Runella sp. SP2: DTQ70_27005
Help
Entry
DTQ70_27005 CDS
T05690
Name
(GenBank) DUF11 domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
rup
Runella sp. SP2
Pathway
rup02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rup00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DTQ70_27005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SdrD_B
DUF11
Ig_7
CarboxypepD_reg
bMG3
SpaA
CarbopepD_reg_2
DUF7619
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYQ35590
UniProt:
A0A3G3GWE6
LinkDB
All DBs
Position
6704136..6710231
Genome browser
AA seq
2031 aa
AA seq
DB search
MAILHRIHQREYATWFVQYSIKTFALLGILLGSFQFVQAQQCSITINKVTVSGCYLLSGQ
SKATVSIEVGWSGAPANDSIEVTLGTDKRYIRPGTFAVKYPATTVMGNQTIVTPQVIAFE
VNATGNSLPITATFTTQASCSATSTAQLPAACPPLVCSGNQAGGTVFNDYDADGVKDAGE
SNGVAGVTVIAYDCTGGIAAQTTTDASGKYVLNVSVSDYPIRVEFVNLPSYAGKGTMQGA
DSRTTVQFVTAPDCTIDLGILDNNDYCQTTPQVVVPCYVYGKPDVGSLSGQMDALVAFDY
GTTGPKDMSKIALLAKAEEVGTLWGVAYDRYKHKVYTSATLKRHAGLGPLGLGGIYVTDM
AANTASQYVDVSQPPLNINVGATNAGDPWFGVTNASRGLNPDPAQPSADSLAFELIGKVG
MGDLEISEDGKSLYFINLFDKKLYQIDISGAAPSLLGSWAIPDPGCTGGTLRPFATKVYK
GKVYIGSVCDASTSTKSNLRGFVNAFDGTNFTQVFDFPLTYPKGAVLINNTPAVVDRVGW
YPWTDSFNTVNSNTTNGTFIRVLYPQPMLTDIEFDIDGSMVLALGDRTGLQSGYNNYRPS
GTGVYTGLAGGDVLRAAFTNGTFILENNGKVPGLSGSGVNNNQGPGFGEFYNDDFLGGNG
GLTHAEIAFGALALKPGSGQVITTAMDPIDQNQTGTNFSGGIRYWSNTTGLAPSGAAMGF
VLYNTNNEVGTFGKSTGLGDMEILCELPMYLELGNYVWNDANKNGVQDPCEKALKDINVT
LYKGTTKIATTKTGTNGEYYFSTKSNLTTGTWEGTGADTTLLPNTAYKLVFGEGQLVGGK
LTVAGLGQFDVTLKDATANSGNDQNDSDAEVISGAFCINLTTGNAGSVNHTFDAGFYCTN
PSIGASSIAVTAPKCAVTVPQNDGKISLSSAIAPYDKYRTKMGTGAWSGDTTYATATAIG
STFPKDLVTGISNAGATYTIRFYNGECCYKDTTITIAPVACCVLPVASATPQKQTICVGG
IVSAFTATPSTGVEYKWYGPLADTTSSLGTAVSGATSATFTPSGAALTTVGTKYYAVVVN
TTGDANCADTVFVQLVVNAKPVIADGSATICAGDSVDLTSKITNYDTYLSPVWTVGTANG
TVVTTPASVKPTGTTTYVLVAQNAAGCKDTANVVVTVNIKPNAGKDTTLACVNAATNTLS
TSYTLVPNPSGGSWSQLGTTPTTATISGNDVTGMSVAGTYQFIYTSVAGCKDTIAVTVAP
CPVCVKPDAGADAASVCQPTSTSKLTAVTTGGTWAPIASPANPSAATIDANGNISGLNAA
GTYKFVFSITSGGQTCTDTAQVIVLAKPVIADGSATICAGESVDLTSKITNYDTYLSPVW
TIETANGTAVATPNSVKPTGTTTYVLVAQNAAGCKDTANVVVTVNAKPNAGNDTTLVCAN
GSVPSSVQLSAAPTGGTWSALTGNPTGATISSSGLVSITNATAQGKSFDFIYTLNDCQDT
VKVIVPVCVQPKGSIGDYVWKDQNDNGVQDSGEPAVAGVIVQLLNPTTSAVLATDTTDAQ
GLYLFPNLNSGTYQVKIVTTSLPAGCVISSKQDLGGDDTKDSDFDPTTGLSQTVTINATG
TGITKDNPTVDAGLVVPCVASSVTLTDAPVCSADVQTYSITFNVSNKLGIVKVNKGTLSG
NNPYTVTGIPSGASVIITDSLSAICKSDTTIVGPNCNCNPPVPVLLAPSMAACIGDTFPT
LKATVVGLVTVEWFSQQTGGTVLSTGLNYKPSGTVTANTVFYAQARSTDPTCPTAVSTSR
VPATINAQTCIDTIDLALKKSINTKIARVGDVLTYTIKVWNEWNKNATGVEVTDSIATTV
QFVSGSFVTSRGSATISGNVIKWNIGNVAANGDTVTLRYQVKATQVGVHLNTAEISKTNE
KDKDSTPGNGKGGEDDIDQQCFTVPFDLCPNQKLEVSVPATLTNVQWFKNGGTTAVATGN
VVLFSEVGTYTFTATNQTCPANGCCPVIIEAGTNCCPVDICVPFTIKKKRK
NT seq
6096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaattttacaccgtatccatcagcgggagtatgcaacgtggtttgtgcaatatagc
ataaaaaccttcgctcttcttggcatcctcctggggtctttccagttcgtccaagcgcaa
caatgctcaattaccattaataaagtaaccgtttcgggctgttatttgttaagtggccaa
agtaaggctactgtgagcattgaagtcggctggtcgggcgcacctgcaaatgatagtatt
gaagtgacacttggtaccgacaaacggtacattcgtccagggacgtttgccgtaaaatac
ccagccacaaccgtgatgggaaaccagaccattgtgacgcctcaagtgattgcttttgag
gtaaatgcaactggaaatagtttgccaattacggccacatttaccacccaagcttcgtgt
agtgcaacctcaacggctcaattgcctgcggcttgtccacccttggtttgtagtggaaat
caggcaggagggacggtctttaacgactatgatgcggatggagtaaaagatgcgggagaa
agcaatggcgtagcaggagtgactgtcatcgcttatgattgtacagggggaattgctgcc
caaacgaccactgatgcttcagggaaatatgtgttaaatgtctctgtttcagactatccg
attcgggtagagtttgtaaatctaccgagttatgcggggaaagggacaatgcaaggggca
gacagccgcacaactgtgcagtttgtaacagcccccgattgtacaattgatttgggaata
cttgataacaatgattattgccaaacgactccccaagtggtggttccttgttatgtgtat
ggaaagccagatgtgggtagtttgagtgggcaaatggatgctttggtggcattcgattat
ggcactactggccccaaggacatgtcaaaaatagcgcttttggccaaggcagaagaagtg
ggtacattgtggggggtagcttatgatagatataaacataaggtatatacctcggccaca
ttgaaacgtcacgcgggcttagggccactcggtttgggaggaatttatgtgacagatatg
gcagcaaacacagcatctcagtatgttgatgtgtcacaaccaccgcttaatatcaatgtt
ggtgctaccaatgcgggtgatccttggtttggggtgaccaatgcctcacgtggccttaat
ccagaccctgctcaaccaagtgccgattcgctggcttttgagctgataggcaaagtcgga
atgggtgatttagaaatttccgaagatggtaagtcgctgtatttcattaatttatttgac
aaaaaattataccaaatcgatattagcggggctgccccaagtttgctaggctcttgggca
attcctgacccaggatgtacgggtggtacactacgcccttttgctaccaaagtgtataaa
gggaaagtgtatataggttcagtttgtgatgcttctacttcaacaaaatcaaacctacgg
ggttttgtcaatgcttttgacggaaccaatttcacccaagtatttgattttccattgacc
taccccaaaggagcggttttgataaacaatacacctgcggtggttgatagagtaggttgg
tatccttggacggacagctttaataccgtcaatagcaatacgaccaatggtacttttata
cgggtattatatcctcagccaatgcttaccgacatcgaattcgacattgacgggtcgatg
gtgttggccttgggtgatcgtactggtttgcagtcgggatacaataactaccgtccttca
ggaacgggtgtatatactggtttagcaggaggtgatgtactaagagctgcatttacgaat
ggtacgtttattcttgaaaataatggaaaagtgccaggactttcaggctcgggtgtgaat
aataaccaaggccctggttttggagaattttataatgacgatttcttaggaggaaatgga
ggattgacgcacgcagaaattgcattcggagcgttggcgttaaaaccagggtcaggccaa
gtaattacgacggcaatggatccaatcgaccagaaccaaacaggtactaacttttcgggc
gggattcgttattggagtaataccacaggacttgcgccaagcggtgctgccatgggattt
gtgttgtacaatacaaacaatgaagtaggtactttcggcaaatcaacgggattgggagat
atggagattttgtgcgagcttcccatgtacctcgaattaggtaactacgtgtggaatgac
gccaacaaaaacggggtacaagacccctgcgaaaaagcgctgaaagacatcaacgtgacg
ctctacaaaggcactaccaaaatagcgacgaccaaaacaggcacgaacggggagtattat
ttttcaacaaaatctaacctgactacgggaacttgggaaggcacaggtgctgataccaca
cttctaccaaacacagcttataagttggtttttggtgaaggccaattagtaggtggaaaa
ttaacagtggcaggtttgggtcaatttgacgtaacgctcaaagatgccacggccaacagc
ggcaacgaccaaaacgacagcgatgcggaagtaatcagcggtgctttttgtataaatctt
accactggaaatgcaggaagtgtcaatcatacttttgatgcaggattttattgtacaaac
ccttcgattggcgctagttcaatcgctgttacagctcctaaatgtgctgttacagttccc
caaaacgatggaaaaatcagtttgagcagtgcgatagctccttatgataaatataggaca
aaaatgggaacgggtgcatggagtggcgatacgacttacgccacagccacggcgattggt
agtactttccccaaagacttggtgacaggcattagcaacgcgggtgcaacatacacgatt
cgtttttataacggcgaatgttgttacaaagacacgacgataactattgcgccagtggct
tgttgcgttttgcccgtagcctcagccactcctcaaaaacaaacgatttgcgtaggtggt
attgtttcagccttcacggctacgccaagtacgggcgtagaatacaaatggtacggacca
ttagcagacacaacgagcagcttaggcacagccgtgagtggtgcgacaagtgcgaccttc
acaccgagcggcgcagcattgacgacggtaggtacaaaatattacgcagtggtagtaaat
acgacgggtgatgcgaattgtgcggatacggtatttgtacaattggtagtgaacgccaag
ccagtaattgctgatggaagtgccacgatatgcgcaggtgattcggtggatttgacgtcg
aagattacgaattacgatacatatttgagtccagtatggacagtgggcacggcgaatggc
acagtagtgacgacgccagcctcagtaaaaccaacgggaacaacgacatacgtattggtt
gctcaaaatgcggctggttgtaaagacacggcgaatgtggtcgtgacggtgaatatcaaa
ccaaatgcaggcaaagacacgaccttggcttgtgtgaatgctgcgacaaataccttgtca
acaagttatactttagtgccaaacccatcgggtggaagttggtcacaactaggtacaacg
ccaacgacagcgacgatttctggtaacgacgtgacgggtatgagtgtggcaggcacatat
cagttcatttatacttcggtagcaggttgcaaagacacgattgcggtgacggtagcaccg
tgcccagtttgcgtgaagcccgatgcaggtgctgacgcagcttcggtatgtcaaccgaca
agtacgtcgaaattgacagcagtaacgacaggtggcacatgggcaccaattgctagcccc
gctaacccaagtgcggcgacgatagatgctaatggcaatatcagtggcttaaatgcagca
ggcacttataaatttgtgttttcaatcacctcaggtggtcaaacgtgtacggacaccgcg
caagtgattgtactagctaagccagtaattgctgatggaagtgcgacgatttgcgcaggt
gagtcagttgatttgacctcaaagattacgaattatgatacttatttgagtccagtgtgg
acaatagaaacagcaaatggcacggccgtagcaacgccaaattcagtaaaaccgactggc
acaacgacttacgtattggtggcacaaaacgccgcaggttgcaaggacacggcgaatgtt
gtagtgacggtgaatgccaaaccaaatgcaggaaatgatacaacattggtatgtgccaat
ggtagtgtgccatcaagcgtacaattatcagcggcaccaacggggggcacatggtcagct
ttgacgggcaatccaacgggagcgaccataagcagttcaggattggtaagtatcaccaat
gctacagcacaaggcaaatcgtttgattttatctatacgttgaatgattgtcaggataca
gtgaaagtgattgtgccagtatgtgtacaacccaaaggttcgattggcgactacgtttgg
aaagaccaaaacgacaacggcgttcaagattcaggtgagccagcagtagcgggtgtgatt
gttcaattattgaacccaacaaccagcgcagttttagcaaccgatacgacggatgcgcaa
ggtttgtacttgttcccgaatttgaactctggcacatatcaagtgaagattgtgacgacg
agtttaccagcaggttgtgtgattagcagcaagcaagatttgggtggcgatgatacgaaa
gactctgactttgacccaacgacaggtttgagtcaaacggtgacaattaatgcaacgggt
acaggcattacgaaagataacccaacagttgatgcagggttagttgttccttgtgtcgca
tccagcgtaactttgacggacgctcccgtttgttcggcagatgtacaaacgtacagcatt
acgtttaatgtgtctaacaaattgggcattgtaaaagtgaacaaaggcacattgagcggt
aacaatccttacacggtgacaggtatcccgtcgggagcgagtgtgatcattacggacagt
ttgagtgcgatttgtaagtcagatacgacgattgttgggcctaactgtaactgtaatcca
ccagttccagtgttgttagctccaagtatggccgcatgtattggtgatactttcccaact
ttgaaagcgacggtggtaggattagttactgtagagtggtttagccagcaaacgggcgga
acagtattatcaacgggcttaaattacaaaccaagtggcacagtgacggcgaatacggtt
ttctacgcccaagcgcgcagtactgacccgacctgtccaacggcagtgagcacaagccgt
gtaccagcgacaatcaacgcccaaacttgcattgacacaattgatttggccttgaagaag
tcaattaatacaaaaatcgcgcgggtgggtgatgtgctgacttacacgattaaagtttgg
aatgaatggaacaagaacgcgacgggtgtagaagtgaccgatagcatcgcaacgacggtt
caatttgtgagcggtagttttgtaacaagtcgtggcagtgcgacaatcagtggcaatgtg
attaagtggaacattggcaatgttgccgctaacggtgacacggtgacgttgcgctaccaa
gtgaaggcgacgcaggtgggcgttcacttaaacacggctgaaatcagcaagaccaacgag
aaagacaaagacagcacaccaggcaacggtaaaggtggtgaagatgacattgatcaacaa
tgcttcacagtgccttttgacttgtgccccaaccaaaagttggaagtgagtgttcctgcg
acattgacgaatgtacaatggttcaaaaacggtggtacaacggcagttgcgacgggaaat
gtggtgctgttctcggaggtaggaacctacactttcacggctacgaaccagacgtgtcca
gccaacggttgctgtccagtcattattgaagcggggacgaattgttgccctgtggatatt
tgtgttccgtttacgatcaagaagaaaagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system