Runella sp. SP2: DTQ70_14275
Help
Entry
DTQ70_14275 CDS
T05690
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
rup
Runella sp. SP2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rup00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rup02000
]
DTQ70_14275
Transporters [BR:
rup02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DTQ70_14275
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M36
Por_Secre_tail
Cutinase
Ig_7
FTP
DUF5428
XopA_Hpa1
TSP1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYQ33253
LinkDB
All DBs
Position
complement(3466121..3472450)
Genome browser
AA seq
2109 aa
AA seq
DB search
MQVSLPKLFFFALFTCLSWATQAQNEIQTATQYLTENATKHKLLKQDIDRMTVSSAYLSP
TTGWYHIYFNQTFESVEVYNSLLSLVVKDGQVQHTTGSFVPNIEALVNQAPISVSPIQAL
QKAALEANLPINTPIQIREISNTPLADGTPGKIVYQSASISDENIVVKKYWFPYEVLEDG
KPHVKVALTWNVQFLTKDQQNGWSMHIDAHTGETIRKVDEVIHCSFGMVHRSGAPHDCSL
EHGSSVGTNAVLTPKATLAPDNTYNVFDYPLEAPTFGSRSLVASPYDKFVPLGTGPGATN
GWHFDGTTNYTTTRGNNVWAQEDANNNNGTGYSPTSSTLDFNYPYTQGLSTAAANRDAAI
TNLFYWNNLIHDVLWKYGFDEPSGNFQNTNQGRGGNGNDYVFADAQDGGGTNNANFFTPI
DGLNGRMQMYLWTNSGSYQPDGDFDNGIITHEYGHGWSTRLTGGPNNSACLQNAEQGGEG
WSDYLTLMLTTDWSSLTATEASGNIPRGIGTYALKQATNGAGIRPYRYAYFNQNTNTVNS
AVTYAGVGNTATFSLPHGIGSIWATMLWDMTWEIILQDAQIVNNIYSTPSNVMDMKGNIA
ALKLVNEGLRLQPCSPSFVQARDAILAADGLLFGGRYRCAIGRAFARRGLGALASTGVST
NDRIVTEDFTPISGASLNSPVAHTVCSNQPFNYTATTPTSGTTFSWTRDAVSGISNTAGS
GNSAAVSETLVNTSPLPVTVKYRFTLNPATCPGNVITQDVNVIVTPTVAATVPAYSVCQN
TAVPSGEGLVSPAVLVNSVSGLLSITDTYVRAMNDNSTVYVATPGSQSHYKTITFVAPNT
EAVTFEVTYAGVYDSDTYLSLYESSFNPAAPATNFLRGDDDIDYNGGNYRSQFTHNLVAG
TTYILVVASYYNLDPGPFILQSTPAVFSTGPTQWYLNASGGAPLATGNVFNPVGVSGSGI
ANTASAGVTTFYAASPLLSECRTPVTFTITPTHSITLTSVASTETQTVCTNTAITPITYS
LGGGATNATVTGLPDGVTYSVNAGVLTISGSPTTVVGSPFNYNITTTGNTCTVATESGTI
AVNTTHSITLTSVASTETQTVCTNTAITSITYSLGGGATNATVTGLPSGVTYSVNAGVLT
ISGSPTTAAGSPFNYNITTSGSSCTAATESGTITVNLAHSITLTSVASTKTQAVCINTAI
TPITYSLGGGATNATVTGLPSGVTYSVNAGVLTISGPPNTAVGSPFNYNITTTGNTCTVA
TESGTITIGNAQTITLTSPSATEAQTLCVNTAITSIVYTLGGGATNATVTGLPNGVTYSV
SAGVLTISGSPTTATGSPFGYTITTTGSVCTPTTKTGTLTVNAAHGIVLTSSPTTETQIA
CINSAIVPITYVLSGGATGATVTGLPTGVTSAINGGVLTISGAPTTISGNPFSYSIITTG
NACATASESGTITVQTKPVLTLSVLQQTLNEGNSQVICDIDANPVNSLQFNVSGTCGSGS
PVWRVQVGSGAWSAWSATVPVSQSSNNQPHRYQAACDANCPTTYTGAIELQINYRSSVPQ
AVSMVADGVTVAAGETKDVCNVEGNELTFNATCAAGEVLIYSVDGSEYGTTVPTQLVDGQ
YHNYRVRCRKSDGTSSCVETESGVMRLRLIMNSMTPVVSLNVTSGCGNSVAFTGTTNCGV
MTSIWYNATTNTALPSLPSQTPSETTSYYVRCQAEGGCLSGKSNVVTYTVSPVNTPPVVI
VSSDVACTGTEVTISTNCPAGTSALWNTGITEASFKVAFANITKQSYSVRCVSSNGCQSG
ASATKDVYWKAYVVTLINIGESKSSVKTNDRAAWVNQFITRDGGPELEQSTQQNPTLFFT
ENVNKIAPRYWTINVDACALGTDGSLTFDMLATPETGLPRSFNTHENNAPYFMYANREGW
TELYAQNHPAYGFYENNGAGGNVYDAGLPKGLYKLGVRYWDQKGWGSIYPSTRKPQGNVL
AYQEYWFRIQSKDGVGVGAARMAESSGQEANGKGQGSDNEKQLTDNGAFASVMPNPVTQM
LRLQIQNSKGQVVQTMLLDAAGRQVLGRRFEPETNTHQEEFGVSELPTGMYFMKVTTSEK
SVLLKVVKL
NT seq
6330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagtttccttgcctaaactgttttttttcgccctttttacttgtttgtcttgggct
acacaagcacaaaatgaaatacaaacggctactcagtatctcactgaaaatgctacaaag
cacaagctattaaagcaagatattgacagaatgaccgtatcgagtgcttatttatcgcct
acgactggttggtatcacatctattttaaccaaacctttgaatcggttgaggtttataat
agtttgttgagtttggttgttaaggatggacaagtccaacacacgacgggtagttttgtt
cctaacatagaagcattggttaaccaagcgccaatttcagtatctccgatacaagcattg
caaaaggcagccctagaggccaatttaccaataaataccccaatccaaatcagggaaatt
agtaacacgccacttgctgatggtacgccagggaaaatagtctatcaatctgcaagtatt
tcggatgaaaatattgttgtaaaaaaatattggtttccttacgaagtacttgaagatgga
aagccacatgtaaaggtagctttaacgtggaatgtgcagtttttgaccaaagaccagcaa
aatggttggagcatgcacattgatgctcatacgggcgaaaccatacgcaaagtagatgaa
gtgattcactgtagttttgggatggtacatcggtcgggtgctcctcacgattgttcttta
gaacacggatcctctgtaggaactaatgctgttcttactcccaaagcaacactggcacct
gataatacctataatgtttttgattacccattagaggctcctacttttggaagccgtagc
cttgtagcttctccatacgacaagtttgtgcccttaggaactggccctggcgcaaccaat
ggttggcattttgatggaacgacaaattatacaacaaccagagggaataacgtttgggcg
caagaggatgctaacaataataacggtactggatatagccccacatcatctacattagat
tttaactatccttatacacaaggactaagtacagcagccgctaacagagatgccgctatc
accaatttattttattggaataaccttattcacgatgttctgtggaaatatggttttgac
gaacctagtggtaacttccaaaataccaaccaagggcgaggtgggaacggaaatgattat
gtttttgccgatgcgcaagatggaggtggaaccaataatgccaatttctttacgccaatc
gatggacttaatggccgaatgcagatgtacctgtggactaattcgggaagttatcagcca
gatggcgattttgataacggaatcattactcacgagtatgggcacggttggtcaactcgt
cttacaggaggacccaataattcggcctgtcttcaaaatgcagagcaaggaggagaaggt
tggagcgattatttaacgttgatgctgacgactgactggtcatcactgacagcgaccgaa
gcaagcggaaacattcctcgcggtattggtacctacgctcttaaacaagctacaaacgga
gcaggtattcgcccttatcgatatgcttactttaaccaaaataccaatacagtcaacagt
gctgtgacctacgcaggcgtgggtaataccgctacattttctttgcctcacggtattggc
tcgatttgggccaccatgctttgggatatgacgtgggagattatcctccaagatgctcaa
atagtgaacaatatttactcgacgccatccaatgtaatggatatgaaagggaatattgct
gcgcttaaattggtaaatgaagggttgcgtttacagccttgtagtcctagttttgtacaa
gcgcgtgatgctattttggctgctgatgggctattgtttggcgggcgttatcgctgtgcg
attgggagagcgtttgctcgtcgtggcttaggtgctttggcttctacgggggtatctacc
aacgaccgaattgtaactgaagattttactccaatctctggagcatcactaaactccccc
gttgcacatactgtttgttctaatcaaccttttaattatacagcaactacacctacaagt
ggaacaacttttagctggacgcgtgatgccgtatctggtattagtaataccgcagggtcg
gggaactctgcagctgtgagtgaaactttggtcaatacctctcctttgcctgtaaccgtc
aaataccgttttacattaaacccagctacctgcccaggcaatgttattacccaagatgta
aatgtgattgtgactcctactgtggcagcaacggtaccagcttacagtgtttgtcaaaat
accgctgttccatcaggggaaggactggtttctcctgctgtattggttaattctgttagt
gggcttctttctataaccgatacctatgtaagagcaatgaatgacaattccaccgtatat
gttgctacgcctgggtcgcagtctcactataaaacaatcacttttgtagcacccaacact
gaggctgttacttttgaggttacttatgctggggtttatgatagtgatacgtatctttca
ttatacgaaagttcatttaatccagcagcacccgctaccaattttttacgtggagatgat
gacatcgactataatggaggaaattatcggtcacaatttacgcataatctagtagctgga
accacttatatattagtggttgcttcatattacaatttagatccaggaccgttcatatta
cagtcaacgcctgctgtattttcaacagggcctacgcagtggtatttaaatgcctcaggg
ggagcgccattggctacaggaaatgtttttaatccagtaggtgtgtcgggttctggaatt
gccaacacagcgagcgcgggtgtcacaactttttatgcggcgagtccattgttgtcagaa
tgtcgaacaccagtaacatttacgattactccaacgcatagcataacgttaacgtcggta
gcttcaacagaaacccaaacggtatgtactaatacagctattactcccattacgtattcg
ttgggaggtggtgctacaaacgccacggtcactggtttacctgacggcgtcacctattcg
gtaaatgcgggtgtattgacgataagtgggtcacctactacggtagtaggcagtccgttt
aattataatattactaccacgggcaatacgtgtacggtagctactgagtctggtactatt
gcagtgaacacaacgcatagcataacactcacgtcggtagcttcaacggaaacccaaaca
gtctgtaccaatacggctattacttccattacatattcgttgggagggggcgcgacaaat
gccacggtcactggtttacctagcggcgtcacctattcggtgaatgcgggtgtattgacg
ataagtggctctcctacaacagcagcaggtagcccatttaattataacatcaccacttca
ggcagttcctgtacagcagccacagagtcgggaactatcacagttaacttagcgcatagc
ataacgttaacatcagtcgcttcaacaaaaacccaagcagtttgtattaatacagctatc
actcccattacatattcgttgggaggcggtgcgacaaatgctacggtcactggtttacct
agcggtgtcacctattcggtaaatgcgggtgtattgacgataagtgggccacctaatacg
gcagtaggcagtccatttaattataatattactaccacaggtaatacgtgtacggtagct
actgagtcggggacgattacgatcggaaacgctcaaacaattacccttacctctcctagc
gcgacggaggctcagacgttatgtgtaaatacggccattacctcaatcgtatatacactc
ggggggggagctacaaacgctaccgttacaggtttacctaatggagttacctattcagtg
agtgcgggggtacttacaattagtggttcgcctactacggctactggtagcccatttggc
tacactattactactactggtagtgtttgtacacctacgaccaaaacgggtacattgaca
gtaaatgcagcccatggaatcgtcttaacatcttctccaacgacagaaacgcagattgct
tgtattaattctgccattgttccgataacgtatgtcttgagtggaggtgcaacaggcgct
acagtgacagggctgccaacaggtgttacgagtgcaatcaacggaggggttcttacaatt
tcaggtgcgcctacgacaatttcaggtaacccatttagctattctatcattaccacgggg
aatgcttgcgcaacggctagtgaatcgggcaccattacagttcaaactaaaccagtatta
acactctcagtacttcaacaaaccctaaacgaaggtaatagccaagtaatctgtgacata
gatgcgaatcctgtgaatagtttgcagtttaacgtttcgggtacttgtggttctggctcg
cctgtttggcgtgttcaagtaggtagtggtgcatggagtgcatggtcggcgacagtacca
gtttcccaatcatccaataaccaaccccaccgctaccaagcagcatgtgatgccaattgc
ccaacgacttatactggtgcaattgagttgcagattaattaccgttcgtcggtaccacaa
gccgtatctatggtggccgatggtgtgaccgttgctgctggtgagacaaaagatgtctgt
aatgtagaaggaaatgaactgacatttaatgccacatgtgccgctggggaggttttaatt
tactcagtcgatgggagtgaatatggcacaacagtaccaacccaattggtggatggccaa
taccacaattaccgtgtacgttgtcgcaaatcagatggaacaagttcgtgcgtagaaacg
gagtcaggagtaatgcgattacgattaattatgaattcaatgacccctgtagttagtttg
aatgtgacgagtggttgtgggaactcagtagcatttacaggtactacaaactgcggagta
atgacgtctatctggtacaatgcaacgacgaatactgcattacctagccttccatcacaa
acgccaagtgaaacaacatcctactatgttcgctgtcaagctgaaggtggttgcttgagc
gggaaaagtaatgtagtaacttatacggtatcgcctgtcaatactccgccagtagtcata
gtaagctcggatgtagcatgtacaggaacggaagtgacgatatcaactaactgccctgca
ggaaccagtgcactttggaatactggtatcacagaggcgagctttaaagtagcgtttgca
aatataaccaagcaaagctattcagttcgatgtgtgtcatcgaatggctgccaaagtggt
gcgagtgcgaccaaagatgtttattggaaagcttatgttgtgacattaatcaatatcggg
gagtcaaaatcatcggtgaaaaccaacgaccgtgctgcttgggttaaccagtttatcacg
cgagatggtggcccagagttggaacaaagtacccaacaaaatccgacgctattttttaca
gaaaatgttaacaagatagccccacgttattggacaattaacgtagatgcttgtgcgttg
ggaacagatggttcgttaacgtttgatatgctggctacccctgagacgggccttccacgc
tcattcaacacgcacgagaacaatgctccgtactttatgtatgccaatcgcgagggttgg
acagaattatacgcgcaaaaccacccagcctacggtttctacgaaaacaatggcgcagga
ggtaatgtatatgatgcaggtttgcccaaaggtttatataaattgggtgttcgctattgg
gatcaaaaaggttggggtagtatttatccatctactcgtaaacctcaaggaaatgtcctt
gcctaccaagaatactggttcagaatccaatcgaaagatggggtaggagtaggagcagcg
aggatggcggagagcagtgggcaagaggcaaacggcaaagggcaagggtcagataacgaa
aaacagttaaccgataacggggcttttgcttcggtcatgcccaaccccgtcacgcaaatg
ctccgccttcaaatccaaaacagcaagggacaagtagtgcaaactatgttgttggatgct
gcgggccgtcaggttttgggtcggaggtttgaacccgaaaccaacacacaccaagaggag
tttggcgtcagcgaattgccaacgggcatgtatttcatgaaggtaacaacgtctgaaaaa
agtgtgttgttgaaagtagtgaaattgtag
DBGET
integrated database retrieval system
