Candidatus Rickettsiella viridis: RVIR1_06930
Help
Entry
RVIR1_06930 CDS
T05765
Name
(GenBank) putative cell wall-associated hydrolase protein
Organism
rvi
Candidatus Rickettsiella viridis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5439
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBB15190
UniProt:
A0A2Z5UWB0
LinkDB
All DBs
Position
732771..735887
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MSKIEVLTDLLGLGVKDKASKLKNIQSIHAAGLLIFDFDPSKVQQALDVMYAATQWNKDI
TDKKLDQKMDQKTLIAICKHAIEFADSKAVLQTLLVIEAVGINTQLFKQELQPYLSTFPA
EIAQLIATLTKAYDGTIKKELLLECLLVAKEKYEEDKKIGLELDTIVYSSLWKEKYKAFS
EENKRLIESYTVKLKGLAYTDTFLFSLLDNEMQSDAYLKRLELASAVVNKCSDKAAALQS
IQALKEKSGDRVDEIMRVIMTSVKVDEALEVAALSSTELLAEDKQSLLSLILKARQPKEA
KSIFEILNKHHLVASTDLFKAILKQDETEGKPTVDRIDSFFNQKSELPKPINTEVSDLIL
LSADIANASQQVSALQELDQRFSNSKSLVLDMLSKQSADSELALEEIQKFKEMAGDGEIS
AILAEKNPLERIKAFLELSTLNEELKGQYLDLVLNAHQPDAAAKIVTDLAAREAIKEEGA
LKCIGLILDKKQATEREQTKLAFIKLKCYPITYELIDCALNLSESALEEVLQVALELFVP
EPCSDKPISAGMFEKMLSTESAIQFKNKLMQLKEKNLLDFVSMHALYHNLDWNKGKNEFL
AEIESLQKLQSSVAASLFACICTSARPIDAANILIKLNQQGLIKKSFWTRAINANDLKVF
EYITAGKTADEMDNRSTNFQSVRQKYLLDFSNSSHSLNLAWALTSENGKNRLNGLIENLD
ANKIIRKSFWTGKIKDQHQTAIRAILSGKDDSAITTRARNLEAIVNAKLFDLIYKADLLD
FILYAPQADAKAHIAFLVDLREKGILKMSYGKGKSAWVVNLKTALLQKDKQAIYSLLASK
GLIHDHALVRAILDSPVVVLKEAKLEQLLKLGLLKKNWRTGKLKASSYQFITALLQSKTE
EERQLAISTYKIKGTLSSIEQAELTNLYPKATLTSPVLQGLAISPPPPPLPLPISRAALL
SSPLPATVPPTSPMNGAAPPPLPISELLSSKRLFNAGTPNNKQQATPKPSREALNAEIIS
KGGLNGLKNRGVGGVNLS
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaaatcgaagtattgactgatctattggggttaggagttaaagataaagcaagt
aagctaaagaatatacaatcaattcatgccgccgggttattaatatttgacttcgatcct
agtaaggttcagcaggcattagacgttatgtatgcggccacgcagtggaataaggacata
acggataaaaaactggatcaaaaaatggatcaaaaaacattaatagctatttgtaaacac
gcgatagagttcgcagattctaaggccgtattgcagacgctgctggttatagaggcagtt
ggtatcaatacccaactttttaaacaggaattacaaccctatttgtcaacctttcctgca
gagatagcgcagctcatcgccactttaaccaaagcatatgatggcaccattaaaaaagag
ttattgcttgaatgtttgcttgttgctaaagaaaaatacgaggaggataaaaaaatcggt
ttagaattagacactattgtttatagtagtttatggaaagaaaaatataaagctttctcc
gaggagaataaacggcttattgagtcttataccgttaaattaaagggtcttgcctatact
gatactttccttttttcacttttagataacgagatgcagtctgatgcctacctgaagcga
ttagaactggcttctgcagtggttaataagtgtagtgataaagcagctgctctacagtct
atccaagcgctaaaggagaaatcaggcgatcgggttgatgaaataatgcgtgttattatg
acatcagttaaagtggatgaggccttagaagttgcggccttaagtagtacagagttactc
gctgaagataaacaatcgctgctttcgttaattttaaaagctaggcaacctaaagaagcg
aaatctatctttgaaatattaaacaagcatcacttagtcgcatcgactgatttatttaag
gctattttaaagcaagatgaaactgaaggtaaaccgacagtggatcgcatagactctttt
ttcaatcaaaaatcagagctccctaagccgataaacacagaagtatcagacctcatctta
ttatcggctgacatagcgaatgcatcgcagcaggtttcagcactacaggagctagatcaa
cgattttctaattctaaaagcctcgtattagatatgctaagcaagcagagtgcggatagt
gagctagcacttgaagaaatacaaaaatttaaggagatggcaggtgacggagaaataagt
gctatcttagctgaaaaaaatcctctagagcgaatcaaggcattcctagagctctctacc
ttaaatgaagaactcaaagggcaataccttgatttggttcttaatgcacatcagcctgat
gcagcggcaaaaatcgtaaccgatttagcggcacgggaagctataaaagaagagggcgca
ttaaaatgtattggcctcattctagataaaaaacaggcgactgaaagagaacaaaccaag
ttagcctttataaagcttaagtgctatcccattacatatgaattgattgactgtgcgctt
aacttgtctgaatcagcgctcgaagaggttctgcaagttgcgctagaactttttgtgcca
gaaccttgtagcgataagccaataagcgcggggatgtttgagaaaatgttaagcactgag
tctgcgattcagtttaaaaataagctaatgcagctaaaggaaaagaatttattagatttt
gtttctatgcatgcgctttatcacaacttagattggaacaagggtaaaaatgagtttcta
gcggagatagagtcgttacaaaaattgcaatcaagtgttgctgcaagcttatttgcgtgt
atttgtacttctgctagaccgattgacgcggcaaacattttaattaaattaaatcagcag
ggattgataaaaaaaagcttctggactagagctatcaatgcgaatgatttaaaggttttt
gagtatatcacagccggaaaaacagcggatgaaatggataatcgatccactaattttcaa
tctgttcgtcaaaagtatttattggattttagtaattcctctcattctttaaatcttgct
tgggctttaacgtcggagaatggcaaaaatagattaaatggtttaatagaaaacttggat
gcgaataagataataaggaagagtttctggaccggtaagattaaagatcaacatcaaact
gcgattagagctattttatccggtaaggatgattctgctataaccactcgagcaaggaat
cttgaagctattgtgaatgcaaaattatttgatttgatttataaagcggatttattagat
tttattttgtatgcgcctcaagcggatgcaaaggcacatattgcgtttctggttgattta
agggaaaaaggtattttaaaaatgagttatggtaaaggaaaatcagcctgggttgttaat
cttaaaacggctttattacaaaaagataaacaagctatttattcattgcttgcgagtaaa
ggtttgattcatgatcatgctttggttagagctattttagattcacccgttgttgtactt
aaggaagctaagctagagcaattgctaaagttaggtttgctaaaaaaaaattggcggaca
ggaaaattaaaagccagttcttatcagtttattacagcgctcttacaatctaaaactgaa
gaggaaagacagctagcgatttctacttataaaattaaagggacactaagcagtattgag
caagcagagcttactaatttatatccaaaagcaacactaacgtcgccagtactgcaggga
ttagcaatatcaccaccaccgccgccgctaccactaccaatcagccgagcagcattgcta
tcgtcgccattgccggccacggttccaccaacatcgccaatgaatggagcagctccacca
ccactgccaataagtgaattattatcgtcaaagcgcttattcaatgcaggcactcctaat
aataaacagcaagctacacctaagccaagcagggaagctcttaatgcggagataatatcg
aagggaggtctaaatgggttaaagaacagaggggtagggggtgttaacctttcataa
DBGET
integrated database retrieval system
