaaactactgctatagtcaga
tgtgttgatatttacagaaagatttttccttgtgccggtagatgtactcaactgctaaat
acatattcagaaaaagttaacacagaaattgaaaatgttgcaactgcaaagaatggtgtt
aagtggttattttcttctaaagaaaataaagataaagcagaaaaagcctatgaatttcta
acctatttagctaaaagtgaatatggtgcttttgctgatgaaagttcaaaatctgcaatt
gatgttgagaaaataactgatgaagaatgttggagtgactttgagaaatattcaattcag
ttctataatattttagaagaaatcacacctaatgcacttggaaataacaaagccttaggt
ttgcctgatgaactggcaaaacaagttgaaagtcaagaggttgaccttacaggtcttgct
tgtgaacttagaaagtatcagttaaccggtgttaagtatgcattcttgcaacagaaagtg
ttgcttggtgatgagatgggtttaggtaaaactattcaggctattgcactaatggttgca
cttagaaatatcggtgctactcgctttatggttgtatgtcctgccagtgttattgccaat
tggtgtagagaaattaccgagaaaagtgacttaatagttgtgaaaattcatggtcaagat
aaatcggttgccttagaaaattggatgcaaaacggtggtgttgcagttactacatatgaa
actacaggctatattgaccttgaggacagttttaggtttgaaaatttaattgttgatgaa
gcccattatattaagaatcctgaggcaagacggtcaagaaatgttagaaatattgcagac
catgcaaaaagaattttgtttatgacaggtactgcccttgaaaatagggtaaatgaaatg
atagagcttatctctattttgcaaccacaaattgcatatgaagttgacggtatggagtat
ctaagttcagcacctgaatttcgtgaaaaggtagcaccggtttattacagaagaaaaaga
gaagaagtactgacagaacttcctcagcttattgaaaacaaagaatggcttgatatgaat
cctgttgaaaaggaagcatattacaatgcagttatgtcagataatatgcaagctcctagg
agagtatcatggaatgttgccaatattgccgactcctcaaaggcaaaaagattaaaagaa
attgttgatgaagctactgatgacggtagaaaagttattgtattctcatatttcttagac
acaattaaaaaggttaaattagttcttggggataaatgtgttgaccatattaacggtgca
gtttctcctcagcgtaggcaagaaattattgatgaatttaacaatgcaaaagcaggtgca
gtgttaccggcacaaattcaagccggtggtacaggactgaatattcagtcagccagtgtt
gtaattatttgtgaaccacagtttaaaccatcaatagaaaatcaagctatttccagagca
tatcgaatgggacaaacaagaaatgttcttgtgtatagactgctttgtgaggactctatt
gatgagcaaatgatgaaaatgctaaacaaaaagcaaaacattttcaatgaatttgccgat
aaatcttctgctaaagatactatcgaaatcaatgaagaaacctttaataatatgatgaaa
gttgagtatgaaagggttaagaacttagttaataattctaatacagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
