Ruminococcus bicirculans (ex Wegman et al. 2014): RBI_I00271
Help
Entry
RBI_I00271 CDS
T03158
Name
(GenBank) Type II restriction-modification system restriction subunit
Organism
rus
Ruminococcus bicirculans (ex Wegman et al. 2014)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_5
AAA_22
AAA_7
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCO04004
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(301567..303195)
Genome browser
AA seq
542 aa
AA seq
DB search
MNSTEIIRNYIDNQLHYPRVNRAGDIDEVTLPSTETIIISYADISITGTERARPQIRIFT
DNATNGYHIARSEKKRFFFLTIYSKAAAYVSYLGHITPSEYIVSLETNVSSISGRMDIRS
MYEWLDGKVAASSAPINCIRCNNGDHACGIYQASFLRISNGGTAIIPAEVTDYLNIFDMR
PYFIPSLVTFNYTPLDERDKRNVIAFGAPGTGKSYFFKKYLDEHHVSSDDYERVTFYSDY
SYSQFIGTYKPVDVGGMITYKFVPGPFMRTLVAALENASTTAPHKHYLIIEELNRAKAAA
VFGDMFQLLDRDDTGRSEYSINASEDIRAYLAEHFGGAASAYSKLAIPNNMYIFATMNSA
DQGVFPMDTAFKRRWNFNYIGIDDEEFKVNIDPSTGVKTATECQSGTFNLADGAVEWNVL
RRAINAKLSNDRIKAHEDKLMGPFFMKTQDSTGTCLFTLGHEDEEFSTLFCEKVIMYLFE
DAAKTKHKELFEGCDSDKLNRFSYICAEFKSRGLAIFGSDFRSREYANQIAERDAAKMEK
EC
NT seq
1629 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattctacagaaattattcgcaattatattgataatcaacttcactatcccagagta
aatcgagctggggacatagatgaggttacactaccctcaacagaaacaataattatttca
tatgctgatatctcaatcactggaacggagcgagctcgacctcagattaggatatttact
gataacgctacaaatggatatcacattgctcgaagcgagaaaaaacgattctttttcctt
accatatatagtaaggcagcagcgtatgtttcttatttgggacatataaccccctctgag
tacattgtttcgcttgaaaccaatgtctcatctatatctggacgcatggacataagaagc
atgtatgagtggctagatgggaaagttgcagcatcctctgcgcccattaattgtattcgt
tgtaataatggtgatcatgcttgtggcatatatcaggcatcttttctcagaatatcaaat
ggtggtactgctataattcctgcagaagtaacagattatctaaatatttttgatatgcga
ccgtattttatcccgtcattagtgacatttaattatacccctcttgacgaaagggacaag
cgcaatgtgattgctttcggggctccaggaactggcaaaagctacttttttaagaaatac
ttagatgaacatcatgtttcatctgatgattatgaacgagtaaccttttattcagattat
tcgtattcgcagtttataggaacatataagccagtagacgttggtggtatgataacttat
aaattcgttcctggtccatttatgcgaacgcttgtcgcggcgttggaaaatgcttcaacc
acagcccctcacaaacattatcttattattgaagaattaaaccgagctaaggctgcggct
gtttttggcgatatgtttcaattgctcgacagggatgataccggaagaagtgaatactca
ataaacgcaagtgaggatatacgggcatatttagctgaacactttggcggtgcagcttcc
gcttattccaaattggcgattccaaataatatgtatattttcgcaactatgaatagtgcg
gatcagggtgtattcccaatggatacagcatttaagcgtaggtggaactttaattatatt
ggcattgatgatgaagaattcaaggtaaatattgatccctcaactggtgtaaaaactgct
acagaatgtcaaagtggaacgtttaatcttgccgacggagccgttgagtggaatgtttta
cgtcgtgcgataaatgctaagttgtcaaatgacagaataaaagctcatgaagataagctg
atgggaccattttttatgaaaacacaagattctaccggaacgtgtttattcacactaggt
catgaggatgaagaattcagtacactattctgtgaaaaagttattatgtatttatttgag
gatgcagcaaagacaaaacataaggaactttttgaagggtgcgatagcgataaattaaat
cgtttttcttacatttgtgcagagtttaaatcaagaggtcttgctatatttggttcagat
ttcagatcaagagaatatgcaaatcagatagcagagcgtgatgccgcaaaaatggaaaaa
gaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system