Ruminococcus bovis: E5Z56_07595
Help
Entry
E5Z56_07595 CDS
T05998
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
ruj
Ruminococcus bovis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ResIII
Helicase_C
SWI2_SNF2
DEAD
MTES_1575
SNF2-rel_dom
AAA_11
DUF559
AAA
ForC_N
Ank_2
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCT07229
UniProt:
A0A4P8XYE6
LinkDB
All DBs
Position
1624206..1626455
Genome browser
AA seq
749 aa
AA seq
DB search
MEKATSVNSIAEEKFVEIFCDTFGPDKANNLYVQYPFVDIYGGHRYIDFALENEDSKIAI
EIDGETYHNPKKVSDNKYFDDLLKQNSMVYQDWKVYRWAYNQLVSQPEKVKDELVTFLGE
TPFFKTFQEYLPNQQGKIFELREYQKEALDNLKKMRENGETIALLYHATGVGKTVTAASD
AKEVGGRTLFLVNALKLADQAENTFAKIWKEATLGKYTGSEKTTDTKVIFATVQSISKNL
LEFQPNSFDYIIVDECHHAAAKTYKKIFSYFKAKFILGLTATPERSDGEDMLNLFQNVAH
KMDLETAVKKEILVPIRCIRIKTDIDLTSVRINGIKYNSQDLESKLFVPERNKIIADTYV
NFVNGKKAVIFCASINHATEIAKLLLEQGVNAESVSGRDKPKVRNKILNDYENGNINVLC
ACDLLNEGWDSPKTEVLFMARPTMSKTVYMQQLGRGTRKCKGKKDLLVFDFVDNANMFNQ
PYSLHRLLNIKEYHPLEYVLAPDNKKKLDKDLLRKGEKPTEYIDLPLNIYDYETVDLFNW
QDEVKTMLSQKEFIRRVDVQSETVDRYVKNGDIKPDLSIPISENKTFNYYKEDTVIMYAK
KYGWDLITPTNIKEKFMKFVDKMDMSFSYKPVLLKAIFDHVDEDGKIRIVDIVNYFIDFY
EERKDNGLIAEKPNSIYQKGGYTEKDVERNIFSNPFKRFADMRFLEHSKNIEYIQINSNV
FRKLSGTDIAHILQVCDEKLDMYYKRITK
NT seq
2250 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaagccacaagtgtgaatagcattgctgaagagaaatttgtagaaatattttgt
gatacatttggtccggataaagcaaataatttatatgttcaatatccatttgttgatata
tacggtggacatagatatattgattttgccttagaaaatgaagattcaaagattgccata
gagattgatggtgaaacatatcacaatccaaagaaagtttctgataataaatactttgat
gacttattaaagcagaacagtatggtatatcaagattggaaagtttatcgttgggcatat
aatcagttggtttcacaacctgaaaaagttaaagatgaattggtaacttttttaggagaa
acaccttttttcaaaacctttcaagaatatctaccaaatcaacaaggaaaaatatttgag
ttaagagagtatcaaaaagaggctttagacaatcttaaaaagatgagagaaaatggtgaa
accattgcacttctttatcatgcaaccggtgttggtaagacagttactgctgcgtcggat
gcaaaagaagttggtggcagaacactattccttgttaatgcactaaaacttgcagaccaa
gcagaaaacacctttgcaaaaatttggaaagaagctacactaggtaaatatacaggtagt
gaaaaaacaactgatactaaagttatttttgcaactgtacagagtatttccaaaaaccta
cttgaatttcaaccaaattcatttgattatattattgttgatgaatgtcaccacgcagca
gcaaaaacctacaagaaaatttttagctattttaaggcaaaatttatattaggcttaact
gcaacacctgaacgctctgatggtgaagatatgctaaatctattccaaaatgttgcacat
aaaatggatttagaaacagcagtaaaaaaagaaatattagttccaataagatgtatcaga
attaaaactgatattgacttaacaagtgtaagaattaacggtattaaatataattctcaa
gatttggaatctaaactttttgtacctgaaagaaataaaattatagccgatacatatgtg
aattttgtaaatggtaaaaaggcagttatcttctgtgctagtattaatcatgctactgaa
atagcaaaactattattagaacaaggtgtaaatgctgaatctgtttcaggtagagataaa
ccaaaagtaagaaataaaatacttaatgattatgaaaacggtaatataaatgtactatgt
gcttgtgaccttctaaatgaaggttgggatagtccaaagacagaagttttgtttatggct
agacctactatgtcaaagactgtttatatgcaacaacttggaagaggtacaagaaaatgt
aaaggtaaaaaagatttattagtgtttgatttcgttgacaatgctaatatgtttaatcaa
ccttattcattacatagacttctcaatatcaaggaatatcatccattggagtatgtactt
gcaccggataataaaaagaaacttgataaagatttgttgagaaaaggtgaaaaaccaaca
gagtatattgatttacctttaaatatttatgattatgaaacggtagatttatttaattgg
caagatgaagtcaaaacaatgttatcacaaaaggaatttattagaagggttgatgtacag
tccgaaaccgttgatagatatgttaaaaacggtgatataaagcctgatttatctattccg
attagtgagaataaaacttttaattactataaagaagatacagtaattatgtatgctaaa
aagtatggttgggatttaataactccaactaatataaaagaaaagtttatgaaatttgtt
gataaaatggatatgagcttttcttataaacctgtgttgctaaaagcaatatttgaccat
gtggatgaagatggcaagataaggattgtagatatagttaattactttattgatttttat
gaggaaagaaaggataatggtctaatcgcagaaaaaccaaatagtatctatcaaaaaggt
ggatataccgaaaaggatgttgaaaggaatattttcagtaacccatttaagcgttttgcc
gatatgagatttcttgaacattctaaaaatattgagtatatccaaattaattctaatgtg
tttagaaagctctccggtactgatatagcacatatcttgcaggtgtgtgatgaaaagtta
gatatgtactataaaagaataactaagtag
DBGET
integrated database retrieval system